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プロトン駆動力による細胞内代謝制御

計画研究

研究領域新光合成:光エネルギー変換システムの再最適化
研究課題/領域番号 16H06559
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

清水 浩  大阪大学, 情報科学研究科, 教授 (00226250)

研究分担者 小山内 崇  明治大学, 農学部, 専任准教授 (60512316)
研究期間 (年度) 2016-06-30 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
104,650千円 (直接経費: 80,500千円、間接経費: 24,150千円)
2020年度: 22,360千円 (直接経費: 17,200千円、間接経費: 5,160千円)
2019年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
2018年度: 22,230千円 (直接経費: 17,100千円、間接経費: 5,130千円)
2017年度: 22,490千円 (直接経費: 17,300千円、間接経費: 5,190千円)
2016年度: 15,470千円 (直接経費: 11,900千円、間接経費: 3,570千円)
キーワードゲノムスケールモデル / システム生物学 / 光合成 / シミュレーション / 代謝フラックス解析 / ゲノムスケール代謝モデル / システムバイオテクノロジー / システムバイオロジー
研究成果の概要

光合成生物が様々な光環境において光化学系と代謝のバランスをどのようにして調節しているのかを理解するため細胞レベルで統合的に議論することが可能なゲノムスケール代謝モデル(GMM)を開発した。シアノバクテリアを用いて波長の異なる光環境下における光化学系と代謝のシミュレーションを行った。光化学系Ⅱ(PSII)および光化学系Ⅰ(PSI)の励起比の情報を取り込むことにより光化学系の直線的電子伝達、サイクリック電子伝達のフラックスを解析することが可能となった。シミュレーションと遺伝子、タンパク質、代謝の階層の実験結果を統合的に解析し光合成の再最適化に向けた戦略の道筋を示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

食糧やエネルギー問題を解決するため、植物や藻類の「光合成の改良」は重要な課題である。従来の研究では、光合成能力を高めることにのみ重点が置かれてきたが、最近の研究により「光エネルギーの効率的利用」と「過剰光からの防御」のバランスの調節の重要性に関する理解が進められてきた。本研究においては、光合成と代謝をシステム的に統合解析を行うことで、光合成の再最適化に向けた戦略の道筋を示すところに新規性がある。この研究により、二酸化炭素排出や地球温暖化を抑制していくための光合成利用に関する基盤が築かれるとともに光合成システムバイオロジーという新たな学術分野が拓かれたと考えられる。

報告書

(6件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (147件)

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (42件) (うち国際共著 6件、 査読あり 41件、 オープンアクセス 18件、 謝辞記載あり 7件) 学会発表 (97件) (うち国際学会 18件、 招待講演 22件) 図書 (1件) 備考 (7件)

  • [雑誌論文] Mutations in hik26 and slr1916 lead to high-light stress tolerance in Synechocystis sp. PCC68032021

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa Katsunori、Ogawa Kenichi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01875-y

    • NAID

      120007028956

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Thioredoxin pathway in Anabaena sp. PCC 7120: activity of NADPH-thioredoxin reductase C2021

    • 著者名/発表者名
      Deschoenmaeker Frederic、Mihara Shoko、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Wakabayashi Ken-Ichi、Toyoshima Masakazu、Shimizu Hiroshi、Hisabori Toru
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 6 ページ: 709-719

    • DOI

      10.1093/jb/mvab014

    • NAID

      40022687787

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Role of type I NADH dehydrogenase in Synechocystis sp. PCC 6803 under phycobilisome excited red light2021

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Plant Science

      巻: 304 ページ: 110798-110798

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2020.110798

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Estimation of linear and cyclic electron flows in photosynthesis based on 13C-metabolic flux analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Chiaki、Toyoshima Masakazu、Kitamura Sayaka、Ueno Yoshifumi、Akimoto Seiji、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 131 号: 3 ページ: 277-282

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.11.002

    • NAID

      40022515104

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Four-carbon dicarboxylic acid production through the reductive branch of the open cyanobacterial tricarboxylic acid cycle in Synechocystis sp. PCC 68032021

    • 著者名/発表者名
      Iijima Hiroko、Watanabe Atsuko、Sukigara Haruna、Iwazumi Kaori、Shirai Tomokazu、Kondo Akihiko、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 65 ページ: 88-98

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2021.03.007

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient extraction and preservation of thermotolerant phycocyanins from red alga Cyanidioschyzon merolae2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Chihiro、Murakami Miyabi、Niwa Anna、Takeya Masahiro、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 131 号: 2 ページ: 161-167

