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超分子ヘモグロビンの構造とナノ組織化機構の解明

計画研究

研究課題/領域番号 16087205
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関金沢大学

研究代表者

福森 義宏  金沢大学, 自然システム学系, 教授 (60135655)

研究分担者 金森 正明  金沢大学, 自然科学研究科, 講師 (20324064)
連携研究者 沼本 修孝  京都大学, 原子炉実験所, 助教 (20378582)
研究期間 (年度) 2004 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
76,000千円 (直接経費: 76,000千円)
2009年度: 10,500千円 (直接経費: 10,500千円)
2008年度: 10,500千円 (直接経費: 10,500千円)
2007年度: 14,600千円 (直接経費: 14,600千円)
2006年度: 15,100千円 (直接経費: 15,100千円)
2005年度: 17,000千円 (直接経費: 17,000千円)
2004年度: 8,300千円 (直接経費: 8,300千円)
キーワード巨大ヘモグロビン / 立体構造 / 協同性 / 有鬚動物 / 超分子複合体 / ヘモグロビン / 環形動物 / 酸素協同性 / 金属イオン / 酸素親和性 / 酸素 / 海産無脊椎動物 / 硫化物 / ナノバイオ / 超分子 / ジスルフィド結合
研究概要

海産無脊椎動物Oligobrachia mashikoi は酸素と硫化水素を同時に運搬するという特徴的な生物学的機能を有する細胞外巨大ヘモグロビンを持つ。本研究では,分子量約45万の細胞外巨大ヘモグロビンの酸素結合型の立体構造をX線結晶構造解析により決定した.さらに,同巨大ヘモグロビンの酸素非結合型の立体構造も決定し,酸素結合型立体構造との比較により,哺乳類ヘモグロビンとは異なる酸素協同性の分子機構を提案した.

報告書

(7件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2009 2008 2007 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (28件) (うち査読あり 17件) 学会発表 (23件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Identification of iron transporters expressed in the magnetotactic bacterium Magnetospirillum magnetotucticum2009

    • 著者名/発表者名
      Taoka A.Umeyama C, Fukumori Y.
    • 雑誌名

      Curr.Microbiol. 58

      ページ: 177-181

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 巨大ヘモグロビンの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 雑誌名

      日本血液代替物学会誌「人工血液」 16

      ページ: 188-197

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Distribution and population of free-living cells related to endosymbiont a harbored in Oligobrachia mashikoi (a Siboglinid Polychaete) inhabiting Tsukumo Bay.2008

    • 著者名/発表者名
      Aida, M., M. Kanemori, Kubota, N., Matada, M., Sasayama, Fukumori, Y
    • 雑誌名

      Microbes and Environments 23

      ページ: 81-88

    • NAID

      110006633697

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of the partially unliganded met state of 400 kDa hemoglobin: Insights into ligand-induced structural changes of giant hemoglobins.2008

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N., Nakagawa, T., Kita, A., Sasayama, Y., Fukumori, Y., Miki, K.
    • 雑誌名

      Proteins 73

      ページ: 113-125

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the heterotropic and homotropic interactions of invertebrate giant hemoglobin.2008

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N., Nakagawa, T., Kita, A., Sasayama, Y., Fukumori, Y., Miki, K.
    • 雑誌名

      Biochemistry 47

      ページ: 11231-11238

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of the partially unliganded met state of 400 kDa hemoglobin : Insights into ligand-induced structural changes of giant hemoglobins2008

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N
    • 雑誌名

      Proteins 73

      ページ: 113-125

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the heterotropic and homotropic interactions of invertebrate giant hemoglobin2008

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N
    • 雑誌名

      Biochemistry 47

      ページ: 11231-11238

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 巨大ヘモグロビンの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝
    • 雑誌名

      日本血液代替物学会誌「人工血液」 16

      ページ: 188-197

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Oxygenation Properties of Extracellular Giant Hemoglobin from Oligobrachia mashikoi2007

    • 著者名/発表者名
      Aki, Y., Nakagawa, T, Nagai, Y., Sasayama, Y, Fukumori, Y, K. Imai
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 360

      ページ: 673-678

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of endosymbionts in Oligobrachia mashikoi (Siboglinidae, Annelida)2007

    • 著者名/発表者名
      Kubota N, Kanemori M, Sasayama Y, Aida M, Fukumori Y
    • 雑誌名

      Microbes and Environments 22(2)

