炎症疾患の代謝アダプテーション

• 研究領域: 代謝アダプテーションのトランスオミクス解析
• 研究課題/領域番号: 17H06302
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 岡田 眞里子 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (10342833)
• 研究期間 (年度): 2017-06-30 – 2022-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 143,520千円 (直接経費: 110,400千円、間接経費: 33,120千円); 2021年度: 24,960千円 (直接経費: 19,200千円、間接経費: 5,760千円); 2020年度: 24,960千円 (直接経費: 19,200千円、間接経費: 5,760千円); 2019年度: 24,960千円 (直接経費: 19,200千円、間接経費: 5,760千円); 2018年度: 24,960千円 (直接経費: 19,200千円、間接経費: 5,760千円); 2017年度: 43,680千円 (直接経費: 33,600千円、間接経費: 10,080千円)
• キーワード: シグナル伝達 / 炎症 / 免疫応答 / NF-kB / オミクス / B細胞 / クロマチン / ライブセルイメージング / エンハンサー / 代謝 / 転写制御 / 数理モデル / 発現制御 / がん / アダプテーション / 感染症 / アトピー性皮膚炎 / 転写因子 / NF-kappaB / 免疫学 / 癌

研究成果の概要

NF-kB転写因子は、炎症や免疫応答において多様な遺伝子発現を誘起するが、その分子基盤には不明な点が多い。本研究では、免疫B細胞、乳がん細胞、アトピー性皮膚炎のモデルを用い、イメージングや次世代シーケンスから得られる多様なオミクスデータを定量的に解析することで、NF-kBの機能発現を明らかにした。その結果、NF-kBによる標的遺伝子の発現増強には、エンハンサーやプロモーター領域におけるクロマチンの開口とNF-kB分子のDNA結合数が重要であることが示された。また、NF-kBは、液液相分離（LLPS）様の状態を核内に引き起こし、遺伝子発現の細胞不均一性を増大させることが示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

炎症疾患や免疫応答において、NF-kB転写因子は重要な働きを示す。このような疾患において、特に問題となるのは、ある時突然に症状が現れ、それがなかなかもとに戻らない状態になることである。このような反応は、生体内の反応が閾値を超えたため、症状となって現れると考えられているが、NF-kBはこの閾値の決定機構に重要な役目を果たすことが明らかになった。特に、細胞核内に存在するNF-kB量とDNAの状態がNF-kBが結合しやすいかどうかによって、この制御が決定される。特に、アトピー性皮膚炎などにおいては、細菌の感染などを防ぎ、NF-kBの核内量を減らすことが重要になる。

研究成果

• [国際共同研究] UCLA(米国)
• [国際共同研究] シカゴ大学(米国)
• [国際共同研究] 中央研究院(中国)
• [国際共同研究] シカゴ大学(米国)
• [国際共同研究] 中央研究院(中国)
• [国際共同研究] インペリアル・カレッジ・ロンドン(英国)
• [国際共同研究] 上海中国科学院（CAS)(中国)
• [国際共同研究] メキシコ国立大学(メキシコ)
• [国際共同研究] シカゴ大学(米国)
• [国際共同研究] インペリアル・カレッジ・ロンドン(英国)
• [雑誌論文] A text-based computational framework for patient-specific modeling for classification of cancers (2022)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Imoto, Sawa Yamashiro, Mariko Okada
  • 雑誌名: iScience 巻: 25 号: 3 ページ: 103944-103944
  • DOI: 10.1016/j.isci.2022.103944
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Systems approaches to investigate the role of NF-κB signaling in aging (2022)
  • 著者名/発表者名: Masatoshi Haga, Mariko Okada
  • 雑誌名: Biochemical Journal 巻: 479 号: 2 ページ: 161-183
  • DOI: 10.1042/bcj20210547
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] IκBα is required for full transcriptional induction of some NFκB-regulated genes in response to TNF in MCF-7 cells (2021)
  • 著者名/発表者名: Minami Ando, Shigeyuki Magi, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Takeya Kasukawa, Diane Lefaudeux, Alexander Hoffmann, Mariko Okada
  • 雑誌名: NPJ systems biology and applications 巻: 7 号: 1 ページ: 1-15
  • DOI: 10.1038/s41540-021-00204-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cell Shape‐Based Chemical Screening Reveals an Epigenetic Network Mediated by Focal Adhesions (2021)
