先制医療の実現にむけたエクソーム解析による遺伝性心筋症のリスク層別化の検討
Project/Area Number |
26461072
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Research Field |
Cardiovascular medicine
|
Research Institution | Ehime University |
Principal Investigator |
大木元 明義 愛媛大学, 医学部附属病院, 准教授 (00403832)
|
Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
|
Project Status |
Discontinued (Fiscal Year 2015)
|
Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2016: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
|
Keywords | 心筋症 / 遺伝子解析 / 次世代シーケンサー / 遺伝性循環器疾患 / リスク層別化 / ターゲットリシーケンス |
Outline of Annual Research Achievements |
遺伝性循環器疾患ではサルコア蛋白などの原因遺伝子変異だけでなく,病態修飾遺伝子多型がその病態に大きく影響していることを報告してきた.既存の原因遺伝子解析では遺伝子変異同定率は約60%であり,病因と予後を解析するうえで限界があった.本研究では,遺伝性循環器疾患に対して網羅的にターゲット・リシーケンスを行い,遺伝性循環器疾患をより正確な診断群として分類することを目的とした.対象は60例(96例を予定)の遺伝性循環器疾患を対象にした.イルミナ社製の次世代シーケンサーMiSeqとTruSight Cardioキットを用いて,17の遺伝性循環器疾患における174遺伝子に対してターゲット・リシーケンス(0.57 Mb)を行った.平均リード深度は230,カバレッジ(20x)が97%であった. 平均297個/症例の遺伝子多型・変異(96%が既報)が確認できた.VariantStudioを使用して,アジア人1%未満のrare variantsを解析すると原因遺伝子候補が平均6個抽出できた.特に,心臓再同期療法や心臓移植登録を行った重症肥大型心筋症の4例では,MYBPC3遺伝子変異(各々Arg820Gln,Glu386Ter,Glu258Lys)だけでなく,まれなTTN遺伝子等の変異も重積していた(平均8個).拡張型心筋症と刺激伝導系障害を合併する家系で,新規のLMNA遺伝子変異(Gln258HisfsTer222)を確認した.この変異は1塩基欠失によりフレームシフトがおこり,本来のLMNA蛋白よりも短い蛋白が翻訳されることが推察された. RBM20遺伝子(Ser75Leu)の重積変異の影響や,男性では女性に比較して若年で発症し重症化する可能性が推察され,早期の心臓再同期療法等による治療介入で病状の進展を抑制できる可能性が示された.今後も,先制医療に向けた新たな治療標的を探求する予定である.
|
Report
(2 results)
Research Products
(19 results)
-
-
[Journal Article] Takayasu arteritis and ulcerative colitis -high concurrence ratio and genetic overlap.2015
Author(s)
Terao C, Matsumura T, Yoshifuji H, Kirino Y, Maejima Y, Kochi Y, Ogimoto A, Yamamoto M, Takahashi H, Nakayamada S, Saito K, Wada Y, Narita I, Kawaguchi Y, Yamanaka H, Ohmura K, Atsumi T, Tanemoto K, Miyata T, Kuwana M, Komuro I, Tabara Y, Ueda A, Isobe M, Mimori T, Matsuda F.
-
Journal Title
Arthritis Rheumatol.
Volume: -
Issue: 8
Pages: 2226-2232
DOI
Related Report
Peer Reviewed
-
-
-
[Journal Article] Aortic prosthetic graft infection detected by 18F-fluorodeoxyglucose positron emission tomography/computed tomography.2015
Author(s)
Kono T, Ogimoto A, Iio C, Fujimoto K, Fujii A, Uetani T, Nagai T, Nishimura K, Inoue K, Suzuki J, Hiasa G, Okayama H, Okura T, Miyagawa M, Mochizuki T
-
Journal Title
Int J Cardiol.
Volume: 203
Pages: 972-974
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Cardiac magnetic resonance imaging for assessment of steroid therapy in a patient with cardiac sarcoidosis and a magnetic resonance-conditional pacemaker2014
Author(s)
Kono T, Ogimoto A, Saito M, Fujimoto K, Fujii A, Uetani T, Nagai T, Nishimura K, Inoue K, Suzuki J, Okura T, Kido T, Miyagawa M, Mochizuki T, Higaki J.
-
Journal Title
Int J Cardiol
Volume: 176
Issue: 3
Pages: e89-e91
DOI
Related Report
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-