核内transcriptomeから解明する肥満大腸がん患者のmetabolism
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23K08093
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 55010:General surgery and pediatric surgery-related
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
藤田 逸人 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (40611281)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
寅田 信博 九州大学, 大学病院, 臨床検査技師 (00398075)
森山 大樹 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (70586859)
永吉 絹子 九州大学, 大学病院, 助教 (90761015)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 大腸癌 / scRNA-seq / metabolism / 肥満 / シングルセル遺伝子発現解析 / 腫瘍微小環境 |
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| Outline of Research at the Start |
大腸癌は有効な薬物療法があるにもかかわらず、依然として高い罹患率、致死率を示している。肥満は、大腸癌の素因となることが知られているが、実際に肥満が大腸癌を引き起こす機序は不明であり、予防法も確立していない。一方、癌微小環境が癌の発生、進展、治療抵抗性に関与していることが近年報告されている。本研究では、BMI≧25の肥満合併大腸癌患者を抽出し、非肥満患者と比較し、免疫細胞など微小環境構成細胞について代謝に関連する遺伝子発現の違いを調べ、肥満と大腸癌の関連について分子生物学的機序から明らかにし、新たな大腸癌予防法の開発につなげることを目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
肥満は、アディポカイン、炎症性メディエーター、免疫細胞の浸潤など他の因子の調節異常による慢性炎症状態を作り出すことにより大腸癌の素因となることが知られているが、実際に肥満により大腸がんが発症する明確な機序は明らかになっておらず、予防法も確立していない。本研究では、単一核遺伝子発現解析(snRNA-seq)を用いて肥満が大腸がん発がんを促進するメカニズムを腫瘍微小環境の代謝の観点から明らかにし、新しい大腸がん発がんの予防法を開発することを目的とする。
本年度は、大腸癌組織を採取し、シングルセル解析を行った。すでに大腸癌を含む消化器固形癌200例を超えるライブラリー作成をしている。解析はRパッケージSeuratを用いて行っており、単一細胞由来のRNA発現からその細胞集団の特徴や機能に着目した解析、分化の方向性を調べる疑似系譜解析、細胞間相互作用の解析、TCRレパトア解析などを行っている。複数の大腸癌組織における腫瘍内の免疫細胞や線維芽細胞などの微小環境構成細胞のheterogeneityを明らかにし報告を行った。また、当科では、年間1000例以上の大腸癌を含む消化器癌の手術を行っており、ほとんどの症例においてOCT compoundで包埋した凍結切片をtissue bankとして保存している。本年度は、胃癌の凍結切片から8例のsnRNA-seqのためのライブラリー作成に成功しており、同様に大腸癌の凍結切片からのライブラリー作成を目指す。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
胃癌の凍結切片を用いたsnRNA-seqのためのライブラリー作成は安定した結果を得ることができるようになっている。また、大腸癌のscRNA-seqのデータを用いて解析をすすめており、免疫微小環境における様々な免疫細胞や線維芽細胞のはたらきについて明らかにしている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は胃癌にならって大腸癌のsnRNA-seqのためのライブラリー作成手技を確立する。肥満の有無でサブグループに分け、得られたsnRNA-seqのデータを用いて微小環境中の各細胞種の遺伝子発現比較を行う。
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Report
(1 results)
Research Products
(1 results)
