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HIV-1感染におけるDNA脱アミノ化酵素群の真の役割の解明

Research Project

Project/Area Number 22K07103
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49060:Virology-related
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

池田 輝政  熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 准教授 (00588410)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
KeywordsAPOBEC3ファミリータンパク質 / 脱アミノ化依存的HIV抑制 / 脱アミノ化非依存的HIV抑制 / G-to-A mutation / HIV-1 / Vif / THP-1 / 遺伝子編集 / APOBEC3 / 宿主因子 / 脱アミノ化
Outline of Research at the Start

ウイルスは宿主細胞の様々なタンパク質を利用することにより自身を複製するが、宿主細胞も様々な防御機構によりウイルス感染を防御しようとする。ウイルス感染抑制に関わる重要なタンパク質の1つがAPOBEC3 (A3) ファミリータンパク質である。A3ファミリータンパク質はヒトでは7つのタンパク質で構成されるが、それぞれの標的や機能が重複しており、A3ファミリータンパク質全体のウイルス感染における役割は完全に明らかにされていない。そこで本研究では、本研究室で樹立した全A3遺伝子欠損細胞を用いて、HIV-1感染におけるA3ファミリータンパク質の真の役割を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

ウイルスは宿主細胞の様々なタンパク質を利用することにより自身を複製するが、宿主細胞も様々な防御機構によりウイルス感染を防御しようとする。ウイルス感染抑制に関わる重要なタンパク質の1つがAPOBEC3 (A3) ファミリータンパク質である。A3ファミリータンパク質はヒトでは7つのタンパク質で構成されるが、それぞれの標的や機能が重複しており、A3ファミリータンパク質全体のウイルス感染における役割は完全に明らかにされていない。そこで本研究では、A3ファミリータンパク質の真の生理的役割を明らかにする目的の一端として、本研究室で樹立したA3A-A3G遺伝子欠損THP-1細胞を用いて、HIV-1感染におけるA3ファミリータンパク質の真の役割を明らかにすることを目的とした。
樹立したA3A-A3G遺伝子欠損株において、シングルラウンドのHIV-1感染実験を行った。その結果、樹立したA3A-A3G遺伝子欠損株では、Vif欠損HIV-1の感染性は、野生株と同等であることが明らかとなった。次に、A3A-A3G遺伝子欠損細胞から産生されたVif欠損HIV-1プロウイルス上のG→A変異数を検証したところ、A3タンパク質由来のG→A変異は観察されなかった。また、HIV-1後期逆転写産物の量を測定したところ、A3A-A3G遺伝子欠損細胞から産生されたVif欠損HIV-1と野生株の逆転写産物の量はほとんど同じであった。さらに、急性感染期に分離されたウイルス株でも同様の結果が得られた。したがってこれらの結果から、THP-1細胞において感染性のHIV-1粒子を産生するために必要なVifの標的タンパク質は、A3ファミリータンパク質であることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画に従って、研究を実施できた。この研究成果をmBio誌に公表している。また本研究に関する総説をFront Virolに公表している。

Strategy for Future Research Activity

HIV-1複製におけるA3ファミリータンパク質の寄与を解析するために、新たにA3A-A3G遺伝子欠損細胞を作製する予定である。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 3 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Remarks (4 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Texas Health San Antonio/University of Minnesota(米国)

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  • [Int'l Joint Research] University Hospital Tubingen(ドイツ)

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  • [Int'l Joint Research] Suez Canal University(エジプト)

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  • [Int'l Joint Research] University of Texas Health San Antonio/University of Minnesota(米国)

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  • [Int'l Joint Research] University Hospital Tubingen(ドイツ)

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      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Suez Canal University(エジプト)

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      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda Terumasa、Shimizu Ryo、Nasser Hesham、Carpenter Michael A.、Cheng Adam Z.、Brown William L.、Sauter Daniel、Harris Reuben S.
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 14

    • DOI

      10.1128/mbio.00782-23

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      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] APOBEC3 family proteins as drivers of virus evolution2023

    • Author(s)
      Jonathan Michael、Ikeda Terumasa
    • Journal Title

      Frontiers in Virology

      Volume: 3 Pages: 1332010-1332010

    • DOI

      10.3389/fviro.2023.1332010

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      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif for virus replication in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda Terumasa、Shimizu Ryo、Nasser Hesham、Carpenter Michael A、Cheng Adam Z、Brown William L.、Sauter Daniel、Harris Reuben S
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2023.03.28.534666

