Integrated analysis of genetic diversity of all conifers in Japan

• Project/Area Number: 23H00337
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 陶山 佳久 東北大学, 農学研究科, 教授 (60282315)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 北村 系子 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (00343814) ; 津村 義彦 筑波大学, 生命環境系, 教授 (20353774) ; Worth James 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (30770771) ; 内山 憲太郎 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (40501937) ; 青木 裕一 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 (40747599) ; 戸丸 信弘 名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (50241774) ; 岩泉 正和 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所 林木育種センター, 主任研究員 等 (50391701) ; 高橋 大樹 東北大学, 農学研究科, 特任助教 (50913216) ; 逢沢 峰昭 宇都宮大学, 農学部, 准教授 (70436294) ; 玉城 聡 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所 林木育種センター, 主任研究員 等 (80370857)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥47,060,000 (Direct Cost: ¥36,200,000、Indirect Cost: ¥10,860,000); Fiscal Year 2024: ¥18,330,000 (Direct Cost: ¥14,100,000、Indirect Cost: ¥4,230,000); Fiscal Year 2023: ¥15,080,000 (Direct Cost: ¥11,600,000、Indirect Cost: ¥3,480,000)
• Keywords: MIG-seq分析 / ゲノムワイドSNP分析 / 集団遺伝 / 森林遺伝資源保全 / 分子系統地理

Outline of Research at the Start

日本産針葉樹を対象として、これまでに個々の研究者が収集して従来技術により分析してきたDNAサンプルを集約する。また、これまでの未着手種・地域分を新規・追加採取し、日本産針葉樹全種（39種）のほぼ全分布域を網羅する。これらから次世代DNA分析技術により高精度・高解像度な遺伝的多様性情報を取得してデータベースを構築するとともに、それらの個別解析・統合解析を実施する。統合解析では、共通評価軸によって各種の遺伝的多様性を種間比較する。また、地域集団の情報を全種で重ね合わせ、日本列島における日本産針葉樹の遺伝的多様性・分化の分布パターンを視覚化して統合解析する。