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ユビキチンによるタンパク質翻訳後修飾のダイナミクス

Publicly

Project AreaNew aspect of the ubiquitin system : its enormous roles in protein regulation
Project/Area Number 25112507
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

紺野 宏記  金沢大学, バイオAFM先端研究センター, 准教授 (80419267)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2014: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywords高速原子間顕微鏡 / ユビキチン / 1分子観察 / ユビキチン修飾 / 高速原子間力顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

ユビキチン化関連酵素の中でも実際にタンパク質にユビキチンを付加する役割を担っているE3のドメイン部分の高速AFM観察を行い、構造生物学的手法により予想されていた大きな構造変化をリアルタイムで検証することに成功した。これはE3のドメイン部分の構造変化をリアルタイムで観察した最初の事例である。さらに、ユビキチン化に必須な各種酵素の構造変化と集合・解離のダイナミクス、及び、それに伴う基質タンパク質のポリユビキチン鎖の伸長反応の高速AFM観察に取り組んだ。この過程で、複数のタンパク質のうち特定のタンパク質のみを選択的に基板上に固定化する必要が生じたため、アビジンとビオチンの強い結合親和性を利用した基盤修飾方法を確立した。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report

Research Products

(9 results)

All 2018 2014 2013

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] Next-generation sequencing-based analysis of reverse transcriptase fidelity.2018

    • Author(s)
      Jin, Y., Kato, T., Furu, M., Nasu, A., Kajita, Y., Mitsui, H., Ueda, M., Aoyama, T., Nakayama, T., Nakamura, T. and Toguchida, J.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 391 Pages: 1259-1264

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Distinct redox behaviors of chloroplast thiol enzymes and their relationships with photosynthetic electron transport in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Yoshida K, Matsuoka Y, Hara S, Konno H, Hisabori T.
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 55 Pages: 1415-1425

    • DOI
      10.1093/pcp/pcu066
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Common evolutionary origin for the rotor domain of rotary ATPases and Flagellar protein exort apparatus.2013

    • Author(s)
      Kishikawa, J., et al
    • Journal Title

      PLos One

      Volume: 8 Pages: 64692013-64692013

    • DOI
      10.1371/journal.pone.0064695
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The chloroplast ATP synthase features the characteristic redox regulation machinery2013

    • Author(s)
      Toru Hisabori
    • Journal Title

      T. Hisabori, E. Sunamura, Y. Kim, H. Konno

      Volume: 19 Pages: 1846-1854

    • DOI
      10.1089/ars.2012.5044
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Sec タンパク質膜透過装置の活写にむけて2014

    • Author(s)
      塚崎 智也、春山 隆充、菅野 泰功、田中 良樹、紺野 宏記
    • Organizer
      第41回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 葉緑体チオール酵素の in vivo レドックス状態に影響を与える因子の探索2014

    • Author(s)
      松岡裕太,吉田啓亮,紺野宏記,久堀徹
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学 五福キャンパス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Investigation of hPrx2 oligomerization process by high-speed AFM2013

    • Author(s)
      Takamitsu Haruyama, Noriyuki Kodera, Hiroki Konno
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Real-time observation of amyloid fibril formation of yeast prion Sup35 by high-speed atomic force microscopy2013

    • Author(s)
      Liwen Zhu, Hiroki Konno, Momoko Okuda, Noriyuki Kodera, Toshio Ando, Hideki Taguchi
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 葉緑体ATP合成酵素の活性調節機構2013

    • Author(s)
      紺野宏記
    • Organizer
      北陸植物学会2013年度北陸地区インターキャンパスセミナー
    • Place of Presentation
      金沢大学サテライト・プラザ
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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