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Elucidation of the regulatory mechanism of the SLF1/2-SMC5/6 pathway in hematopoiesis and its therapeutic application

Research Project

Project/Area Number 24K11514
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

蝶名林 和久  京都大学, 医学研究科, 助教 (00646010)

Project Period (FY) 2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2026: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsSLF1/2-SMC5/6経路 / Atelis症候群 / 遺伝性骨髄不全症候群 / 疾患特異的iPS細胞 / 骨髄性腫瘍
Outline of Research at the Start

本研究は、申請者らが樹立したAtelis症候群患者由来の疾患特異的iPS細胞とその血液分化誘導系を用い、機能解析や網羅的な遺伝子発現解析及びエピゲノム解析を行う事で、SLF1/2-SMC5/6経路の異常が造血不全を呈するメカニズムを解明し、造血を規定する新たな知見を創出し、疾患の治療薬候補を選定することを目的とする。
本研究が産み出す成果は、Atelis症候群の治療法、創薬開発に繋がる事が期待される。さらに、この画期的な疾患iPS細胞を用いた新しいプラットフォームは、Atelis症候群のみならずDNA修復障害及び不安定性が関与する造血不全症候群全体に波及効果をもたらすと期待される。

Outline of Annual Research Achievements

当初の研究計画に沿って、令和6年度に下記の進捗があった。

1)疾患特異的iPS細胞の作製および変異修復:SLF2遺伝子の両アリル病的バリアントを原因とするAtelis症候群-1(ATELS1)患者の末梢血単核細胞および不死化リンパ芽球様細胞株から、複数の疾患iPS細胞株を樹立する事に成功した。さらにisogenic control株として、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集により片アリルのSLF2変異を修復したiPS細胞を作製した。
2)疾患iPS細胞を用いたAtelis症候群の病態再現:疾患iPS細胞株および変異修復株を胚様体形成法による分化誘導系を用いて造血誘導し、造血幹前駆細胞分画(CD45+CD34+CD38+Lin-)でソートして分画をそろえた上で、GM-CSF、G-CSF、IL-3、IL-6、SCF、EPO存在下でコロニーアッセイを行った。その結果疾患iPS細胞株由来の造血幹前駆細胞では、赤芽球系・骨髄球系共にコロニー形成能が高度に障害されていることが証明され、本モデルを用いて造血不全の病態をin vitroで再現する事ができた。また、疾患iPS細胞由来の造血前駆細胞では、γH2AX免疫染色によりDNA損傷の亢進が認められ、細胞周期解析においてG2/M期での細胞周期停止が確認された。
3)疾患iPS細胞由来造血幹前駆細胞の網羅的遺伝子発現解析:疾患iPSおよび変異修復iPS細胞由来造血幹前駆細胞のRNAシークエンスを行い、網羅的に遺伝子発現パターンの比較ををGene Set Enrichment Analysis (GSEA)で行ったところ、疾患iPS細胞由来造血幹前駆細胞ではp53経路の活性化、細胞老化に関わる遺伝子群の発現上昇などを認めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

令和6年度は、上記のように、1)疾患特異的iPS細胞の作製および変異修復、2)疾患iPS細胞を用いたAtelis症候群の病態再現、3)疾患iPS細胞由来造血幹前駆細胞の網羅的遺伝子発現解析を計画していた。1)、2)、3)についてほぼ達成できた。
以上のように、当初検討していた実験計画に関しておおむね順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

上記1)、2)、3)の課題を引き続いて行う。

4)Atelis症候群特異的原因因子の探索:3)で得られた網羅的遺伝子発現解析及びエピゲノム解析の結果と2)で得られた機能解析の結果とを組み合わせる事により、造血幹前駆細胞の分化異常やゲノム不安定性に関わる候補因子を絞り込む。

5)候補因子の機能解析:4)で同定した候補因子について、順次iPS細胞に導入もしくはノックダウン・ノックアウトを行った後に造血誘導し、2)のin vitro病態再現系を用いてAtelis症候群の造血障害の病態への影響を評価し、有望な標的因子に関して、市販の阻害剤などの探索を行う。

Report

(1 results)
  • 2024 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2024 Other

All Presentation (1 results) Remarks (2 results)

  • [Presentation] SLF2, a novel causative gene for inherited bone marrow failure syndrome and MDS, and its mechanism2024

    • Author(s)
      Sho Shibata
    • Organizer
      The 86th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Remarks] 遺伝性血液疾患の疾患モデル研究・創薬

    • URL

      https://hematol.kuhp.kyoto-u.ac.jp/research/iPS.html

    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Remarks] リプログラミング技術を用いた骨髄性腫瘍(MDS、AML)研究

    • URL

      https://hematol.kuhp.kyoto-u.ac.jp/research/iPS.html

    • Related Report
      2024 Research-status Report

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Published: 2024-04-05   Modified: 2025-12-26  

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