過渡的に形成されるDNA結合タンパク質多量体の動的構造の蛍光1分子イメージング
Publicly Offered Research
| Project Area | Novel measurement techniques for visualizing 'live' protein molecules at work |
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| Project/Area Number |
15H01648
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Complex systems
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| Research Institution | The Graduate School for the Creation of New Photonics Industries |
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Principal Investigator |
横田 浩章 光産業創成大学院大学, 光産業創成研究科, 准教授 (90415547)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2016)
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| Budget Amount *help |
¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2015: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
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| Keywords | タンパク質・核酸の構造・動態・機能 / 蛍光1分子イメージング / 磁気共鳴 / ナノ計測 / １分子計測(SMD) / ナノバイオ / 核酸 / 酵素反応 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
DNA複製・修復・組み換えは、種の遺伝的連続性を保証する最も重要な機構である。これまで、これらの機構に関与する数々のタンパク質の同定と構造解析がなされ、詳細な生化学的解析に基づいて反応機構のモデルが提唱されてきた。一方、実際これらのタンパク質が機能する多数のサブユニットからなる複合体の3次元構造やダイナミクスに迫ること困難なこともあり、様々なタンパク質分子の相互作用ダイナミクスについては不明な点が多く残されている。
そのダイナミックなプロセスの理解には、直接タンパク質が機能している現場を可視化することが鍵となると考え、これまでDNA結合タンパク質1分子を直接イメージングしてきた。大腸菌のDNA修復機構で機能する非六量体型ヘリカーゼUvrDについては、単量体ではなく二量体あるいは三量体でDNAを巻き戻していることを明らかにしている。本研究では、このヘリカーゼがDNAを巻き戻す際に形成する過渡的な多量体の動的構造を蛍光1分子イメージングで解明することを目指している。
平成28年度は、UvrDの多量体のタンパク質－タンパク質間相互作用の構造ダイナミクスとDNA巻き戻し活性の関係を探るために、UvrD間の1分子FRET観察を継続した。また、C末のアミノ酸を欠如させた変異体を発現・精製し、その間の1分子FRETも観察した。さらに、野生型のUvrDに存在する6つのシステイン残基をアラニンに置換した変異体を作製した。このシステインフリー変異体から任意の部位にシステイン残基をもつUvrDを作製することができる。また、UvrDの多量体構造の光検出磁気共鳴（ODMR）による解明に向けて、蛍光ダイヤモンドナノ粒子の表面修飾、ビオチン化UvrDの部位特異的蛍光標識、ビオチン－アビジン系を利用したUvrDの蛍光ダイヤモンドナノ粒子標識を行った。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(6 results)
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[Journal Article] A Simple Method for Ion Channel Recordings Using Fine Gold Electrode2016
Author(s)
Okuno, D., Hirano, M., Yokota, H., Onishi, Y., Ichinose, J., Ide, T.
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Journal Title
Analytical Sciences
Volume: 32
Issue: 12
Pages: 1353-1357
DOI
NAID
ISSN
0910-6340, 1348-2246
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Synergistic effect of ATP for RuvA-RuvB-Holliday junction DNA complex formation.2015
Author(s)
Iwasa, T., Han, Y. W., Hiramatsu, R., Yokota, H., Nakao, K., Yokokawa, R., Ono, T., Harada, Y.
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 5
Issue: 1
Pages: 18177-18177
DOI
NAID
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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