| Project/Area Number |
24K18685
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 52020:Neurology-related
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
小河 浩太郎 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (80870500)
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| Project Period (FY) |
2024-04-01 – 2027-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2026: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | 視神経脊髄炎スペクトラム障害 / ゲノムワイド関連解析 / 視神経脊髄炎 / PRS / ゲノム |
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| Outline of Research at the Start |
日本人視神経脊髄炎患者を対象に世界最大規模のゲノムワイド関連解析（GWAS）を実施し、さらにHLA領域の関連解析を実施することで疾患感受性領域の網羅的な探索を行う。次に、GWASデータの有意水準を緩めることで、弱い疾患感受性を持つ多数のSNPを用いて疾患発症リスクを推計する手法であるポリジェニックリスクスコア(PRS)を活用することで視神経脊髄炎患者の層別化を行い、疾患発症リスクの推計や、予後予測に役立つデータベースを構築する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
日本人における視神経脊髄炎スペクトラム障害（NMOSD)のゲノムワイド関連解析（患者240人、対照群50,578人）を実施した。HLA領域およびCCR6に疾患感受性遺伝子領域を同定した。次にPBMCを採取して、単一細胞RNAシーケンス（scRNA-seq）解析（患者25人、対照群101人）を実施し、さらにeQTL解析を実施した。CCR6のリスク変異はCD4陽性T細胞サブセットにおいてeQTL効果を示したゲノム情報から染色体レベルでの体細胞変異であるmCAを検出し、NMOSDと血液腫瘍、NMOSD以外の自己免疫疾患でその頻度を比較解析した。NMOSD患者は他の自己免疫疾患と比較してmCAを有するリスクが高いことが示された。また、NMOSD患者の21番染色体長腕に体細胞変異としての欠失が見られるCD4+T細胞でI型インターフェロンに関連する遺伝子の発現が低下していることを示した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ゲノムワイド関連解析に新規の疾患感受性遺伝子領域の検出に成功し、さらに体細胞変異についても疾患罹患リスクを上昇させる新規の変異を検出できているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続きNMOSDのGWASのサイズを拡大し、さらにAQP4抗体の有無や病変部位などの層別化を行ったうえでリスク評価に使用できるPRS解析を進めていく。
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