「リポクオリティ」領域研究の国際連携

• 研究領域: 脂質クオリティが解き明かす生命現象
• 研究課題/領域番号: 15K21738
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 有田 誠 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (80292952)
• 研究分担者: 有田 正規 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (10356389)
• 研究期間 (年度): 2015-11-06 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 66,820千円 (直接経費: 51,400千円、間接経費: 15,420千円); 2019年度: 14,690千円 (直接経費: 11,300千円、間接経費: 3,390千円); 2018年度: 14,690千円 (直接経費: 11,300千円、間接経費: 3,390千円); 2017年度: 14,690千円 (直接経費: 11,300千円、間接経費: 3,390千円); 2016年度: 14,690千円 (直接経費: 11,300千円、間接経費: 3,390千円); 2015年度: 8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円)
• キーワード: リピドミクス / 国際連携 / 国際標準 / データベース / リポクオリティ

研究成果の概要

リポクオリティ領域の成果を日本脂質生化学会と連携したデータベースより公開し、国内外に発信した。リピドミクス領域の標準作りにも貢献し、構造の命名法や実験法の書き方について国際的ガイドラインを策定した。若手研究者を育成するために国際連携コーディネータ室を設置し、技術研修のための海外から国内拠点あるいはその逆の短期滞在（1～3ヶ月単位）の渡航支援を実施した。繰り越し年度を含む８年の支援期間に技術研修を組みあわせた国際ワークショップを２回主催し、個別の技術研修を海外から国内に17名、国内から海外に８名支援した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

国際連携コーディネータ室が渡航支援した若手研究者はワークショップ参加者を含めると全体で40名を超えており来訪元も10か国以上と多様である。本プログラムは単なる学会参加や口頭発表のみの渡航ではなく一定期間の技術研修を支援した。若手人材の国際交流という点で通常の科研費では達成しにくい国際活動を長期にわたって実現した。新型コロナウイルス感染症のためにおよそ3年間支援が中断されたものの海外の連携拠点と合同でワークショップも開催し、国内脂質研究の成果を国外に発信でき、学術的な意義も十分に達成できた。