      ページ: 136-144

    • NAID

      110006290376

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Actual distribution of bacteriocytes in the trophosome of a beard worm (Oligobrachia mashikoi, Siboglinidae, Annelida): Clarification using whole-mount in situ hybridization.2007

    • 著者名/発表者名
      Deguchi, M, Kubota, N, Matsuno, A, Kanemori, M, Fukumori Y, Sasayama Y
    • 雑誌名

      Acta Zoologica 88

      ページ: 129-135

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Relationship between the lifestyle of a Siboglinid (Pogonophoran) polychaete, Oligobrachia mashikoi, and the total sulfide and nitrogen levels in its habitat.2007

    • 著者名/発表者名
      Sasayama Y., Higashide Y., Sakai M., Tatada M., Fukumori Y.
    • 雑誌名

      Zoolog Sci. 24

      ページ: 131-136

    • NAID

      130000016953

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Oxygenation Properties of Extracellular Giant Hemoglobin from Oligobrachiamashikoi2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Aki
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 360

      ページ: 673-678

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of endosymbionts in Oligobrachia mashikoi (Siboglinidae, Annelida)2007

    • 著者名/発表者名
      Kubota N
    • 雑誌名

      Microbes and Environments 22

      ページ: 136-144

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Actual distribution of bacteriocytes in the trophosome of a beard worm (Oligobrachia mashikoi, Siboglinide, Annelida): Clarification using whole-mount in situ hybridization.2007

    • 著者名/発表者名
      Deguchi, M
    • 雑誌名

      Acta Zoologica 88

      ページ: 129-135

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Actual distribution of bacteriocytes in the trophosome of a beard worm(Oligobrachia mashikoi, Siboglinidae, Annelida) : clarification using whole-mount in situ hybridizaiton2007

    • 著者名/発表者名
      M.Deguchi et al.
    • 雑誌名

      Acta Zoologies 88

      ページ: 129-135

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 巨大ヘモグロビンの謎に迫る?X線結晶構造解析で構造と機能を解き明かせ!2006

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝、福森義宏、三木邦夫
    • 雑誌名

      化学 61

      ページ: 30-34

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 巨大ヘモグロビンの謎に迫る-X線結晶構造解析で構造と機能を解き明かせ!2006

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝 他
    • 雑誌名

      化学 61・3

      ページ: 30-34

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Spatial localizations of Mam22 and Mam12 in the magnetosomes of Magnetospirillum magnetotacticum.2006

    • 著者名/発表者名
      Taoka, A.et al.
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 188・11

      ページ: 3805-3812

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Spatial Localizations of Mam22 and Mam12 in the magnetosomes of Magnetospirillum magnetotacticum2006

    • 著者名/発表者名
      A.Taoka et al.
    • 雑誌名

      J.Bact. (In press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification, characterization and sequence analyses of the extracellular giant hemoglobin from Oligobrachia mashikoi.2005

    • 著者名/発表者名
      T. Nakagawa, S. Onoda, M. Kanemori, Y. Sasayama, Y. Fukumori
    • 雑誌名

      Zool. Sci 22

      ページ: 283-291

    • NAID

      110006281799

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of extracellular giant hemoglobin from pogonophoran Oligobrachia mashikoi.2005

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N., Nakagawa, T., Kita, A., Sasayama, Y., Fukumori, Y., Miki, K.
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta 1750

      ページ: 173-176

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of an extracellular giant hemoglobin of the gutless beard worm Oligobrachia mashikoi.2005

    • 著者名/発表者名
      Numoto, N., Nakagawa, T., Kita, A., Sasayama, Y., Fukumori, Y., Miki, K.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102

      ページ: 14521-14526

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of an extracellular giant hemoglobin of the gutless beard worm Oligobrachia mashikoi2005

    • 著者名/発表者名
      N.Numoto et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102

      ページ: 14521-14526

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of extracellular giant hemoglobin from pogonophoran Oligobrachia mashikoi2005

    • 著者名/発表者名
      N.Numoto et al.
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1750

      ページ: 173-176

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification, characterization and sequence analyses of the extracellular giant hemoglobin from Oligobrachia mashikoi2005

    • 著者名/発表者名
      T.Nakagawa et al.
    • 雑誌名

      Zoological Science 22・3

      ページ: 283-291

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] NO Reduction by Nitric-oxide Reductase from Denitrifying Bacterium Pseudomonas aeruginosa2004

