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果実成熟におけるエピジェネティック制御システムの解明と検証

Research Project

Project/Area Number 22KJ1715
Project/Area Number (Other) 21J22977 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 39030:Horticultural science-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

大森 真史  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords果実成熟 / ブルーベリー / ゲノム編集 / エピジェネティクス
Outline of Research at the Start

ブルーベリーは房内で不均一に成熟が進むため成熟果実を手摘みする必要があり、生産効率を低下させる要因となっている。先行研究において脱メチル化剤処理により果実成熟が促進すること、成熟が進むにつれてグローバルな脱メチル化が起こることが明らかとなっている。本研究では着色遺伝子近傍に挿入されたトランスポゾンの挙動を観察し果実成熟との関係を考察する。また、効率的な遺伝子機能評価系を確立しDNAメチル化を制御する因子の機能解析を行う。以上の実験から果実成熟におけるDNAメチル化の役割を解明し、収穫作業の効率化につながる果実成熟の人為的制御技術の開発につなげる。

Outline of Annual Research Achievements

ブルーベリーは房内で不均一に成熟が進むため成熟果実を手摘みする必要がある。果実成熟を人為的に制御できれば、収穫作業を効率化できる。本研究は果実成熟におけるDNAメチル化の役割の解明,および機能検証のための基盤整備を行った。
DNAメチル化阻害剤5-AzacytidineとABAを果実に処理すると,成熟が急速に進行した。無処理果実では成熟期にグローバルなDNA脱メチル化が発生した。またAGO4等RdDM経路に関わる因子の遺伝子発現がメチル化レベルに影響していること、5-Azacytidine処理がABAシグナル伝達を強化することでVcMYBA1等の成熟関連の遺伝子発現を促進することが示唆された。以上より,果実成熟においてDNAメチル化が重要な役割を果たすと考えられた。本事象に関する重要な因子の機能検証のため、以下の3つのアプローチから機能解析技術の確立を目指した。
1形質転換のボトルネックとなる再分化の分子メカニズム解明:RNA-seq解析によりオーキシンシグナリングが品種間差に寄与している可能性を示した。さらにVcESRの過剰発現によりブルーベリーの再分化が促進され、形質転換効率化ツールとしての使用が期待できる。
2ゲノム編集による早期開花系統の作出:花成抑制遺伝子VcCENをノックアウトし早期開花および連続開花を示す系統を獲得した。これにより幼若相が長い果樹においても遺伝子機能解析を迅速かつ通年で実施できる。
3果実における一過性発現系の開発:高発現ベクターつくばシステムを用いて果実における一過性発現系を確立した。ブルーベリーにおけるVcMYBA1の過剰発現により着色が確認され、VcMYBA1がアントシアニン生合成を促進することが示唆された。成熟期のメチル化変動を制御する候補遺伝子について、ゲノム編集および一過性発現による機能解析を試みたが研究実施期間内に結果を得られなかった。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Comparative transcriptome and functional analyses provide insights into the key factors regulating shoot regeneration in highbush blueberry2024

    • Author(s)
      M. Omori, H. Yamane, R. Tao
    • Journal Title

      Horticulture Research

      Volume: - Issue: 6

    • DOI

      10.1093/hr/uhae114

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Efficient Transient Expression for Functional Analysis in Fruit Using the Tsukuba System Vector2023

    • Author(s)
      Omori Masafumi、Fujiwara Yosuke、Yamane Hisayo、Miura Kenji、Tao Ryutaro
    • Journal Title

      The Horticulture Journal

      Volume: 92 Issue: 3 Pages: 261-268

    • DOI

      10.2503/hortj.QH-062

    • ISSN
      2189-0102, 2189-0110
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The evaluation of CRISPR-Cas9-mediated editing efficiency using endogenous promoters in tetraploid blueberry2023

    • Author(s)
      Omori M.、Yamane H.、Osakabe K.、Osakabe Y.、Tao R.
    • Journal Title

      Acta Horticulturae

      Volume: 1362 Issue: 1362 Pages: 49-56

    • DOI

      10.17660/actahortic.2023.1362.8

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient transient gene expression for functional analysis in fruit using the Tsukuba system vector.2023

    • Author(s)
      M. Omori, Y. Fujiwara, H. Yamane, K. Miura, and R. Tao.
    • Journal Title

