核内足場クロマチン構造を介したncRNA, IPWの作動機序の解明
Publicly Offered Research
| Project Area | Neo-taxonomy of noncoding RNAs |
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| Project/Area Number |
15H01470
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
堀家 慎一 金沢大学, 学際科学実験センター, 准教授 (40448311)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2016)
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| Budget Amount *help |
¥8,840,000 (Direct Cost: ¥6,800,000、Indirect Cost: ¥2,040,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2015: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
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| Keywords | ノンコーディングRNA / エピジェネティクス / クロマチン / 核マトリクス / ncRNA / インプリンティング / 核内構造 / ゲノムインプリンティング / クロマチン構造 / DNA-FISH |
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| Outline of Annual Research Achievements |
現在までに10,000種類にも及ぶノンコーディングな転写産物が同定されているが，これらの分子群が遺伝子の数だけでは説明できないヒトのもつ多様性や複雑さを生み出すための巧妙な遺伝子発現制御を担っている可能性が示唆されている。ノンコーディングな転写産物の中でもmiRNAやpiRNAなどのsmall RNAはこれまでの精力的な研究によりその作用機序が詳細に明らかにされているのに対し，200nt以上の長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)と呼ばれる分子群の作用機序については，未だ不明な点が数多く存在する。最近の研究から核マトリクス(MAR)結合タンパク質，SATB1やhnRNP U/SAF-Aを介したlncRNAの作用機序が提唱され，lncRNAの局所的な染色体領域へ作用には何らかの足場構造(核マトリクス)なるものが関与している可能性が強く示唆された。我々は，15q11-q13領域のゲノムインプリンティングの発現制御機構を解析する中で，インプリンティングセンターから転写されるncRNA，SNORD116HGが周囲の脱凝集したクロマチンを足場に，IC から1Mb離れたMAGEL2, NDN遺伝子領域の核内配置の制御に関わっていることを明らかにしてきた。非常に興味深いことに， Satb1欠損細胞株において，15q11-q13領域のクロマチン脱凝集はコンパクトになり，且つMAGEL2, NDN遺伝子の発現も低下した。つまり，ncRNA，SNORD116HGはSatb1により作り出された脱凝集したクロマチンを足場に遠位のMAGEL2, NDN遺伝子領域作用している可能性が示唆された。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(26 results)
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[Journal Article] Cumulative Impact of Polychlorinated Biphenyl and Large Chromosomal Duplications on DNA Methylation, Chromatin, and Expression of Autism Candidate Genes.2016
Author(s)
Dunaway KW, Islam MS, Coulson RL, Lopez SJ, Vogel Ciernia A, Chu RG, Yasui DH, Pessah IN, Lott P, Mordaunt C, Meguro-Horike M, Horike SI, Korf I, LaSalle JM.
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Journal Title
Cell Report
Volume: 17
Issue: 11
Pages: 3035-3048
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Oxytocin for Male Subjects with Autism Spectrum Disorder and Comorbid Intellectual Disabilities: A Randomized Pilot Study2016
Author(s)
Toshio Munesue, Hiroyuki Nakamura, Mitsuru Kikuchi, Yui Miura, Noriyuki Takeuchi, Tokie Anme, Eiji Nanba, Kaori Adachi, Kiyotaka Tsubouchi, Yoshimichi Sai, Ken-ichi Miyamoto, Shin-ichi Horike, Shigeru Yokoyama, Hideo Nakatani, Yo Niida, Hirotaka Kosaka, Yoshio Minabe and Haruhiro Higashida
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Journal Title
Frontiers in Psychiatry
Volume: 7-2
Pages: 2-2
DOI
NAID
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Functional Investigation of a Non-coding Variant Associated with Adolescent Idiopathic Scoliosis in Zebrafish: Elevated Expression of the Ladybird Homeobox Gene Causes Body Axis Deformation.2016
Author(s)
Guo, L., Yamashita, H., Kou, I., Takimoto, A., Meguro-Horike, M., Horike, S., Adachi, T., Ikegawa, S., Hiraki, Y., Shukunami, C.
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Journal Title
Plos Genetics
Volume: 12
Issue: 1
Pages: e1005802-e1005802
DOI
NAID
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] 新規分子標的、ミトコンドリア内代謝酵素MTHFD2の機能解析2016
Author(s)
西村建徳, 中田飛鳥, 堀家慎一, 齋藤香織, 加藤啓子, 五十嵐香織, 河野晋, 高橋智聡, 曽我朋義, 東條有伸, 後藤典子
Organizer
第39回日本分子生物学会年会
Place of Presentation
パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
Year and Date
2016-11-30
Related Report
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[Presentation] Dependence on the mitochondrial MTHFD2-mediated purine synthetic pathway in lung cancer2016
Author(s)
T.Nishimura, A.Nakata, S.Horike, K.Saitoh, K.Kato, K.Igarashi, S.Kohno, C.Takahashi, T.Soga, A.Tojo, N.Gotoh
Organizer
The 39th Annual meeting of the Molecular Biology Society of Japan
Place of Presentation
パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
Year and Date
2016-11-30
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