    • 著者名/発表者名
      H.Kumita et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279・53

      ページ: 55247-55254

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Conserved region 2.1 of Escherichia coli heat shock transcription factor σ^<32> is required for modulating both metabolic stability and transcriptional activity.2004

    • 著者名/発表者名
      M.Horikoshi et al.
    • 雑誌名

      J Bacteriol. 186・22

      ページ: 7474-7480

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシV2巨大ヘモグロビン(分子量40万)の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティ徳島(徳島)
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシV2巨大ヘモグロビン(分子量40万)の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島)
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシV2ヘモグロビンのX線結晶構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫)
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシV2ヘモグロビンのX線結品構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸国際展示場(兵庫)
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 巨大ヘモグロビン(400 kDa)のリガンド結合に伴う協同的な構造変化2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本)
    • 年月日
      2009-05-22
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 巨大ヘモグロビン(400kDa)のリガンド結合に伴う協同的な構造変化2009

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテル(熊本)
    • 年月日
      2009-05-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 環形動物巨大ヘモグロビン(分子量360万)の5. 6 A分解能X線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第31回秘本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫)
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 環形動物巨大ヘモグロビンの構造生物学-ヒトヘモグロビンとは異なる酸素協同性機構-2008

    • 著者名/発表者名
      福森義宏
    • 学会等名
      第81回日本生化学会大会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 超分子複合体タンパク質の微少重力下での結晶化2008

    • 著者名/発表者名
      長谷川裕
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-12-04
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシ巨大ヘモグロビン(分子量360万)の5. 6 A分解能結晶構造2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 環形動物マシコヒゲムシの細胞外巨大ヘモグロビンの円二色性スペクトル2008

    • 著者名/発表者名
      中川太郎
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシ巨大ヘモグロビンの5.6A分解能結晶構造2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Ligand-induced structural changes of giant hemoglobin, XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography2008

    • 著者名/発表者名
      Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Yuichi Sasayama, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki
    • 学会等名
      invited lecture for Microsymposia "Large macromolecular complexes"
    • 発表場所
      Osaka International Convention Center (Japan)
    • 年月日
      2008-08-24
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Ligand-induced structural changes of giant hemoglobin2008

    • 著者名/発表者名
      Nobutaka Numoto
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      大阪国際会議場
    • 年月日
      2008-08-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 無脊椎動物巨大ヘモグロビンの高分解能結晶構造2008

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第21回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀)
    • 年月日
      2008-01-14
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] マシコヒゲムシ巨大へモグロビンの酸素結合性2007

    • 著者名/発表者名
      安藝弥生
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 年月日
      2007-05-25
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] マシコヒゲムシ巨大ヘモグロビンの金属結合型結晶構造2007

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2007-05-24
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal Structure of Extracellular Giant Hemoglobin of Pogonophoran Oligobrachia mashikoi2006

    • 著者名/発表者名
      Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Yuichi Sasayama, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki
    • 学会等名
      The 7th Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA' 06/CrSJ)
    • 発表場所
      Epochal Tsukuba, (Japan)
    • 年月日
      2006-11-22
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] マシコヒゲムシ巨大ヘモグロビンの一部酸素結合型結晶構造2006

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都)
    • 年月日
      2006-04-26
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 巨大へモグロビンの分子会合機構2005

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第43回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2005-11-25
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structure of a giant hemoglobin of the gutless beard worm Oligobrachia mashikoi2005

    • 著者名/発表者名
      Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Yuichi Sasayama, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki
    • 学会等名
      XX Congress of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Fortezza da Basso (Italy)
    • 年月日
      2005-08-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] マシコヒゲムシ巨大ヘモグロビンの結晶構造2005

    • 著者名/発表者名
      沼本修孝, 中川太郎, 喜田昭子, 笹山雄一, 福森義宏, 三木邦夫
    • 学会等名
      第5回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2005-06-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystallographic Study of Multi Hemoglobin System from Oligobrachia mashikoi2004

    • 著者名/発表者名
      Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki
    • 学会等名
      The 1st Pacific-Rim International Conference on Protein Science
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama (Japan)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] Biomineralization (E.Baeuerlein ed.)2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Fukumori
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      WILEY-VCH
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pronet.s.kanazawa-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pronet.s.kanazawa-u.ac.jp/j/study.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pronet.s.kanazawa-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2018-03-28  

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