発動分子を合理設計・理論計算するための物理化学評価と構造基盤の確立

• 研究領域: 発動分子科学：エネルギー変換が拓く自律的機能の設計
• 研究課題/領域番号: 18H05425
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 複合領域
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 村田 武士 千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (80415322)
• 研究分担者: 長門石 曉 東京大学, 医科学研究所, 特任准教授 (30550248)
• 研究期間 (年度): 2018-06-29 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 125,710千円 (直接経費: 96,700千円、間接経費: 29,010千円); 2022年度: 20,280千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 4,680千円); 2021年度: 23,140千円 (直接経費: 17,800千円、間接経費: 5,340千円); 2020年度: 22,620千円 (直接経費: 17,400千円、間接経費: 5,220千円); 2019年度: 20,800千円 (直接経費: 16,000千円、間接経費: 4,800千円); 2018年度: 38,870千円 (直接経費: 29,900千円、間接経費: 8,970千円)
• キーワード: 発動分子 / 構造基盤 / 物理化学評価

研究成果の概要

本研究領域では、外部エネルギーを受け取ることで機械的な構造変化を起こし、これを利用して別の形のエネルギーへと変換する分子装置を「発動分子」と名付け、これを構築するための基礎学理を築くことを目的としている。本計画班は、研究対象となる各種発動分子（回転型、リニア型、光駆動型、シグナル伝達型などの生体および人工ハイブリッド発動分子）の物理化学的性質と立体構造情報を明らかすることに成功した。そして、発動分子を合理設計・理論計算するための物理化学評価と構造基盤を確立し、「発動分子科学」の発展に貢献した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で得られた成果は、原著論文発表や学会発表、プレスリリース発信を基盤に、科学系雑誌や新聞、インターネット等のメディアを通じて広く発信した。回転型発動分子の成果は、多剤耐性菌に対する抗菌薬の開発に生かされている。リニア型発動分子の成果は、巨大化植物の開発に貢献している。光駆動型（およびシグナル伝達型）発動分子の成果は、光センサーへの応用や新たな創薬開発に役立つことが期待される。以上のことから、本研究成果は「発動分子科学」の発展に貢献するのみならず、日本国民の生活向上にも貢献するものである。

研究成果

• [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)
• [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)
• [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)
• [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)
• [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)
• [国際共同研究] Medical Research Council/University of Oxford/Imperial College London(英国)
• [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)
• [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)
• [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)
• [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)
• [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)
• [雑誌論文] Biophysical Characterization of the Contribution of the Fab Region to the IgG-FcγRIIIa Interaction (2022)
  • 著者名/発表者名: Kosuge Hirofumi、Nagatoishi Satoru、Kiyoshi Masato、Ishii-Watabe Akiko、Terao Yosuke、Ide Teruhiko、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 62 号: 2 ページ: 262-269
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.1c00832
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structure and role of the linker domain of the iron surface-determinant protein IsdH in heme transportation in Staphylococcus aureus. (2022)
  • 著者名/発表者名: Valenciano-Bellido Sandra、Caaveiro Jose M.M.、Morante Koldo、Sushko Tatyana、Nakakido Makoto、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: - 号: 6 ページ: 101995-101995
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2022.101995
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Targeted delivery of lipid nanoparticle to lymphatic endothelial cells via anti-podoplanin antibody (2022)
  • 著者名/発表者名: Sakurai Yu、Abe Nodoka、Yoshikawa Keito、Oyama Ryotaro、Ogasawara Satoshi、Murata Takeshi、Nakai Yuta、Tange Kota、Tanaka Hiroki、Akita Hidetaka
  • 雑誌名: Journal of Controlled Release 巻: 349 ページ: 379-387
  • DOI: 10.1016/j.jconrel.2022.06.052
  • 査読あり
• [雑誌論文] Revealing a Hidden Intermediate of Rotatory Catalysis with X-ray Crystallography and Molecular Simulations (2022)
  • 著者名/発表者名: Shekhar Mrinal、Gupta Chitrak、Suzuki Kano、Chan Chun Kit、Murata Takeshi、Singharoy Abhishek
  • 雑誌名: ACS Central Science 巻: 8 号: 7 ページ: 915-925
  • DOI: 10.1021/acscentsci.1c01599
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A methodology for creating thermostabilized mutants of G‐protein coupled receptors by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering (2022)
  • 著者名/発表者名: Sugaya Kanna、Yasuda Satoshi、Sato Shingo、Sisi Chen、Yamamoto Taisei、Umeno Daisuke、Matsuura Tomoaki、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 31 号: 9
  • DOI: 10.1002/pro.4404
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A methodology for creating mutants of G‐protein coupled receptors stabilized in active state by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering (2022)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto Taisei、Yasuda Satoshi、Kasai Rinshi S.、Nakano Ryosuke、Hikiri Simon、Sugaya Kanna、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Shiroishi Mitsunori、Fujiwara Takahiro K.、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 31 号: 10
  • DOI: 10.1002/pro.4425
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identifying antibiotics based on structural differences in the conserved allostery from mitochondrial heme-copper oxidases. (2022)
  • 著者名/発表者名: Nishida Y, Yanagisawa S, Morita R, Shigematsu H, Shinzawa-Itoh K, Yuki H, Ogasawara S, et al
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 13 号: 1 ページ: 7591-7591
  • DOI: 10.1038/s41467-022-34771-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Assessment of anisotropic transmembrane transport coefficient vector of cell-spheroid under inhomogeneous ion concentration distribution fields by electrical impedance tomography (2022)
  • 著者名/発表者名: Li Songshi、Kawashima Daisuke、Okeyo Kennedy Omondi、Murata Takeshi、Takei Masahiro
  • 雑誌名: Measurement Science and Technology 巻: 34 号: 3 ページ: 035701-035701
  • DOI: 10.1088/1361-6501/acaa4a
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Controlling the Rigidity of Kinesin-Propelled Microtubules in an In Vitro Gliding Assay Using the Deep-Sea Osmolyte Trimethylamine N-Oxide (2022)
  • 著者名/発表者名: Kabir Arif Md. Rashedul、Munmun Tasrina、Hayashi Tomohiko、Yasuda Satoshi、Kimura Atsushi P.、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi、Sada Kazuki、Kakugo Akira
  • 雑誌名: ACS Omega 巻: 7 号: 4 ページ: 3796-3803
  • DOI: 10.1021/acsomega.1c06699
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Discovery of ultrafast myosin, its amino acid sequence, and structural features (2022)
