Elucidation of the molecular mechanism by which the nascent chain of E. coli SecM cooperatively stabilizes translation arrest

Research Project

Project/Area Number	21K15433
Research Category	Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Basic Section 49050:Bacteriology-related
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	丹澤豪人大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員(常勤) (80899328)
Project Period (FY)	2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000) Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000) Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords	リボソーム / タンパク質合成 / 翻訳アレスト / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子解析
Outline of Research at the Start	リボソームにおけるタンパク質合成の途中で，ストレス応答といった負の要因からタンパク質の局在輸送といった正の要因までの様々な条件下において，翻訳を一時停止させる「翻訳アレスト」現象が広く報告されている．これまでの研究で，大腸菌secM mRNA上で翻訳アレストが起きると，リボソーム出口トンネルの外に露出した新生鎖がリボソーム表面に結合することで協働的に翻訳アレストを安定化することが1分子力学測定により示された．本申請研究では，クライオ電子顕微鏡を用いてsecMの翻訳アレスト複合体の単粒子解析を行い，secM新生鎖のリボソーム上での翻訳アレスト安定化メカニズムを分子構造レベルで理解する．