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.09.021

    • NAID

      40022484428

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel allosteric inhibition of phosphoribulokinase identified by ensemble kinetic modeling of Synechocystis sp. PCC 6803 metabolism2020

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering Communications

      巻: 11 ページ: e00153-e00153

    • DOI

      10.1016/j.mec.2020.e00153

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Assessment of Protein Content and Phosphorylation Level in Synechocystis sp. PCC 6803 under Various Growth Conditions Using Quantitative Phosphoproteomic Analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Tokumaru Yuma、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 25 号: 16 ページ: 3582-3582

    • DOI

      10.3390/molecules25163582

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reconstitution of oxaloacetate metabolism in the tricarboxylic acid cycle in Synechocystis sp. PCC 6803: discovery of important factors that directly affect the conversion of oxaloacetate2020

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Hakamada Takumi、Ogino Tatsumi、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 105 号: 6 ページ: 1449-1458

    • DOI

      10.1111/tpj.15120

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effect of pH on metabolite excretion and cell morphology of Euglena gracilis under dark, anaerobic conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Kazumasa、Suzuki Kengo、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Algal Research

      巻: 51 ページ: 102084-102084

    • DOI

      10.1016/j.algal.2020.102084

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fumarase From Cyanidioschyzon merolae Stably Shows High Catalytic Activity for Fumarate Hydration Under High Temperature Conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Iwazumi Kaori、Sukigara Haruna、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 2190-2190

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.560894

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Unconventional biochemical regulation of the oxidative pentose phosphate pathway in the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032020

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Biochemical Journal

      巻: 477 号: 7 ページ: 1309-1321

    • DOI

      10.1042/bcj20200038

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous increases in the levels of compatible solutes by cost‐effective cultivation of Synechocystis sp. PCC 68032020

    • 著者名/発表者名
      Iijima Hiroko、Watanabe Atsuko、Sukigara Haruna、Shirai Tomokazu、Kondo Akihiko、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Biotechnology and Bioengineering

      巻: - 号: 6 ページ: 1649-1660

    • DOI

      10.1002/bit.27324

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overexpression of the response regulator <i>rpaA</i> causes an impaired cell division in the Cyanobacterium <i>Synechocystis</i> sp. PCC 68032020

    • 著者名/発表者名
      Kizawa Ayumi、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 66 号: 2 ページ: 121-128

    • DOI

      10.2323/jgam.2020.01.004

    • NAID

      130007855520

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Flux balance analysis of cyanobacteria reveals selective use of photosynthetic electron transport components under different spectral light conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 143 号: 1 ページ: 31-43

    • DOI

      10.1007/s11120-019-00678-x

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light2019

    • 著者名/発表者名
      Adachi Shunsuke、Tanaka Yu、Miyagi Atsuko、Kashima Makoto、Tezuka Ayumi、Toya Yoshihiro、Kobayashi Shunzo、Ohkubo Satoshi、Shimizu Hiroshi、Kawai-Yamada Maki、Sage Rowan F、Nagano Atsushi J、Yamori Wataru
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Botany

      巻: 70 号: 19 ページ: 5287-5297

    • DOI

      10.1093/jxb/erz304

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biochemical characterisation of fumarase C from a unicellular cyanobacterium demonstrating its substrate affinity, altered by an amino acid substitution2019

    • 著者名/発表者名
      Katayama Noriaki、Takeya Masahiro、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 10629-10629

    • DOI

      10.1038/s41598-019-47025-7

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Increased polyhydroxybutyrate levels by ntcA overexpression in Synechocystis sp. PCC 68032019

    • 著者名/発表者名
      Arisaka Satomi、Terahara Nodoka、Oikawa Akira、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Algal Research

      巻: 41 ページ: 101565-101565

    • DOI

      10.1016/j.algal.2019.101565

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Citrate synthase from Synechocystis is a distinct class of bacterial citrate synthase2019

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Koyama Naoto、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 6038-6038

    • DOI

      10.1038/s41598-019-42659-z

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Time-resolved analysis of short term metabolic adaptation at dark transition in Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Maruyama Masaharu、Nishiguchi Hiroki、Toyohima Masakazu、Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience Bioengineering

      巻: -

    • NAID

      40022037144

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transomics data-driven, ensemble kinetic modeling for system-level understanding and engineering of the cyanobacteria central metabolism2019

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Hiasa Natsuki、Uebayashi Kiyoka、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 52 ページ: 273-283

