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Spatiotemporal Single-Cell Analysis to Elucidate the Mechanism of Malignancy Acquisition in Pancreatic Cancer Cells and Identify Therapeutic Targets

Research Project

Project/Area Number 22K08894
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

Toshima Takeo  九州大学, 大学病院, 講師 (40608965)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 穣  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
三森 功士  九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
吉住 朋晴  九州大学, 医学研究院, 教授 (80363373)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords膵癌 / エンハンサー / シングルセル解析 / NET-CAGE法 / 腫瘍微小環境 / 全ゲノムシークエンス / NET-CAGE / GEX-ATAC / シングルセル解析 NET-CAGE
Outline of Research at the Start

近年、消化器癌の生命予後は手術手技の改善や抗癌剤・新規分子標的薬の開発によって飛躍的に改善した。しかし、依然として膵癌は早期診断が困難な癌腫であり有効な分子標的薬もなく5年生存率が10%と著しく予後不良である。膵癌が高い悪性度を呈する理由に関していくつかの特徴がある。現時点では、切除以外の抜本的な治療法が少ない腫瘍であり、これま でのゲノム変異情報に基づいた分子標的薬の適応を凌駕する新たな視点でのアプローチが必須と考えられる。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we investigated the enhancer activation mechanisms involved in the acquisition of malignancy in pancreatic cancer using advanced techniques such as NET-CAGE and scGEX-ATAC sequencing. We identified enhancers specifically activated in pancreatic cancer tissues and their target genes, and clarified the impact of the spatial co-localization between cancer and stromal cells on tumor progression. These findings suggest the potential of novel therapeutic targets independent of conventional genomic mutation profiles and provide important insights for the development of molecular-targeted therapies for pancreatic cancer.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、これまで十分に解析されてこなかった膵癌のエンハンサー活性化機構に焦点を当て、膵癌細胞と間質細胞の相互作用による悪性度獲得の分子基盤を初めて明らかにした点で学術的意義が高い。特に、非コード領域におけるエンハンサーとその支配遺伝子の同定は、がん研究における新たな解析視点を提供し、膵癌の分子病態解明に貢献する。社会的には、診断や治療標的が限られている膵癌に対し、本研究成果は新規バイオマーカーや分子標的薬開発の基盤を提供し、将来的な早期診断や個別化医療の実現に寄与する点で大きな意義を有する。

Report

(4 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 9 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis2024

    • Author(s)
      Hashimoto Masahiro、Kojima Yasuhiro et. al.
    • Journal Title

      eBioMedicine

      Volume: 103 Pages: 105102-105102

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2024.105102

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Implementable assay for monitoring minimum residual disease after radical treatment for colorectal cancer.2024

    • Author(s)
      Nakano T, Takao S, Dairaku K, Uno N, Low SA, Hashimoto M, Tsuda Y, Hisamatsu Y, Toshima T, Yonemura Y, Masuda T, Eto K, Ikegami T, Fukunaga Y, Niida A, Nagayama S, Mimori K.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: - Issue: 6 Pages: 1989-2001

    • DOI

      10.1111/cas.16149

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer.2024

    • Author(s)
      Hashimoto M, Masuda T, Nakano Y, Tobo T, Saito H, Koike K, Takahashi J, Abe T, Ando Y, Ozato Y, Hosoda K, Higuchi S, Hisamatsu Y, Toshima T, Yonemura Y, Hata T, Uemura M, Eguchi H, Doki Y, Mori M, Mimori K.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: - Issue: 6 Pages: 7538-7548

    • DOI

      10.1111/cas.16129

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] What Are Risk Factors for Graft Loss in Patients Who Underwent Simultaneous Splenectomy During Living-donor Liver Transplantation?2024

    • Author(s)
      Toshima T, Harada N, Itoh S, Tomiyama T, Toshida K, Morita K, Nagao Y, Kurihara T, Tomino T, Kosai-Fujimoto Y, Mimori K, Yoshizumi T.
    • Journal Title

      Transplantation.

      Volume: - Issue: 7 Pages: 1593-1604

    • DOI

      10.1097/tp.0000000000004952

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  • [Journal Article] A rare case of liver regenerative and non-neoplastic lesion resembling a well-differentiated hepatocellular carcinoma.2024

    • Author(s)
      Hirose K, Toshima T, Tobo T, Kai S, Hirakawa M, Higuchi S, Ofuchi T, Hosoda K, Yonemura Y, Hisamatsu Y, Masuda T, Aishima S, Mimori K.
    • Journal Title

      Surg Case Rep.