  • 著者名/発表者名: Haraguchi Takeshi、Tamanaha Masanori、Suzuki Kano、Yoshimura Kohei、Imi Takuma、Tominaga Motoki、Sakayama Hidetoshi、Nishiyama Tomoaki、Murata Takeshi、Ito Kohji
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 119 号: 8
  • DOI: 10.1073/pnas.2120962119
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino Acid Mutations (2022)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Satoshi、Akiyama Tomoki、Kojima Keiichi、Ueta Tetsuya、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Kunishima Naoki、Sudo Yuki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 126 号: 5 ページ: 1004-1015
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.1c08684
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural characterization of proton-pumping rhodopsin lacking a cytoplasmic proton donor residue by X-ray crystallography (2022)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Kano、del Carmen Mar?n Maria、Konno Masae、Bagherzadeh Reza、Murata Takeshi、Inoue Keiichi
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 298 号: 3 ページ: 101722-101722
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2022.101722
  • 査読あり
• [雑誌論文] State-Targeting Stabilization of Adenosine A2A Receptor by Fusing a Custom-Made De Novo Designed α-Helical Protein (2021)
  • 著者名/発表者名: Mitsumoto Masaya、Sugaya Kanna、Kazama Kazuki、Nakano Ryosuke、Kosugi Takahiro、Murata Takeshi、Koga Nobuyasu
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 22 号: 23 ページ: 12906-12906
  • DOI: 10.3390/ijms222312906
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-based screening combined with computational and biochemical analyses identified the inhibitor targeting the binding of DNA Ligase 1 to UHRF1 (2021)
  • 著者名/発表者名: Kori Satomi、Shibahashi Yuki、Ekimoto Toru、Nishiyama Atsuya、Yoshimi Sae、Yamaguchi Kosuke、Nagatoishi Satoru、Ohta Masateru、Tsumoto Kouhei、Nakanishi Makoto、Defossez Pierre-Antoine、Ikeguchi Mitsunori、Arita Kyohei
  • 雑誌名: Bioorg Med Chem 巻: 52 ページ: 116500-116500
  • DOI: 10.1016/j.bmc.2021.116500
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Regulation of cadherin dimerization by chemical fragments as a trigger to inhibit cell adhesion (2021)
  • 著者名/発表者名: Senoo Akinobu、Ito Sho、Nagatoishi Satoru、Saito Yutaro、Ueno Go、Kuroda Daisuke、Yoshida Kouhei、Tashima Takumi、Kudo Shota、Sando Shinsuke、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 4 号: 1 ページ: 1041-1041
  • DOI: 10.1038/s42003-021-02575-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mechanism of dimerization and structural features of human LI-cadherin (2021)
  • 著者名/発表者名: Yui Anna、Caaveiro Jose M.M.、Kuroda Daisuke、Nakakido Makoto、Nagatoishi Satoru、Goda Shuichiro、Maruno Takahiro、Uchiyama Susumu、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 297 号: 3 ページ: 101054-101054
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2021.101054
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Anion solvation enhanced by positive supercharging mutations preserves thermal stability of an antibody in a wide pH range (2021)
  • 著者名/発表者名: Kasahara Keisuke、Kuroda Daisuke、Tanabe Aki、Kawade Raiji、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 563 ページ: 54-59
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.05.053
  • 査読あり
• [雑誌論文] Further thermo‐stabilization of thermophilic rhodopsin from Thermus thermophilus JL ‐18 through engineering in extramembrane regions (2021)
  • 著者名/発表者名: Akiyama Tomoki、Kunishima Naoki、Nemoto Sayaka、Kazama Kazuki、Hirose Masako、Sudo Yuki、Matsuura Yoshinori、Naitow Hisashi、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 巻: 89 号: 3 ページ: 301-310
  • DOI: 10.1002/prot.26015
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM Structure of K+-Bound hERG Channel Complexed with the Blocker Astemizole (2021)
  • 著者名/発表者名: Asai Tatsuki、Adachi Naruhiko、Moriya Toshio、Oki Hideyuki、Maru Takamitsu、Kawasaki Masato、Suzuki Kano、Chen Sisi、Ishii Ryohei、Yonemori Kazuko、Igaki Shigeru、Yasuda Satoshi、Ogasawara Satoshi、Senda Toshiya、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Structure 巻: 29 号: 3 ページ: 203-212.e4
  • DOI: 10.1016/j.str.2020.12.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Measurement of the Intestinal pH in Mice under Various Conditions Reveals Alkalization Induced by Antibiotics (2021)
  • 著者名/発表者名: Shimizu Kouki、Seiki Issei、Goto Yoshiyuki、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Antibiotics 巻: 10 号: 2 ページ: 180-180
  • DOI: 10.3390/antibiotics10020180
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Thermodynamic Dissection of Potency and Selectivity of Cytosolic Hsp90 Inhibitors (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura Chihoko、Nagatoishi Satoru、Kuroda Daisuke、Kodama Yasuo、Uno Takao、Kitade Makoto、Chong-Takata Khoontee、Oshiumi Hiromi、Muraoka Hiromi、Yamashita Satoshi、Kawai Yuichi、Ohkubo Shuichi、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Journal of Medicinal Chemistry 巻: 64 号: 5 ページ: 2669-2677
  • DOI: 10.1021/acs.jmedchem.0c01715
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic identification and validation of novel interactions of the putative tumor suppressor PRELP with membrane proteins including IGFI-R and p75NTR (2021)
  • 著者名/発表者名: Kosuge Hirofumi、Nakakido Makoto、Nagatoishi Satoru、Fukuda Tetsuya、Bando Yasuhiko、Ohnuma Shin-ichi、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 296 ページ: 100278-100278
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100278
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Theoretical identification of thermostabilizing amino acid mutations for G-protein-coupled receptors (2020)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata、Satoshi Yasuda、Tomohiko Hayashi、Masahiro Kinoshita
  • 雑誌名: Biophysical Reviews 巻: － 号: 2 ページ: 323-332
  • DOI: 10.1007/s12551-020-00678-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Domain architecture divergence leads to functional divergence in binding and catalytic domains of bacterial and fungal cellobiohydrolases (2020)
  • 著者名/発表者名: Nakamura A, Ishiwata D, Visootsat A, Uchiyama T, Mizutani K, Kaneko S, Murata T, Igarashi K, Iino R
