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Structure-function relationships of a Fe/Mo-S-C cluster unique to N2-reducing enzymes

Research Project

Project/Area Number 21K20557
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0502:Inorganic/coordination chemistry, analytical chemistry, inorganic materials chemistry, energy-related chemistry, and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Tanifuji Kazuki  京都大学, 化学研究所, 助教 (80911776)

Project Period (FY) 2021-08-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords窒素固定 / 鉄 / モリブデン / 硫黄 / 炭素 / クラスター / 窒素還元酵素(ニトロゲナーゼ)
Outline of Research at the Start

大気中の窒素ガスをアンモニアへ還元する酵素は、この難しい反応をFe、Mo、S、ならび にC原子を有する特異なクラスター([MoFe7S9C], FeMoco)を用いて触媒する。とりわけ、FeMocoの中心に存在するC原子は他の補酵素には見られず、N2の還元と密に関わると考えられる。そこで本研究では、このC原子周りに着目した小分子モデルを合成し、C原子がどのようにFeMocoの構造に寄与し、その触媒能を達成しているか?の解明に取り組む。ここでは特に、(1) C原子を有するFe-Sクラスターの合成とその評価、(2) 配位子デザインに基づくC原子架橋型Fe二核錯体の合成とN2還元反応、に挑戦する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we focused on the active center of enzymes responsible for biological nitrogen fixation, aiming to elucidate how this cluster (FeMoco) consisting of transition metal, sulfur, and carbon can reduce dinitrogen molecules. Our original plan was to replicate the Fe-C-Fe partial structure through the synthesis of a model complexes or clusters with particular interest in the central carbon atom of FeMoco. Although the desired ligand was synthesized, it is believed that decomposition proceeded at the stage of complexation. Meanwhile, using a simplified structural model focusing on its inorganic framework, we succeeded in capturing nitrogen molecules and catalytic dinitrogen reduction reaction (silylation reaction).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、FeMocoの特異な分子構造に基づいてその構造-機能相関に関する知見を得ようと試みた。特にFe-C-Fe構造に着目したアプローチでは有益な知見は得られなかったものの、金属-硫黄の部分構造に着目したアプローチにより、窒素分子の捕捉と還元を達成した。これまで化学合成した金属-硫黄クラスターを用いて窒素分子の触媒的還元に成功した例は知られておらず、今回の成果は、「クラスターを用いた不活性小分子の還元反応」の端緒を切り開いたものと考えられる。またここで達成した触媒回転数は既報の錯体触媒と比較しても高く、今後の検討により窒素分子から異なる有用分子への変換反応へも展開できる可能性がある。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] コロンボ大(スリランカ)

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Nitrogen reduction by the Fe sites of synthetic [Mo3S4Fe] cubes2022

    • Author(s)
      Ohki Yasuhiro、Munakata Kenichiro、Matsuoka Yuto、Hara Ryota、Kachi Mami、Uchida Keisuke、Tada Mizuki、Cramer Roger E.、Sameera W. M. C.、Takayama Tsutomu、Sakai Yoichi、Kuriyama Shogo、Nishibayashi Yoshiaki、Tanifuji Kazuki
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 607 Issue: 7917 Pages: 86-90

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04848-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CO Binding onto Heterometals of [Mo3S4M] (M = Fe, Co, Ni) Cubes2022

    • Author(s)
      K. Tanifuji, Y. Sakai, Y. Matsuoka, M. Tada, W. M. C. Sameera, Y. Ohki
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 95 Issue: 8 Pages: 1190-1195

    • DOI

      10.1246/bcsj.20220143

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 窒素を還元するクラスターの化学-生合成から反応まで-2023

    • Author(s)
      谷藤一樹
    • Organizer
      有機化学学生ウェビナー
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 遷移金属-硫黄クラスターの生合成と触媒活性に関する研究2022

    • Author(s)
      谷藤一樹
    • Organizer
      錯体化学会第72回討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Catalytic Dinitrogen Silylation Using the Fe Sites of [Mo3S4Fe] Cubes2022