      Volume: 10(1) Issue: 1 Pages: 30-30

    • DOI

      10.1186/s40792-024-01820-1

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  • [Journal Article] Subclonal accumulation of immune escape mechanisms in microsatellite instability-high colorectal cancers2023

    • Author(s)
      Kobayashi Y, Niida A, Nagayama S, Saeki K, (中略), Mizuno S, Kawazu M, Kohsaka S, Ueno T, Mano H, Ishihara S, Uemura M, Mori M, Doki Y, Eguchi H, Oshima M, Suzuki Y, Shibata T, Mimori K.
    • Journal Title

      Br J Cancer

      Volume: 129 Issue: 7 Pages: 1105-1118

    • DOI

      10.1038/s41416-023-02395-8

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  • [Journal Article] Successful multidisciplinary treatment with complete response to atezolizumab plus bevacizumab in a 90-year-old patient with hepatocellular carcinoma recurrence.2023

    • Author(s)
      Hosoda K, Toshima T, Takahashi J, Yonemura Y, Hisamatsu Y, Hirose K, Masuda T, Motomura Y, Abe T, Ando Y, Dairaku K, Nakano Y, Hashimoto M, Hiraki Y, Soejima Y, Yoshizumi T, Mimori K.
    • Journal Title

      Int Cancer Conf J.

      Volume: 12(4) Issue: 4 Pages: 274-278

    • DOI

      10.1007/s13691-023-00618-6

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  • [Journal Article] Spatial and single-cell transcriptomics decipher the cellular environment containing HLA-G+ cancer cells and SPP1+ macrophages in colorectal cancer2023

    • Author(s)
      Ozato Y, Mimori K(28番目),他26名
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Issue: 1 Pages: 111929-111929

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111929

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of serum microRNAs as potential diagnostic biomarkers for detecting precancerous lesions of gastric cancer.2022

    • Author(s)
      Otsu H, Nambara S, Hu Q, Hisamatsu Y, Toshima T, Takeishi K, Yonemura Y, Masuda T, Oki E, Mimori K.
    • Journal Title

      Ann Gastroenterol Surg.

      Volume: 7(1) Issue: 1 Pages: 63-70

    • DOI

      10.1002/ags3.12610

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  • [Journal Article] Molecular and clinicopathological differences between depressed and protruded T2 colorectal cancer.2022

    • Author(s)
      Mochizuki K, Kudo SE, Kato K, Kudo K, Ogawa Y, Kouyama Y, Takashina Y, Ichimasa K, Tobo T, Toshima T, Hisamatsu Y, Yonemura Y, Masuda T, Miyachi H, Ishida F, Nemoto T, Mimori K.
    • Journal Title

      PLoS One.

      Volume: 17(10) Issue: 10 Pages: 17-17

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0273566

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] PRKRIP1, A Splicing Complex Factor, Is a Marker of Poor Prognosis in Colorectal Cancer.2022

    • Author(s)
      Ozato Y, Masuda T, Kobayashi Y, Takao S, Hisamatu Y, Toshima T, Yonemura Y, Uemura M, Eguchi H, Doki Y, Mori M, Mimori K.
    • Journal Title

      Anticancer Res.

      Volume: 42(10) Issue: 10 Pages: 4701-4706

    • DOI

      10.21873/anticanres.15974

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  • [Presentation] 肝移植後の免疫抑制状態における肝癌再発機構の解明2024

    • Author(s)
      池原 智彦, 大西 雅也, 細田 清孝, 本村 有史, 安東 由貴, 廣瀬 皓介, 大樂 勝司, 平木 嘉樹, 津田 康雄, 長尾 吉泰, 米村 祐輔, 増田 隆明, 戸島 剛男, 吉住 朋晴, 副島 雄二, 三森 功士, 三森 功士
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      第83回日本癌学会学術総会
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  • [Presentation] がんの進展・浸潤に関与する新たな分子生物学的マーカーの開発 エンハンサー活性とDNAコピー数増幅から探る癌進展の新規分子マーカー2022

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      斉藤 秀幸, 中野 祐輔, 阿部 正, 高橋 純一, 小池 健輔, 酒井 真, 小川 博臣, 宗田 真, 久松 雄一, 戸島 剛男, 米村 祐輔, 増田 隆明, 調 憲, 佐伯 浩司, 三森 功士
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      斉藤 秀幸, 細田 清孝, 大楽 勝司, 中野 祐輔, 橋本 雅弘, 平木 嘉樹, 阿部 正, 安東 由貴, 本村 有史, 久松 雄一, 戸島 剛男, 米村 祐輔, 増田 隆明, 佐伯 浩司, 三森 功士
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      細田 清孝, 増田 隆明, 斉藤 秀幸, 安東 由貴, 阿部 正, 大樂 勝司, 中野 祐輔, 橋本 雅弘, 平木 嘉樹, 米村 祐輔, 戸島 剛男, 久松 雄一, 高橋 純一, 副島 雄二, 三森 功士
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      第81回日本癌学会総会
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      斉藤 秀幸, 中野 貴文, 高橋 純一, 久松 雄一, 戸島 剛男, 米村 祐輔, 増田 隆明, 調 憲, 佐伯 浩司, 三森 功士
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      高橋 純一, 増田 隆明, 橋本 雅弘, 中野 祐輔, 大楽 勝司, 阿部 正, 斉藤 秀幸, 大里 祐樹, 安東 由貴, 中野 貴文, 久松 雄一, 戸島 剛男, 米村 祐輔, 吉住 朋晴, 三森 功士
    • Organizer
      第112回日本外科学会定期学術集会
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Published: 2022-04-19   Modified: 2026-01-16  

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