網羅的なHLA及び臨床情報の機械学習による同種移植の国際標準予後予測アルゴリズム
Project/Area Number |
21K08391
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
諫田 淳也 京都大学, 医学研究科, 講師 (30636311)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
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Keywords | 機械学習 / 同種移植 / 臍帯血移植 / 造血幹細胞移植 / HLAエピトープ |
Outline of Research at the Start |
本研究では、HLA-DPB1, -DQB1 遺伝子座を含む未知のHLA アレルの測定・推測を行い、①患者・ドナー間のHLA適合度及び組み合わせの情報、②GVHDのターゲットとなり得る、HLAエピトープ及びHLA提示ペプチドのエピトープ情報、及び③詳細な臨床情報を含むレジストリーデータを、機械学習により解析することにより、網羅的な解析に基づく、GVHD など移植後予後因子のリスク評価のためのアルゴリズムを確立する。また、欧州の移植データも利用することで、欧米でも利用できる国際標準アルゴリズムを作成する。
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Outline of Annual Research Achievements |
日本造血・免疫細胞療法学会のデータベースを用いて、2010年から2018年に造血器腫瘍に対して初回同種移植を実施した14430例を対象に、同種移植後中長期の合併症に関して、アンサンブルモデルを用いた機械学習による予測モデル確立を試みた。この研究により移植後の急性GVHDのイベントを加えることで、モデルの予測能が改善することが示された。このことは移植前因子のみならず移植後因子を用いることの重要性を示している。 また京都大学関連病院のデータベースを用いて、GVHDが予後に及ぼす影響を臍帯血移植、PTCyハプロ移植、HLA適合移植での比較を行った。軽度の急性GVHDは臍帯血移植およびPTCyハプロ移植においてのみ予後に正の影響を及ぼしており、移植ソースによりGVHDの影響が異なることが示された。 さらに日本造血・免疫細胞療法学会と欧州臍帯血研究組織であるEurocordの共同研究として、悪性リンパ腫に対する臍帯血移植の解析を施行した。2000年から2017年に初回の臍帯血移植を受けた18歳から75歳の患者(欧州 単一臍帯血192例、複数臍帯血304例、日本 単一臍帯血1150例)を対象とした。全身放射線照射を含む移植前処置は、日本および欧州ともに生存に正の影響を及ぼしており、リンパ腫に対する移植におけるTBIの重要性が示された。一方、HLA不適合の意義は欧州と日本で異なっており、民族の差の影響がうかがわれた。 今後は、国際間のHLAの意義の差異および移植後のイベントもモデルに組み込むことにより、さらなる同種移植の国際標準予後予測アルゴリズムの確立を試みたい。
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Report
(3 results)
Research Products
(13 results)
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[Journal Article] Impact of stem cell selection between bone marrow and peripheral blood stem cells for unrelated hematopoietic stem cell transplantation for hematologic malignancies: on behalf of the Donor/Source Working Group of the Japanese Society for Transplantation and Cellular Therapy2024
Author(s)
Hayashi H, Iwasaki M, Nakasone H, Tanoshima R, Shimabukuro M, Takeda W, Nishida T, Kako S, Fujiwara SI, Katayama Y, Sawa M, Serizawa K, Matsuoka KI, Uchida N, Ikeda T, Ohigashi H, Fukushima K, Hino M, Kanda Y, Fukuda T, Atsuta Y, Kanda J
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Journal Title
Cytotherapy
Volume: 26
Issue: 2
Pages: 178-184
DOI
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[Journal Article] Cord blood transplantation for adult mature lymphoid neoplasms in Europe and Japan2024
Author(s)
Watanabe M, Kanda J, Volt F, Ruggeri A, Suzuki R, Rafii H, Kimura F, Cappelli B, Kondo E, Scigliuolo GM, Takahashi S, et al.
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Journal Title
Blood Advances
Volume: 8
Issue: 3
Pages: 640-652
DOI
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[Journal Article] Impact of GVHD on lymphoma progression: Nationwide study from Japanese Society for Transplantation and Cellular Therapy2023
Author(s)
Watanabe M, Kanda J, Fukuda T, Uchida N, Ikegame K, Kataoka K, Kobayashi H, Ara T, Ishikawa J, Matsuoka KI, Sugio Y, Nakazawa H, Ikeda T, Atsuta Y, Kondo E, Suzuki R
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Journal Title
British Journal of Haematology
Volume: 203
Issue: 3
Pages: 446-459
DOI
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Peer Reviewed
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[Journal Article] Mild Acute Graft-Versus-Host Disease Improves Outcomes After HLA-Haploidentical-Related Donor Transplantation Using Posttransplant Cyclophosphamide and Cord Blood Transplantation2023
Author(s)
Wada F, Kanda J, Kamijo K, Nishikubo M, Yoshioka S, Ishikawa T, Ueda Y, Akasaka T, Arai Y, Izumi K, Hirata H, Ikeda T, Yonezawa A, Anzai N, Watanabe M, Imada K, Yago K, Tamura N, Itoh M, Masuo Y, Kunitomi A, Takeoka T, Kitano T, Arima N, Hishizawa M, Asagoe K, Kondo T, Takaori-Kondo A
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Journal Title
Cell Transplantation
Volume: 32
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Development of a Stacked Ensemble Model for Risk Stratification of Chronic Gvhd after Allogeneic HSCT: Trump Cohort Study2023
Author(s)
Iwasaki M, Kanda J, Kimura F, Seo S, Atsuta Y, Uchida N, Doki N, Fukuda T, Nishida T, Katayama Y, Tanaka M, Eto T, Ikegame K, Kanda Y, Sawa M, Onizuka M, Hino M, Ichinohe T, Tabuchi K, Takaori-Kondo A.
Organizer
the 65th ASH Annual Meeting and Exposition
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[Presentation] THE EFFECT OF HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN EPITOPE MATCHING ON OUTCOMES AFTER HAPLOIDENTICAL TRANSPLANTATION DEPENDS ON GRAFT-VERSUS-HOST DISEASE PROPHYLAXIS AND PRETRANSPLANT DISEASE STATUS2023
Author(s)
Iwasaki M, Kanda J, Tanaka H, Ikegame K, Doki N, Nakamae H, Eto T, Tanaka T, Ara T, Hiramoto N, Fukuda T, Ichinohe T, Atsuta Y, Morishima S.
Organizer
EBMT 49th Annual Meeting
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[Presentation] Impact of Human Leukocyte Antigen Epitope Matching on Outcomes after Unrelated Bone Marrow Transplantation2021
Author(s)
Makoto Iwasaki, Junya Kanda, Hidenori Tanaka, Takero Shindo, Noriko Doki, Takahiro Fukuda, Yukiyasu Ozawa, Tetsuya Eto, Naoyuki Uchida, , Yuta Katayama, Keisuke Kataoka, Makoto Onizuka, Yoshinobu Kanda , Tatsuo Ichinohe, Yoshiko Atsuta,Satoko Morishima
Organizer
63th ASH Annual Meeting
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