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 295 号: 43 ページ: 14606-14617
  • DOI: 10.1074/jbc.ra120.014792
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crystal structure of an anti-podoplanin antibody bound to a disialylated O-linked glycopeptide (2020)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara S, Suzuki K, Naruchi K, Nakamura S, Shimabukuro J, Tsukahara N, Kaneko MK, Kato Y, Murata T
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 533 号: 1 ページ: 57-63
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.08.103
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An affinity change model to elucidate the rotation mechanism of V1-ATPase (2020)
  • 著者名/発表者名: Arai Satoshi、Maruyama Shintaro、Shiroishi Mitsunori、Yamato Ichiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 533 号: 4 ページ: 1413-1418
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.10.033
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly sensitive HPLC analysis and biophysical characterization of N‐glycans of IgG‐Fc domain in comparison between CHO and 293 cells using FcγRIIIa ligand (2020)
  • 著者名/発表者名: Kosuge Hirofumi、Nagatoishi Satoru、Kiyoshi Masato、Ishii‐Watabe Akiko、Tanaka Toru、Terao Yosuke、Oe Seigo、Ide Teruhiko、Tsumoto Kouhei
  • 雑誌名: Biotechnology Progress 巻: 36 号: 6
  • DOI: 10.1002/btpr.3016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidation of cosolvent effects thermostabilizing water-soluble and membrane proteins (2020)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Satoshi、Kazama Kazuki、Akiyama Tomoki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Journal of Molecular Liquids 巻: 301 ページ: 112403-112403
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2019.112403
  • 査読あり
• [雑誌論文] How Does a Microbial Rhodopsin RxR Realize Its Exceptionally High Thermostability with the Proton-Pumping Function Being Retained? (2020)
  • 著者名/発表者名: Hayashi Tomohiko、Yasuda Satoshi、Suzuki Kano、Akiyama Tomoki、Kanehara Kanae、Kojima Keiichi、Tanabe Mikio、Kato Ryuichi、Senda Toshiya、Sudo Yuki、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 124 号: 6 ページ: 990-1000
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b10700
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methodology for Further Thermostabilization of an Intrinsically Thermostable Membrane Protein Using Amino Acid Mutations with Its Original Function Being Retained (2020)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Satoshi、Akiyama Tomoki、Nemoto Sayaka、Hayashi Tomohiko、Ueta Tetsuya、Kojima Keiichi、Tsukamoto Takashi、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Sudo Yuki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
  • 雑誌名: Journal of Chemical Information and Modeling 巻: 60 号: 3 ページ: 1709-1716
  • DOI: 10.1021/acs.jcim.0c00063
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-molecule analysis reveals rotational substeps and chemo-mechanical coupling scheme of Enterococcus hirae V1-ATPase (2019)
  • 著者名/発表者名: Iida Tatsuya、Minagawa Yoshihiro、Ueno Hiroshi、Kawai Fumihiro、Murata Takeshi、Iino Ryota
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 294 号: 45 ページ: 17017-17030
  • DOI: 10.1074/jbc.ra119.008947
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Application of High-Sensitivity UV photoemission Spectroscopy to Examine the Electronic Structure of Thermophilic Rhodopsin (2019)
  • 著者名/発表者名: Sano Daisuke、Ide Ichiro、Akiyama Tomoki、Tanaka Yuya、Sudo Yuki、Murata Takeshi、Ishii Hisao
  • 雑誌名: Molecular Crystals and Liquid Crystals 巻: 687 号: 1 ページ: 34-39
  • DOI: 10.1080/15421406.2019.1648052
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metastable asymmetrical structure of shaftless V1 motor (2019)
  • 著者名/発表者名: S. Maruyama, K. Suzuki, M. Imamura, H. Sasaki, H. Matsunami, K. Mizutani, Y. Saito, F. L. Imai, Y. Ishizuka-Katsura, T. Kimura-Someya, M. Shirouzu, T. Uchihashi, T. Ando, I. Yamato, T. Murata
  • 雑誌名: Sci. Adv. 巻: 5 号: 1
  • DOI: 10.1126/sciadv.aau8149
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rotational Mechanism Model of the Bacterial V1 Motor Based on Structural and Computational Analyses (2019)
  • 著者名/発表者名: Singharoy A, Chipot C, Ekimoto T, Suzuki K, Ikeguchi M, Yamato I, Murata T.
  • 雑誌名: Front Physiol. 巻: 10 ページ: 1-12
  • DOI: 10.3389/fphys.2019.00046
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Analyses based on statistical thermodynamics for large difference between thermophilic rhodopsin and xanthorhodopsin in terms of thermostability (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Satoshi、Hayashi Tomohiko、Kajiwara Yuta、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
  • 雑誌名: The Journal of Chemical Physics 巻: 150 号: 5 ページ: 055101-055101
  • DOI: 10.1063/1.5082217
  • NAID: 40022492153
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Off-axis rotor in Enterococcus hirae V-ATPase visualized by Zernike phase plate single-particle cryo-electron microscopy (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsunoda Jun、Song Chihong、Imai Fabiana Lica、Takagi Junichi、Ueno Hiroshi、Murata Takeshi、Iino Ryota、Murata Kazuyoshi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 15632-15632
  • DOI: 10.1038/s41598-018-33977-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular basis for governing the morphology of type-I collagen fibrils by Osteomodulin (2018)
  • 著者名/発表者名: Takumi Tashima , Satoru Nagatoishi, Jose M.M. Caaveiro, Makoto Nakakido, Hiroshi Sagara, Osamu Kusano-Arai, Hiroko Iwanari, Hitomi Mimuro, Takao Hamakubo, Shin-ichi Ohnuma and Kouhei Tsumoto
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 1:33 号: 1 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1038/s42003-018-0038-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Inhibition of homophilic dimerization and disruption of cell adhesion by P-cadherin-specific small molecules from SPR-based assays (2018)
  • 著者名/発表者名: Senoo A, Nagatoishi S, Moberg A, Babol LN, Mitani T, Tashima T, Kudo S, Tsumoto K.
