In situ多層オミクスとリアルワールドデータ活用による口腔がん分子標的探索

• Project/Area Number: 23K24552
• Project/Area Number (Other): 22H03294 (2022-2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2022-2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
• Research Institution: Nippon Medical School
• Principal Investigator: 本田 一文 日本医科大学, 大学院医学研究科, 大学院教授 (10260936)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 森 泰昌 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (00296708) ; 水野 忠快 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (90736050)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000); Fiscal Year 2024: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2023: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2022: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: 口腔がん / 組織マイクロアレイ / 多層オミクス / リアルワールドデータ / 創薬標的 / In situ 多層オミクス

Outline of Research at the Start

われわれは抗体ライブラリーによる蛍光抗体法と仮想病理画像を組み合わせてタンパク質発現を自動定量解析するシステムAQVIPを独自開発し、組織マクロアレイを用いることで200例以上の一般医療で集積された臨床試料を、高速かつ大規模にタンパク質発現プロファイルするための方法の開発に成功した。現在われわれは、「in site kinome情報」を含有する膨大な舌がんの画像データと患者の全生存期間などの臨床情報を所有している。昨今、人工知能や計算科学を駆使したより精度の高い画像処理が可能になってきている。AQVIPのアルゴリズムをアップデートし、臨床情報と突合させることで、さらなる分子標的を抽出する。