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膜1回貫通型受容体を対象にした「構造生物学での最後のフロンティア」解消への挑戦

Research Project

Project/Area Number 22K19375
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

小川 治夫  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (40292726)

Project Period (FY) 2022-06-30 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords膜タンパク質 / 立体構造解析 / 膜1回貫通型受容体 / クライオ電子顕微鏡
Outline of Research at the Start

「構造生物学における最後のフロンティア」である膜1回貫通型受容体の生理的状態での構造決定を、クライオ電子顕微鏡による解析を行うことで目指す。研究代表者の独自の大量発現・精製技術を駆使することで、この「フロンティア」の解消を目指す。これにより、膜1回貫通型受容体での膜を隔てた信号伝達機構・基質認識機構の解明を行うことが可能になると考えられる。

Outline of Annual Research Achievements

X線結晶解析やクライオ電子顕微鏡法(クライオEM)の発展により、G-protein Coupled Receptor (GPCR)等多くの受容体や、イオンチャネル・イオンポンプタンパク質等の膜輸送体の立体構造が報告されている。だがこれまで報告されている膜タンパク質の立体構造は、生体膜を複数回貫通する膜貫通部位を持つ、多回膜貫通型の膜タンパク質である。その一方で、膜を1回のみ貫通する、いわゆる1回貫通型の膜タンパク質の「全長構造」の報告は皆無である。その中で特に重要なものは生体にとって重要なホルモンやサイトカイン等の受容を担う1回貫通型受容体である。だが、1回貫通型受容体は膜貫通領域を1本しか持たないことなどもあり、大量発現・精製や、その後の立体構造解析へ向けたハンドリングが極めて困難であることが知られている。以上のことを考え合わせると、膜1回貫通型受容体の立体構造解析は構造生物学における最後のフロンティアと言っても過言ではないかもしれない。そこで、本研究では申請者のこれまでの研究を発展させ、研究代表者の独自の大量発現・精製技術を駆使することで、この「構造生物学における最後のフロンティア」である膜1回貫通型受容体の生理的状態での構造をクライオ電子顕微鏡により決定することを目指す。これにより、膜1回貫通型受容体での膜を隔てた信号伝達機構・基質認識機構の解明を行うことが可能になると考えられる。令和5年度は令和4年度に引き続き、大量精製した精製標品のナノディスクへの再構成をより効率的に行う手法の検討を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

膜1回貫通型受容体を培養細胞に定常的に発現させ、界面活性剤で可溶化後、タグを用いて精製を行っている。得られた精製標品については生理活性の測定を行い、十分な活性を有していることが確認された。本年度は昨年度に引き続きナノディスクへの再構成を試みたが、より効率的に組み込む手法の検討を行った。精製標品はナノディスク再構成後にも活性を有していたが、再構成されていない空のナノディスクも多数存在した。そこで、ナノディスクへの再構成後、更にタグを用いた精製を行うことでこの問題も概ね解決した。

Strategy for Future Research Activity

昨年度の研究により、ナノディスクへの再構成の効率も上がった。だが依然として構造解析には不十分である。そこで、本年度は再構成の際の脂質成分を変える等の工夫や、その他再構成の手法の検討を行うことで、ナノディスクへの再構成効率を上昇させる。もし、十分量が再構成されたなら、構造解析への転用を考える。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural insight into hormone recognition by the natriuretic peptide receptor-A2024

    • Author(s)
      Haruo Ogawa, Masami Kodama
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 04 March 2024 Issue: 10 Pages: 114-114

    • DOI

      10.1111/febs.17104

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] クライオ電顕による一膜貫通型受容体 NPR-Bの機能構造解析2023

    • Author(s)
      近藤瞳、児玉昌美、加藤博章、小川治夫
    • Organizer
      第44回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Cryo-EMによる立体構造から明らかになったGCase受容体の基質識別機構2023

    • Author(s)
      近藤瞳、児玉昌美、加藤博章、小川治夫
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Remarks] 点対称への変身が受容体によるホルモン認識の鍵! ―新規心不全治療薬へ向けた手がかりを提示―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/sites/default/files/2024-03/2403_ogawa-a70d4cdf0bcf9909e33e38587f4fb663.pdf

    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-07-05   Modified: 2024-12-25  

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