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2019.01.004

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Targeted proteome analysis of microalgae under high-light conditions by optimized protein extraction of photosynthetic organisms.2019

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima, M., Sakata, M., Ohnishi, K., Tokumaru, Y., Kato, Y., Tokutsu, R., Sakamoto, W., Minagawa, J., Matsuda, F., Shimizu, H.
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: 127 号: 3 ページ: 394-402

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.09.001

    • NAID

      40021846292

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Amino acid excretion from Euglena gracilis cells in dark and anaerobic conditions2019

    • 著者名/発表者名
      Tomita Yuko、Takeya Masahiro、Suzuki Kengo、Nitta Nobuko、Higuchi Chieko、Marukawa-Hashimoto Yuka、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Algal Research

      巻: 37 ページ: 169-177

    • DOI

      10.1016/j.algal.2018.11.017

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 and mechanisms of photoinhibition tolerance under extreme high light conditions2018

    • 著者名/発表者名
      Ogawa Kenichi、Yoshikawa Katsunori、Matsuda Fumio、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 126 号: 5 ページ: 596-602

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.05.015

    • NAID

      40021726334

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparative Targeted Proteomics of the Central Metabolism and Photosystems in SigE Mutant Strains of Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Uebayashi Kiyoka、Toyoshima Masakazu、Osanai Takashi、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 23 号: 5 ページ: 1051-1051

    • DOI

      10.3390/molecules23051051

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Metabolic flux of the oxidative pentose phosphate pathway under low light conditions in Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Ueda Kentaro、Nakajima Tsubasa、Yoshikawa Katsunori、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: - 号: 1 ページ: 38-43

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.01.020

    • NAID

      40021601004

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic manipulation to overexpress rpaA altered photosynthetic electron transport in Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Arisaka Satomi、Sukigara Haruna、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: - 号: 2 ページ: 139-144

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.02.005

    • NAID

      40021645297

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification and Characterisation of Malate Dehydrogenase From Synechocystis sp. PCC 6803: Biochemical Barrier of the Oxidative Tricarboxylic Acid Cycle2018

    • 著者名/発表者名
      Takeya Masahiro、Ito Shoki、Sukigara Haruna、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 9 ページ: 947-947

    • DOI

      10.3389/fpls.2018.00947

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Single Amino Acid Change in 6-Phosphogluconate Dehydrogenase from Synechocystis Conveys Higher Affinity for NADP+ and Altered Mode of Inhibition by NADPH2018

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 12 ページ: 2461-2461

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy165

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Production of Bioplastic Compounds by Genetically Manipulated and Metabolic Engineered Cyanobacteria2018

    • 著者名/発表者名
      Katayama Noriaki、Iijima Hiroko、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Advances in Experimental Medicine and Biology

      巻: 1080 ページ: 155-169

    • DOI

      10.1007/978-981-13-0854-3_7

    • ISBN
      9789811308536, 9789811308543
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Cluster-Level Relationships of Genes Involved in Carbon Metabolism in Synechocystis sp. PCC 6803: Development of a Novel Succinate-Producing Strain2018

    • 著者名/発表者名
      Takeya Masahiro、Iijima Hiroko、Sukigara Haruna、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 59 号: 1 ページ: 72-81

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx162

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of alcohol stress tolerance genes of Synechocystis sp. PCC 6803 using adaptive laboratory evolution2017

    • 著者名/発表者名
      Matsusako Takuya、Toya Yoshihiro、Yoshikawa Katsunori、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology for Biofuels

      巻: 10 号: 1 ページ: 307-307

    • DOI

      10.1186/s13068-017-0996-5

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Substrate Specificity and Allosteric Regulation of a d-Lactate Dehydrogenase from a Unicellular Cyanobacterium are Altered by an Amino Acid Substitution2017

    • 著者名/発表者名
      Ito Shoki、Takeya Masahiro、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 7 号: 1 ページ: 15052-15052

    • DOI

      10.1038/s41598-017-15341-5

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Incubation of cyanobacteria under dark, anaerobic conditions and quantification of the excreted Organic acids by HPLC.2017

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Chika、Iijima Hiroko、Sukigara Haruna、Osanai Takashi
    • 雑誌名

      Bio-protocol

      巻: 7 号: 9

    • DOI

      10.21769/bioprotoc.2257

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ACR11 is an activator of plastid-type glutamine synthetase GS2 in Arabidopsis thaliana2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Osanai, Ayuko Kuwahara, Hitomi Otsuki, Kazuki Saito, Masami Yokota Hirai
    • 雑誌名