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 54 号: 42 ページ: 5350-5353
  • DOI: 10.1039/c8cc01964a
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] 発動分子を合理設計・理論計算するための構造基盤 (2023)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 日本化学会第103春季年会
  • 招待講演
• [学会発表] 抗体創薬のための物性解析：これまでとこれから (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉, 津本浩平
  • 学会等名: 第1回日本抗体学会
  • 招待講演
• [学会発表] 生命分子に対する多元機能解明のための物理化学的相互作用解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] Search for Small Molecule Ligands That Functionally Regulate Proteins Based on Calorimetric Analysis (2022)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nagatoishi
  • 学会等名: 11th Japan-China Joint Symposium on Calorimetry and Thermal Analysis (CATS-2022)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] FcγRIIIa受容体の固定化系と溶液系における抗体認識機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉, 木下清晶, 黒田大祐, 小菅啓史, 木吉真人, 石井明子, 寺尾陽介, 井出輝彦, 津本浩平
  • 学会等名: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 物理化学解析を駆使した Protein-Protein Interaction阻害剤開発への挑戦 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉
  • 学会等名: 創薬懇話会2022
• [学会発表] 計算科学により強化される 蛋白質のリガンド結合に関する物理化学解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] P糖タンパク質の構造ダイナミクスと薬物相互作用 (2022)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 日本薬物動態学会 第37回年会年会
  • 招待講演
• [学会発表] GPCRの耐熱化戦略 (2022)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 第96回日本薬理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 抗体を用いた膜タンパク質の精製・機能解析システムの構築 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 諭、陳 思思、中川 史、渋谷 南美、濱口 紀江、佐久間 一輝、宮下 靖臣、安田 賢司、村田 武士
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 統計熱力学計算と進化分子工学を融合した GPCR 耐熱化置換体の構築手法の開発 (2022)
  • 著者名/発表者名: 安田 賢司、菅谷 幹奈、佐藤 愼吾、藤木 祐美、陳 思思、林 智彦、小笠原 諭、木下 正弘、村田 武士
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 新型コロナウイルス 3CL プロテアーゼ阻害剤が結合した P 糖タンパク質のクライオ電子顕微鏡単粒子解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 濱口 紀江、安達 成彦、今野 翔、川崎 政人、守屋 俊夫、安田 賢司、小笠原 諭、林 良雄、千田 俊哉、村田 武士
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 理論計算と進化分子工学の融合によるリガンド結合非依存的に活性型へシフトする GPCR 変異体 のスクリーニング (2022)
  • 著者名/発表者名: 山本 大生、笠井 倫志、肥喜里 志門、藤原 敬宏、中野 僚介、菅谷 幹奈、安田 賢司、小笠原 諭、白石 充典、木下 正弘、村田 武士
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Discovery of the fastest myosin, its amino acid sequence, and structural features (2022)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Haraguchi, Masanori Tamanaha, Kano Suzuki, Kohei Yoshimura, Takuma Imi, Motoki Tominaga, Hidetoshi Sakayama, Tomoaki Nishiyama, Takeshi Murata, Kohji Ito
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Molecular structure dynamics identification method development based on High speed AFM imaging data (2022)
  • 著者名/発表者名: Yui Kanaoka, Yuto Nonaka, Norie Hamaguchi, Takeshi Murata, Florence Tama, Takayuki Uchihashi
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 高速 AFM による ABC トランスポーター P-gp の動態観察 (2022)
  • 著者名/発表者名: Yuto Nonaka, Norie Hamaguchi, Fuhito Nakagawa, Satoshi Ogasawara, Takesi Murata, Takayuki Uchihashi
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Single-molecule analysis and engineering of rotary V-ATPase (2022)
  • 著者名/発表者名: 大友 章裕、飯田 龍也、上野 博史、村田 武士、飯野 亮太
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino-acid Mutations (2022)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata, Satoshi Yasuda, Tomoki Akiyama, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: 第19回レチナール蛋白質国際会議
  • 国際学会
• [学会発表] 抗His-tagモノクローナル抗体を用いたアフィニティー精製系の最適化 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 諭、陳 思思、渋谷 南美、中川 史、濱口 紀江、宮下 靖臣、安田 賢司、村田 武士
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡を用いた薬物動態関連膜タンパク質P糖タンパク質の三次元立体構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 濱口 紀江、安達 成彦、守屋 俊夫、川崎 政人、安田 賢司、千田 俊哉、小笠原 諭、村田 武士
  • 学会等名: 第96回日本薬理学会年会
• [学会発表] 様々なIgG型抗体に関するFcγRIIIaの物理化学的相互作用解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉, 小菅啓史, 木吉真人, 石井明子, 寺尾陽介, 井出輝彦, 津本浩平
  • 学会等名: 日本薬学会第142年会
• [学会発表] 熱力学および速度論を基点とした蛋白質を制御する低分子リガンドの開発 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉
  • 学会等名: 日本化学会 第102春季年会
• [学会発表] 膜タンパク質の構造解析・機能解析のためのアフィニティ精製システムの構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 諭、稲村 光亮、陳 思思、中川 史、安田 賢司、村田 武士
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学年会
• [学会発表] 融合パートナータンパク質のデノボデザインによる GPCR の状態選択的安定化 (2021)
  • 著者名/発表者名: 三本 斉也、菅谷 幹奈、風間 一輝、中野 僚介、小杉 貴洋、村田 武士、 古賀 信康
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学年会
• [学会発表] 膜蛋白質の抗体アフィニティ精製システムの構築 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 諭、陳 思思、中川 史、渋谷 南美、安田 賢司、村田 武士
  • 学会等名: 量子生命科学会第3回大会
• [学会発表] G タンパク質共役型受容体を熱安定化するアミノ酸置換の理論的予測法の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 安田賢司、林智彦、小笠原 諭、村田 武士、木下正弘
  • 学会等名: 量子生命科学会第3回大会
• [学会発表] G タンパク質共役型受容体を熱安定化するアミノ酸置換の理論的予測法の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 菅谷 幹奈 安田 賢司、佐藤 愼吾、藤木祐美、陳 思思、小笠原 諭、木下 正弘、村田 武士
  • 学会等名: 第 2 回 発動分子科学研究会
• [学会発表] Design schemes for peptides imitating β-hairpin conformation of VHH CDR3 (2021)
  • 著者名/発表者名: 山本 晃一、中木戸 誠、黒田 大祐、長門石 曉、森本 淳平、山東 信介、津本 浩平
  • 学会等名: 2021年度医科研発表会
• [学会発表] M.R.S.A: fighting with antibodies (2021)
  • 著者名/発表者名: Valenciano Bellido S, Caaveiro J.M.M, Nakakido M, Nagatoishi S, Tsumoto K.