    • Author(s)
      K. Tanifuji, K. Munakata,Y. Matsuoka, R. Hara, K. Uchida, M. Tada, R. E. Cramer, W. M. C. Sameera, T. Takayama, Y. Sakai, S. Kuriyama, Y. Nishibayashi, Y. Ohki
    • Organizer
      第68回有機金属化学討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] N2-reducing Activity of the Fe Sites of [Mo3S4Fe] Cubes2022

    • Author(s)
      K. Tanifuji, K. Munakata,Y. Matsuoka, R. Hara, K. Uchida, M. Tada, R. E. Cramer, W. M. C. Sameera, T. Takayama, Y. Sakai, S. Kuriyama, Y. Nishibayashi, Y. Ohki
    • Organizer
      Gordon Research Conference: Atomically precise nanochemistry
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Tracing the Sulfur Incorporation into the Nitrogenase Cofactor Precursor via Semi-Synthetic Approach2022

    • Author(s)
      K. Tanifuji, A. J. Jasniewski, D. Villarreal, M. T. Stiebritz, C. C. Lee, J. Wilcoxen, Y. Ohki, R. Chatterjee, I. Bogacz, J. Yano, J. Kern, B. Hedman, K. O. Hodgson, R. D. Britt, Y. Hu, M. W. Ribbe
    • Organizer
      第31回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 窒素を還元するクラスターの生物無機化学2022

    • Author(s)
      谷藤一樹
    • Organizer
      第34回生物無機化学夏季セミナー
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Coordination of CO onto Cubic [Mo3S4M] (M = Fe, Co, Ni) Clusters Bearing Mo-Cp Moieties2022

    • Author(s)
      Y. Matsuoka, Y. Sakai, M. Tada, K. Tanifuji, Y. Ohki
    • Organizer
      第31回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] かさ高いCp配位子を有するキュバン型[Mo3S4M]錯体 (M = Fe, Co, Ni) のCO配位挙動2022

    • Author(s)
      松岡 優音, 坂井優太, 唯 美津木, W. M. C. Sameera, 谷藤 一樹, 大木 靖弘
    • Organizer
      錯体化学会第72回討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Nitrogen Reduction by the Fe Sites of Cuboidal [Mo3S4Fe] Clusters2021

    • Author(s)
      Kazuki Tanifuji, Kenichiro Munakata, Ryota Hara, Keisuke Uchida, Mizuki Tada, Roger E. Cramer, W. M. C. Sameera, Tsutomu Takayama, Yoichi Sakai, Shogo Kuriyama, Yoshiaki Nishibayashi, Yasuhiro Ohki
    • Organizer
      第67回有機金属化学討論会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Catalytic N2 Reduction Using the Fe Sites of [Mo3S4Fe] Cubes2021

    • Author(s)
      Kazuki Tanifuji, Kenichiro Munakata, Ryota Hara, Keisuke Uchida, Mizuki Tada, Roger E. Cramer, W. M. C. Sameera, Tsutomu Takayama, Yoichi Sakai, Shogo Kuriyama, Yoshiaki Nishibayashi, Yasuhiro Ohki
    • Organizer
      第71回錯体化学討論会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Synthesis of Cubic [Mo3S4Co] Clusters and Its Application to N2 Reduction2021

    • Author(s)
      Yuta Sakai, Mayu Fujisawa, Kazuki Tanifuji, Mizuki Tada, Yasuhiro Ohki
    • Organizer
      第67回有機金属化学討論会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] [Mo3S4Co]クラスターを反応点とする配位子置換反応とN2還元反応2021

    • Author(s)
      坂井優太, 藤澤真由, 谷藤一樹, 唯美津木, 大木靖弘
    • Organizer
      第71回錯体化学討論会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 酵素を模倣した金属-硫黄化合物により窒素還元反応を実現

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-07-07

    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2021-10-22   Modified: 2024-01-30  

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