      Plant & Cell Physiology

      巻: 58 号: 4 ページ: 650-657

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx033

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Metabolic engineering of Synechocystis sp. PCC 6803 for enhanced ethanol production based on flux balance analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Bioprocess and Biosystems Engineering

      巻: 40 号: 5 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1007/s00449-017-1744-8

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Editorial: biotechnology of microalgae, based on molecular biology and biochemistry of eukaryotic algae and cyanobacteria2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Osanai, Youn-Il Park, Yuki Nakamura
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8 ページ: 118-118

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.00118

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Allosteric inhibition of phosphoenolpyruvate carboxylases is determined by a single amino acid residue in cyanobacteria2017

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Takeya, Masami Yokota Hirai, Takashi Osanai
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 41080-41080

    • DOI

      10.1038/srep41080

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Metabolic flux analysis of Synechocystis sp. PCC6803 ΔnrtABCD mutant reveals a mechanism for metabolic adaptation to nitrogen-limited conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Tsubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda, and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 58 号: 5 ページ: 537-545

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx047

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Combinatorial deletions of glgC and phaCE enhance ethanol production in Synechocystis sp. PCC 68032016

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Namakoshi, Tubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology

      巻: 239 ページ: 13-19

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2016.09.016

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Succinate and lactate production from Euglena gracilis during dark, anaerobic conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Yuko Tomita, Kazumasa Yoshioka, Hiroko Iijima, Ayaka Nakashima, Osamu Iwata, Kengo Suzuki, Tomohisa Hasunuma, Akihiko Kondo, Masami Yokota Hirai, Takashi Osanai
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 7 ページ: 2050-2050

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.02050

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Anionic metabolite biosynthesis enhanced by potassium under dark, anaerobic conditions in cyanobacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Sakiko Ueda, Yuhki Kawamura, Hiroko Iijima, Mitsuharu Nakajima, Tomokazu Shirai, Mami Okamoto, Akihiko Kondo, Masami Yokota Hirai, Takashi Osanai
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 32354-32354

    • DOI

      10.1038/srep32354

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] FBA シミュレーションによるシアノバクテリアにおける PSI/PSII励起比と光合成電子伝達フラックスの関係ならびに NDH-1 の機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      第6回光合成細菌ワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成生物のシステムバイオロジー2021

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803のΔndhD1/D2株を用いたレドックスバランス感知フィコビリソーム分解制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] NAD(P)H dehydrogenase deletion enhances accumulation of polyhydroxybutyrate in Synechocystis sp. PCC 68032021

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Yajima, Masakazu Toyoshima, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 動的代謝モデルを用いたカルビン回路の代謝制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      田島 遼太郎、池原 万由、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Organic acid excretion from cyanobacteria during fermentation2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Osanai
    • 学会等名
      Genetic Modification Tools in Cyanobacteria and Microalgae
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 13C-metabolic flux analysis reveals photosynthetic cofactor production rates in cyanobacteria2020

    • 著者名/発表者名
      Chiaki Yamamoto、 Sayaka Kitamura、Masakazu Toyoshima、Yoshihiro Toya、 Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      上海交通大学学術交流セミナー
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの光合成と代謝のシミュレーション予測による適応機構の解析2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の光合成電子伝達経路の選択的使用の解明2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析を用いたシアノバクテリアにおける光化学系からのATP/NADPH生産速度の推定2020

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 化学量論モデルを用いたFBAシミュレーションによるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、 植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、 清水浩
    • 学会等名
      第5回光合成細菌ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シアノバクテリアのカルビン回路の反応速度論モデルの開発2020

    • 著者名/発表者名
      田島遼太郎、池原万由、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第85年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] in silico analysis and design of photosynthesis and metabolic pathways of Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      日米二国間セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] FBA simulation of photosynthetic electron flow of Synechocystis sp. PCC 6803 under different spectral light condition2019

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki 、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro 、Akimoto Seiji,、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      日米二国間セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Metabolic Engineering of Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi、Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio
    • 学会等名
      APCChE 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Metabolic engineering of cyanobacteria and eukaryotic algae based on biochemistry and molecular biology2019

