バクテリオファージに学ぶ発動分子システムの創成

• 研究領域: 発動分子科学：エネルギー変換が拓く自律的機能の設計
• 研究課題/領域番号: 18H05421
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 複合領域
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 上野 隆史 東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (70332179)
• 研究分担者: 金丸 周司 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (50376951)
• 研究期間 (年度): 2018-06-29 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 72,930千円 (直接経費: 56,100千円、間接経費: 16,830千円); 2022年度: 15,340千円 (直接経費: 11,800千円、間接経費: 3,540千円); 2021年度: 14,820千円 (直接経費: 11,400千円、間接経費: 3,420千円); 2020年度: 14,430千円 (直接経費: 11,100千円、間接経費: 3,330千円); 2019年度: 17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円); 2018年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
• キーワード: バクテリオファージT4 / 生体超分子 / 高速AFM / T４ファージ / タンパク質集合体 / HSAFM / ソフトマター / 分子機械 / 高速原子間力顕微鏡 / バクテリオファージ / 分子針 / 自己集合 / 超分子化学

研究成果の概要

生命環境では、様々なタンパク質が特異な集合構造を形成し、自発的に機動する分子機関が構築されている。本研究では、巨大分子集合体がさらに集合化して構造体として組み上がるためのタンパク質針精密設計として、gp5の結晶構造やHSAFMの実験結果と分子動力学計算を元に、分子機関としての機能を精密に制御したタンパク質針を実現した。二次元表面の上でgp5の精密な集積を実現するため、異方的な集合構造をとるたんぱく質改変を施した。その結果、高速AFMの実験結果を数理モデルを用いた解析により理解することによって、理論計算からモデルを構築し、新たな集合体形成のメカニズム解明へとつなげることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の特色は、巨大生体超分子の部品蛋白質を基盤とした発動分子を作成することによって、部品蛋白質の機能を発動分子の合成に利用し、本来の機能を拡張する点にある。天然の蛋白質集合体がもつ発動分子としての特徴を使いこなすことができれば、蛋白質ー蛋白質相互作用が関与する様々な生体分子の動きの機能を理解することが可能となり、蛋白質集合体を化学ツールとする革新的な分子操作技術の開発や、生命現象に内在する発動分子科学の基礎原理の理解へと展開し、細胞生物学やケミカルバイオロジー研究にも大きなインパクトを与える新しい生体機能化学分野が拓かれると確信する。

研究成果

• [国際共同研究] 清華大学(中国)
• [国際共同研究] TATA Institute of Fundamental Research(インド)
• [国際共同研究] ナポリ大学(イタリア)
• [国際共同研究] 清華大学(中国)
• [国際共同研究] TATA基礎科学研究所(インド)
• [国際共同研究] 南洋理工大学(シンガポール)
• [国際共同研究] 清華大学(中国)
• [国際共同研究] マサチューセッツ工科大学(米国)
• [国際共同研究] TATA基礎科学研究所(インド)
• [国際共同研究] 清華大学(中国)
• [国際共同研究] KAIST(韓国)
• [国際共同研究] NTU(シンガポール)
• [雑誌論文] Apo-ferritin-Caged Pt Nanoparticles for Selective Hydrogenation of Chloronitrobenzene (2023)
  • 著者名/発表者名: Zhou Yinhuan、Zheng Yilin、Lu Chenlin、Maity Basudev、Chen Yakui、Ueno Takafumi、Liu Zheng、Lu Diannan
  • 雑誌名: ACS Applied Nano Materials 巻: in press 号: 7 ページ: 5835-5843
  • DOI: 10.1021/acsanm.3c00231
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Engineering of an in-cell protein crystal for fastening a metastable conformation of a target miniprotein (2023)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Yuki Hishikawa, Akio Kitao, Takafumi Ueno
  • 雑誌名: Biomaterial Science 巻: 11 号: 4 ページ: 1350-1357
  • DOI: 10.1039/d2bm01759h
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design of a Hierarchical Assembly at a Solid Liquid Interface Using an Asymmetric Protein Needle (2023)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi Kosuke、Date Koki、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Langmuir 巻: 39 号: 6 ページ: 2389-2397
  • DOI: 10.1021/acs.langmuir.2c03146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell-free protein crystallization for nanocrystal structure determination (2022)
  • 著者名/発表者名: Abe Satoshi、Tanaka Junko、Kojima Mariko、Kanamaru Shuji、Hirata Kunio、Yamashita Keitaro、Kobayashi Ayako、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 16031-16031
  • DOI: 10.1038/s41598-022-19681-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Artificial metalloenzymes based on protein assembly (2022)
  • 著者名/発表者名: Maity Basudev、Taher Mohd、Mazumdar Shyamalava、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Coordination Chemistry Reviews 巻: 469 ページ: 214593-214593
  • DOI: 10.1016/j.ccr.2022.214593
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Design of a gold clustering site in an engineered apo-ferritin cage (2022)
  • 著者名/発表者名: Lu Chenlin、Maity Basudev、Peng Xue、Ito Nozomi、Abe Satoshi、Sheng Xiang、Ueno Takafumi、Lu Diannan
  • 雑誌名: Communications Chemistry 巻: 5 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/s42004-022-00651-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Controlled Uptake of an Iridium Complex inside Engineered apo‐Ferritin Nanocages: Study of Structure and Catalysis** (2022)
