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水田土壌中のメタン生成における電導性鉄酸化物と直接電子輸送の役割の解明

Research Project

Project/Area Number 23K23750
Project/Area Number (Other) 22H02485 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 41050:Environmental agriculture-related
Research InstitutionNational Agriculture and Food Research Organization

Principal Investigator

常田 岳志  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 農業環境研究部門, 上級研究員 (20585856)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 酒井 順子  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 農業環境研究部門, 上級研究員 (10354052)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Keywordsメタン / 土壌 / 水田 / 直接電子伝達 / 安定同位体 / 同位体比 / イネ / 微生物
Outline of Research at the Start

水田はコメを生産する人類最大の食糧基地である一方、土壌中の微生物の働きにより強力な温室効果ガスである「メタン」が多量に生成されています。メタンは「土壌中の酸化鉄が還元された状態で生成される」というのがこれまでの常識でしたが、最近、電導性の鉄酸化物を電子が流れることでメタン生成が促進されるという新たな現象(DIETと呼ばれる)の存在が明らかにされました。この研究では独自に考案した炭素と水素の二重安定同位体標識実験とメタゲノム解析等の最新の分子生物学的手法を駆使し、DIETによるメタン生成を世界に先がけて定量し、DIETを司る主要微生物群を明らかにすることを目的とします。

Outline of Annual Research Achievements

水田はコメを生産する人類最大の食糧基地である一方、土壌中の微生物の働きにより強力な温室効果ガスである「メタン」が多量に生成されている。ただし土壌タイプ等によってメタン排出量は大きく異なり、そのメカニズムは十分解明されていない。比較的最近、鉄還元菌の代謝で生成された電子が、電導性の鉄酸化物を経由して直接メタン生成菌に受け渡されるDIET(Direct Interspecies Electron Transfer)と呼ばれる現象の存在が明らかにされ、その現象がメタン排出量の多寡に関与する可能性が示唆されている。
本年度はDIETの定量実験系の構築に向けて、2022年の解析で用いたものと同じ水田の土壌を嫌気培養し、培養時間とガス発生量および鉄還元量の関係を明らかにした。DIETの指標となり得る微生物機能遺伝子を見出すため、本培養試験の培養前後の土壌よりRNAを抽出し、網羅的シークエンスデータを取得した。
安定同位体を用いたDIET直接定量法については、メタンの安定同位体比分析に必要な-130℃~-150℃に調整可能なコールドトラップの構築を進めた。今後、このクライオフォーカス部を完成させ、別途入手したメタンの熱分解炉を含む前処理装置と組み合わせることで、メタンの炭素および水素安定同位体比がともに分析できるようになる見込みである。
一方、水田からのメタン排出量の変動に関する研究に関して、メタンの排出経路や温度依存性との関連を調査し、メタン排出量には大きな日変動および季節変動があること、その主な原因はバブリング経路の排出の増減によって生じることを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

コロナ禍の影響等で、同位体比測定に必要な熱分解炉を備えた前処理装置の入手が予定より遅れたこと、並びに、メタンの同位体比測定に必須となる特殊なクライオフォーカス部分を自作する必要が生じたため、DIET直接定量手法の部分にやや遅れがみられる。

Strategy for Future Research Activity

微生物面の解析ではメタン多排出土壌から微生物のメタトランスクリプトームデータを得ており、今後、メタン多排出の指標となる機能遺伝子候補を見出し、DIETとの関係を調査する。DIETの定量手法構築にあたっては、メタンの安定同位体比分析に必要なコールドトラップ等を自作する必要が生じたため、その構築を加速する。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Open Access: 3 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Diurnal variation in methane emission from a rice paddy due to ebullition2024

    • Author(s)
      Kajiura Masako、Tokida Takeshi
    • Journal Title

      Journal of Environmental Quality

      Volume: 53 Issue: 2 Pages: 265-273

    • DOI

      10.1002/jeq2.20553

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 理化学性の異なる3種類の水田土壌のメタン生成2023

    • Author(s)
      前田旅人、山本昭範、常田岳志
    • Journal Title

      東京学芸大学紀要 自然科学系

      Volume: 75 Pages: 205-211

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Mitigation of Paddy Field Soil Methane Emissions by Betaproteobacterium <i>Azoarcus</i> Inoculation of Rice Seeds2022

