• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Promotion of comprehensive interdisciplinary virology for the post-COVID era

Research Project

Project/Area Number 23K20041
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (International Leading Research )

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

佐藤 佳  東京大学, 医科学研究所, 教授 (10593684)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福原 崇介  北海道大学, 医学研究院, 教授 (70598739)
松野 啓太  北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 准教授 (40753306)
齊藤 暁  宮崎大学, 農学部, 准教授 (30621792)
木村 香菜子  京都大学, 医生物学研究所, 助教 (40726204)
Project Period (FY) 2023-11-17 – 2030-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥689,000,000 (Direct Cost: ¥530,000,000、Indirect Cost: ¥159,000,000)
Fiscal Year 2029: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2028: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2027: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2026: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2025: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2024: ¥104,650,000 (Direct Cost: ¥80,500,000、Indirect Cost: ¥24,150,000)
Fiscal Year 2023: ¥61,100,000 (Direct Cost: ¥47,000,000、Indirect Cost: ¥14,100,000)
Keywordsウイルス / 学際融合 / システムウイルス学 / 若手育成
Outline of Research at the Start

ウイルスのふるまいについて、マクロスケールな流行動態を規定する因子を捕捉し、研究室内におけるメゾスケールな挙動として理解し、ミクロケールな構造生物学の見地から解明する。多階層で学際的なウイルス研究を有機的に展開する。新たなパンデミックリスクに備えた、学際的、国際的、持続的なウイルス学研究を展開するための、将来性と世界的なインパクトに満ちた研究課題である。医学・獣医学ウイルス学領域における若手育成を目指し、「ウイルス学若手ネットワーク」と連携することで、本課題が推進する学際的なウイルス研究に参画する若手ウイルス学者の啓蒙を進め、世界で活躍できる若手研究者の育成を図る。

Outline of Annual Research Achievements

本年度は、2023年夏に出現したXBB系統と系統的に大きく異なるBA.2.86株のウイルス学的性状を明らかにした(Tamura et al., Cell Host Microbe, 2023)。

SARS-CoV-2を含む上記のコロナウイルスはサルベコウイルスに属するコロナウイルスである。しかし、人の脅威たり得るコロナウイルスは他にも多く存在しており、現在は中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)を含むメルベコウイルスにも着目した研究を遂行している。MERS-CoVの感染受容体としてDPP4が知られているが、他グループによる最近の先行研究から、ACE2を受容体とするMESR-CoVに近縁なコウモリ由来のウイルスが同定されている。これらの知見は、MERS-CoVに近縁なウイルスの間で組換えが起きた結果であると考えられているが、その詳細は不明であった。我々は、系統学的な解析手法や遺伝子の相同性解析などを駆使し、MERS-CoVに関連するウイルスにおいて、組換えによって受容体利用が変化した可能性を示した(Tolentino et al., Virol. J., 2024)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、2023年夏に出現したXBB系統と系統的に大きく異なるBA.2.86株のウイルス学的性状を明らかにした(Tamura et al., Cell Host Microbe, 2023)。

SARS-CoV-2を含む上記のコロナウイルスはサルベコウイルスに属するコロナウイルスである。しかし、人の脅威たり得るコロナウイルスは他にも多く存在しており、現在は中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)を含むメルベコウイルスにも着目した研究を遂行している。MERS-CoVの感染受容体としてDPP4が知られているが、他グループによる最近の先行研究から、ACE2を受容体とするMESR-CoVに近縁なコウモリ由来のウイルスが同定されている。これらの知見は、MERS-CoVに近縁なウイルスの間で組換えが起きた結果であると考えられているが、その詳細は不明であった。我々は、系統学的な解析手法や遺伝子の相同性解析などを駆使し、MERS-CoVに関連するウイルスにおいて、組換えによって受容体利用が変化した可能性を示した(Tolentino et al., Virol. J., 2024)。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究の延長として、初年度として順調に研究成果を挙げることができた。これまでに実績のある連携体制をベースにした研究課題であるので、これからも国内での共同研究を円滑に進めることには問題はない。
来年度以降については、国際共同研究、および、若手研究者の育成に向けた活動をいくつか計画している。それらを活用することで、より密接かつ有機的な研究を展開していく。