      The Horticulture Journal

      Volume: -

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Off-season flowering and expression of flowering-related genes during floral bud differentiation of rabbiteye blueberry in a subtropical climate2022

    • Author(s)
      Omori Masafumi、Cheng Chieh-Chi、Hsu Fu-Chiun、Chen Shiang-Jiuun、Yamane Hisayo、Tao Ryutaro、Li Kuo-Tan
    • Journal Title

      Scientia Horticulturae

      Volume: 306 Pages: 111458-111458

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2022.111458

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Generation of early flowering blueberry by CRISPR-Cas9-mediated mutagenesis of a flowering repressor gene, VcCENTRORADIALIS (VcCEN).2024

    • Author(s)
      M. Omori
    • Organizer
      HZAU & KU Bilateral Workshop for Horticultural Plant Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparative transcriptome and functional analyses provide insights into the key factors regulating shoot regeneration in highbush blueberry.2024

    • Author(s)
      M. Omori
    • Organizer
      HZAU & KU Bilateral Workshop for Horticultural Plant Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Establishment of the tools to evaluate the gene function in blueberry.2024

    • Author(s)
      M. Omori, H. Yamane and R. Tao.
    • Organizer
      XIII International Vaccinium symposium
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] つくばシステムを用いた様々な果実における一過性発現系の開発2024

    • Author(s)
      大森真史, 藤原陽介, 山根久代, 三浦謙治,田尾龍太郎.
    • Organizer
      園芸学会令和6年度春季大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] The use of FPX and developmental genes to improve regeneration efficiency from leaf explants of European pear (Pyrus communis L.).2023

    • Author(s)
      F. Dai, M. Kikunaga, K. Ono, M. Omori and R. Tao.
    • Organizer
      4th Asian Horticultural Congress
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification and expression analyses of the CENTRORADIALIS (CEN) gene family involved in flowering regulation in persimmon (Diospyros kaki).2023

    • Author(s)
      C. Iwami, M. Omori, T-F. Hsiang, S. Sugano, T. Akagi and R. Tao.
    • Organizer
      4th Asian Horticultural Congress
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Targeted mutagenesis of CENTRORADIALIS using CRISPR/Cas9 system in highbush blueberry.2022

    • Author(s)
      M. Omori, H. Yamane, K. Osakabe, Y. Osakabe, and R. Tao.
    • Organizer
      31st International Horticultural Congress
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ブルーベリー再分化メカニズムに関するトランスクリ プトーム解析2022

    • Author(s)
      大森真史, 山根久代, 田尾龍太郎.
    • Organizer
      園芸学会令和4年度秋季大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノム編集によるブルーベリー 早期開花系統の作出2022

    • Author(s)
      大森真史,山根久代, 田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和5年度春季大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性プロモーターを用いたブルーベリーにおけるゲノム編集効率の向上2022

    • Author(s)
      大森真史,山根久代,刑部敬史,刑部祐里子, 田尾龍太郎.
    • Organizer
      園芸学会令和4年度春季大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Pollination compatibility and parthenocarpic fruit set in autumn-bloom rabbiteye blueberry cultivars and breeding lines.2021

    • Author(s)
      Omori Masafumi, H. Yamane, R. Tao and K-T Li.
    • Organizer
      XII International Vaccnium symposium
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Environmental regulations on flowering and expression of flowering genes in southern highbush blueberry.2021

    • Author(s)
      Tseng, W-C., M. Omori, F-C. Hsu, H. Yamane, R. Tao and K-T. Li.
    • Organizer
      XII International Vaccnium symposium
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 効率的な再分化系開発に向けたブルーベリーENHANCER OF SHOOT REGENERATION (VcESR)遺伝子の機能解析2021

    • Author(s)
      大森真史,山根久代, 田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和3年度秋季大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Book] ブルーベリーの形質転換とゲノム編集(分担執筆)「ひとりではじめる植物バイオテクノロジー入門 組織培養からゲノム編集まで」2022

    • Author(s)
      大森真史、山根久代
    • Total Pages
      413
    • Publisher
      国際文献社
    • ISBN
      9784910603032
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 京都大学果樹園芸学研究室HP

    • URL

      http://www.pomology.kais.kyoto-u.ac.jp/

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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