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節外性リンパ腫における腫瘍細胞と微小環境の多様性の包括的探索

Research Project

Project/Area Number 22KJ0622
Project/Area Number (Other) 21J21338 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 50010:Tumor biology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

湯淺 光博  東京大学, 大学院医学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords節外性び慢性大細胞型B細胞性リンパ腫 / 腫瘍微小環境 / 節外性リンパ腫
Outline of Research at the Start

節外性リンパ腫の不均一性と腫瘍微小環境の多様性を単一細胞レベルで解析し、その意義を明らかにすることを目的とする。節外性リンパ腫の臨床検体を対象に、CITE-seq技術を用いて、多数の表面マーカー解析とトランスクリプトーム解析・TCR/BCRレパトア解析を行う。得られたデータを用いて、腫瘍細胞自体の多様性と腫瘍微小環境の網羅的探索を行う。また、臨床データや予後との関連について解析を行い、同定された特徴の臨床的意義を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

節外性DLBCL(中枢神経原発び慢性大細胞型B細胞性リンパ腫)に対して, 臨床検体を用いたシングルセル解析を行なった。シングルセルRNA-seq・CITE-seq解析にTCR/BCRレパトア解析を組み合わせることで, 腫瘍細胞及び非腫瘍細胞の同定を行った。腫瘍細胞は, BCRレパトア解析によりクローン性増殖を示すことを確認した。また, 腫瘍細胞は, その変異解析に基づく細胞起源に依って, 正常B細胞とは異なる特徴的な発現プロファイルを示していることを確認した。非腫瘍細胞分画においては, 固形癌において近年整備されたT/NK/Myeloidの各細胞アトラスとの詳細な比較検討を行い, 多彩な細胞分画を同定した。特にT細胞においては、節外性DLBCLは, 反応性リンパ節とは異なるT細胞分画を有しており, 疲弊したCD8T及び細胞周期が亢進したCD8Tが, クローン拡大を伴って増加していることを明らかにした。また腫瘍微小環境に特徴的な制御性T細胞の増加も確認した。
節外性DLBCLマウスモデルを用いて, 腫瘍微小環境に作用する治療法が有用であることを明らかにした。
更に腫瘍細胞の変異解析により同定された腫瘍細胞の遺伝子変異パターンによっては, 細胞障害性を有するNK細胞が豊富に見られることを明らかにした。節外性DLBCLにおいて, 腫瘍細胞と腫瘍微小環境が密接に関連しあっていることを明らかにした。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Inter- and intra-tumor heterogeneity of genetic and immune profiles in inherited renal cell carcinoma2023

    • Author(s)
      Tabata Mariko、Sato Yusuke、Kogure Yasunori、McClure Marni B.、Oshikawa-Kumade Yuji、Saito Yuki、Shingaki Sumito、Ito Yuta、Yuasa Mitsuhiro、Koya Junji、Yoshida Kazushi、Kohno Takashi、Miyama Yu、Morikawa Teppei、Chiba Kenichi、Okada Ai、Ogawa Seishi、Ushiku Tetsuo、Shiraishi Yuichi、Kume Haruki、Kataoka Keisuke
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Issue: 7 Pages: 112736-112736

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112736

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tumor-promoting function and regulatory landscape of PD-L2 in B-cell lymphoma2022

    • Author(s)
      Shingaki S、Koya J、Yuasa M、Saito Y、Tabata M、McClure MB、Ogawa S、Katayama K、Togashi Y、Imoto S、Kogure Y、Kataoka K
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 37 Issue: 2 Pages: 492-496

    • DOI

      10.1038/s41375-022-01772-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-Cell Analysis of the Multicellular Ecosystem in Viral Carcinogenesis by HTLV-12021

    • Author(s)
      Koya J, Saito Y, Kameda T, Kogure Y, Yuasa M, Nagasaki J, McClure MB, Shingaki S, Tabata M, Tahira Y, Akizuki K, Kamiunten A, Sekine M, Shide K, Kubuki Y, Hidaka T, Kitanaka A, Nakano N, Utsunomiya A, Togashi Y, Ogawa S, Shimoda K, Kataoka K
    • Journal Title

      Blood Cancer Discovery

      Volume: 2 Issue: 5 Pages: 450-467

    • DOI

      10.1158/2643-3230.bcd-21-0044

    • NAID

      120007145001

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] A single-cell transcriptome and surface proteome analysis of the tumor and immune microenvironment in DLBCL2022

    • Author(s)
      湯淺 光博
    • Organizer
      第84回日本血液学会学術集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] A single-cell transcriptome and surface proteome analysis of the tumor and immune microenvironment in DLBCL2022

    • Author(s)
      湯淺 光博
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Different post-transcriptional regulation of surface markers across cell types revealed by CITE-seq2021

    • Author(s)
      湯淺 光博
    • Organizer
      第83回日本血液学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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