研究成果

• [国際共同研究] National University of Singapore(シンガポール)
• [国際共同研究] National University of Singapore(シンガポール)
• [国際共同研究] Inst of Agro-Process Sci and Technol/Sichuan Academy of Agricultural Sciences/Chinese Acad of Agricult Sci(中国)
• [国際共同研究] Karolinska Institutet(スウェーデン)
• [国際共同研究] Universiti Kebangsaan Malaysia(マレーシア)
• [国際共同研究] University of Eastern Finland(フィンランド)
• [国際共同研究] National University of Singapore(シンガポール)
• [国際共同研究] Sichuan Academy of Agricultural Sciences(中国)
• [国際共同研究] Karolinska Institutet(スウェーデン)
• [国際共同研究] Universiti Kebangsaan Malaysia(マレーシア)
• [国際共同研究] University of Eastern Finland(フィンランド)
• [国際共同研究] National University of Singapore(シンガポール)
• [国際共同研究] Sichuan Academy of Agricultural Sciences(中国)
• [国際共同研究] University of California Davis(米国)
• [国際共同研究] IMBA(オーストリア)
• [国際共同研究] University of Copenhagen(デンマーク)
• [国際共同研究] University of Eastern Finland(フィンランド)
• [国際共同研究] University of Glasgow(英国)
• [国際共同研究] University of California Davis(米国)
• [国際共同研究]
• [国際共同研究] University of Milan Dept. of Biosciences/National Research Council of Italy(イタリア)
• [国際共同研究] Shanghai Ninth Peoples's Hospital/Shanghai Jiao Tong University(中国)
• [国際共同研究] IMBA(オーストリア)
• [雑誌論文] Introducing the Lipidomics Minimal Reporting Checklist (2022)
  • 著者名/発表者名: McDonald Jeffrey G.、Ejsing Christer S.、Kopczynski Dominik、他29名
  • 雑誌名: Nature Metabolism 巻: 4 号: 9 ページ: 1086-1088
  • DOI: 10.1038/s42255-022-00628-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A lipidome atlas in MS-DIAL 4 (2020)
  • 著者名/発表者名: Tsugawa Hiroshi、Ikeda Kazutaka、Takahashi Mikiko、Satoh Aya、Mori Yoshifumi、Uchino Haruki、Okahashi Nobuyuki、Yamada Yutaka、Tada Ipputa、Bonini Paolo、Higashi Yasuhiro、Okazaki Yozo、Zhou Zhiwei、Zhu Zheng-Jiang、Koelmel Jeremy、Cajka Tomas、Fiehn Oliver、Saito Kazuki、Arita Masanori、Arita Makoto
  • 雑誌名: Nature Biotechnology 巻: 38 号: 10 ページ: 1159-1163
  • DOI: 10.1038/s41587-020-0531-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Elucidation of Gut Microbiota-Associated Lipids Using LC-MS/MS and 16S rRNA Sequence Analyses (2020)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Shu、Okahashi Nobuyuki、Tsugawa Hiroshi、Ogata Yusuke、Ikeda Kazutaka、Suda Wataru、Arai Hiroyuki、Hattori Masahira、Arita Makoto
  • 雑誌名: iScience 巻: 23 号: 12 ページ: 101841-101841
  • DOI: 10.1016/j.isci.2020.101841
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A lipidome atlas in MS-DIAL 4 (2020)
  • 著者名/発表者名: Tsugawa H, Ikeda K, Takahashi M, Satoh A, Mori Y, Uchino H, Okahashi N, Yamada Y, Tada I, Bonini P, Higashi Y, Okazaki Y, Zhou Z, Zhu Z, Koelmel J, Cajka T, Fiehn O, Saito K, Arita M, Arita M.
  • 雑誌名: Nature Biotechnology 巻: in press
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsugawa Hiroshi、Nakabayashi Ryo、Mori Tetsuya、Yamada Yutaka、Takahashi Mikiko、Rai Amit、Sugiyama Ryosuke、Yamamoto Hiroyuki、Nakaya Taiki、Yamazaki Mami、Kooke Rik、Bac-Molenaar Johanna A.、Oztolan-Erol Nihal、Keurentjes Joost J. B.、Arita Masanori、Saito Kazuki
  • 雑誌名: Nature Methods 巻: 16 号: 4 ページ: 295-298
  • DOI: 10.1038/s41592-019-0358-2
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Lipidomics needs more standardization (2019)
  • 著者名/発表者名: Lipidomics Standards Initiative Consortium
  • 雑誌名: Nature Metabolism 巻: 1 号: 8 ページ: 745-747
  • DOI: 10.1038/s42255-019-0094-z
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Creating a Reliable Mass Spectral-Retention Time Library for All Ion Fragmentation-Based Metabolomics (2019)
  • 著者名/発表者名: Tada Ipputa、Tsugawa Hiroshi、Meister Isabel、Zhang Pei、Shu Rie、Katsumi Riho、Wheelock Craig E.、Arita Masanori、Chaleckis Romanas
  • 雑誌名: Metabolites 巻: 9 号: 11 ページ: 251-251
  • DOI: 10.3390/metabo9110251
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Mass Spectrometry Data Repository Enhances Novel Metabolite Discoveries with Advances in Computational Metabolomics (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsugawa Hiroshi、Satoh Aya、Uchino Haruki、Cajka Tomas、Arita Makoto、Arita Masanori
  • 雑誌名: Metabolites 巻: 9 号: 6 ページ: 119-119
  • DOI: 10.3390/metabo9060119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] MS-based lipidomics of human blood plasma: a community-initiated position paper to develop accepted guidelines (2018)
  • 著者名/発表者名: Burla Bo、Arita Makoto、Arita Masanori et al.
  • 雑誌名: Journal of Lipid Research 巻: 59 号: 10 ページ: 2001-2017
  • DOI: 10.1194/jlr.s087163
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identifying metabolites by integrating metabolome databases with mass spectrometry cheminformatics (2017)
  • 著者名/発表者名: Lai Z, Tsugawa H, Wohlgemuth G, Mehta S, Mueller M, Zheng Y, Ogiwara A, Meissen J, Showalter M, Takeuchi K, Kind T, Beal P, Arita M, Fiehn O
  • 雑誌名: Nature Methods 巻: 15 号: 1 ページ: 53-56
  • DOI: 10.1038/nmeth.4512
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of small molecules using accurate mass MS/MS search (2017)
  • 著者名/発表者名: Kind T, Tsugawa H, Cajka T, Ma Y, Lai Z, Mehta SS, Wohlgemuth G, Barupal DK, Showalter MR, Arita M, Fiehn O
  • 雑誌名: Mass Spectrometry Reviews 巻: - 号: 4 ページ: 513-532
  • DOI: 10.1002/mas.21535
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] SPLASH, a hashed identifier for mass spectra (2016)
  • 著者名/発表者名: Wohlgemuth G, Mehta SS, Mejia RF, Neumann S, Pedrosa D, Pluskal T, Schymanski EL, Willighagen EL, Wilson M, Wishart DS, Arita M, Dorrestein PC, Bandeira N, Wang M, Schulze T, Salek RM, Steinbeck C, Nainala VC, Mistrik R, Nishioka T, Fiehn O
  • 雑誌名: Nat Biotechnol 巻: 34 号: 11 ページ: 1099-1101
  • DOI: 10.1038/nbt.3689
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Editorial: Metabolome Informatics and Statistics: Current State and Emerging Trends (2016)