  • 著者名/発表者名: Taher Mohd、Maity Basudev、Nakane Taiki、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Mazumdar Shyamalava
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: 61 号: 13
  • DOI: 10.1002/anie.202116623
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Importance of the Subunit?Subunit Interface in Ferritin Disassembly: A Molecular Dynamics Study (2022)
  • 著者名/発表者名: Li Zhipeng、Maity Basudev、Hishikawa Yuki、Ueno Takafumi、Lu Diannan
  • 雑誌名: Langmuir 巻: 38 号: 3 ページ: 1106-1113
  • DOI: 10.1021/acs.langmuir.1c02753
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Engineering of protein crystals for use as solid biomaterials (2022)
  • 著者名/発表者名: Kojima Mariko、Abe Satoshi、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Biomaterials Science 巻: 10 号: 2 ページ: 354-367
  • DOI: 10.1039/d1bm01752g
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein Needles Designed to Self‐Assemble through Needle Tip Engineering (2022)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi Kosuke、Fukuyama Tatsuya、Uchihashi Takayuki、Furuta Tadaomi、Maeda Yusuke T.、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Small 巻: 18 号: 10 ページ: 2106401-2106401
  • DOI: 10.1002/smll.202106401
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic Behavior of Cargo Proteins Regulated by Linker Peptides on a Protein Needle Scaffold (2022)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Que D.、Kikuchi Kosuke、Kojima Mariko、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 51 号: 1 ページ: 73-76
  • DOI: 10.1246/cl.210599
  • NAID: 130008137585
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solubility enhancement of poorly water soluble domperidone by complexation with the large ring cyclodextrin (2021)
  • 著者名/発表者名: Ismail Abbas、Kerdpol Khanittha、Rungrotmongkol Thanyada、Tananuwong Kanitha、Ueno Takafumi、Ekasit Sanong、Muangsin Nongnuj、Krusong Kuakarun
  • 雑誌名: International Journal of Pharmaceutics 巻: 606 ページ: 120909-120909
  • DOI: 10.1016/j.ijpharm.2021.120909
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Design of in‐cell protein crystal for environmentally responsive construction of a supramolecular filament (2021)
  • 著者名/発表者名: Abe Satoshi、Pham Thuc Toan、Negishi Hashiru、Yamashita Keitaro、Hirata Kunio、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: - 号: 22 ページ: 12341-12345
  • DOI: 10.1002/anie.202102039
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Versatile Manipulations of Self-Assembled Proteins in Vaccine Design (2021)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Que Dan、Kikuchi Kosuke、Maity Basudev、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 22 号: 4 ページ: 1934-1934
  • DOI: 10.3390/ijms22041934
  • 査読あり
• [雑誌論文] In-Cell Engineering of Protein Crystals with Nanoporous Structures for Promoting Cascade Reactions (2021)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Tien K.、Abe Satoshi、Kasamatsu Makoto、Maity Basudev、Yamashita Keitaro、Hirata Kunio、Kojima Mariko、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: ACS Applied Nano Materials 巻: 4 号: 2 ページ: 1672-1681
  • DOI: 10.1021/acsanm.0c03129
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-molecule level dynamic observation of disassembly of the apo-ferritin cage in solution (2020)
  • 著者名/発表者名: Maity Basudev、Li Zhipeng、Niwase Kento、Ganser Christian、Furuta Tadaomi、Uchihashi Takayuki、Lu Diannan、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Physical Chemistry Chemical Physics 巻: 22 号: 33 ページ: 18562-18572
  • DOI: 10.1039/d0cp02069a
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Design of Multinuclear Gold Binding Site at the Two-fold Symmetric Interface of the Ferritin Cage. (2020)
  • 著者名/発表者名: Yuki Hishikawa,Basudev Maity,Nozomi Ito,Satoshi Abe,Diannan Lu,Takafumi Ueno.