  • 学会等名: 2021年度医科研発表会
• [学会発表] Bioengineering of antibodies: the double antibody (2021)
  • 著者名/発表者名: Valenciano S, Caaveiro J.M.M, Nakagawa I, Nakakido M, Nagatoishi S,Tsumoto K
  • 学会等名: UoT-MaC-UT workshop
  • 国際学会
• [学会発表] 抗体表面への正荷電残基変異導入による抗体のpH非依存的な熱安定性獲得機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 笠原 慶亮、黒田 大祐、河出 来時、田部 亜季、長門石 曉、津本 浩平
  • 学会等名: 第59回 日本生物物理学会年会
• [学会発表] aHUSに関連する補体抑制因子CFHと診断薬取得に向けた特異的抗体の機能解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 横尾 尚典、田部 亜季、中木戸 誠、長門石 曉、カアベイロ ホセ、吉田 瑶子、池田 洋一郎、南学 正臣、津本 浩平
  • 学会等名: 第21回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] A novel homodimerization mechanism of LI-cadherin (2021)
  • 著者名/発表者名: nna YuiJose M. M. Caaveiro, Daisuke Kuroda, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Takahiro Maruno, Susumu Uchiyama, and Kouhei Tsumoto
  • 学会等名: The Protein Society 35th Annual Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] プロテオーム解析に基づく腫瘍抑制蛋白質PRELPと膜蛋白質の新規相互作用探索と機能解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 小菅 啓史、中木戸 誠、長門石 曉、福田 哲也、板東 泰彦、大沼 信一、津本 浩平
  • 学会等名: 第94回 日本生化学会大会
• [学会発表] Analysis of the molecular mechanisms involved in the recognition of antigen and the regulation of function by antibodies (2021)
  • 著者名/発表者名: 氏家 寛、田部 亜季、長門石 曉、津本 浩平
  • 学会等名: 第44回 日本分子生物学会
• [学会発表] Fragment-based screening and hit validation targeting enzymes and protein-protein interactions by SPR and ITC (2021)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
  • 学会等名: PACIFICHEM 2021
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 滴定型熱量測定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 長門石 曉
  • 学会等名: 第7回蛋白質工学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Interaction analysis between small-molecules and proteins using HDX-MS in physicochemical screening (2021)
  • 著者名/発表者名: Satoru NAGATOISHI, Kouhei TSUMOTO
  • 学会等名: 第69回質量分析総合討論会
• [学会発表] バンコマイシン耐性腸球菌V-ATPaseの生化学 (2021)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 第９４回日本細菌学会総会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 化膿連鎖球菌由来金属獲得蛋白質MtsAに対する機能阻害剤の探索 (2021)
  • 著者名/発表者名: 中木戸 誠、竹内 美結、長門石 曉、相川 知宏、中川 一路、津本 浩平
  • 学会等名: 第94回 日本細菌学会総会
• [学会発表] Structure of the voltage-dependent potassium channel (hERG) using cryo-electron microscopy (2020)
  • 著者名/発表者名: Tatsuki Asai, Kano Suzuki, Naruhiko Adachi, Masato Kawasaki, Toshio Moriya, Toshiya Senda, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)
• [学会発表] Single-molecule analysis of rotation of Enterococcus hirae V-ATPase depending on sodium ion concentration (2020)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Otomo, Tatsuya Iida, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)
• [学会発表] V1-ATPaseの回転メカニズムを明らかにする親和性変化モデル (2020)
  • 著者名/発表者名: 丸山 慎太郎、新井 聡、白石 充典、山登 一郎、村田 武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会第46回討論会
• [学会発表] 蛋白質-蛋白質間相互作用の速度論的制御に基づくP-カドヘリンの細胞接着形成阻害 (2020)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、長門石 曉、黒田 大祐、伊藤 翔、上野 剛、齋藤 雄太朗、吉田 浩平、田島 卓実、工藤 翔太、山東 信介、津本 浩平
  • 学会等名: 第14回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] aHUSに関連する補体抑制因子CFHと特異的抗体の機能解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 横尾 尚典、田部 亜季、中木戸 誠、長門石 曉、吉田 瑶子、池田 洋一郎、南学 正臣、津本 浩平
  • 学会等名: 第93回 日本生化学会大会
• [学会発表] 計算デザイン Supercharging 抗体の物性機能解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 笠原 慶亮、黒田 大祐 、河出 来時 、田部 亜季 、長門石 曉 、津本 浩平
  • 学会等名: 第48回 構造活性相関シンポジウム
• [学会発表] HDX-MSを活用したP-カドヘリンのホモ複合体に対する低分子阻害剤開発 (2020)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、長門石 曉、伊藤 翔、上野 剛、津本 浩平
  • 学会等名: 第16回 日本臨床プロテオゲノミクス研究会
• [学会発表] Proteomic Identification And Validation Of New Interactions Of Novel Tumor Suppressor PRELP With Membrane Proteins (2020)
  • 著者名/発表者名: Kosuge H, Nakakido M, Nagatoishi S, Fukuda T, Bando Y, Ohnuma S, Tsumoto K
  • 学会等名: 第20回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 化膿連鎖球菌の金属獲得蛋白質MtsAに対する機能阻害剤の探索 (2020)
  • 著者名/発表者名: 竹内 美結、中木戸 誠、長門石 曉、河出 来時、相川 知宏、中川 一路、津本 浩平
  • 学会等名: 第93回 日本生化学会大会
• [学会発表] Inhibition of P-cadherin-mediated cell contact formation through the kinetic effect of chemical fragment (2020)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、齋藤 雄太朗、伊藤 翔、長門石 曉、上野 剛、吉田 浩平、田島 卓実、工藤 翔太、山東 信介、津本 浩平
  • 学会等名: 第20回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] The Molecular Basis of How SNP in LI-cadherin Affected Cancer Metastasis (2020)
  • 著者名/発表者名: 由井 杏奈、菊池 智佳、郷田 秀一郎、工藤 翔太、秋葉 宏樹、中木戸 誠、黒田大祐、長門石 曉
  • 学会等名: 第20回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Molecular basis of increased risk of colorectal cancer metastasis caused by SNPs in LI-cadherin (2020)
  • 著者名/発表者名: 由井 杏奈、菊池 智佳、郷田 秀一郎、丸野 孝浩、内山 進、中木戸 誠、黒田大祐、長門石 曉、新井 修、岩成 宏子、浜窪 隆雄、津本 浩平
  • 学会等名: 第58回 日本生物物理学会年会
• [学会発表] VHH抗体β-hairpin型CDR3を利用したペプチド設計手法の探索 (2020)
  • 著者名/発表者名: 山本晃一、中木戸 誠、黒田 大祐、長門石 曉、森本 淳平、山東 信介、津本 浩平
  • 学会等名: 第43回 日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of new antibacterial drug targeting V-ATPase in Vancomycin-resistant Enterococcus (2019)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Bioenergetics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 統計熱力学から理解する膜タンパク質の熱安定性の原理 (2019)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 第19回蛋白質科学会・第71回細胞生物学会
