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緑膿菌の低酸素環境適応に関わる酸素高親和性呼吸酵素の機能解析

Publicly Offered Research

Project AreaOxygen biology: a new criterion for integrated understanding of life
Project/Area Number 15H01393
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

新井 博之  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (70291052)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2016: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2015: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords呼吸 / 微生物 / エネルギー代謝 / 酸化ストレス
Outline of Annual Research Achievements

(1) cbb3型酵素アイソフォームの機能と緑膿菌の表現型との相関
緑膿菌は好気呼吸において酸素を水に還元する末端酸化酵素を複数持っているが、酸素に対する親和性の高いcbb3型シトクロムc酸化酵素を酸素濃度に依らず主要な酵素として利用するという特徴がある。緑膿菌はゲノム上にコードされている複数のイソサブユニットの組み合わせにより16種類のcbb3型酵素アイソフォームを生産することができ、これらのアイソフォームは主要サブユニットの種類により4タイプ(N1~N4型)に分類できる。このうち、N3型酵素とN4型酵素は、それぞれ亜硝酸イオンおよびシアン化物イオンにより誘導発現する。N3型またはN4型酵素の欠損株、および、それぞれの酵素を唯一の末端酸化酵素として発現する菌株の表現型解析、または、酵素活性の解析を行った結果、N3型およびN4型酵素は、緑膿菌の低酸素環境における窒素酸化物とシアンに対する耐性に、それぞれ寄与していることが明らかとなった。
(2) cco遺伝子群の発現制御解析
N4型cbb3酸化酵素の主要サブユニットccoN4は、シアン化物イオンに応答して誘導発現し、その発現にはGntRファミリーに属するCicRと名付けた転写調節因子が関わる。大腸菌で異種発現、精製したCicRを用いた機能解析の結果、CicRはピリドキサルリン酸(PLP)を補因子として持ち、PLPとシアン化物イオンがシアノヒドリンを形成することで、シアン化物イオンを感知することが示唆された。また、ゲルシフト解析により、CicRはccoN4遺伝子のプロモーター領域に特異的に結合するのに対し、高酸素条件でのシアン耐性呼吸に関わるCyanide insensitive oxidaseの発現制御には直接関与しないことが明らかになった。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Expression of multiple cbb3 cytochrome c oxidase isoforms by combinations of multiple isosubunits in Pseudomonas aeruginosa2016

    • Author(s)
      Takehiro Hirai, Tatsuya Osamura, Masaharu Ishii, and Hiroyuki Arai
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 113 Issue: 45 Pages: 12815-12819

    • DOI

      10.1073/pnas.1613308113

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Discovery of an intermolecular disulfide bond required for the thermostability of a heterodimeric protein from the thermophile Hydrogenobacter thermophilus2016

    • Author(s)
      Keug Tae Kim, Yoko Chiba, Hiroyuki Arai, and Masaharu Ishii
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 80 Issue: 2 Pages: 232-240

    • DOI

      10.1080/09168451.2015.1079476

    • NAID

      120007129882

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 緑膿菌の新規シアン応答転写調節因子の機能解析2017

    • Author(s)
      多田羅圭、石井正治、新井博之
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-19
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA バーコードを用いた緑膿菌のポピュレーション解析2017

    • Author(s)
      木戸玲子、新井博之、石井正治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑膿菌由来一酸化窒素還元酵素のNOおよびH+の輸送に関わるアミノ酸残基の役割2016

    • Author(s)
      山際 来佳、武田真梨子、澤井 仁美、當舎 武彦, 中村 寛夫, 新井 博之, 城 宜嗣
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-27
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 酸素高親和性呼吸酵素による微生物の環境適応と呼吸防御2016

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-29
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑膿菌における高酸素親和性cbb3型末端酸化酵素の機能解析2016

    • Author(s)
      酒井義瑛,石井正治,新井博之
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-28
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑膿菌の新規シアン応答転写調節因子による好気呼吸酵素遺伝子の転写制御解析2016

    • Author(s)
      多田羅圭,石井正治,新井博之
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-28
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 酸素非発生型光合成細菌のエネルギー代謝制御機構2016

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      第1回光合成細菌ワークショップ
    • Place of Presentation
      岩手大学(岩手県・盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-17
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 緑膿菌バイオフィルムの酸素および酸化ストレス応答2016

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      弟50回緑膿菌感染症研究会
    • Place of Presentation
      ヒルトン東京お台場(東京都・港区)
    • Year and Date
      2016-02-05
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 呼吸システムの多様化による緑膿菌の環境適応2015

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2015-12-12
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 複数の好気呼吸酵素の使い分けによる緑膿菌の低酸素環境適応2015

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-04
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 緑膿菌を用いた一酸化窒素還元酵素の組換え体調製と変異体解析2015

    • Author(s)
      山際 来佳, 澤井 仁美, 當舎 武彦, 中村 寛夫, 新井 博之, 城 宜嗣
    • Organizer
      日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Function and regulation of multiple terminal oxidases for aerobic respiration in Pseudomonas aeruginosa2015

    • Author(s)
      新井 博之
    • Organizer
      錯体化学会第65回討論会
    • Place of Presentation
      奈良女子大学(奈良県・奈良市)
    • Year and Date
      2015-09-21
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 緑膿菌由来一酸化窒素還元酵素組換え体の調製と変異体解析2015

    • Author(s)
      山際 来佳, 澤井 仁美, 當舎 武彦, 中村 寛夫, 新井 博之, 城 宜嗣
    • Organizer
      第15回日本蛋白科学会年会
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島県・徳島市)
    • Year and Date
      2015-06-21
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2018-03-28  

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