Establishment of Plant Paleoproteomics
| Project/Area Number |
22K18486
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
西内 巧 金沢大学, 疾患モデル総合研究センター, 准教授 (20334790)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
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| Keywords | パレオプロテオミクス / 植物遺存体 / 種子タンパク質 / 土器付着物 / 種子 / プロテオミクス / 植物遺体 |
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| Outline of Research at the Start |
植物遺体や土器付着物から検出された残存タンパク質には、植物グロブリンやグリシニン等のCupinファミリータンパク質が高頻度に見られることを明らかにしている。本研究では、出土地域や年代が異なり、また多様な植物遺体や土器付着物等の多数の出土試料を用いてタンパク質分析を行うことで、エビデンスを積み重ね、植物を含む考古学試料におけるCupinファミリータンパク質の残存性と普遍性を明らかにし、植物パレオプロテオミクスに有用な基盤データを確立する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、これまでデータベースが整備されていなかった堅果類の中から候補となるコナラ、ミズナラ、アベマキ、スダジイ、トチノキ、オニグルミの6つの植物種を選定し、RNA-Seq解析を実施し、それらがコードするタンパク質のアミノ酸配列を同定することでデータベースの作成を行った。スダジイとトチノキについては、現生の果実試料を用いてタンパク質を抽出してプロテオーム解析を実施することで、それぞれ6135及び5636種のタンパク質を同定することができた。今後、これらのデータベースを用いて、植物遺体及び土器付着炭化物のプロテオーム解析を進める予定である。前年度に検出された土器付着炭化物のクルミ属のCupinファミリータンパク質が、オニグルミ由来と推察されたため、新たに作成したオニグルミのデータベースを用いて再解析したが、オニグルミに特異的なペプチドの検出には至らなかった。また、土器付着炭化物については本年度も継続して解析を行っており、ダイズ属等のCupinファミリータンパク質を検出することができた。一方、現生のイネ果実を土器で煮て得られた炭化付着物について、タンパク質の分析を行ったところ、前年度に炭化米の試料で同定されたタンパク質と同じタンパク質が複数検出された。この結果から、炭化過程において残存したタンパク質が、経年変化の影響をあまり受けないことが示唆された。今後、多様な植物試料を用いて、同様の実験を行うことで、植物果実の炭化過程におけるタンパク質の安定性についても解析を進めたい。
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Report
(2 results)
Research Products
(13 results)
