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哺乳動物初期胚のエピゲノムダイバーシティを単一胚解析で解明する

Research Project

Project/Area Number 23K27056
Project/Area Number (Other) 23H02363 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 42010:Animal production science-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

池田 俊太郎  京都大学, 農学研究科, 教授 (50447893)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 星野 洋一郎  京都大学, 農学研究科, 助教 (50541736)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000)
Fiscal Year 2025: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2024: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
Fiscal Year 2023: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000)
Keywords受精卵 / 初期胚 / エピゲノム / 資源動物 / 家畜
Outline of Research at the Start

資源動物の初期胚(受精卵)を取り巻く環境は多様化、複雑化し、個々の胚が妊娠に成功するかどうかや、生まれてくる子供の形質に差異を生じています。エピジェネティック修飾と呼ばれるゲノムに付加される修飾が個々の胚で異なること(本研究ではエピゲノムダイバーシティと呼んでいます)が考えられますが、その実態は明らかでありません。本研究では複数のエピジェネティック修飾を受精卵一個単位で解析する手法を開発することにより、エピゲノムダイバーシティを解明し、資源動物初期胚の特性に及ぼす環境の影響の評価系を確立して、資源動物生産や生殖補助医療における受胎率の低下防止や産子の健康リスクの低減につなげることを目指します。

Outline of Annual Research Achievements

乳肉生産の高度化、気候変動や異常気象、飼養環境によるストレス、疾病、生殖補助技術の適用等により、家畜を含む資源動物の初期胚(受精卵)を取り巻く環境は多様化、複雑化している。ヒトの初期胚についても、これらと共通する環境要因に加え、生活習慣や社会構造の変化、多様化した社会的ストレスによる同様の状況がある。初期胚を取り巻く環境は個々の胚の発生能力や産子の形質に差異を生じさせている。環境要因によって、DNAを含む構造に付加した化学修飾によって遺伝子機能の制御と伝達を行うエピジェネティック修飾やその総体としてのエピゲノムが個々に変容していること、言わばエピゲノムの多様性(エピゲノムダイバーシティ)が考えられるが、細胞数の少ない初期胚では単一の胚のエピゲノム解析は困難であり、その多様性は複数胚解析による平均化によってマスクされ検出できないという問題があった。本研究課題では、マウスおよびウシ初期胚をモデルとして用い、申請者らが開発した単一胚およびその一部の細胞におけるヒストン修飾解析手法を組み合わせて、単一胚エピゲノム統合解析系を創出し、哺乳動物初期胚のエピゲノムダイバーシティを精査する。得られる結果から資源動物初期胚の特性に及ぼす環境の効果の評価系を確立し、資源動物生産や生殖補助医療における受胎率の低下防止や産子の健康リスクの低減につなげるための基盤的知見を得ることを目的としている。令和5年度は、ウシ胚を用いたバイオプシー方法の検討、バイオプシーからのトランスクリプトーム、ヒストンメチローム、DNAメチローム解析法の検討を行った。また、妊孕性に影響を与えうる食餌介入条件としてマウスへの高脂肪食の給餌条件を検討した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

DNAメチローム解析法としてのバイサルファイトシーケンス法の最適化に課題があり、現在検討を続けている。

Strategy for Future Research Activity

バイサルファイトシーケンスのライブラリー調製方法の最適化を継続する。これによりバイオプシーからのDNAメチローム解析系が確立した後、トランスクリプトーム、ヒストンメチロームデータとの統合解析を行う。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results)

  • [Journal Article] Analysis of histone H3K4me3 modifications in bovine placenta derived from different calf-production methods2024

    • Author(s)
      Kanoko Hattori, Yoichiro Hoshino, Masayuki Kachi, Yasumitsu Masuda, Satoshi Yamamoto, Shinnosuke Honda, Naojiro Minami, Shuntaro Ikeda
    • Journal Title

      Reproduction in Domestic Animals

      Volume: 59(1) Issue: 1

    • DOI

      10.1111/rda.14527

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluating histone modification analysis of individual preimplantation embryos2024

    • Author(s)
      Yiren Zeng, Yoichiro Hoshino, Kazuki Susami, Shinnosuke Honda, Naojiro Minami, Shuntaro Ikeda
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 25(1) Issue: 1 Pages: 75-75

    • DOI

      10.1186/s12864-024-09984-8

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Analysis of histone H3K4me3 modifications in bovine placenta derived from different calf production methods2023

    • Author(s)
      Kanoko Hattori, Yoichiro Hoshino, Shinnosuke Honda, Naojiro Minami, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pcgf5 transcribed from endogenous retroviral element plays a critical role in early mouse embryos2023

    • Author(s)
      Satoshi Mashiko, Naojiro Minami, Shuntaro Ikeda, Shinnosuke Honda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The developmental function of H3.3R26me2 in mouse early embryo2023

    • Author(s)
      Kei Sato, Naojiro Minami, Shuntaro Ikeda, Shinnosuke Honda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Roles of Nsun5 in Hippo signaling in mouse preimplantation embryos2023

    • Author(s)
      Dan Liu, Naojiro Minami, Shinnosuke Honda, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MYC protein is required for mouse embryos to enter the second S-phase2023

    • Author(s)
      Haoxue Wang, Takuto Yamamoto, Hana Sato, Naojiro Minami, Shinnosuke Honda, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Knockdown of maternal effect genes by siRNA electroporation into GV oocytes2023

    • Author(s)
      Yuriko Suzuki, Takuto Yamamoto, Naojiro Minami, Shinnosuke Honda, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      5th World Congress of Reproductive Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Roles of Nsun5 in mouse preimplantation embryos2023

    • Author(s)
      Dan Liu, Naojiro Minami, Shinnosuke Honda, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      第116回日本繁殖生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of Myc function in mouse preimplantation development2023

    • Author(s)
      Haoxue Wang, Takuto Yamamoto, Hana Sato, Naojiro Minami, Shinnosuke Honda, Shuntaro Ikeda
    • Organizer
      第116回日本繁殖生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス内在性レトロウイルスが転写を制御するPcgf5の初期胚発生過程での機能解明2023

    • Author(s)
      増子聖士、南直治郎、池田俊太郎、本多慎之介
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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