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12024

    • Author(s)
      Ikeda T, Shimizu R, Nasser H, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Sauter D, Harris RS
    • Organizer
      「集え、他分野研究者!」感染症キャンプin宮崎
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda T
    • Organizer
      Summer BIOCEV (mini) Symposium
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      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 急性単球性白血病細胞株THP-1においてHIV-1感染に必須なVifの標的因子はA3ファミリータンパク質である2023

    • Author(s)
      清水凌, Hesham Nasser, Michael A. Carpenter, Adam Z. Cheng, William L. Brown, Daniel Sauter, Reuben S. Harris, 池田輝政
    • Organizer
      25th Summer Retrovirus Conference (SRC2023)
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 骨髄性白血病細胞株THP-1においてHIV-1感染に必須なVifの標的因子の解析2023

    • Author(s)
      清水 凌、Nasser Hesham、Carpenter Michael、Cheng Adam、Brown William、Sauter Daniel、Harris Reuben、池田 輝政
    • Organizer
      日本遺伝学会第95回大会
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda T, Shimizu R, Nasser H, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Sauter D, Harris RS
    • Organizer
      The 27th West Coast Retrovirus Meeting
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda T
    • Organizer
      Lecture at Texas Biomedical Research Institute
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      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda T
    • Organizer
      Lecture at The University of Texas Health Science Center at San Antonio
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      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 骨髄性白血病細胞株THP-1において、HIV-1複製に必要なVifの標的はAPOBEC3タンパク質である2023

    • Author(s)
      清水凌、Hesham Nasser、 Michael A. Carpenter、Adam Z. Cheng、William L. Brown、Daniel Sauter、Reuben S. Harris、池田輝政
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] APOBEC3 degradation is the primary function of HIV-1 Vif determining virion infectivity in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Shimizu R, Nasser H, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Sauter D, Harris RS, Ikeda T
    • Organizer
      The 24th Kumamoto AIDS seminar
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 骨髄性白血病細胞株THP-1において、HIV-1の感染性を決めるVifの標的はAPOBEC3タンパク質である2023

    • Author(s)
      池田輝政、清水凌、Hesham Nasser、 Michael A. Carpenter、Adam Z. Cheng、William L. Brown、Daniel Sauter、Reuben S. Harris
    • Organizer
      第37回日本エイズ学会学術集会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] HIV-1 restriction by endogenous APOBEC3 family proteins in the myeloid cell line THP-12023

    • Author(s)
      Ikeda T
    • Organizer
      Oxford-Kumamoto Universities Joint Annual Symposium 2023
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] HIV-1 restriction by endogenous APOBEC3 family proteins in the myeloid cell line THP-12022

    • Author(s)
      Ikeda T, Nasser H, Shimizu R, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Harris RS
    • Organizer
      The 23rd Kumamoto AIDS seminar
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Creation of the myeloid cell line THP-1 that lacks the expression of APOBEC3A to APBEC3G proteins2022

    • Author(s)
      Shimizu R, Nasser H, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Harris RS, Ikeda T
    • Organizer
      The 23rd Kumamoto AIDS seminar
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] APOBEC3遺伝子欠損細胞を用いた、HIV-1感染におけるAPOBEC3タンパク質の機能解析2022

    • Author(s)
      清水凌、Hesham Nasser、Michael A. Carpenter, Adam Z. Cheng, William L. Brown, Reuben S. Harris、池田輝政
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] HIV-1 restriction by endogenous APOBEC3 family proteins in the myeloid cell line THP-12022

    • Author(s)
      Ikeda T, Nasser H, Shimizu R, Carpenter MA, Cheng AZ, Brown WL, Harris RS
    • Organizer
      第36回日本エイズ学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] APOBEC3遺伝子欠損細胞の作製とHIV-1感染におけるAPOBEC3タンパク質の機能解析2022

    • Author(s)
      清水凌、池田輝政
    • Organizer
      Summer Retrovirus Conference 2022
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  • [Remarks] HIVに関する研究の成果をmBio誌に発表しました

    • URL

      https://kumamoto-u-jrchri.jp/post-2046/https://www.ikeda-lab.jp

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  • [Remarks] Front Virol誌に総説を発表しました!

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      https://www.ikeda-lab.jp

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  • [Remarks] Publications

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      https://kumamoto-u-jrchri.jp/post-2046/

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  • [Remarks] Publications

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      https://kumamoto-u-jrchri.jp/post-2126/

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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