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非ドメイン型バイオポリマー領域の組織運営

総括班

研究領域非ドメイン型バイオポリマーの生物学:生物の柔軟な機能獲得戦略
研究課題/領域番号 21H05273
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関北海道大学

研究代表者

中川 真一  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (50324679)

研究分担者 荒川 和晴  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 教授 (40453550)
廣瀬 哲郎  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (30273220)
尾山 大明  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (30422398)
稲田 利文  東京大学, 医科学研究所, 教授 (40242812)
甲斐 歳恵  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (40579786)
依田 隆夫  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (50367900)
伊藤 拓宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (70401164)
泊 幸秀  東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (90447368)
研究期間 (年度) 2021-09-10 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
27,950千円 (直接経費: 21,500千円、間接経費: 6,450千円)
2025年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2024年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2023年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2022年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2021年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
キーワード非ドメイン型バイオポリマー / 非ドメイン型タンパク質 / 非ドメイン型RNA / ノンコーディングRNA / 天然変性タンパク質 / 相分離 / 超天然変性タンパク質 / ゲノム編集 / lncRNA / 天然変性領域
研究開始時の研究の概要

本領域では、種間で高度に保存された一次配列や既知の機能ドメインを持たないにも関わらず重要な機能を発揮するRNAやタンパク質を非ドメイン型バイオポリマーと定義し、その生理的な役割から分子レベルの分子機構まで階層横断的な研究を進め、新たな動作原理に基づく画期的な生体制御技術を開発することを目指しています。総括班では、この研究を円滑にすすめるため、領域の班員間の交流を深めるためのイベントを開催するとともに、領域の成果をホームページやSNSなどを通じて広く一般に発信していきます。

研究実績の概要

領域の構成員同士の交流を図るため、滋賀県長浜市において領域会議を開催した。前年度までの領域会議は1泊2日であったが、より濃密な交流を促進するため、2泊3日の日程とし、交流時間を長めに確保した。また、研究代表者・分担者以外の学生やポスドクにも同伴者として参加してもらい、テーブルディスカッション形式での交流を行った。懇談会の時間も長く設定し、これまで以上に交流を深めることができた。
若手研究者支援の活動として、領域の研究内容と親和性の高い愛知県蒲郡市で開催された「RNAフロンティアミーティング」の開催支援を行った。領域からも複数名の学生が参加した。
国際連携の促進としては、日本生化学会のシンポジウムに、Ludwig-Maximilians-University MunchenのJonathan Bohlen博士、UC BerkeleyのGloria Brar博士を招聘した。また、より多くの研究者との交流の機会を設けるため、サテライトシンポジウムを開催した(理研シンポジウムとの共催)。さらに、分子生物学会のために来日した研究者を集めたサテライトシンポジウムも共催し、多くの研究者との交流の場を提供した。分子生物学会のサテライトシンポジウムには、RNAの相分離研究で顕著な業績を挙げているMITのAnkur Jain博士や、RNA結合タンパク質によるトランスポゾン由来配列の制御研究を進めているMax Planck Institute for Molecular GeneticsのTugce Aktas博士が参加した。
さらに、領域内の共同研究を促進するため、班員間の共同研究で作製された動物の飼育費や、関連研究にかかる消耗品費についても支出を行った。また、班員による関連研究集会への参加費用の補助も実施した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

領域内の共同研究は順調に進んでおり、論文として出版されたものもある。また、領域の計画研究班員が共同で執筆してGenes to Cellsに掲載された総説論文は、当該雑誌の昨年度の最も引用数の高い論文トップ10に入った。

今後の研究の推進方策

これまで通り、領域内の相互理解と研究推進を目的として、領域会議の開催、RNAフロンティアミーティングへの支援、そして海外研究者の招聘を伴う学会シンポジウムおよびサテライトシンポジウムの開催を中心に活動を展開していく予定である。特に今年度は本領域の最終年度にあたるため、これまでの活動をさらに発展させる形で、他の学術変革領域との連携も積極的に進め、より大規模でインパクトのあるサテライトシンポジウムの開催を計画している。
現時点では、変異マウスを用いたノンコーディングRNAの機能解析を進めるMontreal Clinical Research InstituteのMartin Sauvageau博士、および大規模スクリーニングにより非ドメインRNA候補を多数同定しているNew York University/New York Genome CenterのNeville Sanjana博士を招聘する計画である。シンポジウムは分子生物学会終了後に東京大学で開催し、より多くの研究者が参加しやすい環境を整える。
さらに、領域会議については、慶應義塾大学の荒川が世話人を務め、2泊3日の日程で山形県鶴岡市にて実施する計画である。前年度までと同様に、研究代表者・分担者だけでなく、若手研究者や学生・ポスドクの参加も積極的に促し、テーブルディスカッションや懇談会を通じて、階層を越えた率直な意見交換と交流を図ることで、領域内の連携をさらに強化したいと考えている。
加えて、領域内の共同研究をより円滑に進めるための支援として、班員間で行われる共同研究における動物実験に関する飼育費や、研究遂行に必要な消耗品の一部について補助を行う。また、関連する研究集会への参加に伴う旅費等についても、必要に応じて支援を行う方針である。

報告書

(4件)
  • 2024 実績報告書
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] 4.5SH RNA counteracts deleterious exonization of SINE B1 in mice2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto Rei、Nakayama Yuta、Nomura Ikuko、Yamamoto Ikuko、Nakagawa Yumeka、Tanaka Shigeyuki、Kurihara Misuzu、Suzuki Yu、Kobayashi Takehiko、Kozuka-Hata Hiroko、Oyama Masaaki、Mito Mari、Iwasaki Shintaro、Yamazaki Tomohiro、Hirose Tetsuro、Araki Kimi、Nakagawa Shinichi
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 83 号: 24 ページ: 4479-4493

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2023.11.019

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Shell protein composition specified by the lncRNA NEAT1 domains dictates the formation of paraspeckles as distinct membraneless organelles2023

    • 著者名/発表者名
      Takakuwa Hiro、Yamazaki Tomohiro、Souquere Sylvie、Adachi Shungo、Yoshino Hyura、Fujiwara Naoko、Yamamoto Tetsuya、Natsume Tohru、Nakagawa Shinichi、Pierron Gerard、Hirose Tetsuro
    • 雑誌名

      Nature Cell Biology

      巻: 25 号: 11 ページ: 1664-1675

    • DOI

      10.1038/s41556-023-01254-1

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nondomain biopolymers: Flexible molecular strategies to acquire biological functions2023

    • 著者名/発表者名
      Arakawa K, Hirose T, Inada T, Ito T, Kai T, Oyama M, Tomari Y, Yoda T, Nakagawa S.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 28 号: 8 ページ: 539-552

    • DOI

      10.1111/gtc.13050

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2021-10-22   更新日: 2025-12-26  

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