  • 著者名/発表者名: Kanazawa Tomomi、Michida Hiroki、Uchino Yuki、Ishihara Akari、Zhang Suxiang、Tabata Sho、Suzuki Yutaka、Imamoto Akira、Okada Mariko
  • 雑誌名: The FEBS Journal 巻: - 号: 19 ページ: 5613-5628
  • DOI: 10.1111/febs.15840
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Reengineering protein-phosphorylation switches (2021)
  • 著者名/発表者名: Boris N Kholodenko, Mariko Okada
  • 雑誌名: Science 巻: 373 号: 6550 ページ: 25-26
  • DOI: 10.1126/science.abj5028
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Building patient‐specific models for receptor tyrosine kinase signaling networks (2021)
  • 著者名/発表者名: Ebata Kyoichi、Yamashiro Sawa、Iida Keita、Okada Mariko
  • 雑誌名: The FEBS Journal 巻: - 号: 1 ページ: 90-101
  • DOI: 10.1111/febs.15831
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mathematical Modeling and Transcriptome Profiling of Breast Cancer Cells During Tamoxifen Treatment Reveal Multiple Trajectories for Resistant Subtypes (2021)
  • 著者名/発表者名: Magi Shigeyuki、Ki Sewon、Ukai Masao、Naito Atsuhiko、Suzuki Yutaka、Okada Mariko
  • 雑誌名: Research Square 巻: -
  • DOI: 10.21203/rs.3.rs-136924/v1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Number of Transcription Factors at an Enhancer Determines Switch-like Gene Expression (2020)
  • 著者名/発表者名: Michida Hiroki、Imoto Hiroaki、Shinohara Hisaaki、Yumoto Noriko、Seki Masahide、Umeda Mana、Hayashi Tetsutaro、Nikaido Itoshi、Kasukawa Takeya、Suzuki Yutaka、Okada-Hatakeyama Mariko
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 31 号: 9 ページ: 107724-107724
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107724
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A Computational Framework for Prediction and Analysis of Cancer Signaling Dynamics from RNA Sequencing Data?Application to the ErbB Receptor Signaling Pathway (2020)
  • 著者名/発表者名: Imoto Hiroaki、Zhang Suxiang、Okada Mariko
  • 雑誌名: Cancers 巻: 12 号: 10 ページ: 2878-2878
  • DOI: 10.3390/cancers12102878
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The number of transcription factors at an enhancer determine switch-like gene expression. (2020)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Michida, Hiroaki Imoto, Hisaaki Shinohara, Noriko Yumoto, Masahide Seki, Mana Umeda, Tetsutaro Hayashi, Itoshi Nikaido, Kasukawa Takeya, Yutaka Suzuki, Mariko Okada-Hatakeyama.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: -
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Computational prediction of the signal-dependent gene expression dynamics by integrating bioinformatics and modeling approaches. (2020)
  • 著者名/発表者名: Sufeng Chiang, Jia-Hsin Huang, Huai-Kuang Tsai, Mariko Okada.
