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Analysis on interindividual aging process in Caenorhabditis elegans

Research Project

Project/Area Number 22K19353
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Uno Masaharu  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 上級研究員 (00742090)

Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords線虫 / 老化 / 機械学習
Outline of Research at the Start

老化・寿命が、種を超えて保存された普遍的なメカニズムで制御されることがわかってきている。一方で、加齢に伴い罹患する疾病や機能低下する臓器が個体毎に異なることに代表されるように、老化は多様で複雑な過程であることが明らかになりつつある。本研究課題では、従来のように老化過程の変化を集団の平均ではなく、個体毎の変化に着目するという新しい解析アプローチを試み、個体毎の老化・寿命制御メカニズムの理解を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Aging process is controlled by universal mechanisms, yew substantially varies among individuals. In this study, we aim to understand this complex individual aging process focusing on the difference in appearance and transcriptome using model organism <I>C. elegans</I>. Our trained artificial intelligence displayed that the accuracy of age prediction based on appearance changes differs between young and middle age. Individual RNA-seq analysis revealed that the expression of genes related to metabolism and stress response changes during the aging process. This is consistent with previous transcriptome analysis using population total RNA, which suggests the effectiveness of individual differences in aging. We would like to further analyze the differences in gene expression among individuals.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

老化・寿命が、種を超えて保存された普遍的なメカニズムで制御されることがわかってきている。一方で、加齢に伴い罹患する疾病や機能低下する臓器が個体毎に異なることに代表されるように、老化は多様で複雑な過程であることが明らかになりつつある。本研究課題では、従来のように老化過程の変化を集団の平均ではなく、個体毎の変化に着目するという新しい解析アプローチを試みる。モデル生物線虫を用いて個体別のイメージデータ並びにトランスクリプトームデータを、老化過程の個別データとして取得する。個体レベルで詳細に解析することに挑戦する。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Book (1 results)

  • [Book] 大好きなことを研究する科学者になろう!![生物編]2022

    • Author(s)
      協力/理化学研究所
    • Total Pages
      128
    • Publisher
      扶桑社
    • ISBN
      9784594091859
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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