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細胞時計を模倣した周期的遺伝子発現システムの構築

Publicly Offered Research

Project AreaSynthetic biology for the comprehension of biomolecular networks
Project/Area Number 24119507
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

今西 未来  京都大学, 化学研究所, 助教 (80362391)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥14,040,000 (Direct Cost: ¥10,800,000、Indirect Cost: ¥3,240,000)
Fiscal Year 2013: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2012: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Keywords遺伝子発現 / 概日時計 / 人工転写因子
Research Abstract

遺伝子の発現振動は様々な遺伝子に見られ、転写翻訳におけるフィードバック制御の重要性が示唆されているが、転写因子のDNA結合と遺伝子発現振動との分子レベルでの関係は、未だ明らかではない。人工的に周期的発現を生み出すことができれば、遺伝子発現の振動メカニズムを解明するための新しい方法になると考えられる。前年度までに、代表的なDNA結合ドメインとして知られるジンクフィンガードメインと時計タンパク質として知られるBMAL1およびCLOCKタンパク質を用いて人工転写因子を作製し、哺乳細胞において、通常発現振動を起こさない遺伝子に対しても、リズミックな遺伝子発現を誘起することに成功した。また、転写因子のDNA結合親和性が振幅に影響を与えることを示唆する結果を得た。これらの知見を利用し、より大きな振幅を与えるシステムの構築に取り組んだ。ジンクフィンガーを用いたフィードバック回路の追加を試みた結果、抑制因子の発現と分解のバランスや発現のタイミングが振動発現の誘起には重要であることが示唆された。また、ジンクフィンガー以外のDNA結合ドメインを導入した人工転写因子を作製したが、十分な振幅を得ることができなかった。この結果は、転写複合体構造の安定性も発現振動の重要な要素になることを示唆している。一方、時計タンパク質に変異を導入してジンクフィンガーを用いた人工転写因子の標的DNA配列選択性を向上させたところ、より大きな振幅を生み出すことができた。人工システムを用いて得られたこれらの結果は、発現振動を理解するために重要な知見を与えるものである。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Creating a TALE Protein with Unbiased 5'-T Binding2013

    • Author(s)
      Tsuji, S.; Futaki, S.; Imanishi, M.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 441 Issue: 1 Pages: 262-265

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.10.060

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of a rhythm transfer system that mimics the cellular clock2012

    • Author(s)
      Miki Imanishi, Kazutoshi Yamamoto, Hiroyuki Yamada, Yuka Hirose, Hitoshi Okamura, and Shiroh Futaki
    • Journal Title

      ACS Chem. Biol

      Volume: 7 Issue: 11 Pages: 1817-1821

    • DOI

      10.1021/cb300432s

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design of artificial DNA binding proteins toward control and elucidation of cellular functions2012

    • Author(s)
      Imanishi M
    • Journal Title

      Yakugaku Zasshi

      Volume: 132 Pages: 1431-1436

    • NAID

      130002489524

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Control of circadian rhythms by artificial transcription factors

    • Author(s)
      Imanishi, M.
    • Organizer
      Molecular Clock 2014
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 人工タンパク質による概日振動発現の誘起

    • Author(s)
      今西未来、山本和俊、二木史朗
    • Organizer
      日本薬学会第134年会
    • Place of Presentation
      熊本市総合体育館(熊本市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工転写因子による概日リズムの操作

    • Author(s)
      今西未来、中村篤史、土居雅夫、二木史朗、岡村均
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Control of cellular circadian clock by artificial transcription factors

    • Author(s)
      Imanishi, M.; Nakamura, A.; Yamamoto, K.; Okamura, H.; Futaki, S.
    • Organizer
      国際ケミカルバイオロジー学会(ICBS)第2回年会(ICBS2013)
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工DNA結合タンパク質による概日リズムの操作

    • Author(s)
      今西未来、中村篤史、土居雅夫、岡村均、二木史朗
    • Organizer
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工転写因子を用いた細胞分子時計の操作

    • Author(s)
      今西未来
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 人工DNA結合蛋白質による細胞分子時計の操作

    • Author(s)
      今西未来、中村篤史、山本和俊、土居雅夫、岡村均、二木史朗
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会5.0
    • Place of Presentation
      東京工業大学すずかけ台キャンパス(横浜市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Control of cellular circadian phase by an artificial zinc-finger transcription factor

    • Author(s)
      Imanishi M, Nakamura A, Doi M, Okamura H, Futaki S
    • Organizer
      ISNAC2012 第39回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ジンクフィンガーモチーフを用いた人工転写因子の創製と応用

    • Author(s)
      今西未来
    • Organizer
      ナノバイオ研究会
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(名古屋市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Resetting the cellular circadian clock by an artificial zinc-finger transcription factor

    • Author(s)
      Imanishi M, Nakamura A, Doi M, Okamura H, Futaki S
    • Organizer
      FASEB SCIENCE RESEARCH CONFERENCES Genome Engineering: Research & Applications
    • Place of Presentation
      Lucca, Italy
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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