  • 招待講演
• [学会発表] 耐熱性ロドプシンの立体構造と耐熱化メカニズム (2019)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: ISSPワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] 回転分子モータータンパク質によるプロトン輸送メカニズム (2019)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 第９２回日本生化学会
  • 招待講演
• [学会発表] Rotational molecular mechanism of bacterial V1-ATPase (2019)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata
  • 学会等名: 2nd Tokyo ATPase Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 素人でもなんとかなるクライオEM (2019)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 日本分子生物学会フォーラム企画
  • 招待講演
• [学会発表] 多剤耐性腸球菌V-ATPaseを標的とした新規抗菌薬の開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 村田武士
  • 学会等名: 第2回構造生命科学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] 薬剤耐性腸球菌V-ATPaseを標的とした新規抗菌薬の開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 清水 康輝、森山 克彦、後藤 義幸、村田 武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会
• [学会発表] バンコマイシン耐性腸球菌に存在するV-ATPaseを分子標的とした新規抗菌薬の開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 清水 康輝、薬師寺 リカ ファビアナ、森山 克彦、後藤 義幸、村田 武士
  • 学会等名: 第92回日本細菌学会総会
• [学会発表] Inhibition of V-ATPase decrease the growth of Vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) specifically (2019)
  • 著者名/発表者名: Kouki Shimizu, Fabiana Lica Yakushiji, Katsuhiko Moriyama, Yoshiyuki Goto, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第2回AMED薬剤耐性シンポジウム
• [学会発表] Na+-transporting V-ATPase is a new target for drug development against Vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) (2019)
  • 著者名/発表者名: Kouki Shimizu, Fabiana Lica Yakushiji, Katsuhiko Moriyama, Yoshiyuki Goto, Takeshi Murata
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Bioenergetics
  • 国際学会
• [学会発表] Structural insights into the subtype-selective antagonist binding to the M2 muscarinic receptor (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryoji Suno, Sangbae Lee, Shoji Maeda, Satoshi Yasuda, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita, Masaki Yamamoto, Brian Kobilka, Nagarajan Vaidehi, So Iwata, Takuya Kobayashi
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Theoretical Prediction of Thermostabilizing Mutations for GPCR: Identification of Hot-Spot Residues to be Mutated Common in Class A GPCRs (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Yuki Takamuku, Nanao Suzuki, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] The combination of high-speed atomic force microscopy and X-ray crystallography reveals rotary catalysis of a shaftless V1 motor (2019)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Maruyama, Motonori Imamura, Takayuki Uchihashi, Kazuya Nakamoto, Mizutani Kenji, Lica Fabiana Imai, Kano Suzuki, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Tomomi Someya-Kimura, Mikako Shirouzu, Ichiro Yamato, Toshio Ando, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Further Thermo-Stabilization of Thermophilic Rhodopsin through Engineering in Intramembrane and Extramembrane Regions (2019)
  • 著者名/発表者名: Tomoki Akiyama, Naoki Kunishima, Masako Hirose, Sayaka Nemoto, Stoshi Yasuda, Yuki Sudo, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Tailor-made design of superstable proteins from scratch for rational stabilization of GPCR (2019)
  • 著者名/発表者名: Masaya Mitsumoto, Nanao Suzuki, Ryosuke Nakano, Takahiro Kosugi, Takeshi Murata, Nobuyasu Koga
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Chemo-mechanical coupling scheme of rotary molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase revealed by single-molecule analysis (2019)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, Ryota Iino
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] The off-axis rotor of Enterococcus hirae V-type ATPase by Volta phase contrast cryo-EM (2019)
  • 著者名/発表者名: Burton-Smith Raymond. N, Tsunoda Jun, Yamamori Yu, Miyazaki Naoyuki, Imai Fabiana L., Song Chihong, Tomii Kentaro, Iwasaki Kenji, Takagi Junichi, Ueno Hiroshi, Murata Takeshi, Iino Ryota, Murata Kazuyoshi
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] The influence of cosolvent on thermal stability of membrane proteins (2019)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Kazama, Satoshi Yasuda, Tomoki Akiyama, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
  • 学会等名: CBI学会2019年大会
• [学会発表] Development of the screening system to create GPCR mutants stabilized in active states (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryosuke Nakano, Nanao Suzuki, Simon Hikiri, Satoshi Yasuda, Mitsunori Shiroishi, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
  • 学会等名: CBI学会2019年大会
• [学会発表] Analyses based on statistical thermodynamics for large difference between thermophilic rhodopsin and xanthorhodopsin in terms of thermostability (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: CBI学会2019年大会
