Identification and functional analysis of novel type 1 diabetogenic genes in the Japanese population by next-generation sequencing
| Project/Area Number |
21K08567
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 54040:Metabolism and endocrinology-related
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| Research Institution | Kindai University |
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Principal Investigator |
能宗 伸輔 近畿大学, 医学部, 准教授 (90460849)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池上 博司 近畿大学, 医学部, 教授 (20221062)
馬場谷 成 近畿大学, 医学部, 講師 (10449837)
廣峰 義久 近畿大学, 医学部, 講師 (30460851)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | １型糖尿病 / 遺伝子解析 / 次世代シーケンス / 濃厚発症家系 |
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| Outline of Research at the Start |
１型糖尿病は生命維持に必要不可欠なインスリンを分泌する膵β細胞が破壊され、発症するためインスリン注射を生涯継続しなければならない。欧米に比し、日本は有病率が低く全体数は少ないものの、家系内に複数発症する頻度が高いという特有の疫学的特徴がある。従って健常者にほとんど認められず、親から受け継ぐと高い確率で発症に至る強力な遺伝子変異が発症に関与している可能性が高いことが想定される。この仮説を元に１型糖尿病の濃厚発症家系を集積し、最新技術（次世代シーケンス）を用いて染色体上の全遺伝子を解析することで、わが国特有の新規１型糖尿病遺伝子を同定し、１型糖尿病発症の機序解明、発症予知、治療法の確立を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
１型糖尿病は多因子疾患（common disease）であり、その遺伝素因は効果量の小さい疾患感受性遺伝子が多数集積して校正される。しかし我が国の１型糖尿病は欧米に比し有病率が低く、また家族内集積率は高い傾向がある。本研究は有病率が高い欧米と本邦における疫学的特徴の差異に着目し、Common diseaseの発症に関わるありふれた変異（common variant）とは別に、頻度は低いが効果量の大きい新規Rare varinatを見いだすことにより、我が国特有の遺伝素因を分子レベルで解明することを目的としている。寄与率の低いCommon variantの同定には大規模サンプルを集積する必要があるが有病率が低い我が国では困難である。一方で一家系に複数の１型糖尿病発症者を有する家系を対象とすると、大きな効果量をもつrare variantを同定できる可能性がある。我々はこれまで着実に濃厚発症家系の集積を進めており、昨年度時点で15家系54名（罹患者35名、非罹患者19名）であった対象者は、17家系62名（罹患者40名、非罹患者22名）となった。対象者の全エクソームシーケンス（WES）作業をは完了し、初年度に独立基盤形成支援にともなう交付決定後増額を得たことにより各家系の発端者に対して全ゲノムシーケンス（WGS）をおこなうことで、WESだけでは検出し得ない、染色体上の大きな構造変異の探索やミスアライメントの検証など変異解析の精度を飛躍的に向上させることができた。
現状、次世代シーケンス解析によって同定された遺伝子変異が偽陽性である可能性を除外するため、サンガー法を用いたDirect sequencing、およびにTaqman法を用いて遺伝子型を決定する作業をおこなっており、また家族性１型糖尿病と弧発例１型糖尿病におけるＨＬＡハプロタイプの差異については論文執筆中である。
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Report
(3 results)
Research Products
(28 results)
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[Journal Article] Prediction of future insulin-deficiency in glutamic acid decarboxylase autoantibody enzyme-linked immunosorbent assay-positive patients with slowly-progressive type 1 diabetes2024
Author(s)
Kawasaki E, Awata T, Ikegami H, Imagawa A, Oikawa Y, Osawa H, Katsuki T, Kanatsuna N, Kawamura R, Kozawa J, Kodani N, Kobayashi T, Shimada A, Shimoda M, Takahashi K, Chujo D, Tsujimoto T, Tsuchiya K, Terakawa A, Terasaki J, Nagasawa K, Noso S, Fukui T, Horie I, Yasuda K, Yasuda H, Yanai H, Hanafusa T, Kajio H
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 15
Issue: 7
Pages: 835-842
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Bivalent GAD autoantibody ELISA improves clinical utility and risk prediction for adult autoimmune diabetes2023
Author(s)
Kawasaki E, Shimada A, Imagawa A, Abiru N, Awata T, Oikawa Y, Osawa H, Kawabata Y, Kozawa J, Kobayashi T, Takahashi K, Chujo D, Fukui T, Miura J, Yasuda K, Yasuda H, Kajio H, Hanafusa T, Ikegami H; Committee of type 1 diabetes, Japan Diabetes Society.
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 14
Issue: 4
Pages: 570-581
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Comparing the clinical significance and antigen specificity of insulinoma-associated antigen-2 autoantibodies between radioimmunoassay and enzyme-linked immunosorbent assay in Japanese patients with type 1 diabetes2023
Author(s)
Kawasaki E, Shimada A, Imagawa A, Abiru N, Awata T, Oikawa Y, Osawa H, Kawabata Y, Kozawa J, Kobayashi T, Takahashi K, Chujo D, Fukui T, Miura J, Yasuda K, Yasuda H, Kajio H, Hanafusa T, Ikegami H; Committee of type 1 diabetes, Japan Diabetes Society.
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 14
Issue: 1
Pages: 58-66
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Poor glycemic control rather than types of diabetes is a risk factor for sarcopenia in diabetes mellitus: The MUSCLES-DM study.2022
Author(s)
Hiromine Y, Noso S, Rakugi H, Sugimoto K, Takata Y, Katsuya T, Fukuda M, Akasaka H, Osawa H, Tabara Y, Ikegami H.
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 13
Issue: 11
Pages: 1881-1888
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] DIFFERENCES IN PATIENT-REPORTED OUTCOMES BY AGE AND REGION IN ADULTS WITH TYPE 1 DIABETES IN THE SAGE STUDY2021
Author(s)
Berard L,Javier AF, Brette S, Kelly C, Ikegami H, Dubravka EJ, Bruttomesso D, Peters A, Pilorget V, Rammanthan B, Renard E, Wilmot E
Organizer
14th International Conference on Advanced Technologies & Treatments for Diabetes
Related Report
Int'l Joint Research
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