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 49 号: 7 ページ: 840-844
  • DOI: 10.1246/cl.200217
  • NAID: 130007872571
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Dynamic behavior of an artificial protein needle contacting a membrane observed by high-speed atomic force microscopy (2020)
  • 著者名/発表者名: Ueno Takafumi、Niwase Kento、Tsubokawa Daisho、Kikuchi Kosuke、Takai Natsumi、Furuta Tadaomi、Kawano Ryuji、Uchihashi Takayuki
  • 雑誌名: Nanoscale 巻: in press 号: 15 ページ: 8166-8173
  • DOI: 10.1039/d0nr01121e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-Selective Protein Chemical Modification of Exposed Tyrosine Residues Using Tyrosine Click Reaction (2020)
  • 著者名/発表者名: Sato Shinichi、Matsumura Masaki、Kadonosono Tetsuya、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Ueda Hiroshi、Nakamura Hiroyuki
  • 雑誌名: Bioconjugate Chemistry 巻: in press 号: 5 ページ: 1417-1424
  • DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.0c00120
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coordination design of cadmium ions at the 4-fold axis channel of the apo-ferritin cage (2019)
  • 著者名/発表者名: Abe Satoshi、Ito Nozomi、Maity Basudev、Lu Chenlin、Lu Diannan、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Dalton Transactions 巻: 印刷中 号: 26 ページ: 9759-9764
  • DOI: 10.1039/c9dt00609e
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Recent progresses in the accumulation of metal ions into the apo-ferritin cage: Experimental and theoretical perspectives (2019)
  • 著者名/発表者名: Maity Basudev、Hishikawa Yuki、Lu Diannan、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Polyhedron 巻: 印刷中 ページ: 104-111
  • DOI: 10.1016/j.poly.2019.03.048
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Engineering of protein crystals for development of bionanomaterials (2019)
  • 著者名/発表者名: T. K. Nguyen, T. T. Pham, and T Ueno
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 巻: 印刷中
  • NAID: 210000156508
  • 査読あり
• [雑誌論文] Encapsulation of biomacromolecules by soaking and co-crystallization into porous protein crystals of hemocyanin (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsubasa Hashimoto, Yuxin Ye, Asuka Matsuno, Yuki Ohnishi, Akira Kitamura, Masataka Kinjo, Satoshi Abe, Takafumi Uenod, Min Yao, Tomohisa Ogawa, Takashi Matsuia, Yoshikazu Tanaka
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 509 号: 2 ページ: 577-584
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.12.096
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Construction of supramolecular nanotubes from protein crystals (2019)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Tien Khanh、Negishi Hashiru、Abe Satoshi、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Chemical Science 巻: 10 号: 4 ページ: 1046-1051
  • DOI: 10.1039/c8sc04167a
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photoinduced in Vivo Magnetic Resonance Imaging (MRI) with Rapid CO Release from an MnCO-Protein Needle Composite (2018)
  • 著者名/発表者名: Hyodo Fuminori、Sho Takeya、Maity Basudev、Fujita Kenta、Tachibana Yoko、Akashi Satoko、Mano Megumi、Hishikawa Yuki、Matsuo Masayuki、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Chemistry - A European Journal 巻: 24 号: 45 ページ: 11578-11583
  • DOI: 10.1002/chem.201802445
  • 査読あり
• [雑誌論文] Raman spectroscopy insight into Norovirus encapsulation in Bombyx mori cypovirus cubic microcrystals (2018)
  • 著者名/発表者名: Mori Hajime、Oda Naoki、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Zhu Wenliang、Pernstich Chris、Pezzotti Giuseppe
  • 雑誌名: Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 巻: 203 ページ: 19-30
  • DOI: 10.1016/j.saa.2018.05.066
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Photocatalytic hydrogen evolution systems constructed in cross-linked porous protein crystals (2018)
  • 著者名/発表者名: Tabe Hiroyasu、Takahashi Hikaru、Shimoi Takuya、Abe Satoshi、Ueno Takafumi、Yamada Yusuke
  • 雑誌名: Applied Catalysis B: Environmental 巻: 印刷中 ページ: 1124-1129
  • DOI: 10.1016/j.apcatb.2018.01.046
  • NAID: 120006939381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functionalization of protein crystals with metal ions, complexes and nanoparticles (2018)
  • 著者名/発表者名: Abe Satoshi、Maity Basudev、Ueno Takafumi
