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Molecular dissection of post-transcriptional gene regulation by the "mRNA poly(A) tail regulatory system"

Research Project

Project/Area Number 25291004
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypePartial Multi-year Fund
Section一般
Research Field Molecular biology
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

Hoshino Shin-ichi  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (40219168)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 細田 直  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 講師 (40438198)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2015: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
KeywordsmRNAポリA鎖制御 / mRNA分解 / 遺伝子発現 / 品質管理 / ポリA鎖 / 翻訳
Outline of Final Research Achievements

The mRNA 3’ poly(A) tail length regulation plays central roles in the post-transcriptional control of gene expression. In this study, we aimed to verify novel regulatory mechanisms of gene expression targeting mRNA poly(A) tail and unraveled the whole picture of the following mechanisms: (i) negative regulation of gene expression by the shortening of the poly(A) tail of mRNA (e.g., c-myc and GluR2), (ii) positive regulation of gene expression by the lengthening of the poly(A) tail of mRNA (e.g., p27kip1, hnRNPA1 and b-catenin), and (iii) stress-induced global regulation of gene expression by the stabilization of mRNA poly(A) tail and formation of stress granules.

Report

(5 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (49 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (38 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Georgia Tech Biological Sciences(米国)

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  • [Journal Article] RNA exosome complex regulates stability of Hepatitis B Virus's X-mRNA transcript in a Non-Stop mediated (NSD) RNA quality control mechanism.2016

    • Author(s)
      Hussein H. Aly, Junya Suzuki, Koichi Watashi, Kazuaki Chayama, Shin-ichi Hoshino, Makoto Hijikata, Takanobu Kato, and Takaji Wakita
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 291 Issue: 31 Pages: 15958-15974

    • DOI

      10.1074/jbc.m116.724641

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  • [Journal Article] The STAR protein QKI-7 recruits PAPD4 to regulate post-transcriptional polyadenylation of target mRNAs2016

    • Author(s)
      Yamagishi, R., Tsusaka T., Mitsunaga, H., Maehata, T., Hoshino, S.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 44 Issue: 6 Pages: 2475-2490

    • DOI

      10.1093/nar/gkw118

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    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Calpain mediates processing of the translation termination factor eRF3 into the IAP-binding isoform p-eRF3.2015

    • Author(s)
      Hashimoto, Y., Inagaki, H., Hoshino, S.
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 589 Issue: 17 Pages: 2241-2247

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2015.06.041

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] がん抑制遺伝子産物TobによるmRNA分解を介したがん抑制と学習記憶の調節2015

    • Author(s)
      尾上耕一、星野真一
    • Journal Title

      ファルマシア特集号『RNA研究が切り開く薬学フロンティア』

      Volume: 51 Pages: 27-31

    • NAID

      130007447864

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  • [Journal Article] Arsenite inhibits mRNA deadenylation through proteolytic degradation of Tob and Pan3.2014

    • Author(s)
      Yamagishi, R., Hosoda, N., Hoshino, S.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 455 Issue: 3-4 Pages: 323-331

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.11.015

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  • [Journal Article] The processed isoform of the translation termination factor eRF3 localizes to the nucleus to interact with the ARF tumor suppressor2014

    • Author(s)
      Yoshifumi Hashimoto, Naomichi Kumagai, Nao Hosoda, and Shin-ichi Hoshino
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 445 Issue: 3 Pages: 639-644

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.02.063

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  • [Journal Article] Anti prolifetative protein Tob directly regulates c-myc proto-oncogene expression through cytoplasmic polyadenylation element-binding protein CPEB.2013

    • Author(s)
      Ogami, K., Hosoda, N., Funakoshi, N., Hoshino, S.
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: - Issue: 1 Pages: 55-64

    • DOI

      10.1038/onc.2012.548

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  • [Presentation] mRNA分解による抗ウイルス防御2016

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会シンポジウム『転写後制御を通じた病原体―宿主の攻防戦略』
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
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  • [Presentation] 細胞内における人工合成mRNAの安定化および発現効率化2016

    • Author(s)
      野木森拓人、永井貴広、細田直、星野真一
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
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  • [Presentation] The Star protein QKI-7 recruits PAPD4 to regulate polyadenylation of its target mRNA2016

