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Molecular ecological mechanism of bloom disintegration by viral infection

Research Project

Project/Area Number 22H00385
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
Research InstitutionKochi University

Principal Investigator

長崎 慶三  高知大学, 教育研究部自然科学系理工学部門, 教授 (00222175)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 前田 広道  高知大学, 教育研究部医療学系臨床医学部門, 准教授 (20437734)
花崎 和弘  高知大学, 医学部附属病院, 特任教授 (30240790)
岡崎 友輔  京都大学, 化学研究所, 助教 (40823745)
緒方 博之  京都大学, 化学研究所, 教授 (70291432)
吉田 天士  京都大学, 農学研究科, 教授 (80305490)
和田 啓  宮崎大学, 医学部, 教授 (80379304)
遠藤 寿  京都大学, 化学研究所, 准教授 (80795055)
高橋 迪子  高知大学, 医学部, 特任助教 (40868189)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help
¥41,730,000 (Direct Cost: ¥32,100,000、Indirect Cost: ¥9,630,000)
Fiscal Year 2025: ¥7,150,000 (Direct Cost: ¥5,500,000、Indirect Cost: ¥1,650,000)
Fiscal Year 2024: ¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000)
Fiscal Year 2023: ¥10,530,000 (Direct Cost: ¥8,100,000、Indirect Cost: ¥2,430,000)
Fiscal Year 2022: ¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000)
Keywords赤潮プランクトン / ウイルス / 糖鎖認識機構 / 巨大蛋白質 / 長鎖反復配列 / 赤潮 / 二本鎖DNAウイルスHaV / 特異的感染性 / 感受性 / クローン多様性 / 生え戻り現象 / 高度アミノ酸反復領域 / 長鎖反復アミノ酸長鎖配列 / 糖鎖 / 宿主特異性
Outline of Research at the Start

微細藻の大量増殖による海域の着色現象(=赤潮)がどのように終息するかは、あまりよくわかっていない。本研究では、赤潮個体群中でウイルスがどのように出現し、いかなる戦略で感染を遂げるか、それに対して宿主側がどのような遺伝子発現戦略で防御するかを、室内培養系と現場赤潮環境の両方で解明する。赤潮対ウイルスの生態的な関係性を可視現象レベルから分子レベルにわたり精査することで、小中高校の教科書にも書き加える必要があると認められるような赤潮生態学・ウイルス学的知見を発信する。

Outline of Annual Research Achievements

赤潮原因藻ヘテロシグマ株およびHaV株の間で「完全でない溶藻現象」が起こる組合せがあることに注目した。とくに一次的な溶藻の後に宿主株が再増殖する現象(生え戻り)に注目し、生え戻り後の細胞とそれ以前の細胞の性質の違いを精査した。
実験には、①オリジナル培養、②オリジナル培養中の細胞の均一性を確認するために作製した単離株(オリジナル単離株)、および③ウイルス接種後に増殖した生え戻り細胞を単離し株化したもの(生え戻り株)を使用した。
オリジナル培養から単離した94 株はすべてウイルスに感受性を示した。このうち溶藻後に再増殖しない株が64.1 %、次いで生え戻りを起こす株が23.2 %を占めた。生え戻り株はHaV109接種後も増殖を続け、接種から4 日後に219,000 cells/mLまで増殖した。なお、接種時と10 日後のウイルス粒子数には有意差がみられなかった(p<0.05)。これらの結果から、生え戻り株はウイルスに対する抵抗性を獲得している可能性が示された。交差反応試験の結果、生え戻り株はオリジナル培養およびオリジナル単離株とは相補的な感受性パターンを示した点が特に注目された。すなわち生え戻り株は、オリジナル培養・オリジナル単離株に感染するウイルスグループⅠおよびⅡに対しては抵抗性、オリジナル培養・オリジナル単離株に感染しないウイルスグループⅢに対しては感受性であった。
以上の結果から、①単一細胞に由来するクローン培養中においても細胞間で感受性/抵抗性の程度が異なること、ならびに②ウイルス感染によって細胞集団の示す感受性パターンが劇的に変動しうることが示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ウイルス感染を巡るヘテロシグマの生態について新奇な知見が得られた。とくに生え戻り株がオリジナル培養およびオリジナル単離株と相補的な感受性パターンを示した点は、宿主側のウイルス抵抗性を駆動するメカニズムと深くかかわっていると考えられ、今後の研究において注視すべき点と思われる。

Strategy for Future Research Activity

日本各地から宿主株およびウイルス株を収集し、交差反応試験を行う。これにより両者のタイピングを行う。宿主特異性という点で代表的なウイルス株より、高度反復領域をLong PCRで増幅し、ナノポアシーケンスにより解読・配列比較を行う。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (35 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 3 results) Funded Workshop (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Texas A&M University(米国)

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      Virus Genes

      Volume: 60 Issue: 1 Pages: 97-99

    • DOI

      10.1007/s11262-023-02046-3

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      Morimoto Daichi、Tateishi Naohisa、Takahashi Michiko、Nagasaki Keizo
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      PLOS ONE

      Volume: 19 Issue: 3 Pages: e0301185-e0301185

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      10.1371/journal.pone.0301185

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      Funaoka Yusaku、Hiromoto Haruna、Morimoto Daichi、Takahashi Michiko、Wada Kei、Nagasaki Keizo
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      Microbes and Environments

      Volume: 38 Issue: 2 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME23036

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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      Samantha R Coy, Budi Utama, James W Spurlin, Julia G Kim, Harshavardhan Deshmukh, Peter Lwigale, Keizo Nagasaki, Adrienne M S Correa
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      Sci. Rep.

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 5813-5813

    • DOI

      10.1038/s41598-023-31507-w

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      Volume: 37 Issue: 5 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME21066

    • NAID

      130008138832

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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      Michiko Takahashi, Kei Wada, Yuichi Masuda, Shun-ichi Urayama, Keizo Nagasaki
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      Microbes and Environments

      Volume: 37 Issue: 5 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME21075

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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      Volume: 16 Pages: 2-8

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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-06-20  

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