| Project/Area Number |
22K10165
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
坂本 洋右 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (50451745)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊豫田 学 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (40431746)
笠松 厚志 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (60375730)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
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| Keywords | 抗癌剤耐性 / 口腔癌 / scRNA-seq解析 / NGS / シングルセル解析 / 薬剤耐性担当因子 / heterogeneity / single cell RNA sequence |
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| Outline of Research at the Start |
口腔癌治療において様々な癌治療薬が使用されているが，多くの癌治療薬において耐性が出現し，患者を苦しめ続けている．この問題の解決のために，多くの研究者が阻害薬等を開発してきたが満足のいく結果は得られていなかった．これは，Heterogeneity（腫瘍内細胞群の多様性や不均一性）を考慮せずに一つの耐性因子を阻害しようとしたためである.本研究ではHeterogeneityに焦点をあて，各種抗癌剤に耐性を示した細胞亜集団（クラスタ）に特徴的な遺伝子の検索・抽出を行い, 各クラスタ共通の遺伝子に着目し，各種抗癌剤耐性に共通する制御薬剤の同定ならびにそれを応用した治療法の開発を目指すことを目的とした.
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では「Heterogeneity」に焦点をあて，各種抗癌剤に耐性を示した細胞亜集団（クラスタ）を抽出し，各クラスタに特徴的な遺伝子の検索・抽出を行う計画である．具体的には各クラスタ共通の遺伝子もしくは上流遺伝子に着目して，多角的な解析を行うことにより，抗癌剤耐性に共通する制御薬剤の同定とならびにそれを応用した治療法の開発を目指すものである。本年度は, シスプラチン耐性細胞株における「Heterogeneity」の検出を行うべく細胞数や条件を検討したが、in vitroにおける細胞株では検出および解析が困難であることが判明した。そのために、ゲノム領域で抗癌剤耐性や感受性に関与する不均一性はないか検討すべく、ATAC-seq解析を行い詳細な検討を行った。シスプラチンの作用時間によって変化するゲノム領域を同定し、シスプラチン作用によって変化するゲノム領域は、時間によって不均一な変化を示した。それに伴う、転写因子候補も同定した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
シスプラチン耐性細胞株における「Heterogeneity」の検出条件設定に時間がかかった。そのため, 計画を一部修正し, 抗癌剤（シスプラチン)の感受性やIC50算出を口腔癌細胞株で実施したのちに、シスプラチン応答に関するゲノム領域の不均一性を検索・同定するために、ATAC-seq解析を行ったため。
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| Strategy for Future Research Activity |
抗癌剤作用によって不均一に変化するゲノム領域の詳細をさらに検索し、抗癌剤耐性に関与するゲノム変化および転写因子・候補遺伝子を同定する。
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