| Project/Area Number |
24K12895
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 57020:Oral pathobiological science-related
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
阿部 達也 新潟大学, 医歯学系, 助教 (70634856)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
凌 一葦 新潟大学, 医歯学系, 助教 (70804540)
大橋 瑠子 新潟大学, 医歯学系, 教授 (20447600)
山崎 学 新潟大学, 医歯学系, 准教授 (10547516)
田沼 順一 新潟大学, 医歯学系, 教授 (20305139)
丸山 智 新潟大学, 医歯学総合病院, 講師 (30397161)
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| Project Period (FY) |
2024-04-01 – 2027-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2026: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 頭頸部扁平上皮癌 / RNA / 選択的スプライシング / 口腔扁平上皮癌 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、口腔・頭頸部扁平上皮癌の進展・予後にメッセンジャーRNA (mRNA) 選択的スプライシングが関与するとの仮説を立て、腫瘍特異的スプライシングパターンを明らかにし、AI病理画像解析によるスプライシングを基盤とした病理学的解析モデルの確立、さらにはスプライシング産物の機能およびネオアンチゲン特性の観点から腫瘍特異的mRNAスプライシングの意義の解明を行う。これらを通じ、RNA選択的スプライシングと病理組織所見, スプライシング産物の蛋白質機能の相互関係を解明することで病理組織学とmRNA選択的スプライシングの知見を融合させた、新たな“RNA病理学”の創出の可能性を探る。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、癌におけるmRNA選択的スプライシングに注目し、口腔癌を含む頭頸部扁平上皮癌に特異的なRNA選択的スプライシングバリアントおよびスプライシングシグネチャー（複数のスプライシングバリアントから構成されるパターン）を明らかにし, さらにその病理形態像との関連性や機能的意義を解明することを目的としている。
初年度は、公開データベースを用いた頭頸部扁平上皮癌のmRNA選択的スプライシングバリアント解析において、複数の統計学的手法を組み合わせることで、頭頸部扁平上皮癌を生命予後の観点で高リスク群・低リスク群に層別化することができるスプライシングイベントの組み合わせが見出された。いくつかのスプライシングの種類がある中で、エクソンスキッピングに絞った場合、最も予後予測性能の指標が優れていることが示された。また、高リスク群/低リスク群の層別化と臨床病理学的因子との関連性の検討したところ、リンパ節転移病変における節外浸潤や神経周囲浸潤の有無などとの関連性が示唆された。同時に、自施設の口腔扁平上皮癌臨床病理検体を用いたRNAseq解析のため、症例選定と臨床病理学的情報の収集を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度に予定していた公開データベースを用いた頭頸部扁平上皮癌の予後関連スプライシングイベントの同定と、臨床検体によるRNAseqのための症例抽出が実施された。一方、病理形態所見との関連性を検討するための画像解析モデルの構築は、2024年度では大きな進展はなかったが、2025年度よりモデル構築を発展させる予定であることから、おおむね順調に進展していると考える。
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| Strategy for Future Research Activity |
自施設の口腔扁平上皮癌外科切除検体の病理標本より抽出したRNAを用いて、 mRNAスプライシングイベントの検証をRNAseqを用いて行う予定であり、2025年度初頭に解析が開始できる見込みである。また、癌におけるmRNA選択的スプライシングと病理形態所見の関連性を検討するための画像解析モデルを国内外の共同研究先と構築する。
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