    • Author(s)
      Sakoda Midori、Tokida Takeshi、Sakai Yoriko、Senoo Keishi、Nishizawa Tomoyasu
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 37 Issue: 4 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22052

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 水田から排出される温室効果ガス-メタンを削減するための育種的、栽培的アプローチ2022

    • Author(s)
      常田岳志
    • Journal Title

      農業

      Volume: 1693 Pages: 37-43

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Effects of Spatial Distribution of Root on Methane Emissions among Rice Genotypes2024

    • Author(s)
      Ma Xuping、 Masako Kajiura、Tubasa Kawai、Daichi Fukushima、Samuel Kimani、Kyu kyu Hmwe、Yoriko Sakai、Yusaku Uga、Takeshi Tokida
    • Organizer
      International Symposium on Agricultural Meteorology 2024
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pathway-specific emissions and dissolved CH4 pool in the soil as affected by different rice varieties2024

    • Author(s)
      Takeshi Tokida、Masako Kajiura、Takeru Saito、Ma Xuping、Junko Nishiwaki
    • Organizer
      International Symposium on Agricultural Meteorology 2024
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The Influence of Root System Architecture on Methane Emissions: Insights from in situ Root Distribution of Rice Genotypes Having Different Root Angles2023

    • Author(s)
      Xuping Ma, Tsubasa Kawai, Daichi Fukushima, Samuel Munyaka Kimani, Kyukyu Hmwe, Masako Kajiura, Yoriko Sakai, Yusaku Uga, Takeshi Tokida
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 水田における経路別メタン放出と溶存メタン濃度の経時変化に関する研究2023

    • Author(s)
      濱本昌一郎、鶴海遥嘉、小早川竜也、梶浦雅子、常田岳志、山﨑琢平、西村拓
    • Organizer
      2023年度土壌物理学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Prolonged midseason drainage” for reducing greenhouse gas emissions from rice paddies with no yield penalty2023

    • Author(s)
      Takeshi TOKIDA
    • Organizer
      6th International Rice Congress 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Methane fluxes in in rice paddy fields and peatlands2023

    • Author(s)
      Takeshi TOKIDA
    • Organizer
      JSPS Alumni Seminar (ACN); Collaborative Solutions for Sustainable Agriculture in Japan and Norway
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 群落内濃度に基づく水稲メタン発生強度の推定2023

    • Author(s)
      小野圭介、常田岳志
    • Organizer
      日本農業気象学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] An improved pin-board method in combination with a machine-learning image analysis for evaluating root system architecture of rice plant grown in field condition2022

    • Author(s)
      Xuping Ma, Takeshi Tokida, Daichi Fukushima
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2022年度東京大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 水田からの形態別メタン放出の季節変動に関する研究2022

    • Author(s)
      小早川竜也, 濱本昌一郎, 崔丁文,  Ma Xuping, 梶浦雅子, 常田岳志, 西村拓
    • Organizer
      農業農村工学会2022年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Seasonal variations in methane emissions via plant and ebullition from rice paddies2022

    • Author(s)
      Tatsuya Kobayakawa, Soichiro Hamamoto, Dingwen Cui, Ma Xuping, Masako Kajiura, Takeshi Tokida, Taku Nishimura
    • Organizer
      JpGU Meeting 2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] メタン排出量の異なるイネ品種の根圏土壌セルラーゼ活性の比較2022

    • Author(s)
      酒井順子 、迫田翠 、西澤智康、常田岳志
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2022年度東京大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] The molecular genetic analysis on methanogens and methanotrophs of methane-mitigating paddy soil: the effect of bacterium inoculation onto rice seeds2022

    • Author(s)
      Midori Sakoda, Takeshi Tokida, Yoriko Sakai, Keishi Senoo, Tomoyasu Nishizawa
    • Organizer
      Asian Symposium for Microbial Ecology (ASME) 12
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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