  • 雑誌名: Current Opinion in Chemical Biology 巻: 43 ページ: 68-76
  • DOI: 10.1016/j.cbpa.2017.11.015
  • 査読あり
• [学会発表] 生体材料の自律的合成 -静から働の機能へ向けて- (2023)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
  • 招待講演
• [学会発表] 発動分子システムを基盤とする 生体分子集合体材料の創成 (2023)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
  • 招待講演
• [学会発表] Encapsulation of α-Synuclein in Ferritin cage (2023)
  • 著者名/発表者名: Riwa Hao, Basudev Maity, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Crystallization of ferritin directly from E. Coli cell lysate and structure determination (2023)
  • 著者名/発表者名: Basudev Maity, Date Koki, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Molecular design for immobilizing foreign molecules into porous protein crystals (2023)
  • 著者名/発表者名: Yao Xinchen, Yuki Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] In-cell protein crystal engineering for structure determination of intrinsically disordered protein (2023)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103nd CSJ Annual Meeting (2023)
• [学会発表] Stabilization of an in-cell protein crystal by engineering the molecular interface (2023)
  • 著者名/発表者名: Misaki Nagama, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Structure analysis of pH-responsive piston dynamics of R-body (2023)
  • 著者名/発表者名: DATE Koki, Thuc Toan PHAM, Hyeonho LEE, UCHIHASHI Takayuki, KAMIKUBO Hironari, SONG Chihong, MURATA Kazuyoshi, UENO Takafumi
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting (2023)
• [学会発表] Engineering of in-cell Protein Crystals for the Construction of Solid Materials (2023)
  • 著者名/発表者名: satoshi Abe, Junko Tanaka, Yuto Nakasuji, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Accumulation of Protein Cage into in-cell Protein Crystal (2023)
  • 著者名/発表者名: Toan Thuc Pham, Koki Date, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Construction of antifreeze protein like semi-clathrate hydrate in the ferritin cage (2023)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Basudev Maity, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 103rd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Developing protein-cellulose nanocrystal hybrid films for structural coloration (2023)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Kikuchi, Bruno Frka-Petesic, Silvia Vignolini, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 103rd CSJAnnual Meeting
• [学会発表] タンパク質結晶化を促進する細胞内鋳型結晶設計 (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Yuki Kojima, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
• [学会発表] Nanocrystal Structure Determination Using Cell-free Protein Crystallization (2022)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: AsCA2022
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] フェリチンを用いたトリプトファン集積構造の構築 (2022)
  • 著者名/発表者名: Asuka Asanuma, Yuki Hishikawa, Hiroki Noya, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 12th CSJ Chemistry Festa
• [学会発表] pH応答性伸縮タンパク質集合体の細胞内形成メカニズム (2022)
  • 著者名/発表者名: Koki Date, Toan Thuc Pham, Hyeonho Lee, Kosuke Kikuchi, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 12th CSJ Chemistry Festa
• [学会発表] タンパク質集合材料の 構造・機能・動き (2022)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第71回高分子討論会
  • 招待講演
• [学会発表] Comprehensive structure analysis of intrinsically disordered protein using in-cell protein crystal (2022)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Full-length structure analysis of Cry1Aa from Bt bacteria for designing in-cell protein crystal template (2022)
  • 著者名/発表者名: Junko Tanaka, Satoshi Abe, Tohru Hayakawa, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 16th Symposium on Biorelevant Chemistry
• [学会発表] Cell-free protein crystallization for rapid structure analysis (2022)
  • 著者名/発表者名: Junko Tanaka, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 71st Symposium on Macromolecules
• [学会発表] Structural analysis of pH-responsive piston protein assembly (2022)
  • 著者名/発表者名: DATE Koki, Thuc Toan PHAM, UCHIHASHI Takayuki, KAMIKUBO Hironari, SONG Chihong, MURATA Kazuyoshi, UENO Takafumi
  • 学会等名: The 16th Symposium on Biorelevant Chemistry
