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The Mechanism of R-loop resolution in male germ cells and its effects on spermatogenesis and next generation.

Research Project

Project/Area Number 21K20655
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0702:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Shiromoto Yusuke  京都大学, 医学研究科, 特定助教 (40912259)

Project Period (FY) 2021-08-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords精巣 / 精子幹細胞 / R-loop / DNA損傷 / 精子形成
Outline of Research at the Start

生殖細胞は次世代に遺伝情報を継承する唯一の細胞であり、DNA損傷などに起因する DNA変異が生じると次世代に受け継がれてしまう。DNA損傷を引き起こす原因の1つとし て、R-loopの蓄積がある。R-loopは転写されたRNA鎖が鋳型であるDNA鎖と対合した安定な DNA/RNAハイブリッド鎖及び対合していない一本鎖DNAからなる構造であり、DNA損傷や低DNAメチル化を引き起こすことが知られている。本申請研究では生殖細胞におけるR-loopの解消機構、精子分化に対する影響、加えて次世代への影響についての研究を展開する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we established germline stem cells (GS cells) lacking Adar1, an R-loop resolution factor, and analyzed their DNA:RNA hybrid levels and gene expression. The DNA:RNA hybrid levels of whole genome in the cells were not affected by Adar1 knockout. On the other hand, the expression of p16INK4a, a senescence marker, was elevated in Adar1 knockout cells. This result suggests that Adar1 may contribute to cellular senescence in GS cells.
A screening for ADAR1-related factors in cultured cells identified ATM, TDP1, and XPF as candidate factors that function in regulation of R-loop. Further analysis is needed on the function of Adar1 in R-loop resolution by ATM, TDP1, and XPF in germ cells. Testis-specific Adar1-deficient mice have been generated and are currently being analyzed for effects on spermatogenesis and their offspring.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

生殖細胞は次代に遺伝情報を伝達する細胞であり、その異常は次世代に受け継がれる。R-loop解消因子であるADAR1を欠損するGS細胞では細胞内全体のDNA:RNAハイブリッド量やインプリント遺伝子のDNAのメチルに変化は認められなかったが、ADAR1がTDP1などと協調して機能する可能性が示唆された。これらの成果はR-loop解消機構の理解に加え、カンプトテシンなどR-loopを誘導する抗がん剤に対する細胞の生存機構の理解にも繋がり、安全な薬剤使用に貢献できる。
ADAR1欠損GS細胞において老化マーカーであるp16の発現が上昇したことから、老化による男性不妊症の原因解明に繋がる可能性がある。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] ADAR1 downregulation by autophagy drives senescence independently of RNA editing by enhancing p16INK4a levels2022

    • Author(s)
      Hao Xue、Shiromoto Yusuke、Sakurai Masayuki、Towers Martina、Zhang Qiang、Wu Shuai、Havas Aaron、Wang Lu、Berger Shelley、Adams Peter D.、Tian Bin、Nishikura Kazuko、Kossenkov Andrew V.、Liu Pingyu、Zhang Rugang
    • Journal Title

      Nature Cell Biology

      Volume: 24 Issue: 8 Pages: 1202-1210

    • DOI

      10.1038/s41556-022-00959-z

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2021-10-22   Modified: 2024-01-30  

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