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HIV-1粒子形成に至るGag複合体の実体解明

Research Project

Project/Area Number 22K07102
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49060:Virology-related
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

駒 貴明  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(医学域), 准教授 (00803496)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
KeywordsGag集合 / HIV-1 / 多量体形成 / 集合 / Gag / 粒子形成 / 液-液相分離
Outline of Research at the Start

HIV-1のGag分子は粒子の骨格を成す。ウイルス集合過程においてGag分子はウイルスゲノムRNAや宿主因子と結合し、さらにGag同士が多量体を形成することでGag複合体を作る。この複合体は密度勾配遠心の沈降係数によって分けることができ、本研究では粒子形成に至るHIV-1 Gag集合過程の各複合体に含まれる因子を解明する。またGag集合過程において非膜性顆粒が宿主因子として含まれることから、これらのGag集合への関与も明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

HIV-1 Gag-NCとgRNAとの結合は集合の核形成に重要な役割を持っており、Gag 6量体格子の重合には必要がないとされてきたが(Rein A. Trends Microbiol. 2019)、研究代表者は、NCとgRNAとの結合は6量体格子重合に重要であることを示した。当該年度はこの結果を裏付けるために、NCのRNA結合に重要な5つの塩基性アミノ酸をAに置換したNC-Penta変異体、NC-ZnFモチーフのH23とH44をCに置換したNC-HC変異体などを新たに追加して、生化学的解析を実施した。NC-HCとNC-Pentaはいずれも粒子産生量が著減しており、粒子中のgRNAパッケージング効率は親株を1とした際にそれぞれ平均0.07と0.19であった。変異体を発現させた細胞のvelocity sedimentation(VS)解析において、NC-Penta変異体は500S/750S複合体の割合低下に加えて、30Sと80S複合体が検出されないことが明らかとなった。これは、NC-PentaはRNA結合に寄与する塩基性アミノ酸をAに置換していることで、RNA全般と結合する能力が低下しているためであると考えられた。2021年に、500SよりS値が小さいGag複合体の大部分がリボソームと結合した単量体または二量体のGagである可能性を報告したが、今回の結果はそのWilliamsonらの結果と一致した(J Mol Biol. 2021)。また、研究代表者のプロテオソーム解析では、30Sと80S画分には大量の40S/60Sリボソームが含まれることも明らかにした。すなわち、これまでLingappaらはVS解析によって分離される10S~750Sまでの複合体はGag多量体形成の段階を表していると考えてきたが、本当は粒子形成に至るGag多量体形成は500S以降の現象であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の研究計画とは異なるが、Gag集合過程の解明につながる興味深い結果が得られたため、Gag-gRNA結合のGag集合過程の役割について、重点的に解析を行った。本研究では、Gag集合におけるNC-gRNA結合の役割は従来考えられてきたものとは異なり、Gag 6量体格子の形成に必要であることを示した。また、NC-Penta変異体のVS解析とプロテアソーム解析から、Gagは10Sから順に30S、80S、150S、500S/750S複合体を経て粒子形成に至るというLingappaらの仮説とは異なり、30Sと80S複合体は粒子形成に至らないGagが多く含まれていると考えられた。これらの成果をまとめ、第70回日本ウイルス学会学術集会と熊本大学ヒトレトロウイルス学共同研究センター 第18回ウイルス研究交流会で発表した。
以上の理由から、この研究は新たな知見を提供しており、概ね妥当に進んでいると評価した。

Strategy for Future Research Activity

これまでの結果を踏まえ、VS解析により分離した150S、500S/750S複合体は何量体のGagを含んでいるのかをサイズ排除クロマトグラフィー、超解像度共焦点顕微鏡や微粒子計測機器を用いて明らかにする。また当初の計画通り、Gag集合を促進する候補因子についてもプロテアソーム解析の結果をもとにスクリーニングを行う。Gag集合初期過程における非膜性顆粒の関与についての解析は、現在、条件検討に留まっているために、最終年度にはその関係性について明らかにする。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022

All Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Presentation] HIV-1集合における Gag-NCとgRNAの相互作用の意義2023

    • Author(s)
      駒貴明、Bao Quoc Le、土肥直哉、薦田奈々子、一ノ宮匠海、近藤智之、足立昭夫、野間口雅子
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] HIV-1 Gag-MA S9残基の集合における役割解明2023

    • Author(s)
      駒貴明
    • Organizer
      熊本大学ヒトレトロウイルス学共同研究センター 第18回ウイルス研究交流会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] HIV-1 Gag-MAにおけるGag前駆体二量体化部位のウイルス学的解析2022

    • Author(s)
      駒 貴明、小谷 治、土肥 直哉、近藤 智之、横山 勝、足立 昭夫、佐藤 裕徳、野間口 雅子
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] HIV-1 Gag MAのGag二量体化における役割の解明2022

    • Author(s)
      駒 貴明、小谷 治、土肥 直哉、近藤 智之、横山 勝、足立 昭夫、佐藤 裕徳、野間口 雅子
    • Organizer
      第36回日本エイズ学会学術集会・総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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