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非コードRNA作用マシナリー

総括班

研究領域非コードRNA作用マシナリー
研究課題/領域番号 21115001
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

泊 幸秀  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90447368)

研究分担者 影山 裕二  神戸大学, 遺伝子実験施設, 准教授 (90335480)
鈴木 健夫  東京大学, 大学院工学系研究科, 講師 (90533125)
程 久美子  東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (50213327)
中澤 敬信  大阪大学, 大学院薬学研究科, 特任准教授 (00447335)
和田 猛  東京理科大学, 薬学部, 教授 (90240548)
佐渡 敬  近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)
連携研究者 塩見 美喜子  東京大学, 大学院理学系研究科, 教授 (20322745)
宮川 さとみ  大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任講師 (90291153)
中川 真一  独立行政法人理化学研究所, 中川RNA 生物学研究室, 准主任研究員 (50324679)
竹下 文隆  独立行政法人国立がんセンター, 分子細胞治療研究分野, 主任研究員 (40466199)
小田 健昭  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 研究員 (00608523)
山下 暁朗  横浜市立大学, 医学部, 講師 (20405020)
西村 教子  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 特任助教 (30514567)
研究期間 (年度) 2009-07-23 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
キーワード遺伝子 / 発現制御 / 核酸 / 蛋白質 / ゲノム
研究実績の概要

H21~25年度の新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」領域からは非コードRNA動作原理に関する優れた研究成果が多数生み出され、本領域はホームページや雑誌企画、ワークショップ、一般向けのプレスリリースなど、外部に対して積極的に情報を発信し、得られた研究成果を社会に還元するように努めてきた。これまで、当該分野で顕著な成果を上げている海外の研究者と共に国際シンポジウムを開催することで、国際的にもこの分野を牽引する日本の非コードRNA研究を世界に向けて発信してきた。平成26年度の本研究取りまとめにおいては、過去の実績を踏まえ、本領域の研究期間である5年間を通して得られた研究成果を取りまとめ、その全体像を当該学問領域のみならず、一般国民に分かりやすく還元すると共に情報の発信を継続することを目的として下記の計画を遂行した。
①本分野をリードする著名な海外の研究者を第37回日本分子生物学会年会シンポジウムおよびワークショップに招聘するとともに、本領域主催の「非コードRNA作用マシナリー」をテーマとした国際シンポジウムの開催し、領域の研究成果を国内外に発信すると共に海外の研究者との情報交換を強化した。②領域の研究成果を広く社会・国民に発信するためのアウトリーチ活動の一環として、領域班員がRNA関連研究を伝える活動を地域の教育・研究機関で行った。③領域の研究成果や上記イベント等を広報するために、引き続きncrna.jpドメインを維持し、ホームページやブログを継続公開・更新した。④研究成果をわかりやすくまとめた成果報告書を作成し、本領域外の科学分野面にも広く配布した。
以上のように、本領域の研究成果を当該分野のみならず、広く一般国民に還元することができたと考える。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(7件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2014 2013 2012 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 20件) 備考 (6件)

  • [雑誌論文] Elements and machinery of non-coding RNAs : toward their taxonomy2014

    • 著者名/発表者名
      Hirose T, Mishima Y, Tomari Y.
    • 雑誌名

      EMBO Rep

      巻: 15(5) ページ: 489-507

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear lncRNAs as epigenetic regulators-beyond skepticism2014

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa S, Kageyama Y.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta

      巻: 39(3) ページ: 215-222

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Making piRNAs in vitro2014

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Katsuma S, Tomari Y.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 1093 ページ: 35-46

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hsp90 facilitates accurate loading of precursor piRNAs into PIWI proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Kawaoka S, Yasuhara S, Suzuki Y, Sugano S, Katsuma S, Tomari Y.
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 19(7) ページ: 896-901

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The comprehensive epigenome map of piRNA clusters2013

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Hara K, Shoji K, Kobayashi M, Shimada T, Sugano S, Tomari Y, Suzuki Y, Katsuma S
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 41(3) ページ: 1581-1590

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Targeted gene silencing in mouse germ cells by insertion of a homologous DNA into a piRNA generating locus2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Y, Watanabe T, Hoki Y, Shirane K, Li Y, Ichiiyanagi K, Kuramochi-Miyagawa S, Toyoda A, Fujiyama A, Oginuma M, Suzuki H, Sado T, Nakano T, Sasaki H
    • 雑誌名