    • Author(s)
      Yamagishi, R., Sekido, Y., Hoshino, S.
    • Organizer
      The 75th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-10-06
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  • [Presentation] MicroRNA-Ago-TNRC6 complex-mediated translational activation2016

    • Author(s)
      Iwaoka, R., Aoki, K., Hosoda, N., Hoshino. S., Wakiyama, M.
    • Organizer
      EMBO/EMBL symposium ‘The complex life of mRNA’
    • Place of Presentation
      ドイツ、ハイデルベルク
    • Year and Date
      2016-10-05
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      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural Characterization of PABP Multimerization on Poly(A) Tail2016

    • Author(s)
      Ryoichi Sawazaki*1, Shunsuke Imai*2, Mariko Yokogawa1, Yoko Usui1, Takeru Sagae1, Shin-ichi Hoshino3, Ichio Shimada2, Masanori Osawa1
    • Organizer
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2016-08-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] mRNAポリA鎖調節とストレス顆粒形成2016

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      第1回RNA顆粒/RNAタンパク質複合体研究会
    • Place of Presentation
      岡崎市
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 脊髄小脳変性症の原因因子Ataxin-2は標的mRNAのポリA鎖を安定化する2016

    • Author(s)
      稲垣佑都、細田直、星野真一
    • Organizer
      第1回RNA顆粒/RNAタンパク質複合体研究会
    • Place of Presentation
      岡崎市
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] ポリA上でのPABP多量体化の構造生物学的解析2016

    • Author(s)
      沢崎綾一、今井駿輔、横川真梨子、臼井遥子、星野真一、堅田利明、嶋田一夫、大澤匡範
    • Organizer
      第136回日本薬学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA品質管理因子Dom34による新規抗ウイルス防御機構2016

    • Author(s)
      西浦久達、野木森拓人、川島生、永井貴広、細田直、今高寛晃、星野真一
    • Organizer
      第136回日本薬学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 脊髄小脳変性症の原因因子Ataxin-2によるストレス顆粒形成のメカニズム2016

    • Author(s)
      堀田昴志、山岸良多、細田直、星野真一
    • Organizer
      第62回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
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      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 統合失調症関連因子QKI-7はp27kip1 mRNAのポリA鎖伸長を制御する2016

    • Author(s)
      古舘和也、山岸良多、星野真一
    • Organizer
      第62回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
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      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 自然免疫制御システムOAS-RNaseLによる外来性RNA分解制御2016

    • Author(s)
      永井貴広、野木森拓人、細田直、星野真一
    • Organizer
      第62回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 脊髄小脳変性症の原因因子Ataxin-2は標的mRNAのポリA鎖を安定化する2016

    • Author(s)
      稲垣佑都、細田直、星野真一
    • Organizer
      第62回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] mRNA分解の分子機構(mRNA分解研究の新展開)2016

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      愛知県がんセンター特別招聘セミナー
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ストレス時のmRNAポリA鎖安定化とストレス顆粒形成のメカニズム2015

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-12-03
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    • Invited
  • [Presentation] mRNA品質管理因子Dom34による抗ウイルス防御2015

    • Author(s)
      川島生、野木森拓人、西浦久達、堀田昂志、細田直、今高寛晃、星野真一
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2015-07-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 外来性mRNAは品質管理類似の分子機構により除去される2015

    • Author(s)
      野木森拓人、西浦久達、川島生、細田直、星野真一
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2015-07-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Ataxin-2オーソログPbp1はmRNA分解において機能する2015

    • Author(s)
      田中杏里、細田直、星野真一
    • Organizer
      第61回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2015-07-04
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] mRNA分解因子による抗ウイルス防御2015

    • Author(s)
      川島生、野木森拓人、西浦久達、堀田昂志、細田直、星野真一
    • Organizer
      第61回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2015-07-04
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内における人工合成mRNAの分解機構2015

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      第135回日本薬学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-03-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] mRNAポリA鎖調節および品質管理を介した高次生命機能の制御2015

