Phylodynamics of regional Streptococcus pneumoniae serotype 19A-ST320 lineage in Okinawa prefecture and the analysis of pbp1a transmission between different pneumococcal clones in Japan

• Project/Area Number: 21K15432
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 49050:Bacteriology-related
• Research Institution: National Institute of Infectious Diseases
• Principal Investigator: 中野 哲志 国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (30794987)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2023-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2021)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2022: ¥130,000 (Direct Cost: ¥100,000、Indirect Cost: ¥30,000); Fiscal Year 2021: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
• Keywords: 肺炎球菌 / 19A-ST320 / 全ゲノム解析 / 侵襲性肺炎球菌感染症 / カルバペネム耐性

Outline of Research at the Start

本研究は肺炎球菌ワクチンの定期接種化後に本邦に出現したカルバペネム耐性肺炎球菌の発生原因の本質に迫る研究である。同菌株はpbp1a-13という耐性に寄与する遺伝子を保持しているが、現時点では同遺伝子の由来は定かでない。しかし、最近になって沖縄県を中心に同遺伝子を保持している肺炎球菌が検出されている。本研究では全ゲノム解析を用いて、この沖縄株の由来と沖縄株と本島株との関連性を調べる。