    • 著者名/発表者名
      Osanai Takashi
    • 学会等名
      Cyano2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] FBAによるシアノバクテリアの光合成電子伝達フラックス状態の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析によるシアノバクテリアにおける光化学反応の補酵素生産速度の推定2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオームと絶対定量2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達経路のフラックス状態の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析に基づくシアノバクテリアの単波長光照射下に対する応答解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光合成装置の絶対定量に関する研究2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、大西一輝、阪田真澄、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      新光合成、光合成若手の会ジョイント若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる異なるPSI/PSII励起比におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      2019年度ラン藻ゲノム交流会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2019

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 異なるPSI/PSII励起比における光合成電子伝達並びに呼吸鎖のフラックスバランス解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] FBAによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達と代謝のシミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアのクエン酸回路を基盤としたバイオプラ原料の生産2019

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第60回植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第61回植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Systems Biology and Metabolic Engineering of Photosynthetic Organisms2018

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Relationship between PSI/PSII excitation ratio and photosynthetic electron transport of Synechocystis sp. PCC 6803 by FBA simulation2018

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Rational metabolic engineering of central metabolism in cyanobacteria using kinetic model ensemble2018

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic modeling of central metabolism in cyanobacteria for improving ethanol production2018

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Overview of microalgal biotechnology based on enzymatic analyses2018

    • 著者名/発表者名
      Osanai Takashi
    • 学会等名
      RIKEN Seminar
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Relationship between increased production of PHB and photosynthesis due to overexpression of ntcA in Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Arisaka Satomi、Terahara Nodoka、Oikawa Akira、Osanai Takashi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シアノバクテリアのゲノムスケール代謝モデルを用いたFBAシミュレーションによる解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第5回分子珪藻研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるPSI/PSII励起比とサイクリック電子伝達の解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度秋季領域会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 代謝工学による光合成の統合解析と工学応用2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会 シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会 生物工学功績賞受賞講演
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 様々な波長の光照射下におけるシアノバクテリアの解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 動的代謝モデルアンサンブルを用いたエタノール生産シアノバクテリアの代謝工学2018

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリア中心炭素代謝における光量変化時の短期応答の解析2018

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの代謝モデルを利用した動的解析に向けて2018

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博、豊島正和、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] FBAを用いた様々な波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の野生株とNDH-1欠損株の代謝シミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオーム解析とQconCAT法による絶対定量2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、 得津隆太郎、 皆川純、 豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 適応進化実験によるシアノバクテリア強光耐性株の獲得とその解析2018

    • 著者名/発表者名
      吉川勝徳、小川健一、戸谷吉博、秋本誠志、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 様々な波長の光照射下のSynechocystis sp. PCC 6803 の野生株とNDH-1欠損株の生育を代謝シミュレーションする2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の検討と利用2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝, 徳丸雄磨, 得津隆太郎, 皆川純, 豊島正和, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ピルビン酸関連酵素からみるシアノバクテリア炭素代謝の不思議2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      マリンバイオテクノロジー学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 微細藻類の遺伝子工学による二酸化炭素からの有用2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      高分子討論会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シアノバクテリアのメタボロミクスと有機酸生産2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      メタボロームシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 嫌気発酵条件におけるバイオコハク酸の細胞外生産2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      ユーグレナ研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の開発2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、得津隆太郎、皆川純、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝応答の解析2018

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 安定同位体非定常の13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析によるn-ブタノールを生産するSynechococcus elongatus PCC 7942の代謝状態の推定2018

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎英一郎、James C Liao、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] FBAを用いた様々な波長の光条件下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の代謝シミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 四重極タンデム質量分析装置を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のターゲットリン酸化プロテオーム解析2018

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨・豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のndhF遺伝子破壊株におけるNADPH消費機構の寄与率の解明2018

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアを用いた二酸化炭素からのバイオコハク酸生産2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 微細藻類の発酵による二酸化炭素を出発物質とした有機酸生産2018

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      JBA発酵と代謝研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成微生物の化学量論モデルを利用したシミュレーションとその応用2017

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博,吉川勝徳,松田史生,清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] シグマ因子SigEによるSynechocystis sp. PCC 6803のプロテオームの制御2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨, 植林希代加, 小山内崇, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 代謝物濃度の絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴, 永井暉, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアのシステムバイオロジーによる統合理解と工学応用2017

    • 著者名/発表者名
      清水浩、豊島正和、戸谷吉博、松田史生
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] nanoLC-MSを用いたシアノバクテリアの網羅的定量プロテオーム解析2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Chlamydomonas reinhardtiiの定量プロテオミクスのための膜タンパク質可溶化手法の検討2017