      Genome Res

      巻: 23(2) ページ: 292-299

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and function of Zucchini endoribonuclease in piRNA biogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimasu H, Ishizu H, Saito K, Fukuhara S, Kamatani MK, Bonnefond L, Matsumoto N, Nishizawa T, Nakanaga K, Aoki J, Ishitani R, Siomi H, Siomi MC, Nureki O
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 491(7423) ページ: 284-287

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A role for transcription from a piRNA cluster in de novo piRNA production2012

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Mitsutake H, Kiuchi T, Kobayashi M, Yoshikawa M, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Kobayashi J, Tomari Y, Katsuma S
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 18(2) ページ: 265-273

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish2012

    • 著者名/発表者名
      Mishima Y, Fukao A, Kishimoto T, Sakamoto H, Fujiwara T, Inoue K
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 109(4) ページ: 1104-1109

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA and epigenetic silencing : insight from fission yeast2012

    • 著者名/発表者名
      Goto DB, Nakayama J.
    • 雑誌名

      Dev Growth Differ

      巻: 54(1) ページ: 129-141

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The silkworm W chromosome is a source of female-enriched piRNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Kadota K, Arai Y, Suzuki Y, Fujii T, Abe H, Yasukochi Y, Mita K, Sugano S, Shimizu K, Tomari Y, Shimada T, Katsuma S
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 17(12) ページ: 2144-2151

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 3' end formation of PIWI-interacting RNAs in vitro2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Izumi N, Katsuma S, Tomari Y
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 43(6) ページ: 1015-1022

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Zygotic amplification of secondary piRNAs during silkworm embryogenesis2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Arai Y, Kadota K, Suzuki Y, Hara K, Sugano S, Shimizu K, Tomari Y, Shimada T, Katsuma S
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 17(7) ページ: 1401-1407

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role for piRNAs and noncoding RNA in de novo DNA methylation of the imprinted mouse Rasgrf1 locus2011

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Tomizawa S, Mitsuya K, Totoki Y, Yamamoto Y, Kuramochi-Miyagawa S, Iida N, Hoki Y, Murphy PJ, Toyoda A, Gotoh K, Hiura H, Arima T, Fujiyama A, Sado T, Shibata T, Nakano T, Lin H, Ichiyanagi K, Soloway PD, Sasaki H
    • 雑誌名

      Science

      巻: 332 ページ: 848-852

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MITOPLD is a mitochondrial protein essential for nuage nuage formation and piRNA buigenesis in the mouse germline2011

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Chuma S, Yamamoto Y, Kuramochi-Miyagawa S, Totoki Y, Toyoda A, Hoki Y, Fujiyama A, Shibata T, Sado T, Noce T, Nakano T, Nakatsuji N, Lin H, Sasaki H
    • 雑誌名

      Dev Cell

      巻: 23 ページ: 364-375

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hsc70/Hsp90 chaperone machinery mediates ATP-dependent RISC loading of small RNA duplexes2010

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki S, Kobayashi M, Yoda M, Sakaguchi Y, Katsuma S, Suzuki T, Tomari Y
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 39(2) ページ: 292-299

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila2010

    • 著者名/発表者名
      Taniue K, Nishida A, Hamada F, Sugie A, Oda T, Ui-Tei K, Tabata T, Akiyama T
    • 雑誌名

      Development

      巻: 137(10) ページ: 1755-1764

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Agmatine-conjugated cytidine in a tRNA anticodon is essential for AUA decoding in archaea2010

    • 著者名/発表者名
      Ikeuchi Y, Kimura S, Numata T, Nakamura D, Yokogawa T, Ogata T, Wada T, Suzuki T, Suzuki T
    • 雑誌名

      Nat Chem Biol

      巻: 6(4) ページ: 277-282

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA silencing in germlines--exquisite collaboration of Argonaute proteins with small RNAs for germline survival2009

    • 著者名/発表者名
      Siomi MC, Kuramochi-Miyagawa S
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Cell. Biol

      巻: 21(3) ページ: 426-434

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Yb integrates piRNA intermediates and processing factors into perinuclear bodies to enhance piRISC assembly

    • 著者名/発表者名
      Murota Y, Ishizu H, Nakagawa, S, Iwasaki YW, Shibata S, Kamatani, MK, Saito K, Okano H, Siomi H and Siomi MC
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [備考] 新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」ホームページ

    • URL

      https://ncrna.jp/machinery/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」

    • URL

      http://ncrna/jp/index.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」

    • URL

      http://ncrna.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] 「非コードRNA作用マシナリー」のwebページ

    • URL

      http://ncrna.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] 「非コードRNA作用マシナリー」のwebページ

    • URL

      http://ncrna.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考] 「非コード作用マシナリー」のwebページ

    • URL

      http://ncrna.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2019-07-29  

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