KMT2A再構成急性骨髄性白血病の新規検査技術確立とクローン構造解析
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22K08475
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
松尾 英将 京都大学, 医学研究科, 助教 (80769737)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
足立 壯一 京都大学, 医学研究科, 教授 (10273450)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2025: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
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| Keywords | 急性骨髄性白血病 / KMT2A / 遺伝子変異 / 次世代シークエンス / 再発 / クローン進化 / シングルセル |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、KMT2A再構成急性骨髄性白血病(AML)の臨床検体を用いて網羅的遺伝子解析を行い、各クローンが有する遺伝子変異の共存関係、再発に至るまでのクローン進化機構、およびそれらの臨床的意義を明らかにする。さらに、クローン構造解析に必要な凍結保存細胞がない場合の新たなアプローチ法を追求することで、解析対象となる症例数を増加させることを目指す。本研究の成果はKMT2A再構成AMLの分子病態に立脚した治療法の開発に加え、各種悪性腫瘍に共通する機構である腫瘍内不均一性の理解に向けた新規検査法の確立に貢献することが期待される。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、急性骨髄性白血病(AML)における新規検査技術を確立し、KMT2A再構成症例を主な対象として詳細なクローン構造やその進化機構、臨床的意義を明らかにすることを目的としている。
新規検査技術の確立については、レーザーマイクロダイセクション技術を用いて塗抹標本より採取した細胞からの全ゲノム解析を試みた。KPAM1細胞株を30, 100, 300細胞採取して、DNA抽出後に全ゲノム解析を実施したところ、100, 300細胞採取したサンプルでは既知のGATA1変異が検出された。よってレーザーマイクロダイセクションで採取したサンプルからの全ゲノム解析には、おおよそ100細胞程度必要と考えられた。
また、クローン構造解析については、日本小児がん研究グループ(JCCG)AML-05/99臨床試験登録症例を含めたKMT2A再構成症例、計27例の初発時・再発時セット検体のターゲットシークエンス結果を比較した。その結果、27例中14例(51.9%)で再発時にsignaling pathway変異の消失がみられた。同様の解析をKMT2A再構成以外のAMLで実施したところ、signaling pathway変異の消失は122例中36例(29.5%)と、KMT2A再構成症例と比較して有意に割合が低い結果が得られた。再発時にsignaling pathway変異を消失したKMT2A再構成症例は、転写因子や細胞周期に関わる遺伝子の変異を獲得している頻度が有意に高かった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
新規検査技術の確立については、細胞株を用いた検討により、レーザーマイクロダイセクションで採取したサンプルからの全ゲノム解析に必要な細胞数情報が得られた。
また、クローン構造解析については、KMT2A再構成AML症例とそれ以外のAML症例の間でクローン進化機構が異なる可能性を見出しており、研究開始時の少数例の知見に基づく仮説と一致する結果が得られているため、進捗状況はおおむね順調と判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
新規検査技術の確立については、細胞株を用いた予備検討の結果をもとに、臨床検体を用いた検討を進める。また、クローン構造解析については、KMT2A再構成AML症例の中でも再発時にsignaling pathway変異の消失がみられた症例の臨床的特徴を明らかにする。さらに、研究代表者が過去に明らかにしたKMT2A再構成AMLの予後不良因子：KRAS遺伝子変異(Blood Adv. 2020)について、変異の部位やパターンによりクローン進化や予後に違いがみられるのか、検討を行う。
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Report
(1 results)
Research Products
(6 results)
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[Presentation] Frequent formation of granulocytic sarcoma in NOD/Shi-scid IL2rgamma(null) mice transplanted with THP-1 cells.2022
Author(s)
Nana Ito, Hidemasa Matsuo, Yutarou Harata, Aina Inagami, Moe Higashitani, Yuri Ito, Masahiro Hirata, Keita Jinnouchi, Takashi Mikami, Itaru Kato, Souichi Adachi
Organizer
第84回日本血液学会学術集会
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