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精神遅滞関連蛋白質PQBP-1の揺らぎと機能の解明

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
Project/Area Number 23107710
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

水口 峰之  富山大学, 大学院医学薬学研究部(薬学), 教授 (30332662)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2012: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywordsタンパク質 / 天然変性タンパク質 / 天然変性蛋白質 / ポリグルタミン / NMR
Outline of Annual Research Achievements

PQBP-1の変異体を蛍光小分子であるFlAsHでラベルするために、PQBP-1のN末端側にHisタグとテトラシステインモチーフ (Cys-Cys-Pro-Gly-Cys-Cys)を付加した。変異体は98-192欠損変異と82-222欠損変異の2種類準備した。PQBP-1のWWドメインに結合すると予想される9~12残基のペプチドをGST融合タンパク質として発現・精製した。ペプチドは、GRAPPRYGS, GTSPSYSPG, PPGPPPRGPPPP, PRLLPPGPPPGRの4種類である。これらのGST融合タンパク質とFlAsH標識PQBP-1との結合を蛍光偏光解消法で調べた。さらに、FlAsH標識PQBP-1とU5-15kDの結合も同様の方法で調べた。
また、PQBP-1とU5-15kDとの結合を表面プラズモン共鳴法によって調べた。野生型PQBP-1では、U5-15kDとの結合の解離定数が0.02 mMであった。さらに、PQBP-1の変異体(K223D, K228D, F240D, Y245D, Y245A, P248D, P248A, V251D, V251A, L252D, L252A, R253D, R253A, N255D, N255A, E257A, R260D, K262D, R260A, D265R, E257A/D265R)についても同様に調べた。その結果、PQBP-1のY245D, P248D, V251D, L252D, L252A変異体はU5-15kDに結合しなかった。また、Y245A, P248A, V251A, R253D, N255Dでは、解離定数が0.38~0.87 mMであり、結合が弱くなった。以上の結果から、PQBP-1のY245, P248, V251, L252が、U5-15kDとの結合に最も重要な残基であることがわかった。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Structural Study of Polyglutamine Tract-binding Protein 12013

    • Author(s)
      Mizuguchi, M., Okazawa, H.
    • Journal Title

      YAKUGAKU ZASSHI

      Volume: 133 Issue: 5 Pages: 519-526

    • DOI

      10.1248/yakushi.13-00001-2

    • NAID

      130003361945

    • ISSN
      0031-6903, 1347-5231
    • Year and Date
      2013-05-01
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hydrogen-bond network and pH sensitivity in transthyretin : neutron crystal structure of human transthyretin2012

    • Author(s)
      Yokoyama, T., et al
    • Journal Title

      Journal of Structural Biology

      Volume: 177 Pages: 283-290

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 天然変性蛋白質PQBP1のセグメント標識2012

    • Author(s)
      水口峰之,鍋島裕子
    • Organizer
      第51回NMR討論会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2012-11-08
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ポリグルタミン結合タンパク質の構造生物学的研究2012

    • Author(s)
      水口峰之
    • Organizer
      日本薬学会第132年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-29
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-12012

    • Author(s)
      Mizuguchi M.
    • Organizer
      9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR
    • Place of Presentation
      Hokkaido University(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-16
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Dynamic structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-12012

    • Author(s)
      Mizuguchi M.
    • Organizer
      4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences, Experiments and Simulations
    • Place of Presentation
      Cultural Center of Todaiji-Temple(招待講演)
    • Year and Date
      2012-01-11
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 精神遅滞の原因タンパク質PQBP-1の構造と機能2011

    • Author(s)
      水口峰之
    • Organizer
      第21回WSフォーラムタンパク質・ペプチド研究の現状と展望
    • Place of Presentation
      九州大学(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-19
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 天然変性蛋白質PQBP-1の動的な構造変化2011

    • Author(s)
      水口峰之
    • Organizer
      物理学会2011年秋季大会
    • Place of Presentation
      富山大学(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-22
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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