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ビフィズス菌の腸内定着の確立におけるミルクオリゴ糖やムチン糖鎖代謝産物の役割

Research Project

Project/Area Number 22K05974
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 42010:Animal production science-related
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

向井 孝夫  北里大学, 獣医学部, 教授 (20229917)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
KeywordsEnterococcus gallinarum / ミルクオリゴ糖 / ムチン / シアリダーゼ / Bifidobacterium / 硫酸化ムチン / sulfatase / 腸内細菌 / オリゴ糖 / スルファターゼ
Outline of Research at the Start

本研究課題では,①ヒト乳児期の主要な腸内細菌はなぜ3菌種のビフィズス菌に限られるのか?②この3菌種に限られることで宿主に有益な効果はあるのか?という二つの学術的な問いに対する答えを提示することをめざし,特に母乳オリゴ糖や酸性ムチン糖鎖に存在するGlcNAc-6-SO3やシアル酸を介した乳児型ビフィズス菌の共生関係の一端を明らかにするとともに、同様な現象が他の動物種でも生じているのかを明らかにすることを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

2年目以降の研究においては、ヒト乳児でみられるミルクオリゴ糖やムチン糖鎖を介した腸内細菌叢の栄養共生関係が、哺乳動物で一般化される現象であるか否かを明らかにする第一歩として、ラット哺乳期から分離されたEnterococcus gallinarumにおいて、これまで全く報告されていないシアリダーゼを同定するとともにその役割を明らかにすることを目的とした。
E. gallinarumのゲノムデータベース検索を行い、シアリダーゼ遺伝子の検索を行った。その結果、菌株依存的に14種類のシアリダーゼ様遺伝子が存在し、それらは「Exo-alpha-sialidase」および「Family 16 glycosylhydrolase」の二つのグループに分類できた。また、14種類のシアリダーゼ様遺伝子とAH4株のゲノムとの相同性検索の結果、AH4株のゲノムにはExo-alpha-sialidaseグループのシアリダーゼ様遺伝子に98~100%一致するSiaBと、Family 16 glycosylhydrolaseに96~100%一致するSiaAの二つのシアリダーゼ様遺伝子が確認された。また、シグナル配列とドメイン検索を行った結果、 SiaBは菌体内型酵素であり、SiaAは分泌型酵素であると推定された。さらに、SiaAにはO-アセチルエステラーゼ活性を有していると推察されるドメインが存在し、ムチン糖鎖のO-アセチル化シアル酸に作用する可能性が考えられた。
次いで、大腸菌発現系を用いて組換えSiaAおよびSiaBを作製した。現在、部分精製の段階であるが、組換えSiaBではシアリダーゼ活性が見られず、組換えSiaAで活性が見られた。したがって、E. gallinarum AH4株において主として機能しているシアリダーゼはSiaAであることが示唆された。また、E. gallinarum AH4株のシアリダーゼ活性の局在を調べたところ、菌体内および菌体表面では活性が見られず、培養上清でのみ活性が見られたことからも、SiaAがE. gallinarum AH4株の主なシアリダーゼであることが示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ヒトミルクオリゴ糖は、乳児腸内のビフィズス菌に選択的に利用されることでビフィズス菌優勢な腸内細菌叢の形成に寄与する。また、ムチン糖鎖も腸内細菌叢の形成に寄与していることが示唆されている。しかし、ヒト以外の哺乳類ではこうした宿主-腸内細菌の共生関係にミルクオリゴ糖が寄与しているという知見はほとんどない。これを解決するために、申請者らはこれまで主要なミルクオリゴ糖がシアリルラクトースであるというオリゴ糖の構成が単純なラットを選び、哺乳期の乳仔ラット腸内細菌叢を解析してきた。その結果、シアリダーゼを産生する細菌群としてE. gallinarumを見出した。本課題では、ゲノムデータベース検索からE. gallinarum には2種類のシアリダーゼ様遺伝子が存在すること、また、それらのうち一方にシアリダーゼ活性が存在する可能性を見出した。本菌が、シアリルラクトース分解物のうち、ラクトースは利用せず、シアル酸のみを利用することをすでに明らかにしていることを踏まえると、本課題でその存在が強く推察されたシアリダーゼSiaAが、ラット哺乳期の腸内細菌叢の確立に重要な役割を発揮している可能性が強く推察された。以上から、おおむね計画通り研究が進んでいるものと評価した。

Strategy for Future Research Activity

2年目までの研究において、ヒト乳飲期においてヒトミルクオリゴ糖を介したクロスフィーディングによって3種類のビフィズス菌が優勢になるのと同様に、乳飲期ラット腸内細菌叢において、シアル酸結合オリゴ糖を介したクロスフィーディングによってE. gallinarumとL. johnsoniiの2菌種が優勢になり、その共生にはE. gallinarumのシアル酸利用戦略が重要な役割を果たしているものと推察された。これらを踏まえ、最終年度では、SiaAタンパク質のドメインの構造と機能を明らかにするとともに、シアル酸結合オリゴ糖を介したクロスフィーディングの解明、並びにSiaAの関与の評価を行う。また、ヒトやラット腸内細菌においてミルクオリゴ糖やムチン分解に寄与するシアリダーゼ産生菌が菌叢の確立や維持に重要な役割を果たしていることが推察されたことから、さらに他の動物腸内細菌におけるシアリダーゼ産生菌の存在を明らかにするとともに、シアリダーゼの特徴を明らかにすることを試みる。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Genome sequence of Enterococcus gallinarum AH4, a milk oligosaccharide-degrading strain isolated from suckling rats2023

    • Author(s)
      Yamamoto, Y., Suzuki, Y., Tsukuda, R., Asai, C., Ishizuka, M., Tsujikawa, Y., Sakane, I., Osawa, R. and Mukai, T.
    • Journal Title

      Microbiol Resour Announc.

      Volume: 12 Issue: 10

    • DOI

      10.1128/mra.00395-23

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sharing of Moonlighting Proteins Mediates the Symbiotic Relationship among Intestinal Commensals.2023

    • Author(s)
      Nishiyama K, Yong CC, Moritoki N, Kitazawa H, Odamaki T, Xiao JZ, Mukai T.
    • Journal Title

      Applied and environmental microbiology

      Volume: 89 Issue: 3

    • DOI

      10.1128/aem.02190-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] O-acetylesterase activity of Bifidobacterium bifidum sialidase facilities the liberation of sialic acid and encourages the proliferation of sialic acid scavenging Bifidobacterium breve.2022

    • Author(s)
      Yokoi T, Nishiyama K, Kushida Y, Uribayashi K, Kunihara T, Fujimoto R, Yamamoto Y, Ito M, Miki T, Haneda T, Mukai T, Okada N.
    • Journal Title

      Environmental microbiology reports

      Volume: 14 Issue: 4 Pages: 637-645

    • DOI

      10.1111/1758-2229.13083

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 乳飲期ラットから分離されたEnterococcus gallinarum AH4株におけるミルクオリゴ糖代謝遺伝子の同定2023

    • Author(s)
      山本裕司, 附田怜央, 高岡あゆ美, 田村奏瑛, 辻川勇治, 坂根巌, 鈴木康規, 大澤朗, 向井孝夫.
    • Organizer
      第4回ビフィズス菌シンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Bifidobacterium breveにおける硫酸化糖代謝関連遺伝子の同定2022

    • Author(s)
      附田怜央、春日美咲、山本裕司、向井孝夫
    • Organizer
      日本酪農科学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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