  • 雑誌名: FEBS Letter 巻: - 号: 10 ページ: 1477-1496
  • DOI: 10.1002/1873-3468.13757
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Essential role of the Crk family-dosage in DiGeorge-like anomaly and metabolic homeostasis. (2020)
  • 著者名/発表者名: Akira Imamoto, Sewon Ki, Leiming Li, Kazunari Iwamoto, Venkat Maruthamuthu, John Devany, Ocean Lu, Tomomi Kanazawa, Suxiang Zhang, Takuji Yamada, Akiyoshi Hirayama, Shinji Fukuda, Yutaka Suzuki, Mariko Okada
  • 雑誌名: Life Science Alliance 巻: - 号: 2 ページ: e201900635-e201900635
  • DOI: 10.26508/lsa.201900635
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Postnatal liver functional maturation requires Cnot complex-mediated decay of mRNAs encoding cell cycle and immature liver genes (2019)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Toru、Kikuguchi Chisato、Nishijima Saori、Nagashima Takeshi、Takahashi Akinori、Okada Mariko、Yamamoto Tadashi
  • 雑誌名: Development 巻: 146 号: 4
  • DOI: 10.1242/dev.168146
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pulmonary phagocyte-derived NPY controls the pathology of severe influenza virus infection (2019)
  • 著者名/発表者名: Seiki Fujiwara, Midori Hoshizaki, Yu Ichida, Dennis Lex, Etsushi Kuroda, Ken Ishii, Shigeyuki Magi, Mariko Okada, Hiroyuki Takao, Masahiro Gandou, Hirotaka Imai, Ryujiro Hara, Herbert Herzog, Akihiko Yoshimura, Hitoshi Okamura, Josef Penninger, Arthur Slutsky, Stefan Uhlig, Keiji Kuba, and Yumiko Imai
  • 雑誌名: Nature Microbiology 巻: 4 ページ: 258-268
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Hunt for the tipping point during endocrine resistance process in breast cancer by dynamic network biomarkers (2018)
  • 著者名/発表者名: Rui Liu, Jinzeng Wang, Masao Ukai, Ki Sewon, Pei Chen, Yutaka Suzuki, Haiyun Wang, Kazuyuki Aihara, Mariko Okada-Hatakeyama, Luonan Chen
  • 雑誌名: Journal of Molecular Cell Biology 巻: - 号: 8 ページ: 1-16
  • DOI: 10.1093/jmcb/mjy059
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF‐1A and reduces cancer cell survival (2018)
  • 著者名/発表者名: Cortes Ernesto、Lachowski Dariusz、Robinson Benjamin、Sarper Muge、Teppo Jaakko S、Thorpe Stephen D、Lieberthal Tyler J、Iwamoto Kazunari、Lee David A、Okada‐Hatakeyama Mariko、Varjosalo Markku T、del R?o Hern?ndez Armando E
  • 雑誌名: EMBO reports 巻: 20 号: 1
  • DOI: 10.15252/embr.201846557
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] [Regular Paper] Inference of Genetic Networks Using Random Forests: Use of Different Weights for Time-Series and Static Gene Expression Data (2018)
  • 著者名/発表者名: Kimura Shuhei、Tokuhisa Masato、Okada-Hatakeyama Mariko
  • 雑誌名: Proc. of the 18th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering 巻: - ページ: 98-103
  • DOI: 10.1109/bibe.2018.00026
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Stratification of cancer patients based on the signaling dynamics. (2022)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022. Co-hosted with the Institute for Protein Research (IPR) , Osaka University
• [学会発表] A computational platform for mathematical modeling of cancer networks (2021)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The international Chemical Congress of Pacific Basin
• [学会発表] 個別化医療に向けた臨床オミクスデータの数理モデルへの適用 (2021)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 第47回東北眼疾患病態研究会
• [学会発表] 細胞シミュレーションによる患者固有モデルの構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 大阪大学 数理・データ科学教育研究センター主催 講演会 「医学研究における数理的方法」
• [学会発表] Prediction and validation of NF-kB mediated gene expression mechanisms in B cells using bulk and single cell sequencing data (2020)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 8th Annual Meeting of the International Cytokine & Interferon Society
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Reclassification of cancer subtypes based on the dynamic cell behaviors (2020)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 1st International Symposium on Human InformatiX
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Quantitative analysis of immune response using Omics and imaging (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 1st International Symposium on Inflammation Cellular Society
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Analyze immune response using Omics and imaging (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 3rd International Symposium for Trans-Omics
  • 国際学会
• [学会発表] Quantitative analysis of biological networks using mathematical models (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 9th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2019) The CJK-SIAMs joint mini-symposium on Mathematical Biology
  • 国際学会
• [学会発表] Cooperative mechanism in epigenetic network controls gene expression quantity (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: Bioinformatics Seminar, Academia Sinica, Taiwan
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 細胞制御メカニズム理解のための数理モデル構築とツール開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: 第16回 生物数学の理論とその応用ー生命現象の定量的理解に向けてー
  • 招待講演
• [学会発表] Model-based understanding of cell proliferation (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 42nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
• [学会発表] Analyze Omics data using kinetic model (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 57th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
• [学会発表] Quantitative evaluation of kinase activities and transcriptional regulation using mathematical model (2019)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 第92回日本薬理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Modeling and Omics analysis of NF-kB system (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 'IPR Seminar "BioNetworks in Health and Diseases"
  • 国際学会
• [学会発表] 細胞ネットワークの数理モデリングと疾患研究への応用 (2018)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 公開シンポジウム「医療情報分析の実際」
• [学会発表] Integrative analysis to reveal transcriptional regulation of NF-kB (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: IMS-JSI International Symposium on Immunology 2018 "Checkpoint in medical science and its technology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 炎症疾患の代謝アダプテーション (2018)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 新学術研究「代謝オミクス」第2回 領域会議
  • 国際学会
• [学会発表] Modeling of signal-transcriptional network (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 18th World Congress of Basic and Clinical Pharmacology (WCP2018 Kyoto)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Quantitative transcriptional control of NF-kB (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: ISMB 2018, Chicago
  • 国際学会
• [学会発表] Data-driven modelling of cellular network (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 2018 International Conference on Computational Systems B Biology (ISB 2018)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biological significance of the oscillatory dynamics of NF-kB for target gene expression (2018)
  • 著者名/発表者名: Minami Ando, Shigeyuki Magi, Kazunari Iwamoto, Mariko Okada
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Model-based prediction of ErbB signaling activities on cell cycle entry (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Imoto, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Experimental Validation of a Mathematical Model of ErbB Receptor Signaling to Cell Cycle (2018)
  • 著者名/発表者名: Kyoichi Ebata, Hiroaki Imoto, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada-Hatakeyama
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Investigation of the crosstalk mechanism between two damped oscillators, NF-kB and p38 MAP kinase (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Michida, Minami Ando, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Mariko Okada
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Understanding biological systems from multi-order kinetics (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会「多次元速度論からの生物の理解」
• [学会発表] Biological significance of the oscillatory dynamics of NF-kB for target gene expression (2018)
  • 著者名/発表者名: Minami Ando, Shigeyuki Magi, Kazunari Iwamoto, Mariko Okada
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会
• [学会発表] Predictions of cellular responses with a mathematical model integrating ErbB signaling and cell cycle (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Imoto, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会
• [学会発表] Crk遺伝子ファミリーによる細胞機能制御の統合的解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 金沢 朋実, 岩本 一成, 間木 重行, 張 素香, 今本 公, 岡田 眞里子
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会
• [学会発表] Time-sries analysis on the process of acquiring tamoxifen resistance in breast cancer cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigeyuki Magi, Yutaka Suzuki, Mariko Okada
  • 学会等名: 第77回日本癌学会学術総会
• [学会発表] Quantitative analysis of transcriptional regulation (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: Seminar at Chinese Academy of Sciences, Shanghai
  • 招待講演
• [学会発表] Quantitative Transcription Control Mediated by Signaling Network (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The 19th International Conference on Systems Biology (ICSB 2018)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Dynamics and regulatory principles of biological networks (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 蛋白研６０週年記念講演会
• [学会発表] 細胞システム解析の考え方と基礎・応用 (2018)
  • 著者名/発表者名: 岡田 眞里子
  • 学会等名: 第16回日本糖鎖科学コンソーシアム シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 乳がんのタモキシフェン耐性獲得過程の時系列解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 間木 重行, 奇 世媛, 鵜飼 正雄, 鈴木 穣, 岡田 眞里子
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] NF-kB - p38 MAPK crosstalk mechanism regulating gene expression dynamics (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Michida, Minami Ando, Shigeyuki Magi, Mariko Okada
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Signal-dependent transcriptional regulation for cell fate control (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: 3rd Symposium on Complex Biodynamics & Networks
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Time-series analysis on the process of acquiring resistance for estrogen receptor antagonist in breast cancer cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigeyuki Magi, Sewon Ki, Masao Ukai, Yutaka Suzuki, Mariko Okada
  • 学会等名: 3rd Symposium on Complex Biodynamics & Networks
  • 国際学会
• [学会発表] An input-output relationship of signaling-epigenetic regulation. Symposium on Chromosome Biology and Cell Signalling. (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: Joint IPR Seminar by IISER TVM and Osaka Univ.
  • 国際学会
• [学会発表] Systems biology of signaling network (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: Seminar at Centre for Molecular Medicine, Jawaharlal Nehru University
  • 国際学会
• [学会発表] Trans-Omics analysis of NF-kappaB regulation (2017)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: CREST & Scientific Research on Innovative Areas Symposium. “The 1st International Symposium for Trans-Omics”
  • 国際学会
• [学会発表] Mathematical modeling of cancer signaling network. (2017)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: The Third Trilateral Workshop for Frontier Protein Studies 2017
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of Omics data using kinetic model (2017)
  • 著者名/発表者名: Mariko Okada
  • 学会等名: Seminar at Dept. of Bioengineering, Imperial College London
  • 国際学会
• [学会発表] オミクスと数理モデリングによる細胞制御機構の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: 23th Cardiovascular Metabolism and Aging Conference
  • 招待講演
• [学会発表] 細胞モデリングとAI - オミクス研究から実用的システム生物学の構築へ- (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] Classic yet unique dynamic properties of NF-kappaB gene regulation (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: OIST-JST Joint Seminar
  • 招待講演
• [学会発表] 細胞の形態と代謝ネットワーク (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: 第11回メタボロームシンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] システムバイオロジーとバイオデータベース (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: NBDCワークショップ
• [学会発表] 細胞形態と代謝を繋ぐシグナル軸の同定. (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: アステラス病態代謝研究会 平成29年度研究報告会
• [学会発表] NF-kappaB転写因子の動態と機能 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: 九州大学生体防御制御研究所セミナー
• [学会発表] シグナル伝達の数理モデル化と細胞変換 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: 新学術領域「数理シグナル」第１回若手ワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] システムバイオロジーと創薬 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡田眞里子
  • 学会等名: バイオグリッド研究会2017 ～AI、シミュレーション、システムバイオロジーと創薬～
  • 招待講演
• [図書] Quantitative imaging analysis of NF-κB for mathematical modelling applications. Computational Modeling of Signaling Networks (Edited by Lan Nguyen). (2020)
  • 著者名/発表者名: Johannes Nicolaus Wibisana, Takehiko Inaba, Yasushi Sako, Mariko Okada
  • 出版者: Methods in Molecular Biology, Springer Nature.
• [備考] 大阪大学 細胞システム研究室
  • URL: http://www.protein.osaka-u.ac.jp/cell_systems/index_ja.html
• [備考] 患者固有モデルpasmopy
  • URL: https://github.com/okadalabipr/pasmopy
• [備考] 大阪大学 蛋白質研究所 細胞システム研究室
  • URL: http://www.protein.osaka-u.ac.jp/cell_systems/index.html
• [備考] 大阪大学 蛋白質研究所 細胞システム研究室
  • URL: http://www.protein.osaka-u.ac.jp/cell_systems/
• [産業財産権] 腫瘍のサブタイプ決定方法及びその応用、並びにサブタイプ決定のための方法 (2021)
  • 発明者名: 井元宏明、山城紗和、岡田眞里子
  • 権利者名: 井元宏明、山城紗和、岡田眞里子
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2021