• [学会発表] Protein crystallization and structure analysis using cell-free protein synthesis (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Junko Tanaka, Yuki Kojima, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 人工タンパク質針を内包した細胞内タンパク質結晶材料の創成 (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Toan Thuc Pham, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] Construction of histidine clusters in a ferritin cage for the oxidase-mimetic catalysis (2022)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Basudev Maity, Abe Satoshi, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 71st Symposium on Macromolecules
• [学会発表] Head-to-head and Tail-to-tail Dual Interactions by Head-tail Asymmetric Protein Needles for Designing Hierarchical Two-dimensional Assembly Networks Head-tail (2022)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Kikuchi, Koki Date, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 71st Symposium on Macromolecules
• [学会発表] Engineering of Protein Cage for Coordination Nanomaterials (2022)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: XXX International Materials Research Congress
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 無細胞タンパク質結晶化を用いたナノ結晶構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Junko Tanaka, Yuki Kojima, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [学会発表] In-cell Synthesis of Cage-Based Protein Solid Material (2022)
  • 著者名/発表者名: Yuto Nakasuji, Satoshi Abe, Hironari Kamikubo, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [学会発表] Reaction mechanism of pH responsive piston protein assembly (2022)
  • 著者名/発表者名: Koki Date, Thuc Toan Pham, Tatsuya Niwa, Taguchi Hideki, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 71st SPSJ Annual Meeting
• [学会発表] In-situ analysis of in-cell protein crystallization (2022)
  • 著者名/発表者名: Yuto Nakasuji, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 71st SPSJ Annual Meeting
• [学会発表] Construction of Antifreeze protein like semi-clathrate hydrate in the ferritin cage (2022)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Kenji Yasuda, Basudev Maity, Satoshi Abe, Takeshi Murata, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 71st SPSJ annual meeting
• [学会発表] Functionalization of amyloid beta peptide into ferritin cage and observation of the cage disassembly. (2022)
  • 著者名/発表者名: Basudev Maity, Shiori Kameyama, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Analysis of Dynamic Behavior of Aromatic Interactions using Protein Cages (2022)
  • 著者名/発表者名: Yuki Hishikawa, Asuka Asanuma, Basudev Maity, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Dynamics structural analysis of miniprotein by in-cell crystal engineering (2022)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kojima, Yuki Hishikawa, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] 無細胞タンパク質結晶エンジニアリングによる構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 田中 潤子, 安部 聡, 金丸 周司, 上野 隆史
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] In-cell crystal engineering for the development of solid biomaterials (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Mariko Kojima, Junko Tanaka, Yuto Nakasuji, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Structural investigation of a semi-clathrate hydrate formation using porous ferritin crystals (2022)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Basudev Maity, Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] Design of the heteroepitaxial vertical assembly of asymmetric protein needles (2022)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Kikuchi, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 102nd CSJ Annual Meeting
• [学会発表] タンパク質ケージ内芳香族クラスターによる蛍光分子特性制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, MAITYBASUDEV, 吉沢道人, 森本 正和, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 迅速タンパク質結晶化とサブミクロン結晶構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡, 田中潤子, 上野隆史
  • 学会等名: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 無細胞タンパク質合成を利用した結晶化とサブミクロン結晶構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 70th Symposium on Macromolecules
• [学会発表] Effect of Alanine substitution at the 2-fold symmetric interface of the ferritin cage (2021)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Basudev Maity, Satoshi Abe, Kenji Yasuda, Takeshi Murata, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 70th Symposium on Macromolecules
