Unraveling evolution of whole-genome duplication through chromosome conformation capture analysis approach

Research Project

Project/Area Number	24K09557
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 45020:Evolutionary biology-related
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	宇野好宣東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (60609717)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2026: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000) Fiscal Year 2025: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000) Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords	脊椎動物 / 全ゲノム重複 / 染色体 / ゲノム進化 / ツメガエル
Outline of Research at the Start	脊椎動物の共通祖先で起きた全ゲノム重複は、一方の親種のゲノムでの優位な遺伝子消失など、非対称なゲノム進化を遂げたことが示唆されているが、その詳細なプロセスは不明である。そこで本研究では、比較的最近に独自に全ゲノム重複が生じた異質四倍体ツメガエル2種において、染色体テリトリーやそれに関与している部位特異的反復配列を対象した染色体高次構造解析を行う。そしてこれらの種間や近縁種の二倍体ツメガエル種との比較を行うことで、脊椎動物祖先で生じた全ゲノム重複後のゲノム進化について新たな知見を提供する。