  • 著者名/発表者名: Carroll AJ, Salek RM, Arita M, Kopka J, Walther D
  • 雑誌名: Front Bioeng Biotechnol 巻: 4 ページ: 63-63
  • DOI: 10.3389/fbioe.2016.00063
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Data standards can boost metabolomics research, and if there is a will, there is a way (2016)
  • 著者名/発表者名: Rocca-Serra P, Salek RM, Arita M, Correa E, Dayalan S, Gonzalez-Beltran A, Ebbels T, Goodacre R, Hastings J, Haug K, Koulman A, Nikolski M, Oresic M, Sansone SA, Schober D, Smith J, Steinbeck C, Viant MR, Neumann S
  • 雑誌名: Metabolomics 巻: 12 号: 1 ページ: 14-14
  • DOI: 10.1007/s11306-015-0879-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] Advanced lipidomics technology reveals the biology of lipid diversity and disease control (2023)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: 11th International Singapore Lipid Symposium (iSLS11)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Development of the platform for C=C position-resolved untargeted lipidomics using oxygen attachment dissociation and spatial lipidomics using MALDI-MS imaging (2023)
  • 著者名/発表者名: Haruki Uchino
  • 学会等名: NUS-CSRS Joint Workshop on LipoQuality
  • 国際学会
• [学会発表] Comprehensive analysis of IBD-associated microbial lipids by untargeted lipidomics (2023)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Morozumi
  • 学会等名: NUS-CSRS Joint Workshop on LipoQuality
  • 国際学会
• [学会発表] Advanced non-targeted lipidomics and its application to vascular biology (2022)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: 10th International Singapore Lipid Symposium (iSLS10)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biology of LipoQuality: Advanced lipidomics technology and its application in biology (2020)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: 9th International Singapore Lipid Symposium (iSLS9)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cheminformatics for Predicting Structures from Mass Spectra (2019)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: 1st Annual Conference of Chinese Society of Metabolomics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Data sharing and the power of omics integration (2019)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: 6th Global Forum of Leaders for Agricultural Science and Technology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biology of LipoQuality: omega-3 fatty acid cascade that controls inflammation and tissue homeostasis (2019)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: 2nd International Conference on LipoQuality
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Database for understanding the quality of lipids (2019)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: 2nd International Conference on LipoQuality
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] The importance of LipoQuality in biological systems (2019)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: William Harvey Research Institute Seminar
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Open genome analysis in the post-genomic era (2018)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: International Workshop on Data Science
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Computational Metabolomics (2018)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: 6th Annual Korea Metabolomics Society (plenary)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Distribution of Glycosphingolipids Revealed by LipidBank (2018)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: International Life Science Integration Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] The importance of LipoQuality in biological system (2018)
  • 著者名/発表者名: Makoto Arita
  • 学会等名: 7th International Singapore Lipid Symposium 2018 (iSLS7)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Identifying Metabolites with Theoretical References (2017)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: The 26th International KOGO Annual Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Prediction of Molecular Structures from their Spectra (2017)
  • 著者名/発表者名: Masanori Arita
  • 学会等名: The 4th International Conference on Plant Metabolism (ICPM 2017)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] MS2スペクトルのフラグメンテーション解析と前駆体構造予測 (2016)
  • 著者名/発表者名: 有田 正規, 津川裕司
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会 シンポジウム「生命システムを俯瞰するための質量分析情報解析技術とデータベースの活用」
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] Comprehensive lipidomics and Mass/LipidBank databases (2015)
  • 著者名/発表者名: 有田正規
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: ポートピアホテル（兵庫・神戸）
  • 年月日: 2015-12-04
  • 招待講演
• [学会発表] Comprehensive Acquisition of MS/MS Spectra Benefits Database Research (2015)
  • 著者名/発表者名: 有田正規
  • 学会等名: 6th International Singapore Lipid Symposium
  • 発表場所: Singapore (Singapore)
  • 年月日: 2015-12-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] リポクオリティ領域ウェブサイト
  • URL: https://web.archive.org/web/20220717074457/https://sites.google.com/site/lipoqualityjpn/outline
• [備考] リポクオリティ領域HP
  • URL: https://sites.google.com/site/lipoqualityjpn/
• [備考] リエゾンオフィス・ホームページ
  • URL: https://sites.google.com/site/lipoqualityjpn/home/liaison-office
• [備考] 国際連携支援・申請ページ
  • URL: https://docs.google.com/a/nig.ac.jp/forms/d/1n3f_ozI5ICUJmFJZrGb9Ln1GsoHGZwSV1xly2M1tewA
• [備考] 国際連携支援・報告書ページ
  • URL: https://docs.google.com/forms/u/0/d/1juKXiLVPAuCmTwGt8LWOp1paaFarqS-71d7NR5G2BM0/viewform
• [備考] リポクオリティ・データベース
  • URL: http://jcbl.jp/wiki/Lipoquality:Search
• [学会・シンポジウム開催] NUS-CSRS Joint Workshop on LipoQuality (2023)
• [学会・シンポジウム開催] LipoQuality International Workshop on Lipidomics (2019)