• [学会発表] βヘリックスタンパク質分子針の末端設計による二次元集合制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菊池 幸祐, 福山達也, 古田 忠臣, 内橋 貴之, 前多裕介, 上野 隆史
  • 学会等名: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] タンパク質分子針の末端構造設計による二次元集合パターン制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菊池 幸祐, 福山達也, 古田 忠臣, 前多裕介, 内橋 貴之, 上野 隆史
  • 学会等名: 第１回発動分子科学研究会
• [学会発表] 細胞内タンパク質結晶を利用した天然変性タンパク質の構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] DESIGN OF IN-CELL PROTEIN CRYSTALS FOR DEVELOPMENT OF BIO-SOLID MATERIALS (2021)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe, Takafumi Ueno
  • 学会等名: 22nd American Conference on Crystal Growth and Epitaxy (ACCGE-22)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] タンパク質ケージ結晶を用いた芳香族クラスターの動的挙動解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, 野谷大樹, MAITYBASUDEV, 長門石 曉, 津本浩平, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: The 70th SPSJ Annual Meeting
• [学会発表] タンパク質分子針の末端設計による二次元集合パターン制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菊池幸祐, 福山達也, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史
  • 学会等名: The 70th SPSJ Annual Meeting
• [学会発表] The role of helix modification in building hybrid ferritin cages (2021)
  • 著者名/発表者名: Jiaxin Tian, Kenji Yasuda, Basudev Maity, Satoshi Abe, Takeshi Murata, Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 70th SPSJ Annual Meeting
• [学会発表] β-ヘリックス人工分子針の動的集合設計 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菊池幸祐, 福山達也, Maity Basudev, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史
  • 学会等名: 日本化学会第101春季年会
• [学会発表] タンパク質ケージ内における芳香族分子集積と反応制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, 野谷大樹, Basudev Maity, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 日本化学会第101回春季年会
• [学会発表] Energy Analysis of Miniprotein by in Vivo Protein Crystallization (2021)
  • 著者名/発表者名: 小島 摩利子, 菱川 湧輝, 安部 聡, 古田 忠臣, Tran Phuoc Duy, 北尾 彰朗, 上野 隆史
  • 学会等名: 日本化学会第101春季年会
• [学会発表] Design of the two-dimensional protein assembly patterns by β-helical protein needle (2020)
  • 著者名/発表者名: 菊池 幸祐, 上野 隆史
  • 学会等名: 第69回高分子討論会
• [学会発表] 無細胞タンパク質合成による微小結晶構造解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 第14回バイオ関連化学シンポジウム2020
• [学会発表] タンパク質ケージを利用した芳香族クラスターの構築と外来分子内包 (2020)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, 野谷大樹, Basudev Maity, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 発動分子科学第5回領域会議
• [学会発表] Construction of Fibril Protein Assemblies From Engineered Protein Crystals (2020)
  • 著者名/発表者名: PHAM Toan Thuc, 安部 聡, 根岸 走, 上野 隆史
  • 学会等名: 69th Symposium on Macromolecules
• [学会発表] Construction of Filament Protein Assembly From Autonomous Cross-Linked Crystals (2020)
  • 著者名/発表者名: PHAM Toan Thuc, 安部 聡, 根岸 走, 上野 隆史
  • 学会等名: 14th Bio-related Chemistry Symposium
• [学会発表] タンパク質結晶工学による新機能材料 (2020)
  • 著者名/発表者名: 上野隆史
  • 学会等名: 第28回ポリマー材料フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] GPCR 内包を目指したタンパク質ハイブリッド結晶の構築 (2020)
  • 著者名/発表者名: 田中潤子, 安部聡, 長田俊哉, 上野隆史
  • 学会等名: 第 10 回 CSJ 化学フェスタ
• [学会発表] Molecular design of protein needle for norovirus vaccine (2020)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Dan Que, 上野 隆史
  • 学会等名: 第 10 回 CSJ 化学フェスタ
• [学会発表] Protein Crystals for Designing Multiple Nanofunctions (2020)
  • 著者名/発表者名: 上野 隆史
  • 学会等名: The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 招待講演
• [学会発表] 細胞内タンパク質結晶化の最適化と迅速構造解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡, 小島摩利子, 小暮遼河, 上野隆史
  • 学会等名: 第14回バイオ関連シンポジウム
• [学会発表] フェリチンケージのサブユニット界面を利用した多核金結合サイトの構築 (2020)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, Basudev Maity, 安部聡, Diannan Lu, 上野隆史
  • 学会等名: 第70回錯体化学会討論会
• [学会発表] タンパク質ケージの内部空間設計による芳香族クラスターの構築 (2020)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, 野谷大樹, Basudev Maity, 安部聡, 上野隆史
  • 学会等名: 第14回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] In vivo Protein Crystal Engineering for Structure Analysis of Meta-stable State Mini-protein (2020)
  • 著者名/発表者名: 小島 摩利子, 安部 聡, 上野 隆史
  • 学会等名: 第69回高分子討論会
• [学会発表] タンパク質の迅速結晶化とサブミクロン結晶の構造解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡, 小島摩利子, 上野隆史
  • 学会等名: 第69回高分子討論会
• [学会発表] かご状タンパク質フェリチンのサブユニット界面における金集積機構の解明 (2020)
  • 著者名/発表者名: 菱川湧輝, Basudev Maity, 安部聡, Diannan Lu, 上野隆史
