ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析

• 研究領域: ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
• 研究課題/領域番号: 18H05511
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 複合領域
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究院, 准教授 (70416270)
• 研究分担者: 五條堀 淳 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 講師 (00506800) ; 河合 洋介 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, 副プロジェクト長 (30435515) ; 藤本 明洋 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (30525853)
• 研究期間 (年度): 2018-06-29 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 49,140千円 (直接経費: 37,800千円、間接経費: 11,340千円); 2022年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2021年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2020年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2019年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2018年度: 10,660千円 (直接経費: 8,200千円、間接経費: 2,460千円)
• キーワード: ゲノム / 日本列島人 / ヤポネシア / 日本列島 / ヒト / 進化 / 遺伝的多様性 / 日本人 / 人口動態 / 集団遺伝学 / ヤポネシア人 / ゲノム配列

研究成果の概要

本研究計画は，ゲノム配列データを用いてヤポネシア（日本列島）人の歴史を高精度に推定する手法を開発し，それらを実際のデータに適用することにより，ヤポネシア人がどのようにして日本列島に到達し，混血し，発展していったのかを明らかにすることを目的とする．ハプロタイプ，希少変異，性染色体，非SNPマーカーという4つの面に着目し，領域内の他の研究計画から得られたゲノムデータを中心に，日本列島内における現代人の詳細な遺伝構造や，1000年前からの人口動態の推定，現代人と古代人の遺伝的関係性の評価など，さまざまな解析を行い，新たな知見が得られた．

研究成果の学術的意義や社会的意義

日本列島における人類史を明らかにすることは，東アジアの島嶼地域への初期人類の移住という、世界的に見ても人類学的に非常に興味深い例として知られているだけでなく，われわれ日本人のアイデンティティにもかかわる重要な問題である．さまざまな方面からこのような研究が行われているが，近年急速に発展したゲノム情報を用いた方法は非常に有用であり，今後ますます重要性が増していくだろうと考えられる．本研究計画は、ゲノム配列解析の手法を開発・改良し，それらをプロジェクトで生み出されるデータに適用することで，日本人の祖先が辿った歴史を明らかにし，その知見を社会に還元していくという意義をもっている．

研究成果

• [国際共同研究] University College Dublin(アイルランド)
• [国際共同研究] Trinity Collage Dublin(アイルランド)
• [雑誌論文] Localized assembly for long reads enables genome-wide analysis of repetitive regions at single-base resolution in human genomes (2023)
  • 著者名/発表者名: Ko Ikemoto , Hinano Fujimoto , Akihiro Fujimoto
  • 雑誌名: Hum Genomics 巻: 9 号: 1 ページ: 21-21
  • DOI: 10.1186/s40246-023-00467-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequencing analysis of wild house mice (<i>Mus musculus</i>) captured in Madagascar (2022)
  • 著者名/発表者名: Kazumichi Fujiwara, Marie C. Ranorosoa, Satoshi D. Ohdachi, Satoru Arai, Yuki Sakuma, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 97 号: 4 ページ: 193-207
  • DOI: 10.1266/ggs.22-00090
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 年月日: 2022-08-01
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Insights into Mus musculus population structure across Eurasia revealed by whole-genome analysis (2022)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara K., Kawai Y., Takada T., Shiroishi T., Saitou N., Suzuki H., and Osada N
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 14(5) 号: 5 ページ: 1-14
  • DOI: 10.1093/gbe/evac068
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of microsatellite polymorphisms in human populations (2022)
  • 著者名/発表者名: Gochi Leo、Kawai Yosuke、Fujimoto Akihiro
  • 雑誌名: Human Genetics 巻: 142 号: 1 ページ: 45-57
  • DOI: 10.1007/s00439-022-02484-3
• [雑誌論文] The NBDC-DDBJ imputation server facilitates the use of controlled access reference panel datasets in Japan (2022)
  • 著者名/発表者名: Hachiya Tsuyoshi、Ishii Manabu、Kawai Yosuke、Khor Seik-Soon、Kawashima Minae、Toyo-Oka Licht、Mitsuhashi Nobutaka、Fukuda Asami、Kodama Yuichi、Fujisawa Takatomo、Tokunaga Katsushi、Takagi Toshihisa
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 9 号: 1 ページ: 48-48
  • DOI: 10.1038/s41439-022-00225-6
• [雑誌論文] Phylogeographic study using nuclear genome sequences of <i>Asip</i> to infer the origins of ventral fur color variation in the house mouse <i>Mus musculus</i> (2021)
  • 著者名/発表者名: Takeishi, T., Fujiwara, K., Osada, N., Mita, A., Takada, T., Shiroishi, T., and Suzuki, H.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 96 号: 6 ページ: 271-284
  • DOI: 10.1266/ggs.21-00075
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 年月日: 2021-12-01
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Demographic history of the brown bear (Ursus artcos) on Hokkaido Island, Japan, based on whole-genomic sequence analysis. Genome Biology and Evolution (2021)
  • 著者名/発表者名: Endo, Y., Osada, N., Mano, T., and Masuda, R.
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: - 号: 9
  • DOI: 10.1093/gbe/evab195
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ヤポネシア人の人口・歴史推定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 雑誌名: メディカル・サイエンス・ダイジェスト 巻: 47 ページ: 476-478
• [雑誌論文] Exploring models of human migration to the Japanese archipelago using genome-wide genetic data (2021)
  • 著者名/発表者名: OSADA NAOKI、KAWAI YOSUKE
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 129 号: 1 ページ: 45-58
  • DOI: 10.1537/ase.201215
  • NAID: 130008030483
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Modern human DNA analyses with special reference to the inner dual-structure model of Yaponesian (2021)
  • 著者名/発表者名: Jinam T. A., Kawai Y., and Saitou N.
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 129 号: 1 ページ: 3-11
  • DOI: 10.1537/ase.201217
  • NAID: 130008030443
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Whole genome sequencing with long-reads reveals complex structure and origin of structural variation in human genetic variations and somatic mutations in cancer. (2021)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Wong JH, Yoshii Y, Akiyama S, Tanaka A, Yagi H, Shigemizu D, Nakagawa H, Mizokami M, and Shimada M.
  • 雑誌名: Genome Medicine 巻: 13 号: 1 ページ: 65-65
  • DOI: 10.1186/s13073-021-00883-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Characterization of intermediate-sized insertions using whole-genome sequencing data and analysis of their functional impact on gene expression (2021)
  • 著者名/発表者名: Ashouri Saeideh、Wong Jing Hao、Nakagawa Hidewaki、Shimada Mihoko、Tokunaga Katsushi、Fujimoto Akihiro
  • 雑誌名: Human Genetics 巻: 140 号: 8 ページ: 1201-1216
  • DOI: 10.1007/s00439-021-02291-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences. (2021)
  • 著者名/発表者名: Mizuno, F., Gojobori, J., Kumagai, M., Baba, H., Taniguchi, Y., Kondo, O., Matsushita, M., Matsushita, T., Matsuda, F., Higasa, K., Hayashi, M., Wang, L., Kurosaki, K. and Ueda, S.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/s41598-021-91357-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] House mouse Mus musculus dispersal in East Eurasia inferred from 98 newly determined complete mitochondrial genome sequences. (2021)
  • 著者名/発表者名: Li Y, Fujiwara K, Osada N, Kawai Y, Takada T, Kryukov AP, Abe K, Yonekawa H, Shiroishi T, Moriwaki K, Saitou N, Suzuki H
  • 雑誌名: Heredity 巻: 126 号: 1 ページ: 132-147
  • DOI: 10.1038/s41437-020-00364-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genome-wide SNP data of Izumo and Makurazaki populations support inner-dual structure model for origin of Yamato people (2021)
  • 著者名/発表者名: Jinam Timothy、Kawai Yosuke、Kamatani Yoichiro、Sonoda Shunro、Makisumi Kanro、Sameshima Hideya、Tokunaga Katsushi、Saitou Naruya
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: - 号: 7 ページ: 681-687
  • DOI: 10.1038/s10038-020-00898-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Testing sex-biased admixture origin of macaque species using autosomal and X-chromosomal genomic sequences (2020)
  • 著者名/発表者名: Osada Naoki、Matsudaira Kazunari、Hamada Yuzuru、Malaivijitnond Suchinda
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 13 ページ: 1-14
  • DOI: 10.1093/gbe/evaa209
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of Characteristic Genomic Markers in Human Hepatoma HuH-7 and Huh7.5.1-8 Cell Lines (2020)
  • 著者名/発表者名: Kawamoto M#, Yamaji T#, Saito K, Shirasago Y, Satomura K, Endo T, Fukasawa M, Hanada K, Osada N.
  • 雑誌名: Front Genet 巻: 11 ページ: 546106-546106
  • DOI: 10.3389/fgene.2020.546106
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comparative characterization of flavivirus production in two cell lines: Human hepatoma-derived Huh7.5.1-8 and African green monkey kidney-derived Vero (2020)
  • 著者名/発表者名: Kyoko Saito, Masayoshi Fukasawa, Yoshitaka Shirasago, Ryosuke Suzuki, Naoki Osada, Toshiyuki Yamaji, Takaji Wakita, Eiji Konishi, Kentaro Hanada
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 15 号: 4 ページ: e0232274-e0232274
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0232274
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dysfunctional missense variant of OAT10/SLC22A13 decreases gout risk and serum uric acid levels. (2020)
  • 著者名/発表者名: Higashino T, Morimoto K, Nakaoka H, Toyoda Y, Kawamura Y, Shimizu S, Nakamura T, Hosomichi K, Nakayama A, Ooyama K, Ooyama H, Shimizu T, Ueno M, Ito T, Tamura T, Naito M, Nakashima H, Kawaguchi M, Takao M, Kawai Y, Osada N, Ichida K, Yamamoto K, Suzuki H, Shinomiya N, Inoue I, Takada T, Matsuo H.
  • 雑誌名: Ann Rheum Dis. 巻: 79(1) 号: 1 ページ: 164-166
  • DOI: 10.1136/annrheumdis-2019-216044
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Multiregional whole‐genome sequencing of hepatocellular carcinoma with nodule‐in‐nodule appearance reveals stepwise cancer evolution (2020)
  • 著者名/発表者名: Takeda Haruhiko、Takai Atsushi、Kumagai Ken、Iguchi Eriko、Arasawa Soichi、Eso Yuji、Shimizu Takahiro、Ueda Yoshihide、Taura Kojiro、Uemoto Shinji、Kita Ryuichi、Haga Hironori、Marusawa Hiroyuki、Fujimoto Akihiro、Seno Hiroshi
  • 雑誌名: The Journal of Pathology 巻: 252 号: 4 ページ: 398-410
  • DOI: 10.1002/path.5533
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aberrant (pro)renin receptor expression induces genomic instability in pancreatic ductal adenocarcinoma through upregulation of SMARCA5/SNF2H (2020)
  • 著者名/発表者名: Shibayama,Y., Takahashi, K., Yamaguchi, H., Yasuda, J., Yamazaki, D., Rahman, A., Fujimori, T., Fujisawa, Y., Takai, S., Furukawa, T., Nakagawa, T., Ohsaki, H., Kobara, H., Wong, J.H., Masaki, T., Yuzawa, Y., Kiyomoto, H., Yachida, S., Fujimoto, A., Nishiyama, A.
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 3 号: 1 ページ: 724-724
  • DOI: 10.1038/s42003-020-01434-x
  • NAID: 130008001357
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Whole genome sequencing analysis identifies recurrent structural alterations in esophageal squamous cell carcinoma (2020)
  • 著者名/発表者名: Dutta Munmee、Nakagawa Hidewaki、Kato Hiroaki、Maejima Kazuhiro、Sasagawa Shota、Nakano Kaoru、Sasaki-Oku Aya、Fujimoto Akihiro、Mateos Ra?l Nicol?s、Patil Ashwini、Tanaka Hiroko、Miyano Satoru、Yasuda Takushi、Nakai Kenta、Fujita Masashi
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 8 ページ: e9294-e9294
  • DOI: 10.7717/peerj.9294
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Evolutionary History of the Risk of SNPs for Diffuse-Type Gastric Cancer in the Japanese Population (2020)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki Risa L.、Ishiya Koji、Kanzawa-Kiriyama Hideaki、Kawai Yosuke、Gojobori Jun、Satta Yoko
  • 雑誌名: Genes 巻: 11 号: 7 ページ: 775-775
  • DOI: 10.3390/genes11070775
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Do Genes Associated with Dyslexia of Chinese Characters Evolve Neutrally? (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama Kumiko V.、Satta Yoko、Gojobori Jun
  • 雑誌名: Genes 巻: 11 号: 6 ページ: 658-658
  • DOI: 10.3390/genes11060658
• [雑誌論文] Classification of primary liver cancer with immunosuppression mechanisms and correlation with genomic alterations. (2020)
  • 著者名/発表者名: Fujita M, Yamaguchi R, Hasegawa T, Shimada S, Arihiro K, Hayashi S, Maejima K, Nakano K, Fujimoto A, Ono A, Aikata H, Ueno M, Hayami S, Tanaka H, Miyano S, Yamaue H, Chayama K, Kakimi K, Tanaka S, Imoto S, Nakagawa H.
  • 雑誌名: EBioMedicine 巻: 53 ページ: 102659-102659
  • DOI: 10.1016/j.ebiom.2020.102659
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Rare allele sharing in the East Asian (2020)
  • 著者名/発表者名: Gojobori, J
  • 雑誌名: Archivio per l’Antropologia e la Etnologia 巻: CL
• [雑誌論文] Comprehensive Analysis of Indels in Whole-genome Microsatellite Regions and Microsatellite Instability across 21 Cancer Types (2020)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A*, Fujita M, Hasegawa T, Wong JH, Maejima K, Oku-Sasaki A, Nakano K, Shiraishi Y, Miyano S, Yamamoto G, Akagi K, Imoto S, and Nakagawa H
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 30 号: 3 ページ: 334-34
  • DOI: 10.1101/gr.255026.119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Pan-cancer analysis of whole genomes (2020)
  • 著者名/発表者名: The ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium
  • 雑誌名: Nature 巻: 578 号: 7793 ページ: 82-93
  • DOI: 10.1038/s41586-020-1969-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Implications of HLA diversity among regions for bone marrow donor searches in Japan (2020)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto S, Nakajima F, Imanishi T, Kawai Y, Kato K, Kimura T, Miyata S, Takanashi M, Nishio M, Tokunaga K, Satake M
  • 雑誌名: HLA 巻: in press 号: 1 ページ: 24-42
  • DOI: 10.1111/tan.13881
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] 港川人のミトコンドリア DNA全塩基配列からわかること (2020)
  • 著者名/発表者名: 水野文月，五條堀淳
  • 雑誌名: 学術の動向 巻: 25 ページ: 2-2
  • NAID: 130007865037
• [雑誌論文] eVIDENCE: a practical variant filtering for low-frequency variants detection in cell-free DNA (2019)
  • 著者名/発表者名: Mizuno Kei、Akamatsu Shusuke、Sumiyoshi Takayuki、Wong Jing Hao、Fujita Masashi et al.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 15017-15017
  • DOI: 10.1038/s41598-019-51459-4
  • NAID: 120006734882
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Late Jomon male and female genome sequences from the Funadomari site in Hokkaido, Japan (2019)
  • 著者名/発表者名: Kanzawa-Kiriyama Hideaki、Jinam Timothy A.、Kawai Yosuke、Sato Takehiro、Hosomichi Kazuyoshi、Tajima Atsushi、Adachi Noboru、Matsumura Hirofumi、Kryukov Kirill、Saitou Naruya、Shinoda Ken-Ichi
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 127 号: 2 ページ: 83-108
  • DOI: 10.1537/ase.190415
  • NAID: 130007696474
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A key metabolic gene for recurrent freshwater colonization and radiation in fishes (2019)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa Asano, Kabeya Naoki, Ikeya Koki, Kakioka Ryo, Cech Jennifer N., Osada Naoki, Leal Miguel C., Inoue Jun, Kume Manabu, Toyoda Atsushi, Tezuka Ayumi, Nagano Atsushi J., Yamasaki Yo Y., Suzuki Yuto, Kokita Tomoyuki, Takahashi Hiroshi et al.
  • 雑誌名: Science 巻: 364 号: 6443 ページ: 886-889
  • DOI: 10.1126/science.aau5656
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genetic diversity and population structure of Glossina morsitans morsitans in the active foci of human African trypanosomiasis in Zambia and Malawi (2019)
  • 著者名/発表者名: Yukiko Nakamura, Junya Yamagishi, Kyoko Hayashida, Naoki Osada, Elisha Chatanga, Cornelius Mweempwa, Kalinga Chilongo, John Chisi, Jenelisa Musaya, Ryosuke Omori, Noboru Inoue, Boniface Namangala, Chihiro Sugimoto
  • 雑誌名: PLoS Negl. Trop. Dis 巻: 13 号: 7 ページ: e0007568-e0007568
  • DOI: 10.1371/journal.pntd.0007568
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Achiasmy and sex chromosome evolution (2019)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiro Satomura, Naoki Osada, Toshinori Endo
  • 雑誌名: Ecological Genetics and Genomics 巻: 13 ページ: 1000046-1000046
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 日本人ゲノム解析において集団差をどう考えるか (2019)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介
  • 雑誌名: IBD Research 巻: 13 ページ: 31-34
• [雑誌論文] 東アジアの人々のゲノム多様性 (2019)
  • 著者名/発表者名: 徳永勝士，河合洋介
  • 雑誌名: 腎臓内科・泌尿器科 巻: 10 ページ: 561-565
  • NAID: 40022102238
• [雑誌論文] ヤポネシア人の歴史の解明が医学にもたらすもの (2019)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 37 ページ: 926-929
• [雑誌論文] Clinical utility of androgen receptor gene aberrations in circulating cell-free DNA as a biomarker for treatment of castration-resistant prostate cancer (2019)
  • 著者名/発表者名: Sumiyoshi Takayuki、Mizuno Kei、Yamasaki Toshinari、Miyazaki Yu、Makino Yuki、Okasho Kosuke、Li Xin、Utsunomiya Noriaki、Goto Takayuki、Kobayashi Takashi、Terada Naoki、Inoue Takahiro、Kamba Tomomi、Fujimoto Akihiro、Ogawa Osamu、Akamatsu Shusuke
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 4030-4030
  • DOI: 10.1038/s41598-019-40719-y
  • NAID: 120006709427
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Late Jomon male and female genome sequences from the Funadomari site in Hokkaido, Japan (2019)
  • 著者名/発表者名: Kanzawa-Kiriyama H, Jinam TA, Kawai Y, Sato T, Hosomichi K, Tajima A, Adachi N, Matsumura H, Kryukov K, Saitou N and Shinoda K
  • 雑誌名: Anthropological Science 巻: -
  • NAID: 130007696474
  • 査読あり
• [雑誌論文] POGLUT1, the putative effector gene driven by rs2293370 in primary biliary cholangitis susceptibility locus chromosome 3q13.33 (2019)
  • 著者名/発表者名: Hitomi, Y. Ueno, K. Kawai, Y. Nishida, N. , Umemura, T. et al
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 9 号: 1 ページ: 102-102
  • DOI: 10.1038/s41598-018-36490-1
  • NAID: 120006715480
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel endogenous simian retroviral integrations in Vero cells: implications for quality control of a human vaccine cell substrate (2018)
  • 著者名/発表者名: Sakuma Chisato、Sekizuka Tsuyoshi、Kuroda Makoto、Kasai Fumio、Saito Kyoko、Ikeda Masaki、Yamaji Toshiyuki、Osada Naoki、Hanada Kentaro
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 644-644
  • DOI: 10.1038/s41598-017-18934-2
  • NAID: 120006401475
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comprehensive phylogenomic analysis reveals a novel cluster of simian endogenous retroviral sequences in Colobinae monkeys (2018)
  • 著者名/発表者名: Ikeda Masaki、Satomura Kazuhiro、Sekizuka Tsuyoshi、Hanada Kentaro、Endo Toshinori、Osada Naoki
  • 雑誌名: American Journal of Primatology 巻: 80 号: 7
  • DOI: 10.1002/ajp.22882
  • NAID: 120006643589
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole Genome Sequencing of a Vietnamese Family from a Dioxin Contamination Hotspot Reveals Novel Variants in the Son with Undiagnosed Intellectual Disability (2018)
  • 著者名/発表者名: Nguyen Dang、Nguyen Hai、Nguyen Thuy、Nguyen Thi、Nakano Kaoru、Maejima Kazuhiro、Sasaki-Oku Aya、Nguyen Van、Nguyen Duy、Le Bach、Wong Jing、Tsunoda Tatsuhiko、Nakagawa Hidewaki、Fujimoto Akihiro、Nong Van
  • 雑誌名: International Journal of Environmental Research and Public Health 巻: 15 号: 12 ページ: 2629-2629
  • DOI: 10.3390/ijerph15122629
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] IMSindel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu Daichi、Miya Fuyuki、Akiyama Shintaro、Okuda Shujiro、Boroevich Keith A、Fujimoto Akihiro、Nakagawa Hidewaki、Ozaki Kouichi、Niida Shumpei、Kanemura Yonehiro、Okamoto Nobuhiko、Saitoh Shinji、Kato Mitsuhiro、Yamasaki Mami、Matsunaga Tatsuo、Mutai Hideki、Kosaki Kenjiro、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 5608-5608
  • DOI: 10.1038/s41598-018-23978-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Loss-of-function mutations in Zn-finger DNA-binding domain of <i>HNF4A</i> cause aberrant transcriptional regulation in liver cancer (2018)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi Hiroaki、Fujimoto Akihiro、Kono Hidetoshi、Furuta Mayuko、Fujita Masashi、Nakagawa Hidewaki
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 9 号: 40 ページ: 26144-26156
  • DOI: 10.18632/oncotarget.25456
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] NFKB1 and MANBA Confer Disease Susceptibility to Primary Biliary Cholangitis via Independent Putative Primary Functional Variants. (2018)
  • 著者名/発表者名: Hitomi Y, Nakatani K, Kojima K, Nishida N, Kawai Y, Kawashima M, Aiba Y, Nagasaki M, Nakamura M, Tokunaga K.
  • 雑誌名: Cell Mol Gastroenterol Hepatol 巻: 7 号: 3 ページ: 515-532
  • DOI: 10.1016/j.jcmgh.2018.11.006
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A Genome-wide Association Study Identifying RAP1A as a Novel Susceptibility Gene for Crohn’s Disease in Japanese Individuals (2018)
  • 著者名/発表者名: Kakuta Yoichi、Kawai Yosuke、Naito Takeo、Hirano Atsushi、Umeno Junji、Fuyuno Yuta、Liu Zhenqiu、Li Dalin、Nakano Takeru、Izumiyama Yasuhiro、Ichikawa Ryo、Okamoto Daisuke、et al.
  • 雑誌名: Journal of Crohn's and Colitis 巻: - 号: 5 ページ: 2019-2019
  • DOI: 10.1093/ecco-jcc/jjy197
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of a two-SNP PLA2R1 Haplotype and HLA-DRB1 Alleles as Primary Risk Associations in Idiopathic Membranous Nephropathy (2018)
  • 著者名/発表者名: Latt Khun Zaw、Honda Kenjiro、Thiri Myo、Hitomi Yuki、Omae Yosuke、Sawai Hiromi、Kawai Yosuke、Teraguchi Shunsuke、Ueno Kazuko、Nagasaki Masao、Mabuchi Akihiko、Kaga Hajime、Komatsuda Atsushi、Tokunaga Katsushi、Noiri Eisei
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 15576-15576
  • DOI: 10.1038/s41598-018-33612-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Regional genetic differences among Japanese populations and performance of genotype imputation using whole-genome reference panel of the Tohoku Medical Megabank Project (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Jun、et al.,
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19 号: 1 ページ: 551-551
  • DOI: 10.1186/s12864-018-4942-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Evaluation of reported pathogenic variants and their frequencies in a Japanese population based on a whole-genome reference panel of 2049 individuals article (2018)
  • 著者名/発表者名: Y Yamaguchi-Kabata, J Yasuda, O Tanabe, Y Suzuki, H Kawame, N Fuse, M Nagasaki, Y Kawai, K Kojima, F Katsuoka, S Saito, I Danjoh, I Motoike, R Yamashita, S Koshiba, D Saigusa, G Tamiya, S Kure, N Yaegashi, Y Kawaguchi, F Nagami, S Kuriyama, J Sugawara, N Minegishi, A Hozawa, T Takai-Igarashi, K Kinoshita, M Yamamoto.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics. 巻: 63 号: 2 ページ: 213
  • DOI: 10.1038/s10038-017-0347-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Involvement of chalcone reductase in the soybean isoflavone metabolon: identification of GmCHR5, which interacts with 2-hydroxyisoflavanone synthase (2018)
  • 著者名/発表者名: Mameda Ryo、Waki Toshiyuki、Kawai Yosuke、Takahashi Seiji、Nakayama Toru
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 96 号: 1 ページ: 56-74
  • DOI: 10.1111/tpj.14014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Strong Association of the HLA-DR/DQ Locus with Childhood Steroid-Sensitive Nephrotic Syndrome in the Japanese Population. (2018)
  • 著者名/発表者名: Jia X, Horinouchi T, Hitomi Y, Shono A, Khor SS, Omae Y, Kojima K, Kawai Y, Nagasaki M, Kaku Y, Okamoto T, Ohwada Y, Ohta K, Okuda Y, Fujimaru R, Hatae K, Kumagai N, Sawanobori E, Nakazato H, Ohtsuka Y, Nakanishi K, Shima Y, Tanaka R, Ashida A, Kamei K, Ishikura K, Nozu K, Tokunaga K, Iijima K
  • 雑誌名: J Am Soc Nephrol. 巻: 29 号: 8 ページ: 2189-2199
  • DOI: 10.1681/asn.2017080859
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] 進化遺伝学とがんゲノム解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 増刊号 ページ: 105-109
• [雑誌論文] ゲノムシークエンスデータの情報解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 58 ページ: 001-003
  • NAID: 130007378613
• [雑誌論文] 肝癌の全ゲノムシークエンス解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 8月4日号 ページ: 399-404
• [学会発表] Hybrids meet in Japan: pattern and mode of genomic admixture between subspecies of wild house mice (Mus musculus) in East Asia (2023)
  • 著者名/発表者名: Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Tomoki Yano, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada
  • 学会等名: IMGC2023
  • 国際学会
• [学会発表] ゲノムから探る人類と野生ハツカネズミの歴史 (2022)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 招待講演
• [学会発表] The genetic diversity of Japanese populations inferred from the whole genome sequencing data (2022)
  • 著者名/発表者名: Kawai Y., Watababe Y., Omae Y., Miyahara R., Khor SS., Noiri E. & Tokunaga, K
  • 学会等名: American Society of Human Genetics
  • 国際学会
• [学会発表] 全ゲノムシークエンスデータから探る日本列島人の遺伝的多様性の起源 (2022)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介, 大前陽輔, 野入英世, 徳永勝士
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
• [学会発表] 現代日本列島人の地域的遺伝多様性 (2022)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介
  • 学会等名: 日本進化学会
• [学会発表] Comprehensive analysis of microsatellite polymorphisms in human populations (2022)
  • 著者名/発表者名: 郷地麗央、河合洋介、藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
• [学会発表] 長鎖シークエンス技術を用いたゲノム、トランスクリプトーム解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
  • 招待講演
• [学会発表] Whole genome and transcriptome sequencing of human cancer using long-read sequencing technology (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 4th International Conference on Vocational Innovation and Applied Science
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 長鎖シークエンス技術を用いたヒトゲノム解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本進化学会
• [学会発表] マダガスカル産野生ハツカネズミの全ゲノム配列を用いた遺伝的背景の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，Marie C. Ranorosoa，大舘智志，新井智，佐久間有希，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本遺伝学会
• [学会発表] 日本産野生ハツカネズミにおける適応進化にかかわるゲノム領域の探索 (2022)
  • 著者名/発表者名: 久保俊平，藤原一道，遠藤俊徳，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本遺伝学会
• [学会発表] 縮約ゲノム解析による日本産モグラ類（Mogera imaizumii, Mogera wogura）の系統地理学的解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 角井建，木下豪太，原田正史，佐藤淳，郷康広，辰本将司，三橋れい子，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本遺伝学会
• [学会発表] 集団ゲノム配列解析による東アジアにおける野生ハツカネズミの移住・混合様式の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本進化学会
• [学会発表] ヒグマはどのように分散し，定着したかー全ゲノム解析によるユーラシア内陸部と島嶼のヒグマの移動史ー (2022)
  • 著者名/発表者名: 遠藤優，長田直樹，間野勉，Alexei V. Abramov，増田隆一
  • 学会等名: 日本進化学会
• [学会発表] 日本産野生ハツカネズミにおいて適応的遺伝子侵入を受けたゲノム領域の探索 (2022)
  • 著者名/発表者名: 久保俊平，藤原一道，遠藤俊徳，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本分子生物学会
• [学会発表] ニホンザルの分岐年代推定および過去の集団サイズ減少がゲノムに与えた影響の考察 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大倉拓真，遠藤俊徳，長田直樹
  • 学会等名: 日本分子生物学会
• [学会発表] 野生ハツカネズミの全ゲノム集団解析：亜種間比較と移住・混合様式の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，鈴木仁，長田直樹
  • 学会等名: 日本分子生物学会
• [学会発表] 古代・現代人ゲノムデータをもとにしたヤポネシアへの人類移住経路の考察 (2021)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第75回日本人類学会
  • 招待講演
• [学会発表] 現代・古代人ゲノム情報を用いた日本列島への移住経路と混合様式の推定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第67回大会
  • 招待講演
• [学会発表] 現代ヤマト人のゲノムから探るヤポネシア人成立の歴史 (2021)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第66回大会/第28回日本遺伝子診療学会大会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] ナショナルセンターバイオバンクネットワークにおける全ゲノムシークエンス解析の取り組み (2021)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第66回大会/第28回日本遺伝子診療学会大会シンポジウム
• [学会発表] ロングリードをもちいたゲノム構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第66回大会/第28回日本遺伝子診療学会大会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Comprehensive analysis of microsatellites polymorphism in the human population (2021)
  • 著者名/発表者名: 郷地麗央、河合洋介、嶋多美穂子、藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第66回大会/第28回日本遺伝子診療学会大会シンポジウム
• [学会発表] Development of a haplotype-resolved local assembly tool with nanopore data (2021)
  • 著者名/発表者名: 池本滉、藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第66回大会/第28回日本遺伝子診療学会大会シンポジウム
• [学会発表] The investigation of the sign of selection on genes associated with dyslexia of Chinese characters. (2021)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama, K., Satta, Y. & Gojobori, J.
  • 学会等名: Cultural Evolution Society Conference
  • 国際学会
• [学会発表] 漢字の識字障害関連遺伝子群に対する自然選択の検定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 西山久美子, 颯田葉子, 五條堀淳
  • 学会等名: 第75回 日本人類学会大会
• [学会発表] ヒト東アジア集団において識字障害関連遺伝子DCDC2上に見られる自然選択の痕跡について (2021)
  • 著者名/発表者名: 西山久美子, 颯田葉子, 五條堀淳
  • 学会等名: 日本進化学会第23回東京大会
• [学会発表] PCA-UMAPを用いた現代および古代東アジア人の集団構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 久保俊平, 遠藤俊徳, 長田直樹
  • 学会等名: 第23回日本進化学会大会
• [学会発表] 全ゲノム配列データを用いたユーラシア産ハツカネズミMus musculusの系統解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道, 河合洋介, 森脇和郎, 高田豊行, 城石俊彦, 斎藤成也, 鈴木仁, 長田直樹
  • 学会等名: 第23回日本進化学会大会
• [学会発表] Whole genome sequencing with long-reads reveals complex structure and origin of structural variation in human genetic variations and somatic mutations in cancer (2021)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: Genome Concept Centennial Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Genome-wide genetic diversity of wild house mice across Eurasia (2021)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: Genome Concept Centennial Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] マカク属7種のゲノム解析による進化モデルの構築 (2020)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹，松平一成，濱田穣，Malaivijitnond Suchinda
  • 学会等名: 第36回日本霊長類学会
• [学会発表] ゲノム配列データからヤポネシア人の起源について考える (2020)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第22回日本進化学会オンライン大会
• [学会発表] 長鎖シークエンス技術を用いた構造多型／変異の検出とそれらの起源の推定 (2020)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類学会
  • 招待講演
• [学会発表] Whole genome sequencing with long-reads reveals complex structure and origin of structural variation in human genetic variations and somatic mutations in cancer (2020)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
  • 招待講演
• [学会発表] Rare allele sharing in Yaponesians and its surrounding populations (2020)
  • 著者名/発表者名: 五條堀淳
  • 学会等名: 第22回日本進化学会オンライン大会
  • 招待講演
• [学会発表] Demographic inference of human population from haplotype sharing information. The 2019 SMBE conference (2019)
  • 著者名/発表者名: Yosuke Kawai
  • 学会等名: SMBE 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of Mutations and Protein Stability on Human Mitochondrial DNA Haplogroups (2019)
  • 著者名/発表者名: Kazumichi Fujiwara, Toshinori Endo, Naoki Osada
  • 学会等名: SMBE 2019
  • 国際学会
• [学会発表] ハプロタイプ共有長の分布から推定する東アジア人の集団史 (2019)
  • 著者名/発表者名: 河合洋介
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
  • 招待講演
• [学会発表] Identification of structural variations and analysis of their functional roles (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
  • 招待講演
• [学会発表] Genetic diversity of wild house mice (Mus musculus) using whole-genome sequences of multiple samples (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，長田直樹，鈴木仁
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
  • 招待講演
• [学会発表] The negative selection pressure on autosomal recessive congenital ichthoyosis is weaker in African population (2019)
  • 著者名/発表者名: 東野俊英，長田直樹
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
• [学会発表] Temporal change of protein stability in human mitochondria during out-of-Africa migration (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，里村和浩，遠藤俊徳，長田直樹
  • 学会等名: 日本進化学会第21回大会
• [学会発表] Identification of structural variations and analysis of their functional roles (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本癌学会
  • 招待講演
• [学会発表] 長鎖シークエンス技術を用いた癌の全ゲノムシークエンス (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
• [学会発表] Population Genetics (2019)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Fujimoto
  • 学会等名: InCoB
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Identification of structural variations and analysis of their functional roles (2019)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Fujimoto
  • 学会等名: InCoB
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ミトコンドリア塩基配列から推定された日本人集団特異的な有効集団サイズの増加 (2019)
  • 著者名/発表者名: 五條堀 淳，日笠 幸一郎，松田 文彦，石谷 孔司，水野 文月，熊谷 真彦，植田 信太郎
  • 学会等名: 第73回日本人類学会大会
• [学会発表] ハツカネズミ（Mus musculus）亜種を用いた全ゲノム集団解析ハツカネズミ（Mus musculus）亜種を用いた全ゲノム集団解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，河合洋介，斎藤成也，長田直樹，鈴木仁
  • 学会等名: 第91回日本遺伝学会
• [学会発表] 構造異常／構造多型の検出と機能的意義の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: ナノポア現場の会
  • 招待講演
• [学会発表] 情報解析と人類遺伝学 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 遺伝統計学・夏の学校
  • 招待講演
• [学会発表] がんゲノム配列決定と今後の課題 -B型・C型肝炎に由来する肝癌の全ゲノム配列解析を例に- (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 京大小児科血液腫瘍研究会
  • 招待講演
• [学会発表] 「港川人骨のミトコンドリア DNA 全塩基配列からわかること」 (2019)
  • 著者名/発表者名: 五條堀淳，水野文月
  • 学会等名: 日本学術会議シンポジウム「日本旧石器人研究の発展:沖縄の現場から」
  • 招待講演
• [学会発表] ヒトゲノムの多様性をどのように解析するのか (2019)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: BI人材育成講座
  • 招待講演
• [学会発表] ソフトウェア講習 (2019)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第3回木村資生記念進化学セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Big data in biology: perspectives of genomic diversity studies (2019)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 学会等名: Winter International Symposium on Big-Data, Cybersecurity and IoT
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 性による移住率の偏りをゲノムデータから推定する (2018)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第72回日本人類学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] ミトコンドリアDNAハプログループに注目した，ヒトミトコンドリアタンパク質複合体IVにおける突然変異とタンパク質構造安定性に関する研究 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，遠藤俊徳，長田直樹
  • 学会等名: 第72回日本人類学会大会
• [学会発表] ミトコンドリアタンパク質複合体IVでの突然変異とそのタンパク質の構造安定性が与える影響について (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤原一道，遠藤俊徳，長田直樹
  • 学会等名: 第90回日本遺伝学会大会
• [学会発表] 霊長類ミトコンドリア遺伝子における多重置換に対する自然選択 (2018)
  • 著者名/発表者名: 里村和浩，長田直樹，遠藤俊徳
  • 学会等名: 第90回日本遺伝学会大会
• [学会発表] Understanding the relationship among the structural and functional properties of amino acid changes to predict the effect of mutations on human beta globin gene (2018)
  • 著者名/発表者名: Sangeetha Udani Ratnayake, Toshinori Endo, Naoki Osada
  • 学会等名: 第90回日本遺伝学会大会
• [学会発表] Predicting disease causality of mutations in human beta globin gene (2018)
  • 著者名/発表者名: Sangeetha Udani Ratnayake, Toshinori Endo, Naoki Osada
  • 学会等名: SMBE2018
  • 国際学会
• [学会発表] Hybrid type of nuclear and plastid DNAs suggests the hypothesis for ancient propagation of American bottle gourd (Lagenaria siceraria) (2018)
  • 著者名/発表者名: Dai Watabe, Hiroshi Yuasa, Naoki Osada, Kazuhiro Satomura, Toshinori endo
  • 学会等名: SMBE2018
  • 国際学会
• [学会発表] Search for the factors related to HCV replication in the HuH-7 cell line lineages (2018)
  • 著者名/発表者名: Masaki Kawamoto, Toshinori Endo, Masayoshi Fukasawa, Kentaro Hanada, Naoki Osada
  • 学会等名: SMBE2018
  • 国際学会
• [学会発表] Compensatory back mutations in mitochondrial genome of primates (2018)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiro Satomura, Naoki Osada, Toshinori Endo
  • 学会等名: SMBE2018
  • 国際学会
• [学会発表] 全ゲノム塩基配列を用いたヤポネシアとその周辺集団の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 五條堀淳
  • 学会等名: 第72回日本人類学会大会
• [学会発表] Genome-wide genetic variation of people in Japan and its implication of demographic history (2018)
  • 著者名/発表者名: Kawai Y, Mimori T, Hitomi Y, Khor SS, Gervais O, Nagasaki M and Tokunaga K
  • 学会等名: SMBE2018
  • 国際学会
• [学会発表] Comprehensive Analysis of Indels in Whole-genome Microsatellite Regions and Microsatellite Instability across 21 Cancer Types (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: アメリカ人類遺伝学会
  • 国際学会
• [学会発表] Identification of structural variations and analysis of their functional roles (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 招待講演
• [学会発表] ヒトのゲノム配列の解析と今後の課題；ゲノム解析の基礎、がんゲノム.研究、リキッドバイオプシーの個別化医療への応用 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 薬物動態談話会
  • 招待講演
• [学会発表] ヒト肝癌のゲノム異常の包括的解析と今後の課題 (2018)
  • 著者名/発表者名: 藤本明洋
  • 学会等名: 関西肝癌局所療法研究会
  • 招待講演
• [図書] 遺伝学の百科事典 (2022)
  • 著者名/発表者名: 日本遺伝学会（編）
  • 総ページ数: 690
  • 出版者: 丸善出版
  • ISBN: 9784621306604
• [図書] ヒトの分子遺伝学 (2021)
  • 著者名/発表者名: 戸田 達史、井上 聡、松本 直通（編）
  • 総ページ数: 904
  • 出版者: メディカル・サイエンス・インターナショナル
  • ISBN: 9784815730321
• [図書] ヒトゲノム事典 (2021)
  • 著者名/発表者名: 井ノ上 逸朗, 今西 規, 河村 正二, 斎藤 成也, 颯田 葉子, 田嶋 敦（編）
  • 総ページ数: 448
  • 出版者: 一色出版
  • ISBN: 9784910389127
• [図書] Evolution of the Human Genome II: Human Evolution Viewed from Genomes (Evolutionary Studies) (2021)
  • 著者名/発表者名: Naruya Saitou (ed)
  • 総ページ数: 268
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9784431569022
• [図書] 最新DNA研究が解き明かす。日本人の誕生 (2020)
  • 著者名/発表者名: 斎藤成也、木村亮介、鈴木留美子、河合洋介、松波雅俊
  • 総ページ数: 240
  • 出版者: 秀和システム
  • ISBN: 9784798060224
• [図書] 進化で読み解く バイオインフォマティクス入門 (2019)
  • 著者名/発表者名: 長田 直樹
  • 総ページ数: 232
  • 出版者: 森北出版
  • ISBN: 9784627261419
• [備考] ヤポネシアゲノム
  • URL: http://www.yaponesian.jp/
• [学会・シンポジウム開催] New development of human genome diversity studies (2019)