• [学会発表] Calorimetric Selection of Ligands to Inhibit the Protein Functions in Cell and in Vivo (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
  • 学会等名: The Seventh International Symposium on the New Frontiers of Thermal Studies of Materials
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Thermodynamic selection of ligands to inhibit the protein functions in cell and in vivo (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto
  • 学会等名: The 7th International Postgraduate Conference on Pharmaceutical Sciences
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Elucidation of the interactions for natural flexible and unstable proteins using HDX-MS (2019)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 学会等名: 第65回質量分析総合討論会
  • 招待講演
• [学会発表] 生体分子を制御する特異的リガンドの物理化学的探索と解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 学会等名: 生有研シンポジウム 2019
  • 招待講演
• [学会発表] Disruption of Homophilic Protein-protein Interaction of P-cadherin by A Fragment Compound as A Trigger To Inhibit Cell Adhesion (2019)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、長門石 曉、吉田 浩平、伊藤 翔、上野 剛、田島 卓実、工藤 翔太、津本 浩平
  • 学会等名: 33rd The Protein Society Annual Symposium
• [学会発表] Biophysics of the Protein-ligand Interactions to Regulate the Protein Function (2019)
  • 著者名/発表者名: S Nagatoishi、K Tsumoto
  • 学会等名: 10th RSC-CSJ Joint Symposium
• [学会発表] 医薬品設計の提案を指向したHDX-MSによる蛋白質間相互作用解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、 展天承、 森千夏、 中木戸誠、 津本浩平
  • 学会等名: 第15回日本臨床プロテオゲノミクス研究会
• [学会発表] 低分子リガンドによる細胞接着蛋白質P-カドヘリンの同種親和的二量体化阻害に対する分子機構解明 (2019)
  • 著者名/発表者名: 妹尾暁暢、長門石曉、吉田浩平、伊藤翔、上野剛、田島卓実、工藤翔太、津本浩平
  • 学会等名: 第19回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] S100A4-MetAP2蛋白質間相互作用に対するペプチド阻害剤の相互作用解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 片桐直宏、長門石曉、遠藤英也、津本浩平
  • 学会等名: 第19回 日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 小分子リガンドによる細胞接着蛋白質P-カドヘリンの分子間相互作用制御と構造情報に基づくリガンド設計 (2019)
  • 著者名/発表者名: 妹尾暁暢、齋藤雄太朗、伊藤翔、長門石曉、上野剛、吉田浩平、田島卓実、工藤翔太、山東信介、津本浩平
  • 学会等名: 第13回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] ホモ二量体形成蛋白質P-カドヘリンによる細胞接着阻害を可能にする新規低分子リガンド結合部位の同定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 妹尾暁暢、長門石曉、吉田浩平、伊藤翔、上野剛、田島卓実、工藤翔太、津本浩平
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] S100A4-MetAP2間相互作用に対するHelix-turn-helix構造を形成するペプチド 阻害剤の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 片桐直宏、長門石曉、遠藤英也、津本浩平
  • 学会等名: 第37回 メディシナルケミストリーシンポジウム
• [学会発表] 物理化学的手法を駆使した細胞接着蛋白質P-カドヘリンのホモ二量体化相互作用を阻害する低分子の同定とその阻害機構解明 (2019)
  • 著者名/発表者名: 妹尾暁暢、齋藤雄太朗、伊藤翔、長門石曉、上野剛、吉田浩平、田島卓実、工藤翔太、山東信介、津本浩平
  • 学会等名: 第37回 メディシナルケミストリーシンポジウム
• [学会発表] New methodologies for human membrane protein crystallography (2019)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata
  • 学会等名: Gordon Research Conference on IGF and Insulin System in Physiology and Disease
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 蛋白質-リガンド, 抗原-抗体相互作用解析における熱分析の活用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 学会等名: 熱測定スプリングスクール2019
  • 招待講演
• [学会発表] Further thermostabilization of thermophilic rhodopsin TR (2018)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata
  • 学会等名: 23th Biophysics Conference in Taiwan
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 理論計算を用いた膜蛋白質の耐熱化法の開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 村田 武士
  • 学会等名: 第４回蛋白質工学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Further thermostabilization of Microbial rhodopsins (2018)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Murata
  • 学会等名: The 79th Okazaki Conference
  • 招待講演
• [学会発表] X線結晶構造解析を用いたシャフトレスV1-ATPaseの非対称構造形成機構の探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
  • 学会等名: 量子生命科学研究会第2回学術集会
• [学会発表] N 末端側βバレルドメインのクラウン構造が非対称性を生み、恊動性を付与する (2018)
  • 著者名/発表者名: 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Immobilization of conformational state of E.hirae V-ATPase complex using PA tag system for structural analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Fabiana L Yakushiji, Jun Tsunoda, Chihong Song, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Satoshi Ogasawara, Junichi Takagi, Kazuyoshi Murata, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] all-αタンパク質のデザイン (2018)
  • 著者名/発表者名: 佐久間 航也、杉木 俊彦、鈴木 花野、小林 直也、小杉 貴洋、小林 直宏、 村田 武士、古賀 理恵、古賀 信康
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 大腸菌発現系を用いたヒト由来 A2Aアデノシン受容体の発現・精製検討 (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 七緒、高椋 勇樹、吉田 千香、村田 武士
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] G タンパク質共役受容体の不安定領域の再デザイン (2018)
  • 著者名/発表者名: 三本 斉也、村田 武士、古賀 信康
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Chemo-mechanical coupling scheme of rotary molecular motor V1-ATPase revealed by single-molecule analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, and Ryota Iino
  • 学会等名: The 79th Okazaki Conference
• [学会発表] Statistical thermodynamics on the large difference between thermophilic rhodopsin and xanthorhodopsin in terms of thermostability (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, and Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: The 79th Okazaki Conference