  • 学会等名: 第69回高分子学会年次大会
• [学会発表] タンパク質の細胞内迅速・微量結晶化と構造解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡, 小島摩利子, 小暮遼河, 上野隆史
  • 学会等名: 第69回高分子学会年次大会
• [学会発表] Construction of Fibril Protein Assembly From Protein Crystals (2020)
  • 著者名/発表者名: Thuc Toan PHAM,Satoshi Abe,Hashiru Negishi,Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 100th CSJ Annual Meeting
• [学会発表] ミニタンパク質融合多角体タンパク質の細胞内結晶化 (2020)
  • 著者名/発表者名: 小島摩利子,安部聡,上野隆史
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会
• [学会発表] Design of the Two-dimensional Protein Assembly Patterns by Modifying the Tip of β-helical Protein Needle (2020)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Kikuchi,Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 100th CSJ Annual Meeting
• [学会発表] タンパク質の迅速構造解析を目指した多角体の結晶化設計 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡,小島摩利子,小暮遼河,上野隆史
  • 学会等名: 日本化学会 第100春季年会（2020）
• [学会発表] 細胞内結晶化の最適化 (2020)
  • 著者名/発表者名: 小暮遼河,安部 聡,上野隆史
  • 学会等名: 日本化学会 第100春季年会（2020）
• [学会発表] Disassembly reaction of the ferritin cage observed by high-speed AFM (2020)
  • 著者名/発表者名: MAITY Basudev,Zhipeng LI,Kento NIWASE,Diannan LU,Takafumi UENO,Takafumi
  • 学会等名: The 100th Annual Meeting 2020 of CSJ
• [学会発表] Artifical enzymes Artifical enzymes using protein assemblies (2020)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 8th ELSI SYMPOSIUM EXTENDING VIEWS OF CATALYSIS
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 外来タンパク質固定化のための細胞内タンパク質結晶の空間設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡,上野隆史
  • 学会等名: 日本結晶学会令和元年（2019年度）年会
• [学会発表] 高速原子間力顕微鏡による針状タンパク質の集合体構造の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 菊池幸祐,上野隆史
  • 学会等名: 第9回CSJ化学フェスタ2019
• [学会発表] Engineering of Protein Assembly? for Coordination Chemistry (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 12th CJJSMCC 2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] アミロイドβ融合蛋白質ケージの設計とその動的挙動解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 亀山志織,MAITYBASUDEV,安部聡,上野隆史
  • 学会等名: 第9回CSJ化学フェスタ
• [学会発表] 多角体タンパク質の結晶化設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡,小島摩利子,上野隆史
  • 学会等名: 第13回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 原子、分子そして生命へ (2019)
  • 著者名/発表者名: 上野隆史
  • 学会等名: 錯体化学会第69回討論会
  • 招待講演
• [学会発表] ミニタンパク質融合多角体タンパク質の結晶設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 小島摩利子,安部聡,上野隆史
  • 学会等名: 第13回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 高速原子間力顕微鏡による針状タンパク質の集合体観察 (2019)
  • 著者名/発表者名: 菊池幸祐,上野隆史
  • 学会等名: 第68回高分子討論会
• [学会発表] アミロイドβオリゴマー形成機序の解明に向けた融合蛋白質ケージの設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 亀山志織,MAITYBASUDEV,安部聡,上野隆史
  • 学会等名: 第13回バイオ関連化学シンポジウム
  • 国際学会
• [学会発表] 球状タンパク質フェリチンを用いたアミロイドβオリゴマーの動的挙動追跡 (2019)
  • 著者名/発表者名: 亀山志織,MAITYBASUDEV,安部聡,上野隆史
  • 学会等名: 第68回高分子討論会
• [学会発表] Construction of Supramolecular Structures from Protein Crystals (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 10th International Conference on Materials for Advanced Technologies
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Construction of Protein Needle with Cargo Protein from Norovirus (2019)
  • 著者名/発表者名: Que Dan NGUYEN,Kazuhiko Katayama,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 10th International Conference on Materials for Advanced Technologies
  • 国際学会
• [学会発表] Assembly Formation of Needle-Like Protein from Bacteriophage T4 Observed by High Speed Atomic Force Microscopy (2019)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Kikuchi,Kento Niwase,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 10th International Conference on Materials for Advanced Technologies
  • 国際学会
• [学会発表] In Cell Protein Crystals Containing Organometallic Complexes (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Creation of functional materials using in vivo protein crystals (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Abe,Makoto Kasamatsu,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第68回高分子年次大会
• [学会発表] In vivo crystallization of polyhedra protein fused with metal binding peptide” (2019)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kojima,Satoshi Abe,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 第68回高分子学会年次大会
