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Genetic diagnosis of vascular malformations by liquid biopsy and its application to precision medicine

Research Project

Project/Area Number 23K09072
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 56070:Plastic and reconstructive surgery-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

石川 耕資  北海道大学, 医学研究院, 助教 (60791374)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 有平  北海道大学, 医学研究院, 教授 (70271674)
舟山 恵美  北海道大学, 医学研究院, 准教授 (10533630)
前田 拓  北海道大学, 大学病院, 講師 (80813542)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Keywords動静脈奇形 / 静脈奇形 / 血管奇形 / 脈管奇形 / PI3K/AKT/mTORシグナル伝達経路 / MAPKシグナル伝達経路 / 遺伝子変異解析 / リキッドバイオプシー / 遺伝子診断 / 遺伝子変異 / 個別化医療
Outline of Research at the Start

脈管奇形症例の臨床・画像所見を調査し、症例レジストリを行う。対象症例のホルマリン固定パラフィン包埋組織を用いて、PI3K/AKT/mTOR経路およびRAS/MAPK経路のリン酸化されたタンパク質の局在を明らかにする。対象症例の血液およびホルマリン固定パラフィン包埋組織を用いて、PI3K/AKT/mTOR経路およびRAS/MAPK経路の遺伝子変異を包括的に解析する。血中の遊離DNAからでも、病変のパラフィン包埋組織と同じ遺伝子変異を検出可能か明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

脈管奇形は、局所的な脈管形成異常により生じた先天性の病変で、病変を構成する脈管の種類により、静脈奇形、動静脈奇形、毛細血管奇形、リンパ管奇形およびそれらの混合型脈管奇形に分類される。近年、脈管奇形の原因遺伝子同定が進み、シロリムスやアルペリシブなどの分子標的薬による薬物療法が報告されている。しかし、これらの薬物療法を行うには、ターゲットとなる低発現頻度の遺伝子変異を確認することが望ましい。これまでの遺伝子変異解析は、主に凍結組織を用いて行われてきたが、生検や手術という侵襲的な介入が必要である。
そこで脈管奇形の患者の血液をサンプルとして、低侵襲なリキッドバイオプシーを行うことにより、局所的な脈管奇形病変の細胞に存在する低発現頻度の遺伝子変異を末梢血中の遊離DNAからを検出することを本研究の目的とした。本研究によって、リキッドバイオプシーによる遺伝子診断の方法が確立されれば、今後の個別化医療への架け橋となることが期待できる。
これまでに対象となる動静脈奇形、静脈奇形、混合型脈管奇形の症例レジストリを行い、研究同意説明文書の同意を得られた40例から遊離DNA抽出用採血管を用いて10mlもしくは20mlの採血を行い、DNA抽出および品質評価を行った。本年度に解析対象とするPI3K/AKT/mTORシグナル伝達経路およびMAPKシグナル伝達経路の遺伝子を決定した。次年度は、カスタムパネルを用いて次世代シーケンサーによる遺伝子変異解析を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、対象となる動静脈奇形、静脈奇形、混合型脈管奇形の症例レジストリを行い、対象者から研究同意説明文書の同意を得られた38例から遊離DNA抽出用採血管を用いて採血を行い、DNA抽出および品質評価を行った。解析対象とする遺伝子を決定した。

Strategy for Future Research Activity

次年度は、次世代シーケンサーを用いてPI3K/AKT/mTORシグナル伝達経路およびMAPKシグナル伝達経路の遺伝子変異解析を行う予定である。

Report

(2 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] Molecular genetics of hemangiomas and vascular malformations2024

    • Author(s)
      石川耕資, 佐々木雄輝, 佐々木了
    • Journal Title

      The Japanese Journal of Pediatric Hematology / Oncology

      Volume: 61 Issue: 5 Pages: 339-345

    • DOI

      10.11412/jspho.61.339

    • ISSN
      2187-011X, 2189-5384
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 脈管異常の遺伝子異常2023

    • Author(s)
      石川耕資, 佐々木了
    • Journal Title

      皮膚科

      Volume: 4 Pages: 712-725

    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2023-04-13   Modified: 2025-12-26  

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