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、阪田真澄、豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアのSigEの代謝制御解明に向けた定量プロテオーム解析 "2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、豊島正和、小山内崇、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803における多様な波長の光環境下での代謝シミュレーション2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] nanoLC-MSを用いた網羅的定量プロテオーム解析に向けたタンパク質抽出方法の検討2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、徳丸雄磨、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ブタノール生産シアノバクテリアの代謝解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田 圭介、植林 希代加、 戸谷 吉博、傳寶 雄大、Putri Sastia 、松田 史生、福崎 英一郎、 Liao James C ,、清水 浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝適応機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴・西口大貴、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第11回メタボロームシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 代謝物絶対定量データを用いたシアノバクテリア動的代謝モデル構築2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第11回メタボロームシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シグマ因子SigEによるシアノバクテリア代謝制御の定量プロテオーム解析2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、小山内崇、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析を用いたn-ブタノール生産シアノバクテリア株の代謝解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎 英一郎、Liao James、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 光合成微生物の代謝モデルの開発と応用2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、吉川勝徳、 松田史生、 清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803の中心代謝経路と光化学系の制御メカニズムの解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、戸谷吉博、吉川勝徳、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803の光化学反応を精緻化したゲノムスケールモデルを用いた様々な光条件における代謝シミュレーション2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803の精緻化した代謝モデルを用いた光合成研究への応用2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 光量条件がシアノバクテリアの代謝フラックスに及ぼす影響の解析2017

    • 著者名/発表者名
      上田賢太朗、仲嶋翼、吉川勝徳、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光化学装置の定量プロテオミクス2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、徳山健斗、和田圭介、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative proteome analysis of microalgae under high light stress2017

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Toyoshima, Masumi Sakata, Kazuki Ohnishi, Yuma Tokumaru, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      I-Bios2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Metabolic engineering of cyanobacteria for bio-succinate production with metabolomic analysis.2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Osanai
    • 学会等名
      The 8th Asia and Oceania Conference on Photobiology.
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ラン藻の代謝工学によるバイオプラスチック原料生産の展開2017

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      JST-CREST/さきがけ領域公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 微細藻類を用いたプラスチック原料の生産2017

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      NPO法人地球環境カレッジ
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 微細藻類を用いたプラスチック原料の新規増産法の開発2017

    • 著者名/発表者名
      小山内崇
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Integration of in silico design and experimental evaluation of metabolic pathways for creation of microbial cell factories,2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Conference on the Metabolic Science,
    • 発表場所
      Nanjiao Hotel, Shanghai China,
    • 年月日
      2016-10-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量によるシアノバクテリア代謝律速点の解析2016

    • 著者名/発表者名
      西口大貴, 永井 暉, 松田 史生, 清水 浩
    • 学会等名
      第10回メタボロームシンポジウム
    • 発表場所
      鶴岡メタボロームキャンパス(山形県鶴岡市)
    • 年月日
      2016-10-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 13C-metabolic flux analysis for rational design of metabolic pathway modification of the industrially useful microorganisms2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 13th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • 発表場所
      East Lake Hotel, Wuhan, China
    • 年月日
      2016-10-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 糖代謝遺伝子の分子系統と発現制御の解析2016

    • 著者名/発表者名
      竹屋壮浩, 小山内崇
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの時計関連遺伝子rpaA過剰発現による光合成の改変2016

    • 著者名/発表者名
      有坂聡美, 小山内崇
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Euglena gracilisにおける好気 / 嫌気条件下での一次代謝産物の変化2016

    • 著者名/発表者名
      冨田結芙子, 小山内崇
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄県宜野湾市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [図書] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda
    • 総ページ数
      36
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 清水浩研究室

    • URL

      http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/hp/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書 2018 実績報告書 2017 実績報告書 2016 実績報告書
  • [備考] 新光合成 光エネルギーシステムの最適化

    • URL

      http://photosynthesis.nibb.ac.jp/index.htm

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 明大農学部農芸化学科環境バイオテクノロジー 研究室

    • URL

      https://osanaimeiji.wixsite.com/website

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 新光合成 光エネルギーシステムの最適化

    • URL

      http://photosynthesis.nibb.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 新光合成 光エネルギー変換システムの最適化

    • URL

      http://photosynthesis.nibb.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 新光合成 光エネルギー変換システムの再最適化

    • URL

      http://photosynthesis.nibb.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 新光合成 光エネルギー変換システムの再最適化

    • URL

      http://photosynthesis.nibb.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2016-07-04   更新日: 2022-01-27  

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