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細胞時計同調の包括的理解と人為的制御のための人工入力系の構築

Publicly Offered Research

Project AreaSynthetic biology for the comprehension of biomolecular networks
Project/Area Number 26119709
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

今西 未来  京都大学, 化学研究所, 講師 (80362391)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥13,650,000 (Direct Cost: ¥10,500,000、Indirect Cost: ¥3,150,000)
Fiscal Year 2015: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Fiscal Year 2014: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
KeywordsDNA結合タンパク質 / 概日時計
Outline of Annual Research Achievements

概日時計システムは、生体分子ネットワークが生み出す振動現象を理解し、人工遺伝子回路構築といった合成生物学分野へ応用するためのモデルとして極めて重要である。概日時計システムの発振系のメカニズムの解明が進む一方で、哺乳細胞時計が外的環境に応答して位相を双方向にシフトさせる同調機構に関する情報は不足している。本研究では、高い標的選択性を有する人工転写因子を設計し、これを用いて同調機構を理解することを目的とした。
本年度は、DNA結合蛋白質として知られるジンクフィンガーを用いて、時計遺伝子プロモーターに選択的に結合し、任意のタイミングで機能を発揮するスイッチ型人工転写因子の作製を行い、これらのジンクフィンガー型人工転写因子の誘導量と細胞の概日時計の位相シフト量との関係に関して検討した。まず、転写活性化ドメインの影響を調べるため、種々の転写活性化ドメインをジンクフィンガーに融合し、プロモーター活性を示すドメインの選択を行った。また、レポーターアッセイによって、その人工転写因子が高いDNA結合配列選択性を有することを確認した。さらに、この人工転写因子の細胞内蓄積量をリガンド添加量によって調節できることを確認した。概日時計振動周期における様々なタイミングでリガンドを添加したところ、リガンド添加のタイミングによって、位相を前後にシフトさせることが可能なこと、またリガンド濃度に応じて位相シフトの変化量が変わることを明らかにした。血清やホルモンなど、従来用いられてきた同調刺激が様々な遺伝子に作用してしまうのに対し、本結果は、単一の時計遺伝子の活性化が細胞時計の位相シフトを誘起し得ることを示唆している。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2016 2015 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] 細胞概日時計の人為的制御2016

    • Author(s)
      今西未来
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: in press

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Design of Artificial DNA Binding Proteins towards Manipulation of Cellular Functions2015

    • Author(s)
      Miki Imanishi
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Design of artificial DNA binding proteins towards manipulation of biological rhythms2015

    • Author(s)
      Miki Imanishi
    • Organizer
      RNA & CLOCK 2015
    • Place of Presentation
      淡路市
    • Year and Date
      2015-03-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 遺伝子発現リズムを操る人工タンパク質の創製2014

    • Author(s)
      今西 未来
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会7.0
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2014-11-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Control of the circadian clock by artificial transcription factors2014

    • Author(s)
      Miki Imanishi
    • Organizer
      3rd Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium
    • Place of Presentation
      Bern (Switzerland)
    • Year and Date
      2014-10-03
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Manipulation of the cellular clock using artificial transcription factors2014

    • Author(s)
      Miki Imanishi
    • Organizer
      FASEB SRC "Genome engineering: Cutting-edge research and application"
    • Place of Presentation
      Nassau (Bahamas)
    • Year and Date
      2014-06-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-28  

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