Report

(3 results)
  • 2023 Abstract ( PDF )   Comments on the Screening Results ( PDF )   Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2024

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results)

  • [Journal Article] Enterovirus A71 does not meet the uncoating receptor SCARB2 at the cell surface2024

    • Author(s)
      Nishimura Yorihiro、Sato Kei、Koyanagi Yoshio、Wakita Takaji、Muramatsu Masamichi、Shimizu Hiroyuki、Bergelson Jeffrey M.、Arita Minetaro
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 20 Issue: 2 Pages: 1012022-1012022

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1012022

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Vulnerability to APOBEC3G linked to the pathogenicity of deltaretroviruses.2024

    • Author(s)
      Shichijo T, Yasunaga JI, Sato K, Nosaka K, Toyoda K, Watanabe M, Zhang W, Koyanagi Y, Murphy EL, Bruhn RL, Koh K, Akari H, Ikeda T, Harris RS, Green PL, Matsuoka M.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 121 Issue: 13 Pages: 00-00

    • DOI

      10.1073/pnas.2309925121

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SARS-CoV-2 ORF7a Mutation Found in BF.5 and BF.7 Sublineages Impacts Its Functions2024

    • Author(s)
      Timilsina Uddhav、Ivey Emily B.、Duffy Sean、Plianchaisuk Arnon、Ito Jumpei、Sato Kei、Stavrou Spyridon、The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 25 Issue: 4 Pages: 2351-2351

    • DOI

      10.3390/ijms25042351

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Neutralizing immunity against coronaviruses in Tanzanian health care workers2024

    • Author(s)
      Barabona Godfrey et al.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 00-00

    • DOI

      10.1038/s41598-024-55989-4

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Longitudinal analysis of genomic mutations in SARS-CoV-2 isolates from persistent COVID-19 patient2024

    • Author(s)
      Futatsusako Hiroki、Hashimoto Rina、Yamamoto Masaki、Ito Jumpei、Matsumura Yasufumi、Yoshifuji Hajime、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Sato Kei、Nagao Miki、Takayama Kazuo
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 27 Issue: 5 Pages: 109597-109597

    • DOI

      10.1016/j.isci.2024.109597

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Akaluc bioluminescence offers superior sensitivity to track in?vivo dynamics of SARS-CoV-2 infection2024

    • Author(s)
      Tamura Tomokazu、Ito Hayato、Torii Shiho、Wang Lei、Suzuki Rigel、Tsujino Shuhei、Kamiyama Akifumi、Oda Yoshitaka、Tsuda Masumi、Morioka Yuhei、Suzuki Saori、Shirakawa Kotaro、Sato Kei、Yoshimatsu Kumiko、Matsuura Yoshiharu、Iwano Satoshi、Tanaka Shinya、Fukuhara Takasuke
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 27 Issue: 5 Pages: 109647-109647

    • DOI

      10.1016/j.isci.2024.109647

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Recombination analysis on the receptor switching event of MERS-CoV and its close relatives: implications for the?emergence of MERS-CoV2024

    • Author(s)
      Tolentino Jarel Elgin、Lytras Spyros、Ito Jumpei、Sato Kei
    • Journal Title

      Virology Journal

      Volume: 21 Issue: 1 Pages: 00-00

    • DOI

      10.1186/s12985-024-02358-2

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Virological characteristics of the SARS-CoV-2 BA.2.86 variant2024

    • Author(s)
      Tamura Tomokazu、Mizuma Keita、Nasser Hesham、Deguchi Sayaka、Padilla-Blanco Miguel、Oda Yoshitaka、Uriu Keiya、Tolentino Jarel E.M.、Tsujino Shuhei、Suzuki Rigel、Kojima Isshu、Nao Naganori、Shimizu Ryo、Wang Lei、Tsuda Masumi、Jonathan Michael、Kosugi Yusuke、et al.
    • Journal Title

      Cell Host &Microbe

      Volume: 32 Issue: 2 Pages: 170-180.e12

    • DOI

      10.1016/j.chom.2024.01.001

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-11-20   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi