• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

現代人ゲノム配列解析にもとづくヤポネシア人進化の解明

計画研究

研究領域ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
研究課題/領域番号 18H05506
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

斎藤 成也  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 特任教授 (30192587)

研究分担者 井ノ上 逸朗  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (00192500)
吉浦 孝一郎  長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (00304931)
Jinam TimothyA  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 助教 (20648258)
松波 雅俊  琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (60632635)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
98,280千円 (直接経費: 75,600千円、間接経費: 22,680千円)
2022年度: 19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円)
2021年度: 19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円)
2020年度: 19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円)
2019年度: 19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円)
2018年度: 21,320千円 (直接経費: 16,400千円、間接経費: 4,920千円)
キーワードヤポネシア人 / 現代人ゲノム / ゲノム進化 / オキナワ人 / ヤマト人 / ヤポネシア / 現代ゲノム / 人類進化 / 日本列島人 / ゲノム多様性 / うちなる二重構造 / ヤホネシア人
研究成果の概要

以下の地域からサンプルを入手した:宮古島、枕崎、五島列島、出雲、鳥取、徳島、八丈島。4人の祖父母がすべてその地域出身者である提供者からDNAサンプルを得た。沖縄地域は松波が、九州は斎藤と吉浦が、その他の地域は斎藤がサンプリングを担当した。これらのサンプルについて全ゲノムSNP多型データを決定し、Jinamらが解析して論文を発表した。八丈島については、2023年3月に訪問した際には十分な人数のサンプルを集めることができなかったので、2023年6月にもう一度八丈島を訪問し、唾液サンプルを追加収集する予定である。井ノ上は縄文時代の糞石から古代ウイルスを検出し、塩基配列を決定して論文を発表した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ヤポネシア(日本列島)のあちこちに在住する日本人からDNAサンプルを収集し、理化学研究所の発表したデータとあわせてゲノム多様性を解析したことにより、「うちなる二重構造」モデルを検証できたことは、学術的に高い意義がある。
社会的意義としては、一般の方々にも関心を持っていただける、日本人の起源に関する研究テーマだったので、多くの一般向け講演会をおこなったり、一般向けの雑誌からの執筆依頼に応じて、研究成果の流布につとめた。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 7件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (28件) (うち国際学会 6件、 招待講演 14件) 図書 (11件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Extraction of CRISPR-targeted sequences from the metagenome2022

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto Ryota、Nishimura Luca、Nguyen Phuong Thanh、Inoue Ituro
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 3 号: 3 ページ: 101525-101525

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2022.101525

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Detection of Ancient Viruses and Long-Term Viral Evolution2022

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Luca、Fujito Naoko、Sugimoto Ryota、Inoue Ituro
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 14 号: 6 ページ: 1336-1336

    • DOI

      10.3390/v14061336

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Allelic and haplotypic HLA diversity in indigenous Malaysian populations explored using Next Generation Sequencing2022

    • 著者名/発表者名
      Jinam Timothy A.、Hosomichi Kazuyoshi、Nakaoka Hirofumi、Phipps Maude E.、Saitou Naruya、Inoue Ituro
    • 雑誌名

      Human Immunology

      巻: 83 号: 1 ページ: 17-26

    • DOI

      10.1016/j.humimm.2021.09.005

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Preface to the special issue on the Yaponesia Genome Project2021

    • 著者名/発表者名
      Saitou N.
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 129 号: 1 ページ: 1-2

    • DOI

      10.1537/ase.210114

    • NAID

      130008030486

    • ISSN
      0918-7960, 1348-8570
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modern human DNA analyses with special reference to the inner dual-structure model of Yaponesian2021

    • 著者名/発表者名
      Jinam T. A., Kawai Y., and Saitou N.
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 129 号: 1 ページ: 3-11

    • DOI

      10.1537/ase.201217

    • NAID

      130008030443

    • ISSN
      0918-7960, 1348-8570
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide SNP data of Izumo and Makurazaki populations support inner-dual structure model for origin of Yamato people2021

    • 著者名/発表者名
      Jinam Timothy、Kawai Yosuke、Kamatani Yoichiro、Sonoda Shunro、Makisumi Kanro、Sameshima Hideya、Tokunaga Katsushi、Saitou Naruya
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: - 号: 7 ページ: 681-687

    • DOI

      10.1038/s10038-020-00898-3

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Robust ridge regression for estimating the effects of correlated gene expressions on phenotypic traits2020

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Michimae, Masatoashi Matsunami, Takeshi Emura
    • 雑誌名

      Environmental and Ecological Statistics

      巻: 27 号: 1 ページ: 41-72

    • DOI

      10.1007/s10651-019-00434-3

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Late Jomon male and female genome sequences from the Funadomari site in Hokkaido, Japan2019

    • 著者名/発表者名
      Kanzawa-Kiriyama Hideaki、Jinam Timothy A.、Kawai Yosuke、Sato Takehiro、Hosomichi Kazuyoshi、Tajima Atsushi、Adachi Noboru、Matsumura Hirofumi、Kryukov Kirill、Saitou Naruya、Shinoda Ken-Ichi
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 127 号: 2 ページ: 83-108

    • DOI

      10.1537/ase.190415

    • NAID

      130007696474

    • ISSN
      0918-7960, 1348-8570
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation of Face2Gene using facial images of patients with congenital dysmorphic syndromes recruited in Japan2019

    • 著者名/発表者名
      Mishima Hiroyuki、Suzuki Hisato、Doi Michiko、Miyazaki Mutsuko、Watanabe Satoshi、Matsumoto Tadashi、Morifuji Kanako、Moriuchi Hiroyuki、Yoshiura Koh-ichiro、Kondoh Tatsuro、Kosaki Kenjiro
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 64 号: 8 ページ: 789-794

    • DOI

      10.1038/s10038-019-0619-z

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Late Jomon male and female genome sequences from the Funadomari site in Hokkaido, Japan2019

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Kanzawa-Kiriyama, Timothy A. Jinam, Yosuke Kawai, Takehiro Sato, Kazuyoshi Hosomichi, Atsushi Tajima, Noboru Adachi, Hirofumi Matsumura, Kirill Kryukov, Naruya Saitou, and Ken-ichi Shinoda
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 127

    • NAID

      130007696474

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic and phenotypic landscape of the major histocompatibilty complex region in the Japanese population.2019

    • 著者名/発表者名
      Hirata J, Hosomichi K, Sakaue S, Kanai M, Nakaoka H, Ishigaki K, Suzuki K, Akiyama M, Kishikawa T, Ogawa K, Masuda T, Yamamoto K, Hirata M, Matsuda K, Momozawa Y, Inoue I, Kubo M, Kamatani Y, Okada Y.
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 51 号: 3 ページ: 470-480

    • DOI

      10.1038/s41588-018-0336-0

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Multiple conserved elements structuring inverted repeats in the mammalian coat color-related gene Asip2019

    • 著者名/発表者名
      Sakuma Y., Matsunami M., Takada T., and Suzuki H.
    • 雑誌名

      Zoological Science

      巻: 36 号: 1 ページ: 23-30

    • DOI

      10.2108/zs180081

    • NAID

      40021802414

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Detection of de novo single nucleotide variants in offspring of atomic-bomb survivors close to the hypocenter by whole-genome sequencing.2018

    • 著者名/発表者名
      Horai M, Mishima H, Hayashida C, Kinoshita A, Nakane Y, Matsuo T, Tsuruda K, Yanagihara K, Sato S, Imanishi D, Imaizumi Y, Hata T, Miyazaki Y, Yoshiura KI.
    • 雑誌名

      J Hum Genet.

      巻: 63 号: 3 ページ: 357-363

    • DOI

      10.1038/s10038-017-0392-9

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] External Edge Elimination (3E) method for phylogeney construction2022

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本進化学会第24回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヤポネシア人の起源をもとめて2022

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本遺伝学会第94回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヤポネシア人への道 はるかなり2022

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本遺人類学会・日本霊長類学会合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムから探る日本列島人の起源と成立2022

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本股関節学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム情報から復元された琉球列島人の集団史2022

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      東京外国語大学アジア・アフリカ言語文化研究所・海外学術フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヤポネシアのしっぽの集団ゲノミクス:これまでとこれから2022

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      第76回日本人 類学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヤポネシア人の「うちなる二重構造」モデルを支持するデータ2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ユーラシアにおける東西交流DNAとゲノムからさぐる2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本文化人類学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Yaponesia Genome Project - combination of genome sequence analyses of modern humans, animals, and plants as well as archeological and linguistic data analyses2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      国際分子進化学会(SMBE2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Whole genome sequence analysis of the Aeta, a First Sundaland people from the Philippines2019

    • 著者名/発表者名
      Timothy A. Jinam
    • 学会等名
      国際分子進化学会(SMBE2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Okinawa Bioinformation Bank Project: understanding human genetic diversity in the Ryukyu Archipelago2019

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      国際分子進化学会(SMBE2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ゲノムからみたヤポネシア人2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      臨床遺伝2019 in Sapporo
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新人の拡散にしたがった新しい大陸名の提唱2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 琉球列島人の集団ゲノム解析2019

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Modern genomes of people who live in South East Asia and their relationships with Yaponesians2019

    • 著者名/発表者名
      Timothy A. Jinam
    • 学会等名
      日本遺伝学会第91回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Problem when softwares for molecular evolution are applied to linguistic data2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本言語地理学会第1回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genome-wide association studies for metabolic traits in the Ryukyu populations2019

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics(ASHG2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヤポネシアゲノムプロジェクトの紹介2019

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヤポネシアゲノムプロジェクトにおけるHLA遺伝子群を用いた集団遺伝学2019

    • 著者名/発表者名
      井ノ上逸朗
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 沖縄バイオインフォメーションバンクの情報から琉球列島人の遺伝的多様性を探る2019

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genome Sequence for diagnosis and successive research of genetics disorders2019

    • 著者名/発表者名
      吉浦孝一郎
    • 学会等名
      第59回日本先天異常学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Origins of Yaponesians from genetic and linguistic viewpoints2019

    • 著者名/発表者名
      Saitou Naruya & Endo Mitsuaki
    • 学会等名
      Transeurasian millets and beans, languages and genes
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 東ユーラシアにおけるヤポネシア人の起源とその成立2018

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      韓国の釜山大学博物館特別講演会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 現代出雲人と出雲神話をつなげるゲノムDNA研究2018

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第27回学術集会 公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ミトコンドリアDNA研究の興亡2018

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 学会等名
      第72 回日本人類学会大会 公開シンポジウム2「DNAからみたヒトの進化」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヤポネシア現代ゲノム班の活動計画~琉球地域を中心として~2018

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      第72 回日本人類学会一般シンポジウム12「新学術領域「ヤポネシアゲノム」始動!」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本人のなか耳垢型多型2018

    • 著者名/発表者名
      吉浦孝一郎
    • 学会等名
      第72 回日本人類学会大会 公開シンポジウム2「DNAからみたヒトの進化」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genomic History of Negritos in Sundaland2018

    • 著者名/発表者名
      Timothy A. Jinam
    • 学会等名
      第72 回日本人類学会一般シンポジウム7「グローバル気候変動と現代型サピエンス全移動史」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 図解 人類の進化2021

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也ら
    • 総ページ数
      269
    • 出版者
      講談社
    • ISBN
      9784065261361
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 人類はできそこないである2021

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 総ページ数
      226
    • 出版者
      SBクリエイティブ社
    • ISBN
      9784815603113
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] ヒトゲノム事典2021

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也・井ノ上逸朗・松波雅俊ら
    • 総ページ数
      431
    • 出版者
      一色出版
    • ISBN
      9784910389127
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] Evolution of the Human Genome II2021

    • 著者名/発表者名
      Timothy Jinam, Saitou Naruyaほか
    • 総ページ数
      260
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9784431569022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] フィールドと文献からみる日琉諸語の系統と歴史2021

    • 著者名/発表者名
      林 由華、衣畑 智秀、木部 暢子
    • 総ページ数
      316
    • 出版者
      開拓社
    • ISBN
      9784758923545
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 商工ジャーナル2020年1月号2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      商工ジャーナル
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] ラリルレロボットの未来2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤 成也、太田 聡史
    • 総ページ数
      272
    • 出版者
      勁草書房
    • ISBN
      9784326050185
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 生体の科学2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      医学書院
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 最新DNA研究が解き明かす。日本人の誕生2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也、木村亮介、鈴木留美子、河合洋介、松波雅俊
    • 総ページ数
      240
    • 出版者
      秀和システム
    • ISBN
      9784798060224
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 日本語の起源をめぐる日本言語学史の光と影2020

    • 著者名/発表者名
      斎藤成也
    • 総ページ数
      360
    • 出版者
      三省堂
    • ISBN
      9784385365084
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [図書] 遺伝医学への招待改訂第6版2020

    • 著者名/発表者名
      吉浦孝一郎
    • 総ページ数
      196
    • 出版者
      南江堂
    • ISBN
      9784524249312
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] ヤポネシアゲノム A01班の研究報告

    • URL

      http://www.yaponesian.jp/research_han0100001.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2018-07-20   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi