多様な選択圧下での大腸菌進化実験による揺らぎ－応答関係の定量解析

• 研究領域: 進化の制約と方向性 ～微生物から多細胞生物までを貫く表現型進化原理の解明～
• 研究課題/領域番号: 17H06389
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 古澤 力 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (00372631)
• 研究分担者: 若本 祐一 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (30517884) ; 津留 三良 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任助教 (80594506)
• 研究期間 (年度): 2017-06-30 – 2022-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 145,340千円 (直接経費: 111,800千円、間接経費: 33,540千円); 2021年度: 19,500千円 (直接経費: 15,000千円、間接経費: 4,500千円); 2020年度: 24,440千円 (直接経費: 18,800千円、間接経費: 5,640千円); 2019年度: 23,920千円 (直接経費: 18,400千円、間接経費: 5,520千円); 2018年度: 34,450千円 (直接経費: 26,500千円、間接経費: 7,950千円); 2017年度: 43,030千円 (直接経費: 33,100千円、間接経費: 9,930千円)
• キーワード: 進化実験 / 大腸菌 / 進化的制約 / 表現型揺らぎ / 揺らぎ / ラボオートメーション / 進化 / 微生物 / ゆらぎ

研究成果の概要

生物システムは環境変化に応じて柔軟にその表現型を変化させる。その表現型の適応進化が持つ性質を定量的に解析するために、多様な環境下での系統的な大腸菌進化実験を行い、進化株の表現型と遺伝子型の変化を解析した。結果として、大腸菌の取り得る表現型の変化は低次元に拘束をされていることと、その変化の大きさはは遺伝子型の変化に依らない表現型揺らぎの大きさと相関していることが示された。こうした結果は理論的予測と良い一致を示すとともに、短い世代であれば進化の予測と制御が可能であることを示唆している。

研究成果の学術的意義や社会的意義

今回の研究では、適応進化の過程が比較的少数の変数によって記述可能であることを示している。このことは、その適切な少数自由度を抽出することにより、進化の軌跡を予測したり制御したりすることが可能であることを示唆している。今回の研究を基にしたさらなる研究開発により、この進化の予測と制御を可能となれば、病原菌の薬剤耐性能の獲得を抑制する、微生物による有用物質の生産性を向上させるなど、医学・薬学・工学の分野に貢献をすることが期待できる。

研究成果

• [雑誌論文] Experimental demonstration of operon formation catalyzed by insertion sequence (2022)
  • 著者名/発表者名: Kanai Yuki、Tsuru Saburo、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 50 号: 3 ページ: 1673-1686
  • DOI: 10.1093/nar/gkac004
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Potential contribution of intrinsic developmental stability toward body plan conservation (2022)
  • 著者名/発表者名: Uchida Yui、Shigenobu Shuji、Takeda Hiroyuki、Furusawa Chikara、Irie Naoki
  • 雑誌名: BMC Biology 巻: 20 号: 1 ページ: 82-82
  • DOI: 10.1186/s12915-022-01276-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Laboratory evolution of Mycobacterium on agar plates for analysis of resistance acquisition and drug sensitivity profiles (2021)
  • 著者名/発表者名: Maeda Tomoya、Kawada Masako、Sakata Natsue、Kotani Hazuki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 15136-15136
  • DOI: 10.1038/s41598-021-94645-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Morphological change of coiled bacterium Spirosoma linguale with acquisition of β-lactam resistance (2021)
  • 著者名/発表者名: Maeda Tomoya、Kotani Hazuki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 13278-13278
  • DOI: 10.1038/s41598-021-92787-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mutational property of newly identified mutagen l-glutamic acid γ-hydrazide in Escherichia coli (2021)
  • 著者名/発表者名: Maeda Tomoya、Shibai Atsushi、Yokoi Naomi、Tarusawa Yumeko、Kawada Masako、Kotani Hazuki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis 巻: 823 ページ: 111759-111759
  • DOI: 10.1016/j.mrfmmm.2021.111759
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decoding gut microbiota by imaging analysis of fecal samples (2021)
  • 著者名/発表者名: Furusawa Chikara、Tanabe Kumi、Ishii Chiharu、Kagata Noriko、Tomita Masaru、Fukuda Shinji
  • 雑誌名: iScience 巻: 24 号: 12 ページ: 103481-103481
  • DOI: 10.1016/j.isci.2021.103481
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intrinsic growth heterogeneity of mouse leukemia cells underlies differential susceptibility to a growth-inhibiting anticancer drug (2021)
  • 著者名/発表者名: Seita Akihisa、Nakaoka Hidenori、Okura Reiko、Wakamoto Yuichi
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 16 号: 2 ページ: 0236534-0236534
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0236534
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Toward understanding of evolutionary constraints: experimental and theoretical approaches (2020)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa*, Naoki Irie*
  • 雑誌名: Biophysical Reviews 巻: 12 号: 5 ページ: 1155-1161
  • DOI: 10.1007/s12551-020-00708-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Understanding metabolic adaptation by using bacterial laboratory evolution and trans-omics analysis (2020)
  • 著者名/発表者名: Horinouchi Takaaki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Biophysical Reviews 巻: － 号: 3 ページ: 677-682
  • DOI: 10.1007/s12551-020-00695-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Suppression of antibiotic resistance evolution by single-gene deletion (2020)
  • 著者名/発表者名: Horinouchi Takaaki、Maeda Tomoya、Kotani Hazuki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 4178-4178
  • DOI: 10.1038/s41598-020-60663-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] High-throughput laboratory evolution reveals evolutionary constraints in Escherichia coli (2020)
  • 著者名/発表者名: Maeda Tomoya、Iwasawa Junichiro、Kotani Hazuki、Sakata Natsue、Kawada Masako、Horinouchi Takaaki、Sakai Aki、Tanabe Kumi、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 11 号: 1 ページ: 5970-5970
  • DOI: 10.1038/s41467-020-19713-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 大腸菌進化実験の表現型・遺伝子型解析：微生物生態系進化の予測と制御へ向けて (2020)
  • 著者名/発表者名: 古澤力, 前田智也, 芝井厚
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 38(18) ページ: 3072-3072
• [雑誌論文] Complete Genome Sequence of a Radioresistant Bacterial Strain, Deinococcus grandis ATCC 43672 (2019)
  • 著者名/発表者名: Shibai Atsushi、Satoh Katsuya、Kawada Masako、Kotani Hazuki、Narumi Issay、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Microbiology Resource Announcements 巻: 8 号: 45
  • DOI: 10.1128/mra.01226-19
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Complete Genome Sequences of Three Star-Shaped Bacteria, Stella humosa, Stella vacuolata, and Stella Species ATCC 35155 (2019)
  • 著者名/発表者名: Shibai Atsushi、Maeda Tomoya、Kawada Masako、Kotani Hazuki、Sakata Natsue、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: Microbiology Resource Announcements 巻: 8 号: 32
  • DOI: 10.1128/mra.00719-19
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 微生物進化実験の定量解析：予測・制御・細胞状態論へ向けて (2019)
  • 著者名/発表者名: FURUSAWA Chikara、HORINOUCHI Takaaki
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 59 号: 5 ページ: 262-265
  • DOI: 10.2142/biophys.59.262
  • NAID: 130007718911
  • ISSN: 0582-4052, 1347-4219
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 適応と進化におけるマクロ現象論--表現型変化の低次元拘束と揺らぎ-応答関係 (2019)
  • 著者名/発表者名: 金子邦彦, 古澤力
  • 雑誌名: 日本物理学会誌 巻: 74 ページ: 137-145
  • NAID: 130007690582
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-throughput identification of the sensitivities of an Escherichia coli ΔrecA mutant strain to various chemical compounds (2019)
  • 著者名/発表者名: Maeda Tomoya、Horinouchi Takaaki、Sakata Natsue、Sakai Aki、Furusawa Chikara
  • 雑誌名: The Journal of Antibiotics 巻: - 号: 7 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1038/s41429-019-0160-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Toward prediction and control of antibiotic-resistance evolution (2018)
  • 著者名/発表者名: Furusawa Chikara、Horinouchi Takaaki、Maeda Tomoya
  • 雑誌名: Current Opinion in Biotechnology 巻: 54 ページ: 45-49
  • DOI: 10.1016/j.copbio.2018.01.026
  • 査読あり
• [雑誌論文] Formation of dominant mode by evolution in biological systems (2018)
  • 著者名/発表者名: Furusawa Chikara、Kaneko Kunihiko
  • 雑誌名: Physical Review E 巻: 97 号: 4 ページ: 1-24
  • DOI: 10.1103/physreve.97.042410
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Toward prediction and control of microbial evolution: Analysis of phenotypic constraints in laboratory evolution (2022)
  • 著者名/発表者名: Furusawa Chikara
  • 学会等名: BDR Symposium 2022
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] マイクロバイオームの大規模継代培養実験による共生関係の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 前田智也、古澤力
  • 学会等名: 第16回ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] 代謝ネットワークの構造によるジェネラリスト・スペシャリスト戦略の出現 (2022)
  • 著者名/発表者名: 新美倫太郎、古澤力、姫岡優介
  • 学会等名: 日本物理学会第77回年次大会
• [学会発表] 空間分割された細胞モデルにおける触媒反応ネットワークの分業の進化 (2022)
  • 著者名/発表者名: 一井俊介, 姫岡優介, 古澤力
  • 学会等名: 日本物理学会第77回年次大会
• [学会発表] オペロン構造を基本とする遺伝子発現制御機構の起源に関するIDE 仮説の実証実験 (2022)
  • 著者名/発表者名: 金井雄樹, 津留三良, 古澤力
  • 学会等名: 第46回 生命の起原および進化学会学術講演会
• [学会発表] Inferring multi-omics states from cellular Raman spectra (2022)
  • 著者名/発表者名: Wakamoto Yuichi
  • 学会等名: 2022 AIST-KU Joint Workshop Recent Trends in Biosensing and Bioimaging
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Toward prediction and control of microbial evolution: Analysis of phenotypic constraints (2021)
  • 著者名/発表者名: Furusawa Chikara
  • 学会等名: 2nd AsiaEvo Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ロボット駆動実験による新たな生命科学 (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 日本ロボット学会 若手ロボティクス研究会「生物学のすすめ 生物学×ロボティクスの学際研究」
  • 招待講演
• [学会発表] ロボットによる大規模実験系を用いた共生進化機構の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第23回日本進化学会年大会
  • 招待講演
• [学会発表] 異種間相互作用による薬剤耐性進化ダイナミクスへの影響 (2021)
  • 著者名/発表者名: 前田智也、古澤力
  • 学会等名: 第15 回細菌学若手コロッセウム
  • 招待講演
• [学会発表] 実験室進化による薬剤耐性進化ダイナミクスの解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 前田智也、岩澤諄一郎、古澤力
  • 学会等名: 日本生物工学会北日本支部会・シンポジウム講演
  • 招待講演
• [学会発表] 生きている状態をどのように理解するか～理論と実験からのアプローチ～ (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第13回研究会
  • 招待講演
• [学会発表] 細胞の壊し方：進化実験によるアプローチ (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 細胞を創る研究会14
  • 招待講演
• [学会発表] 大腸菌の大規模進化実験：進化の予測と制御に向けて (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Toward prediction and control of microbial evolution: Analysis of phenotypic constraints (2021)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa
  • 学会等名: Quantitative evolution, phylogeny and ecology: from models to data and back
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 微生物進化の予測と制御へ向けて：大腸菌の大規模進化実験 (2021)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] 大規模進化実験で解き明かす大腸菌の薬剤耐性進化における制約 (2021)
  • 著者名/発表者名: 前田智也, 岩澤 諄一郎, 古澤 力
  • 学会等名: 第94回日本細菌学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] 環境pH変化に依存した酵母のフェロモン活性の揺らぎ (2021)
  • 著者名/発表者名: 清家泰介, 阪田奈津枝, 小谷葉月, 古澤 力
  • 学会等名: 第15回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] 大腸菌進化実験の薬剤耐性時系列を用いた適応度地形の推定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 岩澤諄一郎, 前田智也, 古澤力
  • 学会等名: 日本物理学会第76回年次大会
• [学会発表] Estimating Bacterial Quantitative Proteomes from Cellular Raman Spectra (2021)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichiro F Kamei, Koseki J Kobayashi-Kirschvink, Hidenori Nakaoka, and Yuichi Wakamoto
  • 学会等名: BPS2021 65th Biophysical Society Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] History-Dependent Adaptation to Lethal Genetic Modification under Antibiotic Exposure (2021)
  • 著者名/発表者名: Yuta Koganezawa, Miki Umetani, Moritoshi Sato, Yuichi Wakamoto
  • 学会等名: Virtual Keystone Symposia "Single Cell Biology" (EK26)
  • 国際学会
• [学会発表] 進化過程の予測と制御へ向けて：大規模大腸菌進化実験の表現型・遺伝子型解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第22回日本進化学会年大会
  • 招待講演
• [学会発表] 表現型揺らぎと進化可能性：微生物進化実験によるアプローチ (2020)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 日本植物学会
  • 招待講演
• [学会発表] 腸菌の種内進化において高発現遺伝子への純化選択は緩和されている (2020)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚，古澤力
  • 学会等名: 第12回生命情報科学若手の会
• [学会発表] 大腸菌プロモーターの変異に対するロバストネスの測定と解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 畑中直木, 津留三良, 古澤力
  • 学会等名: 第22回日本進化学会年大会
• [学会発表] 高変異率の大腸菌長期実験進化から遺伝子進化速度の一般法則を探る (2020)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚, 古澤力, 津留三良
  • 学会等名: 第22回日本進化学会年大会
• [学会発表] 遺伝暗号における適応度地形の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 大町祐史, 斉藤稔, 古澤力
  • 学会等名: 第58回生物物理学会年会
• [学会発表] Study on evolutionary fluctuation-response relationship in multicellular development (2020)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第58回生物物理学会年会
• [学会発表] 細胞ラマンスペクトルに基づくマルチオミクスと生理状態の推定 (2020)
  • 著者名/発表者名: 若本祐一
  • 学会等名: 第93回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Microfluidic single-cell time-lapse microscopy and Raman spectroscopic omics analysis applied to the study of cancer (2020)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Wakamoto
  • 学会等名: 第79回日本癌学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] 合成遺伝子回路における細胞間相互作用依存的な発現と分化多能性 (2020)
  • 著者名/発表者名: 池森慧，若本祐一
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
• [学会発表] High-dimensional data acquisition for analysis of microbial evolution and ecology (2020)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: The 29th Hot Spring Harbor International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 実験室進化手法を応用した大腸菌のストレス耐性機構の解明とその制御 (2020)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 日本農芸化学会大会2020
  • 招待講演
• [学会発表] 機械学習を用いた生物形態の定量化 (2020)
  • 著者名/発表者名: 堤真人,斉藤稔,古澤力
  • 学会等名: 日本物理学会第75回大会
• [学会発表] フェロモンが変化できる進化パスを実験的に探索する (2020)
  • 著者名/発表者名: 清家泰介,小谷葉月,古澤力
  • 学会等名: 第14回日本ゲノム微生物学会
• [学会発表] 機械学習と大腸菌実験室進化データを用いた進化拘束の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 岩澤諄一郎, 前田智也, 堀之内貴明, 古澤力
  • 学会等名: 第14回日本ゲノム微生物学会
• [学会発表] History-dependent maintenance of resistant phenotype against resistant gene deletion (2020)
  • 著者名/発表者名: 小金澤優太、梅谷実樹、佐藤守俊、若本祐一
  • 学会等名: 第93回日本細菌学会総会
• [学会発表] Analysis of Evolutionary Constraints and Plasticity by Microbial Laboratory Evolution and Computational Models (2019)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: 2nd Joint Symposium between MBI and UBI
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] High-dimensional data acquisition for analysis of microbial evolution and ecology (2019)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: The 1st Symposium of China-Japan Joint Laboratory for Natural Products and Chemical Biology--Trends in Gut Microbiome Research
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Analysis of Evolutionary Constraints and Plasticity by Microbial Laboratory Evolution and Computational Models (2019)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: From Molecular Basis to Predictability and Control of Evolution
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of Phenotypic Constraints and Plasticity by Microbial Laboratory Evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: The 20th International Conference on Systems Biology
  • 国際学会
• [学会発表] Combining interpretable machine learning with high dimensional multi-omics data from laboratory evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: J. Iwasawa, T. Maeda, T. Horinouchi, C. Furusawa
  • 学会等名: The 20th International Conference on Systems Biology
  • 国際学会
• [学会発表] Identification of mutations conferring resistance to anti-tuberculosis drugs by laboratory evolution of non-pathogenic Mycobacterium on agar plate (2019)
  • 著者名/発表者名: T. Maeda, C. Furusawa
  • 学会等名: The 20th International Conference on Systems Biology
  • 国際学会
• [学会発表] Feedback control of evolutionary trajectory of bacterial cells on fitness landscape (2019)
  • 著者名/発表者名: A. Shibai, C. Furusawa
  • 学会等名: The 20th International Conference on Systems Biology
  • 国際学会
• [学会発表] History-dependent Maintenance of Drug Resistant Phenotypes against Resistant Gene Deletion (2019)
  • 著者名/発表者名: Yuta Koganezawa, Moritoshi Sato, Yuichi Wakamoto
  • 学会等名: qBio 2019 Conference
  • 国際学会
• [学会発表] 自動化システムを用いた大腸菌進化実験:進化の予測と制御へ向けて (2019)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of Phenotypic Constraints and Plasticity by Microbial Laboratory Evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: C. Furusawa
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 生物システムの安定性と可塑性の理解へ向けて:実験室進化と理論解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: CBI学会2019年大会
  • 招待講演
• [学会発表] Toward prediction and control of microbial evolution: Analysis of phenotypic constraints in laboratory evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Dynamic association between gene expression and fitness in adaptive resistance (2019)
  • 著者名/発表者名: 梅谷実樹、橋本幹弘、大倉玲子、古澤力、若本祐一
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] History Dependent Phenotypic Buffering of Bacteria against Drug Resistant Gene Deletion (2019)
  • 著者名/発表者名: 小金澤優太、佐藤守俊、若本祐一
  • 学会等名: 第92回日本細菌学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] 適応度地形の動的変化を通した細菌進化のフィードバック制御の試み (2019)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚，古澤力
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
• [学会発表] A genetic tool to tune gene-inactivating mutation rate and its application to experimental evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: 金井雄樹, 津留三良, 古澤力
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
• [学会発表] 骨を用いた動物形態の機械学習 (2019)
  • 著者名/発表者名: 堤真人
  • 学会等名: 第59回生命科学夏の学校
• [学会発表] Laboratory evolution of Escherichia coli reveals constrained evolutionary states for antibiotic resistance (2019)
  • 著者名/発表者名: 岩澤諄一郎, 前田智也, 堀之内貴明, 古澤力
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会
• [学会発表] Construction of a genetic tool for tuning gene-inactivating mutations and its application to experimental evolution of genome reduction (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Kanai, S. Tsuru, C. Furusawa
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会
• [学会発表] Quantitation of cell shape by machine learning (2019)
  • 著者名/発表者名: 堤真人, 古澤力, 澤井哲, 斉藤稔
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会
• [学会発表] 大腸菌を用いた実験室内進化におけるタンパク質の配列進化速度の制約 (2019)
  • 著者名/発表者名: S. Tsuru, A. Shibai, C. Furusawa
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Fitness landscape of antibiotic-resistance evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: 平中優圭, 斉藤稔, 古澤力
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 近縁種の作るフェロモンを使って、S. pombeを交配させる実験的試み (2019)
  • 著者名/発表者名: 清家泰介, 阪田奈津枝, 下田親, 仁木宏典, 古澤力
  • 学会等名: 酵母遺伝学フォーラム第52回研究報告会
• [学会発表] 自動培養系を用いた細菌実験進化のフィードバック制御の試み (2019)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚，古澤力
  • 学会等名: 第11回生命情報科学若手の会
• [学会発表] ストレス条件と耐性獲得との関係に基づく細菌進化のフィードバック制御 (2019)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚，古澤力
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] A ubiquitous law in the rate of divergent evolution of protein sequence (2019)
  • 著者名/発表者名: S. Tsuru, A. Shibai, C. Furusawa
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 耐性遺伝子の除去に抗した薬剤耐性表現型の履歴依存的な維持 (2019)
  • 著者名/発表者名: 小金澤優太、佐藤守俊、若本祐一
  • 学会等名: 第13回細菌学若手コロッセウム in みやぎ蔵王
• [学会発表] 耐性遺伝子の除去に抗した薬剤耐性表現型の履歴依存的な維持 (2019)
  • 著者名/発表者名: 小金澤優太、佐藤守俊、若本祐一
  • 学会等名: 第91回日本遺伝学会
• [学会発表] 全自動培養システムを用いた多種ストレス環境下における大腸菌の大規模実験室進化 (2019)
  • 著者名/発表者名: 前田智也、岩澤諄一郎、堀之内貴、阪田奈津枝、川田正子、小谷葉月、酒井亜希、田邊久美、古澤力
  • 学会等名: 第13回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] 細菌の薬剤耐性進化における変異率と進化速度の関係 (2019)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚, 井筒弥那子, 古澤力
  • 学会等名: 第13回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] High-throughput Laboratory Evolution of E. coli to Unveil Phenotypic Plasticity and Constraint (2019)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 細菌の抗生物質耐性進化における最適変異率モデルと実験検証 (2018)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚, 井筒弥那子, 古澤力
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 「生物の状態変化をどのように記述すべきか：実験室進化と理論解析」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第6回MACSコロキウム
  • 招待講演
• [学会発表] 「細胞状態の記述・予測・制御へ向けて：構成的実験と理論解析」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: JST-CRDS 多次元生命システム研究開発戦略 科学技術未来ワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] 全自動培養システムを用いた多種ストレス環境下における大腸菌の大規模実験室進化 (2018)
  • 著者名/発表者名: 前田智也、堀之内貴明、阪田奈津枝、川田正子、小谷葉月、酒井亜希、田邊久美、古澤力
  • 学会等名: 生命科学系フロンティアミーティング2018
• [学会発表] High-throughput Laboratory Evolution of E. coli to Unveil Phenotypic Plasticity and Constraint (2018)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa
  • 学会等名: 46th Naito Conference, Sapporo
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 大規模実験室進化を用いた転写因子の破壊による大腸菌の薬剤耐性化の制御 (2018)
  • 著者名/発表者名: 堀之内貴明, 前田智也 小谷葉月, 酒井亜希, 古澤力
  • 学会等名: 日本生物工学会第70回大会
• [学会発表] 高変異率条件における細菌の長期実験進化 (2018)
  • 著者名/発表者名: 芝井厚, 堀之内貴明, 古澤力, 津留三良
  • 学会等名: 日本進化学会第20回大会
• [学会発表] 「生物システムの記述と制御に向けて：大腸菌進化実験と理論解析」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第15回 生物数学の理論とその応用 -次世代の数理科学への展開-
  • 招待講演
• [学会発表] 「表現型進化はどのように拘束されているか：進化実験を用いた定量解析」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 進化学会第20会大会
  • 招待講演
• [学会発表] High-throughput laboratory evolution of E. coli: toward understanding of phenotypic plasticity and constraint (2018)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa
  • 学会等名: Euro EvoDevo2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] High-throughput Laboratory Evolution of E. coli to Unveil Phenotypic Plasticity and Constraint (2018)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa
  • 学会等名: 1st Asia Evo., China
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 大腸菌進化実験を用いた進化的拘束の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 生命の起源および進化学会第43 回学術講演会
  • 招待講演
• [学会発表] Phenotypic Constraints Shaped by Evolution: Numerical and Experimental Approaches (2017)
  • 著者名/発表者名: 7.Chikara Furusawa, Kunihiko Kaneko, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda
  • 学会等名: 生物物理学会第55 回年会
• [学会発表] 大腸菌の人工進化実験における表現型・遺伝子型の網羅的解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 学会等名: 第16 回微生物研究会-微生物の多様な生き様にせまる
  • 招待講演
• [学会発表] 大規模実験室進化とオミックス解析による大腸菌のストレス耐性機構の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 堀之内貴明, 前田智也, 古澤力
  • 学会等名: 第69 回生物工学会大会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 大腸菌実験室進化とオミックス解析を用いて大腸菌の適応進化過程を解析する (2017)
  • 著者名/発表者名: 堀之内貴明, 前田智也, 古澤力
  • 学会等名: 第五回NGS現場の会
  • 招待講演
• [学会発表] 全自動培養システムを用いた多種ストレス環境下における大腸菌の大規模実験室進化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 前田智也, 堀之内貴明, 阪田奈津枝, 小谷葉月, 酒井亜希, 田邊久美, 古澤力
  • 学会等名: 第12回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] 全自動培養システムを用いた多種ストレス環境化における大腸菌進化ダイナミクスの解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 前田智也, 堀之内貴明, 阪田奈津枝, 小谷葉月, 酒井亜希, 田邊久美, 古澤力
  • 学会等名: 第16 回微生物研究会
• [学会発表] Phenotypic diversity and constraints in microbial adaptive evolution (2017)
  • 著者名/発表者名: Chikara Furusawa
  • 学会等名: Les Houches School“Evolution of Diversity ”
  • 国際学会 / 招待講演
• [図書] 細胞の理論生物学 (2020)
  • 著者名/発表者名: 金子 邦彦、澤井 哲、高木 拓明 、古澤 力
  • 総ページ数: 352
  • 出版者: 東京大学出版会
  • ISBN: 9784130626217
• [図書] 定量生物学 (2018)
  • 著者名/発表者名: 古澤力
  • 総ページ数: 290
  • 出版者: 化学同人
  • ISBN: 9784759817300
• [図書] あなたのラボにAI（人工知能）×ロボットがやってくる (2017)
  • 著者名/発表者名: 夏目 徹
  • 総ページ数: 144
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758122368
• [備考] ロボットによる微生物の大規模進化実験 －薬剤耐性進化を支配する拘束条件を発見－
  • URL: https://www.riken.jp/press/2020/20201124_3/