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      第3回CCR4-NOT研究会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2015-03-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Control of mRNA deadenylation by apoptosis signal regulating kinase (ASK1)2014

    • Author(s)
      Fukushima, M., Wakita, E., Hosoda, N., Hoshino, S.
    • Organizer
      4th Zing Nucleic Acids Conference
    • Place of Presentation
      メキシコ、カンクン
    • Year and Date
      2014-12-05 – 2014-12-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] A eRF3-targeted novel regulatory system in gene expression and apoptosis2014

    • Author(s)
      Hashinoto, Y., Nakamura, Y., Hoshino, S.
    • Organizer
      Joint Australia and Japan RNA Meeting
    • Place of Presentation
      オーストラリア、シドニー
    • Year and Date
      2014-11-02 – 2014-11-05
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] mRNA分解の分子メカニズムと遺伝子発現調節2014

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      自然科学研究機構生理学研究所/統合バイオサイエンスセンター部門公開セミナー
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2014-09-12
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] mRNA分解機構の解明と人工合成mRNAの安定化2014

    • Author(s)
      星野真一
    • Organizer
      アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2014
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-09-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] eRF3ファミリーに属するGタンパク質GTPBP1の機能解析2014

    • Author(s)
      西浦 久達、野木森 拓人、川島 生、細田 直、星野 真一
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ストレスキナーゼAsk1 によるmRNA ポリA 鎖分解の制御2014

    • Author(s)
      福島 真、脇田 恵里、細田 直、星野 真一
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 脊髄小脳変性症の原因遺伝子Ataxin-2はmRNAデキャッピングを促進する2014

    • Author(s)
      稲垣 佑都、成瀬 貴文、細田 直、星野 真一
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] B型肝炎の治療を目指した人工合成mRNAの安定化・高効率発現系の確立2014

    • Author(s)
      野木森 拓人、西浦 久達、川島 生、細田 直、星野 真一
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ストレス時のmRNA安定化とストレス顆粒形成の分子機構2014

    • Author(s)
      山岸 良多、杉山 遥、富田 一範、成瀬 貴文、細田 直、星野 真一
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] CPEBによって制御されるmRNAポリA鎖分解機構2013

    • Author(s)
      細田直、釣真由美、船越佑司、星野真一
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] B型肝炎治療を目指したmRNAトランスフェクションによる高効率遺伝子発現系の確立2013

    • Author(s)
      野木森拓人、細田直、星野真一
    • Organizer
      日本病院薬剤師会東海ブロック学術大会、日本薬学会東海支部合同学術大会2013
    • Place of Presentation
      鈴鹿
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  • [Presentation] 翻訳終結因子eRF3のプロセス体p-eRF3の新規機能2013

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      橋本芳史、細田直、星野真一
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      第86回日本生化学会大会
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      横浜
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  • [Presentation] 翻訳終結因子eRF3の細胞内局在制御2013

    • Author(s)
      橋本芳史、細田直、星野真一
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
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      愛媛
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  • [Presentation] STARファミリー蛋白質QKIによるポリA鎖伸長を介した遺伝子発現の転写後調節機構2013

    • Author(s)
      山岸良太、津阪剛史、光永紘子、前畑高明、星野真一
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛
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      2013 Annual Research Report
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      岡本淳志、細田直、星野真一
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ポリA鎖分解酵素NocturninによるmRNA動態制御2013

    • Author(s)
      奥村真由、細田直、星野真一
    • Organizer
      第59回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] eRF3ファミリーに属するG蛋白質GTPBP1の機能解析2013

    • Author(s)
      西浦久達、細田直、星野真一
    • Organizer
      第59回日本薬学会東海支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 人工合成mRNAの発現を効率化する技術2016

    • Inventor(s)
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Holder
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2016-11-09
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      2016 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 人工合成mRNAを細胞内において安定化させる方法2014

    • Inventor(s)
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Holder
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2014-098133
    • Filing Date
      2014-05-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 人工合成mRNAの翻訳効率化方法2014

    • Inventor(s)
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Holder
      星野真一、細田直、野木森拓人
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2014-107562
    • Filing Date
      2014-05-23
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2013-05-21   Modified: 2022-02-16  

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