• [学会発表] Protein Crystal Engineering for Coordination Chemistry (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: China-Japan Symposium of Functional Coordination Chemistry
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] In cell design of protein assembly materials (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: Japan-BIOCEV conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Solid-biocatalysts constructed from immobilized enzymes within in vivo protein crystals (2019)
  • 著者名/発表者名: Tien Khanh Nguyen,Satoshi Abe,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 13th Biofunctioned conference
• [学会発表] Solid biocatalysts designed from in vivo protein crystals (2019)
  • 著者名/発表者名: Tien Khanh Nguyen,Satoshi Abe,Takafumi Ueno
  • 学会等名: 68th Symposium on Macromolecules
• [学会発表] タンパク質結晶工学による新機能材料 (2019)
  • 著者名/発表者名: 上野隆史
  • 学会等名: 第28回ポリマー材料フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] Protein crystals for designing biosupramolecular materials (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: Tokyo Tech NCCR Molecular Systems Engineering Joint Symposium, Basel,
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Bioinorganic Design of Protein Assembly (2019)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 2019 KAIST School of Molecular Science BK21 Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metal Coordination Functions Designed in Protein Cage (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 3rd Japan-UK Joint Symposium on Coordination Chemistry
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metal Coordination and Function Designed in Protein Assembly (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: 2018 Korea-Taiwan-Japan Bioinorganic Chemistry Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Functional Design of Protein Cage for Sustainable Bionanomaterial (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: ASPIRE League forum
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Functions designed in Crystalline Protein Assembly? (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: JST Fujita ACCEL International Symposium Coordination Chemistry for Structural Elucidation ICCC2018?
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Dynamic Process of Proteins Observed in Crystalline Cages (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 79th Okazaki Conference Synthetic, Biological, and Hybrid Molecular Engines
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Dynamic Function of Crystalline Protein Assembly (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: ACSIN-14 & ICSPM26, Nanobiology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Artificial metalloproteins constructed with protein assemblies for bioinorganic materials (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 18th Japan-Korea Joint Symposium on Organometallic and Coordination Chemistry
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Artificial metalloproteins constructed with protein assemblies for bionano applications (2018)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Ueno
  • 学会等名: The 9th Asian Biological Inorganic Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [図書] Cell-Inspired Materials and Engineering (2021)
  • 著者名/発表者名: H. Tabe and T. Ueno
  • 総ページ数: 257
  • 出版者: Springer
• [図書] 機能性高分子金属錯体 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡、上野隆史
  • 出版者: 三共出版
• [図書] 光エネルギー変換における分子触媒の新展開 (2020)
  • 著者名/発表者名: 安部 聡、上野隆史
  • 出版者: 化学同人
• [備考] Ueno Lab
  • URL: https://www.ueno.bio.titech.ac.jp/
• [備考] Ueno Lab
  • URL: http://www.ueno.bio.titech.ac.jp/
• [備考] ueno lab
  • URL: http://www.ueno.bio.titech.ac.jp/index.html
• [産業財産権] ＭＨＣ分子に適合する病原微生物由来のペプチドが担持された複合ポリペプチド単量体、当該単量体の会合体、及び当該会合体を有効成分とするコンポーネントワクチン (2021)
  • 発明者名: 上野 隆史／Nguyen Dan Que
  • 権利者名: 上野 隆史／Nguyen Dan Que
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2021-001522
  • 出願年月日: 2021
• [産業財産権] コロナウイルスの蛋白質が担持された複合ポリペプチド単量体、当該単量体の会合体、及び当該会合体を有効成分とするコンポーネントワクチン (2020)
  • 発明者名: 上野隆史、片山和彦
  • 権利者名: 上野隆史、片山和彦
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2020-088508
  • 出願年月日: 2020
• [産業財産権] 融合タンパク質及びその使用 (2019)
  • 発明者名: 上野隆史、亀山志織
  • 権利者名: 上野隆史、亀山志織
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2018-088420
  • 出願年月日: 2019