• [学会発表] Design of all-α proteins (2018)
  • 著者名/発表者名: Koya Sakuma, Naohiro Kobayashi, Kano Suzuki, Toshihiko Sugiki, Naoya Kobayashi, Takahiro Kosugi, Takeshi Murata, Toshimichi Fujiwara, Rie Koga, Nobuyasu Koga
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Electronic structure of a film with TR observed by technique using photoelectron emission 2: Comparison with RxR (2018)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Sano, Yuki Takeda, Tomoki Akiyama, Kanae Kanahara, Takeshi Murata, Yuki Sudo, Hisao Ishi
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Gap state of lysozyme thin film observed by high-sensitivity UV photoelectron spectroscopy (2018)
  • 著者名/発表者名: Ichiro Ide, Daisuke Sano, Shintaro Maruyama, Yuya Tanaka, Takeshi Murata, Hisao Ishii
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Physical origin of exceptionally high thermostability of thermophilic rhodopsin (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Thermostabilization of the microbial rhodopsin TR by carotenoid binding and amino-acid mutation (2018)
  • 著者名/発表者名: Tomoki Akiyama, Keigo Nishikawa, Sayaka Nemoto, Satoshi Yasuda, Daisuke Umeno, Masahiro Kinoshita, Yuki Sudo, Takeshi Murata
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Statistical thermodynamics for the extremely high thermostability of a microbial rhodopsin from the eubacterium Rubrobacter (RxR) (2018)
  • 著者名/発表者名: Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Kano Suzuki, Tomoki Akiyama, Kanae Kanehara, Yuki Sudo, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rational Design of G-Protein Coupled Receptors Stabilized in Aimed State (2018)
  • 著者名/発表者名: Masaya Mitsumoto, Ryosuke Nakano, Takeshi Murata, Nobuyasu Koga
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Efficient screening system construction to create thermo-stabilized GPCR mutants using theoretical calculation and evolutional engineering (2018)
  • 著者名/発表者名: Shingo Sato, Nanao Suzuki, Satoshi Yasuda, Yuta Kaziwara, Hiroki Nakai, Kinuka Isshiki, Tomoaki Matsuura, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
  • 学会等名: 日本分子生物学会
• [学会発表] 理論計算と進化分子工学を融合したGPCR安定化変異体スクリーニング系の構築 (2018)
  • 著者名/発表者名: 佐藤愼吾、鈴木七緒、梶原佑太、安田賢司、仲井宏紀、一色衣香、松浦友亮、木下正弘、村田武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
• [学会発表] GPCR活性型変異体スクリーニング系の構築 (2018)
  • 著者名/発表者名: 中野僚介、肥喜里志門、安田賢司、白石充典、木下正弘、村田武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
• [学会発表] メラトニン1A受容体の高発現・熱安定化改変体の創出 (2018)
  • 著者名/発表者名: 扇谷和希、佐藤愼吾、鈴木七緒、安田賢司、白石充典、木下 正弘、村田武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
• [学会発表] N末端βバレルクラウンがV1モーターの非対称構造形成に寄与する (2018)
  • 著者名/発表者名: 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、イマイ ファビアナ リカ、石塚（桂） 芳子、木村（染谷） 友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤敏夫、山登 一郎、村田 武士
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
• [学会発表] Physicochemical and Computational Analysis for S100A4-MetAP2 peptide Interaction (2018)
  • 著者名/発表者名: Naohiro Katagiri, Satoru Nagatoishi, Hideya Endo, Kouhei Tsumoto
  • 学会等名: sian Biophysics Association Symposium in conjunction with the Australian Society for Biophysics Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] 天然変性タンパク質のフラグメント化によるタンパク質間相互作用阻害リガンド探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 学会等名: 第12回バイオ関連化学シンポジウム
• [学会発表] 細胞内の蛋白質間相互作用を制御する物理化学的リガンド探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会
• [学会発表] Nanodisc-GPCRを用いた物理化学的アプローチによる低分子薬剤探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉田 浩平、長門石 曉、黒田 大祐、津本 浩平
  • 学会等名: 第9回スクリーニング学研究会
• [学会発表] SPRを用いた化膿連鎖球菌の宿主感染関連PPIを阻害する天然物化合物の探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、長門石 曉、中木戸 誠、星野 将人、中山 登、坂東 泰彦、石崎 仁將、澤 竜一、五十嵐 雅之、津本 浩平
  • 学会等名: 第9回スクリーニング学研究会
• [学会発表] LI-cadherinのTrp残基への変異導入がホモ二量体形成に与える影響 (2018)
  • 著者名/発表者名: 由井 杏奈、菊池 智佳、郷田 秀一郎、工藤 翔太、秋葉 宏樹、中木戸 誠、長門石 曉、新井 修、岩成 宏子、浜窪 隆雄、津本 浩平
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Nanodisc を用いたリン脂質二重膜環境中におけるヒトセロトニン受容体の機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉田 浩平、黒田 大祐、長門石 曉、津本 浩平
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 物理化学測定を用いた異なる脂質環境におけるセロトニン受容体の機能評価 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉田 浩平、長門石 曉、津本 浩平
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] SPRを活用した鉄獲得機構を標的とした化膿連鎖球菌に対する新規抗菌剤の探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 妹尾 暁暢、長門石 曉、福田 哲也、小尾 奈緒子、中山 登、坂東 泰彦、石崎 仁將、澤 竜一、五十嵐 雅之、津本 浩平
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] SAXS及びITCによるホモ二量体形成蛋白質LI-cadherinの物性解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 由井 杏奈、菊池 智佳、郷田 秀一郎、工藤 翔太、秋葉 宏樹、中木戸 誠、長門石 曉、新井 修、岩成 宏子、浜窪 隆雄、津本 浩平
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [図書] 医薬品開発のための分光法 (2022)
  • 著者名/発表者名: 津本 浩平、長門石 曉、半沢 宏之
  • 総ページ数: 272
  • 出版者: 講談社
  • ISBN: 9784065295823
• [図書] 創薬研究のための相互作用解析パーフェクト (2021)
  • 著者名/発表者名: 長門石曉、津本浩平
  • 総ページ数: 368
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 4758122563