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Elucidation of the mechanisms controlling the physicochemical properties and functions of supercharged antibodies and development of their applications

Research Project

Project/Area Number 23KJ0394
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund
Section国内
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

笠原 慶亮  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2023-04-25 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords抗体 / 生物物理化学 / 蛋白質工学 / 抗体改変技術 / 計算科学 / 表面電荷
Outline of Research at the Start

蛋白質の表面電荷改変(Supercharge)はその物性の向上や新たな機能付加の手法として注目されている。本研究では、材料・生体応用を指向したSupercharge抗体の合理的設計指針を提案する。物理化学的手法を用いてSupercharge抗体の構造、安定性、抗原結合親和性などの物性・機能を解析することで、抗体表面への変異導入可能な部位を特定するとともに、本手法による抗体物性・機能の改質メカニズムを解明する。さらに検査キットやイメージング、細胞内取り込み・エフェクター機能に重要なFc受容体との相互作用解析にSupercharge抗体を用い、抗体の材料・生体応用における本手法の実用性を検証する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、計算デザインによって設計したスーパーチャージ抗体の物理化学的手法を用いた物性・機能の解析を通して、本手法による抗体物性・機能改質の分子基盤を明らかにする。また検査キットやイメージングにおける応用性を評価するため、それらに用いられるナノ粒子と作製した定常領域スーパーチャージ抗体を用いた解析を行う。相互作用解析や修飾した粒子の活性・凝集評価などを通じて、抗体の材料・生体応用における本手法の実用性を検証する。以上を通じて、材料・生体応用を指向したスーパーチャージ抗体の合理的設計指針を提案することを目的として研究を実施している。
複数モデル抗体の正電荷・負電荷変異体を用いて、動的/静的光散乱法によるコロイド安定性解析を行った。酸性条件において、正電荷変異体のコロイド安定性が高くなる傾向が共通して見られた。しかしながら、コロイド安定性の指標となる、拡散相互作用パラメータと第2ビリアル係数の相関関係について、先行研究と概ね一致するモデル抗体と一致しないモデル抗体が存在した。後者については、変異導入箇所が軽鎖表面に集中しており、表面電荷分布がより不均質なことが原因であると考察した。さらに、モデル抗体HyHEL-10の負電荷変異体と抗原であるリゾチームの複合体は、低塩濃度条件で凝集し、塩濃度を向上させることで再び溶解した。円偏光二色性解析の結果、再溶解した複合体は凝集前と同様の二次構造を維持していることが確認され、スーパーチャージによって、抗原結合依存的に可逆凝集を引き起こせることが示唆された。
ラテラルフローイムノアッセイ(LFI)に使用されるナノ粒子に対して、吸着量や配向性の向上を目指した。IgG1抗体CH3ドメインへの正電荷、CH1, CLドメインへの負電荷の変異導入を行った。これらの変異を組み合わせた抗体を用いたLFIの結果、抗原検出感度を約8倍向上させることに成功した。

Report

(2 results)
  • 2024 Annual Research Report
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2025 2024 2023

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Supercharging design of an anti-lysozyme Fab antibody to regulate ligand-dependent reversible aggregation2025

    • Author(s)
      Keisuke Kasahara, Makoto Nakakido, Daisuke Kuroda, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
    • Journal Title

      Polymer Journal

      Volume: -

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Unveiling the structural mechanisms behind high affinity and selectivity in phosphorylated epitope-specific rabbit antibodies2024

    • Author(s)
      Kasahara Keisuke、Kawade Raiji、Nakakido Makoto、Matsunaga Ryo、Akiba Hiroki、Entzminger Kevin C.、Maruyama Toshiaki、Okumura Shigeru C.J.、Caaveiro Jose M.M.、Kuroda Daisuke、Tsumoto Kouhei
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 300 Issue: 12 Pages: 107989-107989

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2024.107989

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Unveiling the affinity?stability relationship in anti-measles virus antibodies: a computational approach for hotspots prediction2024

    • Author(s)
      Paul Rimpa、Kasahara Keisuke、Sasaki Jiei、P?rez Jorge Fern?ndez、Matsunaga Ryo、Hashiguchi Takao、Kuroda Daisuke、Tsumoto Kouhei
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 10 Pages: 1302737-1302737

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1302737

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] スーパーチャージによる抗体の安定性と相互作用パラメータの制御の探究2024

    • Author(s)
      笠原慶亮, 平尾篤紀, 黒田大祐, カアベイロホセ, 山脇つくし, 中木戸誠, 長門石曉, 津本浩平
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] The molecular basis through which Fv-supercharging affects the physicochemical properties of antibodies2024

    • Author(s)
      Keisuke Kasahara, Daisuke Kuroda, Jose M.M. Caaveiro, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
    • Organizer
      21st Congress of the International Union for Pure and Applied Biophysics (兼 第61回日本生物物理学会年会)
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Fc-supercharging to enhance the adsorption and control the orientation of antibodies to the cellulose nanoparticles2024

    • Author(s)
      Keisuke Kasahara, Junichi Sato, Keisuke Murakami, Hirokazu Nagai, Daisuke Kuroda, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
    • Organizer
      The 38th Annual Symposium of The Protein Society
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 抗体の物性・機能向上とナノ粒子への結合量・配向制御のためのスーパーチャージ抗体設計2024

    • Author(s)
      笠原慶亮, 佐藤潤一, 永井宏和, 黒田大祐, 長門石曉, 津本浩平
    • Organizer
      第3回日本抗体学会学術大会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 可変領域スーパーチャージ抗体の安定性・結合親和性とその溶媒依存性の解明2023

    • Author(s)
      笠原慶亮,黒田大祐,長門石曉,津本浩平
    • Organizer
      第22回東京大学生命科学シンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 可変領域の表面電荷改変による抗体の安定性・結合親和性制御メカニズムの解明2023

    • Author(s)
      笠原慶亮,黒田大祐,長門石曉,津本浩平
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Elucidation and control of physicochemical properties of antibodies by supercharging of variable regions2023

    • Author(s)
      笠原慶亮,黒田大祐,長門石曉,津本浩平
    • Organizer
      The 37th Annual Symposium of The Protein Society
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Thermodynamic analysis of Fv-supercharged antibody-antigen interactions and control of interaction parameters2023

    • Author(s)
      笠原慶亮,黒田大祐,カアベイロホセ,長門石曉,津本浩平
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Fab 抗体と Nanobody のスーパーチャージによる物性・機能改質2023

    • Author(s)
      笠原慶亮,黒田大祐,カアベイロホセ,山脇つくし,氏家寛,中木戸誠,長門石曉,津本浩平
    • Organizer
      第2回日本抗体学会学術大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 等電点が改変されたドメインを有する抗体2025

    • Inventor(s)
      村上桂介,佐藤潤一,永井宏和,笠原慶亮,長門石曉,津本浩平
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人 東京大学, 旭化成株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2025
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 等電点が改変されたドメインを有する抗体2024

    • Inventor(s)
      村上桂介, 永井宏和, 笠原慶亮, 長門石曉, 津本浩平
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人 東京大学, 旭化成株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2024-029004
    • Filing Date
      2024
    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2023-04-26   Modified: 2025-12-26  

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